Basic Info |
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| OsMH63_01G0423000 | OGI:01077870 | 3/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr01:27126905-27132537 | ||||||||
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| CDS seq | ATGGTCAAGACCCTAAGGCACTCAAGTGCATATGACGGCAGACCAAGTGATGTGTACCTTGCTGGAATAGATGGTTTTCTTCAGTTTGCATATAGGGAAAAGAGTCTTGAAGATAAGATCCGATGTCCATGTAAGGAGTGTGTCAACAAGTGGTTATTAACGCGGGATGAAGTGTATGATCATTTAGTATGTCATGGAATGTTACTTGGGTATAGTCCTTGGGGTTGTCACGGTGAAACCACATCATTCATCTCTGCCAACAGTAGGGGAACAGAGTCACAAAGTAGAGGAATGGATGGTAACATGCGCCAACTAGTGCAAGATGCTTTTGGGAACACAAACAATGACCCTCCAGTGAATGAATATGATGTACAAAATTCTTTAAACAGTGGGCCAGACCATGAAACAAAAGCATTCTATGACTTGCTCCGAGATGCTCATGACCCTTTGTGGGAAGGGTGTGAACTTACAAGGCTGTCATTTCTAGTTCTCTTGTTTCACATAAAATCAGTTAACAAGTGGAGTAATAAATCATTAAATGATTTGCTAGCAATCTTGCAACAAGCAATTCCAAATGGTAAGAATTTACCTGGAACATTTGCTGAAGCTAAGAAGATAATAGGAAAGCTTGGACTTAATTATGTCAAAATTCATGTTTGTCCAAATAACTGCCAGCTTTATAGGAAAGCTAAGGCAAACGATGACTTTTGTTCAAAATGTGGTACTTCAAGGTGGAAAAACAAAGAAGATAAAACTACTTTAACAAAGAAAGAAAGGAGAAGGGCAACCCCAAGGAAAGTGTTAAGGTACTTCCCAATTAAGCCAAGGCTTAAGAGGTTATTTATGCACAAGGAAACAGCTATAGCATTAAGATGGCATGATGAGGGTCGTACAAAGGATGGTGTGTTGCGTCATCCAGCTGACTCAGAGGCTTGGAAGTCCATTGACTCTAGGAATCCCCAGTTTGCATCGGATTCTCGAAACATCAGGTTTGCAATGGCTAGTGATGGATTTAATCCTTTTGGGACATTGAGTTCAACTTATAGTTGTTGGCCAGTTGTCTTGATTCCATATAACCTTCCTCCATGGTTATGCATGAAAGCATCTTCTATTATGCTTGCACTAATAATTCCTGGTCCATCTTACCCTGGAAAGGATTTTCATTTATTTATGGAACCAATTTATGAAGAGTTATTTGATTTATTTGAGGTTGGAACTCCTACATATGATGCATCTCAAAATGAGATGTTTCAGCTTCGTGCTACAGTAATGTTCACTATTAGTGACTATCCTGGGATTGGGATCTTTGCGGGATATAGTGTCAATGGTGAATTTGCTTGTATTACGTGTCGTGAAGAAACGTGCTCTAAACGTTTGAAACATGGACACAAGTATTGTTTCATGGGACATCGTCGATTTCTTCCTCTGGACCATGAATTACGATATAATGAAAATTCTTTTGATGGAACCGAAGAACATAGAGTAGAACCTCTTGCTTATTCTGAAACATCAGTTTTACAAAAGATAGAGAAAATTAATGATTTTGAGAAGTCAAAAACATGGAAATGCCGTAGTGGCTTATTTTCGTTGCCTTACTGGGACTTGAATGTACTCCATCATAATCTTGATGTAATGCATATTGAGAAGAATGTTTGTGATAACATATATGGGACATTGTTAGGACTGGAAGGCAAATCAAAGGATAATTTACAAGCACGCTTGGACCTACAAGAAATGAATATAAGGCCAGATTTGCATCCCATAAGAAAAGCTAATAATAAGTATTATTTGCCTCCTGCTTCCTATACAATGTCTAAACGGGAGAAACATCAATTTTGCAAAGTTCTCCATGATATTAAGGTTCCAGATGGATATGCAGGAAACATCTCAAAATGTATAAATGTTAGTCAAGGGAAAATTTCAGGTCTTAAAAGTCATGACTGTCATATTCTAATGCAAGATCTTCTCCCAGTTGCTTTGCGGTGTGTGCTTCCTTACAATGTCACTTCTGTCTTATTTGATCTATGTGGATATTTTAGAGAACTGAGTTCAAAAGTCCTGTACATTGATGTGCTTGACAAGTTAGAGGAACAAATTAAAATGACATTATGTCGTTTGGAGATGATATTTCCACCAGGTTTTTTTACCATTATGGTGCACTTGGTTGTTCATTTAGCCACTGAAGCAAAATTAGGAGGTCCTGTGTGTTACCGATGTATGTATTTTGTGGAAAGGTATTTGAGTGTATTAAAGTCATATGTGCGTAATAAGGCACATCCTGAAGGATGTATTGCAGAAGCATATTTGGCAGATGAGTGTATGACATTTTGTTCAAGATATCTTGAAGGTTTTGAGACAAAGCATAACCAGCCTACACAAAATGATGATAATGATGAGTCAGTTGCATGTTCAGATGATGAATGCACACCATATCTTTTTCCTCATGTTGGAAAACCACTTGGCAAGCCGAGAAGTTATGTTATTAGGGGCTTGACTAAAATGCAAGCACATAGATATGTGCTCTTCAACTGTCCAGATGTCAACCCATACCTTCGAACTCATGCTGATGAGATTAGAAGAACATATCGGCAAGGCCGCATCACCCCAAAGATTATCGAGCGTATCCAAAATGAAAAATTCCATGAATGGTTCAGAGCTCATATAATGGATCTAGAGAGGAAAAATGGCATATGCAGTGTCAAGAATGATCATAGATGGCTGGCTCGTGGTCCGATTGGTCCAGCAAAAAGATATCGTGCTTTCAATACCCGTGGCTTCCGGTTTAGGCCTAAACATTTGGATGGAGTGACACAGAATAGCGGAGTTGTCCTAAGTGCAAAAACATCCAGTTATACTAAATCAAGTGACACAAATCCAATATTGGGTGATCTAACATACTATGGTAGAGTCATCGATATTATTGAGCTAAATTACTCTGGACAATTTTCAGTAGTACTGTTTAAATGTGAATGGGTTGATGTTGTTTCTGGAAAAGGAGTTAAAAAAGATAAGTATGGTTACACACTAGTTAACTTCTCACATCTCATACATACTAGAGAAAAAGTTGAGCATGAGCCTTTTATTTTCCCCAATCAAGCAGATCAAGTTTATTATGTTGATGATCCAATGAATCCTGGGTGGTCTGTGGTAAGGAAGAACAAACCTAGAGATATATATGACATTGGTGAGGATGAATGGGCAGGTGACATAGAAATTGAGCCATTCCATGTTTCACACCTTGGTGGAATGTCCAGTAATGCAAACAATTACAAGCAATGGGTTAGAACAGATGTTGAAGGAACAGCAGTAGATGTCCATTATTTTGATGCAGACGCAGTTACATTGGCAAGACTCACTCGCTAA
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| Protein seq | MVKTLRHSSAYDGRPSDVYLAGIDGFLQFAYREKSLEDKIRCPCKECVNKWLLTRDEVYDHLVCHGMLLGYSPWGCHGETTSFISANSRGTESQSRGMDGNMRQLVQDAFGNTNNDPPVNEYDVQNSLNSGPDHETKAFYDLLRDAHDPLWEGCELTRLSFLVLLFHIKSVNKWSNKSLNDLLAILQQAIPNGKNLPGTFAEAKKIIGKLGLNYVKIHVCPNNCQLYRKAKANDDFCSKCGTSRWKNKEDKTTLTKKERRRATPRKVLRYFPIKPRLKRLFMHKETAIALRWHDEGRTKDGVLRHPADSEAWKSIDSRNPQFASDSRNIRFAMASDGFNPFGTLSSTYSCWPVVLIPYNLPPWLCMKASSIMLALIIPGPSYPGKDFHLFMEPIYEELFDLFEVGTPTYDASQNEMFQLRATVMFTISDYPGIGIFAGYSVNGEFACITCREETCSKRLKHGHKYCFMGHRRFLPLDHELRYNENSFDGTEEHRVEPLAYSETSVLQKIEKINDFEKSKTWKCRSGLFSLPYWDLNVLHHNLDVMHIEKNVCDNIYGTLLGLEGKSKDNLQARLDLQEMNIRPDLHPIRKANNKYYLPPASYTMSKREKHQFCKVLHDIKVPDGYAGNISKCINVSQGKISGLKSHDCHILMQDLLPVALRCVLPYNVTSVLFDLCGYFRELSSKVLYIDVLDKLEEQIKMTLCRLEMIFPPGFFTIMVHLVVHLATEAKLGGPVCYRCMYFVERYLSVLKSYVRNKAHPEGCIAEAYLADECMTFCSRYLEGFETKHNQPTQNDDNDESVACSDDECTPYLFPHVGKPLGKPRSYVIRGLTKMQAHRYVLFNCPDVNPYLRTHADEIRRTYRQGRITPKIIERIQNEKFHEWFRAHIMDLERKNGICSVKNDHRWLARGPIGPAKRYRAFNTRGFRFRPKHLDGVTQNSGVVLSAKTSSYTKSSDTNPILGDLTYYGRVIDIIELNYSGQFSVVLFKCEWVDVVSGKGVKKDKYGYTLVNFSHLIHTREKVEHEPFIFPNQADQVYYVDDPMNPGWSVVRKNKPRDIYDIGEDEWAGDIEIEPFHVSHLGGMSSNANNYKQWVRTDVEGTAVDVHYFDADAVTLARLTR
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 7.194071 | 11.610084 | 59.882141 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0768600 | RBH | 0.523054 | 0.854246 | 1.589102 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g56270 | RBH | 0.297937 | 0.579515 | 0.355271 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0768600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_12G0289500 | RBH | 2.2000215 | 0.8019965 | 5.831212 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0411800 | RBH | 10.21922 | 18.670108 | 5.9032415 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
