Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_04G0240500 | OGI:01024340 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr04:15611577-15619202 | ||||||||
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| CDS seq | ATGGGGTGGACGTGGTCATACGTGGATAGGGCCTCGCGTTGGATTCCCTGGCCCGATTACTTTGCACTGTGCAAATTTCGATTTCCGCGCTTGTCCGTAGCCGTTTTTTATTTCCCCTCGCTGATCCCGCTCTCTCCTCGCATTTCTCTCTCTCGCTTTCCCCTTTTCTTCTCTTCTCTTCTCGTTTTCTCCGCGAGGCGAGAGAGAGATCTCGTCGGAGTGAGTGCTTGCTGGAGAGGTTTGTCTCGTCGGTATAAGTGCTCGCCGGAGAGGACTGTCTTGTCGGTGTGCATGCTCACCGGAGAGTGTAGGTCCGATTTGCTCACCGGAGAGATGCCTCGTGTCCAAACATCAAGGTTGGGTAAAAATCCCATTGAAGTTGATTCTGATGGAGGTGAAGATTTACATGTTGATTATGAAGTTGGTAATGATGTTGATGAAGGTCCTGAACATGGTGAAATTGATGGTTTATTCTCTGTTGTGCTCAGGAAAATGATTGTTCAAGAAGTGAAAAAGAATTTGGTTGACACTTCTTCTGTCAATTTTCACAATCCCATTGTGCTTTATCTGGATTATGTTGAGTTTGGTGACAAGAATATTCCTATTGGTTTTCCTAGAATTTCTCACTGGAAGAATAATATGATTACTTTGTATTCTGACCTTGACAAAGTTGATGAAGAAAACTTTGGCCTTAGGCCCATTAAGGATTTCAATGATACAACTTATTTCAAGGTTGTACCCCCTGAAAATAGAATTAATACATTCAGAGATAAATTGGAGTCTGCTATTGGTACTATGTTACCTGCTTTCATTAAGGAGAAAATTTGTTCAATGGTTGTTAGTCATTGTTCTGCCAATCACATTGTTGACAGTGAGTCTTGTGAAGATATTGCTATCAGCATTATGCTCTTGCTATGTGAACATGCTGGTTCTAGAGATGGTGGTGATCCTGATGAAAACTTAATTTTTGATAATATCAACCCTGGGTTTCAGCCTAACTATGCAATTGATGTTGAAAATGAAATCCCTTGTGATGCTCATAACAATGGAAGTACCAATAAATCTGTTGCTAGTAAAGCTAATGAAACAAGTTTTCGCCATACACCTTCTCATGATAAGGAATTGGGGGTAAATGATGATTCTGTTATTGTCTCTAAATCTGTTGTTAGATTTTCCCTTTCACCAAACTTTGAAAAAGATCAAGGCTTACTAACCCCTGAAGTTGGATATGCTAATAACTCCAATTCACGATTTGAACATTCTCGATCTGCTTCAGGTCCTACTGTATCTGCTGTAGCTGCTGTTAGGAATGTTGCAAATAAAATTAAATCAAGATTATCTCAACTCAACAATGATGACAAAAGAGGACCATTGTTCCCTGATTTAATTGATTCTTGTGAAGATGAAGCTGTTGGTTATGCTAAGTCACTTTCATGTCAAAAGGAATATCTTAACCCTCGATATGTCACTTCCTCTTCATCACAGCCTGGTATATCTTTTCACTGTCTTGACAATTCACCTATTCAAGTAATTGGTATAAATAATAATGAAGGAACAAGCAGAACTCATTGTATTCAGAATGTGAAGAAGAGGCGTTTTGATGATGTTACTAATTCTCCTGATGTGGAATATCTTGGTCATTCTATATTTCCTGATTGCTGCAAGGTATTGTGTACCCAAACTAATAATTTGTATAATGCCAAGAACATGTTGAAAAGTAACAACCTGGATTTGAGTTCTACCGGTGGAAAATTACCTCCCCATGGCCCTAGAAGAGTTTTAGTTCCTTCTCGGAAATTTTCAGATCCTTATGTTCTTTCTGTTAGACGCCAATTTCCAGTGTCAGATCAAGAAAAGAGACATTACAATGCAATATGCAAGTTGTCCGAGAGCTCTAAATGGCATAGTTATGATGCTGTAGACATTGATAATGTTAGAGCAAAATTCTCTTCTTTTGGGCAATCTCTCATGAAAGGTGGTATTGTATTGAGCTATGTTATCAATGTGTTTTGCCGTGTTTTGTTCAACAACAATCATCCTTCAAACTCCAAGAGACACTATTTCTTCTCTTCTATTGGTGAACTATTATTAACTGATCTATCTTGTGCTGATTTGAGCAAGGTGAAAAGATCGTTTCTTGGAGCAGCTAGTGCTAGGAAGTTGCACCTTTCTGACATGCTATTTTTCCCCATCGAACACCTTGAACATTGGTTCCTTTTTGTTGTTGATATAAAGGACAGAATGTTGGTCCTCTTAGATTCTTTACATGAAAAAGGTGATCCCTATTTTGAAGACATTGAATGCTTACTGATCAATAATTTACAGACATTCTGGGATTCTTATGATGGCTCTTCAATTGATTTTACTACTTTGAAGAAAGTTTACCCTTGTGTTCCAAAACAGAGATCTTGCTTTGATTCTGGAATTTTTGTTATGAAGTGTATGGAATTGTGGTCATCAAGGGTTGTTCTACCAAATGAATTTTCTTCAGATGATATTGACAATATTCGGATGCTGTATGCAAATCAGTTATTCTTCCATCCAACGAATAAAATGCTGCAGACTGAAGTTGAAGAAGTTGTGCTCAATTGGTTTAATCCTGCTGAAATTTTTCAGAAAGATAGTTGCTATGAAAATTGGTTTAATCTTGATCAATTTGCTGGTGAAGGCTAA
