Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_04g0008740 | OGI:01024340 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:13520415-13526685 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | - | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_04g0008740 | OsKeNa_04g0008740.01 | Chr04 | 13520415 | 13526685 | + | NAM | ||
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| Protein seq | MGWTWSYVDRASRWIPWPDYFALCKFRFPRLSVAVFYFPSLIPLSPRISLSRFPLFFSSLLVFSARRERDLVGVSACWRGLSRRYKCSPERTVLSVCMLTGEMPRVQTSRLGKNPIEVDSDGGEDLHVDYEVGNDVDEGPEHGEIDGLFSVVLRKMIVQEVKKNLVDTSSVNFHNPIDKKSKVHSKTEPSYSRFSTKYFSTVLSSLSPDQQRTIGDYDKVIAINKECVHYILGLPIGGMEFPTDCDAGKSFILSKFGKSALPSVRFFGDKFIRKETLSDDEVITSFLIVAMACFLCPNSSLVPSTKYLTVFENVDELRSYDWSKFVYEWMMTSIKKIQKFNTLGGCWFLWAVLYLDYVEFGDKNIPIGFPRISHWKNNMITLYSDLDKVDEENFGLRPIKDFNDTTYFKVVPPENRINTFRDKLESAIGTMLPAFIKEKICSMVVSHCSANHIVDSESCEDIAISIMLLLCEHAGSRDGGDPDENLIFDNINPGFQPNYAIDVENEIPCDAHNNGSTNKSVASKANETSFRHTPSHDKELGVNDDSVIVSKSVVRFSLSPNFEKDQGLLTPEVGYANNSNSRFEHSRSASGPTVSAVAAVRNVANKIKSRLSQLNNDDKRGPLFPDLIDSCEDEAVGYAKSLSCQKEYLNPRYVTSSSSQPGISFHCLDNSPIQVIGINNNEGTSRTHCIQNVKKRRFDDVTNSPDVEYLGHSIFPDCCKVLCTQTNNLYNAKNMLKSNNLDLSSTGGKLPPHGPRRVLVPSRKFSDPYVLSVRRQFPVSDQEKRHYNAICKLSESSKWHSYDAVDIDNVRAKFSSFGQSLMKGGIVLSYVINVFCRVLFNNNHPSNSKRHYSSLLWCELLLTDLSCADLSKVKRSFLGAASARKLHLSDMLFFPSNT
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0946800 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g25680 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0946800 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0008100 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0000250 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0008440 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0008200 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0008340 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0240500 | RBH | 0 | 0 | 0.00491 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_10g0014770 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0236700 | RBH | 0 | 0 | 0.0318915 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0007930 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_10g0014400 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_10g0014830 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0008100 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0008460 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G020130 | SBH | 0.0 | 0.408342 | 0.073269 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0005940 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
