Basic Info

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Function Subtilisin-like protease SBT6.1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q0WUG6]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

MALERRLAYAALIPFLLLALPILPSDSPSGGGGGGAGGGGGGGETLDPPAAKYVVRFVEYRPADEHREYLEDGLRGAARPPPAASWRWVERRNPAAAFPTDFAVLEIRDACRAAVVDAVSALGRVRDVHADASYSRGVLSADRPRQQGKLFTAMSFEGEEGGGDREVGCSTDSNNSSSAGWRRKLLVQRSQVTSLFGAERLWGRGFTGRKVKMAIFDTGIRADHPHFRNIKERTNWTNEDTLNDNLGHGTFVAGVIAGQDAECPGFAPDTEIYAFRVFTDAQISYTSWFLDAFNYAIATGMDVLNLSIGGPDYLDLPFVEKVWELTANNIIMVSAIGNDGPLYGTLNNPADQSDVIGVGGIDYNNHIASFSSRGMTTWELPHGYGRVKPDVVAYSRDIMGSKISTGCKTLSGTSVASPVVAGVVCLLVSVIPEEHRKSILNPATMKQALVEGASRLSGPNMYEQGAGKIDLWQSYEILKSYQPRASIFPNTLDFTDCPYFWPFCRQPLYAGAMPVVFNATILNGMGVIGYVKDPPVWQPSEDVGNILSVHFTYSDVIWPWTGYLALHLQVKDEGSQFSGIISGKVTLSIYSPAAHGESSPRSSSCVLYLKVKVVPTPVRSRRILWDQFHNIKYPSGFVPRDSLNVHNDILDWHGDHLHTNFHILFNMLRDAGYYIETLGSPLTCFDASNYGTLLMVDLEDEYFSEEIQKLKDDVVHKGLGVVVFAEWYHVDTMVKMTFFDENTRSWWTPITGGANVPALNELLAPFGIAFGDKVLSGDFSINGEQTHYASGTDIVQFPAGGFLHSFQLQDNSKISQDNSRSADTQNTPDKSKLSSILGMMEAGKGRVAVYGDSNCLDSSHMVTNCYWLLRKLVEFTGNRIKDPVLFSESAQLKFPVFESIHQLSRRPDVNFSTYSTVVGNELICHQDSRFEVWGTKGYGTQQTGTTRKLPEYQKSEAYNISTPIASDSTPDEAGLQRNISTPIASKFDKRMDYFGFLGHEEIDIGMLVASQWMVPCFAATACLMLYLSCRVQQKRRRRKKGSTAARLSSMDRMV

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 3.9363165 9.971484 14.8908145

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0163500 RBH 1.090146 0.837566 3.906707
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g06810 RBH 0.671145 0.512847 0.915536
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0163500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0004700 RBH 0.442023 6.536257 3.070749
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_06g0004620 RBH 0.322271 1.177737 1.326367
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0004550 RBH 1.414528 2.303757 6.219182
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0004670 RBH 0.173444 0.154345 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0004580 RBH 3.100363 9.305385 11.436358
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0004460 RBH 0.198469 0.322911 0.542716
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0055300 RBH 4.5969905 11.7006355 12.519036
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0004700 RBH 0.221019 0.102926 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0004560 RBH 0.333041 6.544498 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0004610 RBH 1.223124 22.488171 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_06g0004580 RBH 0.000000 0.438786 0.297320
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0004460 RBH 0.272584 1.489488 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G004370 RBH 0.521378 1.153090 1.235814
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0004610 RBH 1.234287 6.532220 6.239560
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