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| Protein seq | MGWTWSYVDRASRWIPWPDYFALCKFRFPRLSVAVFYFPSLIPLSPRISLSRFPLFFSSLLVFSARRERDLVGVSACWRGLSRRYKCSPERTVLSVCMLTGECRSDLLTGEMPRVQTSRLGKNPIEVDSDGGEDLHVDYEVGNDVDEGPEHGEIDGLFSVVLRKMIVQEVKKNLVDTSSVNFHNPIVLYLDYVEFGDKNIPIGFPRISHWKNNMITLYSDLDKVDEENFGLRPIKDFNDTTYFKVVPPENRINTFRDKLESAIGTMLPAFIKEKICSMVVSHCSANHIVDSESCEDIAISIMLLLCEHAGSRDGGDPDENLIFDNINPGFQPNYAIDVENEIPCDAHNNGSTNKSVASKANETSFRHTPSHDKELGVNDDSVIVSKSVVRFSLSPNFEKDQGLLTPEVGYANNSNSRFEHSRSASGPTVSAVAAVRNVANKIKSRLSQLNNDDKRGPLFPDLIDSCEDEAVGYAKSLSCQKEYLNPRYVTSSSSQPGISFHCLDNSPIQVIGINNNEGTSRTHCIQNVKKRRFDDVTNSPDVEYLGHSIFPDCCKVLCTQTNNLYNAKNMLKSNNLDLSSTGGKLPPHGPRRVLVPSRKFSDPYVLSVRRQFPVSDQEKRHYNAICKLSESSKWHSYDAVDIDNVRAKFSSFGQSLMKGGIVLSYVINVFCRVLFNNNHPSNSKRHYFFSSIGELLLTDLSCADLSKVKRSFLGAASARKLHLSDMLFFPIEHLEHWFLFVVDIKDRMLVLLDSLHEKGDPYFEDIECLLINNLQTFWDSYDGSSIDFTTLKKVYPCVPKQRSCFDSGIFVMKCMELWSSRVVLPNEFSSDDIDNIRMLYANQLFFHPTNKMLQTEVEEVVLNWFNPAEIFQKDSCYENWFNLDQFAGEG
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0 | 0 | 0.00491 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0946800 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g25680 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0946800 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0008100 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0008740 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0008440 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0008200 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0008340 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_10G0298800 | SBH | 0.021897 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_10g0014770 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0236700 | RBH | 0 | 0 | 0.0318915 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0007930 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_10g0014400 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_10g0014830 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0008100 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0008460 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G020130 | SBH | 0.0 | 0.408342 | 0.073269 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0000240 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
