Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_01G0208700 OGI:01037640 | 15/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr01:12878955-12896789
Gene Symbol POD2, OsPOD2, PRX13, OSPRX13, RP-2 or RP-4, prx13, prx14
DNA seq

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Protein seq

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Function Peroxidase 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:A5H8G4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_01G0208700 OsMH63_01T0208700-mRNA-1 Chr01 12884987 12896789 + maker
CDS seq

ATGACCATATACACGTTTAGAGCTTGCTTGGAAAAAAAGATGGCCGGTCAGCGTGTGGTGGCCGCGGTGGCCGTCGCTCTGGGCGTGTGCCTGCTGCAGCTGCCGGCGGCGAGCCGCGGCCAGCTGCAGGTGGGGTTCTACAACACCAGCTGCCCCAATGCGGAGACGCTGGTCCGGCAGGCCGTCACCAACGCCTTCGCCAACGACTCCGGCATCGCCGCCGGCCTCATCCGCCTCCATTTCCACGACTGCTTCGTCAGAGGTTGCGACGCGTCGGTGCTGCTGACGTCGCCCAACAACACGGCGGAGCGCGACGCGGCGCCGAACAACCCCAGCCTCCGCGGCTTCCAGGTGATCGACGCCGCCAAGGCTGCCGTTGAGCAGAGCTGCGCGCGCACGGTGTCCTGCGCCGACATCGTCGCGTTCGCCGCCCGCGACAGCGTCAACCTCACTGGCGGCGTCTCCTACCAGGTCCCCTCCGGCCGCCGCGACGGCAACGTCTCCGTTGCCCAGGACGCCCTCGACAACCTCCCCCAGCCCACCTTCACCGCCGCCCAGCTCGTCGCCAGCTTCGCCAACAAGTCGCTCTCCGCCGAGGAGATGGTCGTCCTCTCCGGCGCCCACACCGTCGGCCGCTCCTTCTGCTCCTCCTTCCTCGCCCGCATCTGGAACAACACCACCCCCATCGTGGACACGGGGCTGAGCCCGGGGTACGCGGCGCTGCTGAGGGCGCTGTGCCCGTCGAACGCGTCGGCGACGGCGACGACGGCGATCGACGTGAGCACGCCGGCGACGCTGGACAACAACTACTACAAGCTGCTGCCGCTCAACCTGGGGCTCTTCTTCTCCGACAACCAGTTGCGGGTGAACGCGACGCTGGGCGCGTCGGCGAGCAGCTTCGCGGCGAACGAGACGCTGTGGAAGGAGAAGTTCGTCGCAGCCATGGTCAAGATGGGGAGCATCGAGGTGCTCACCGGCAGCCAGGGCGAGGTCAGGCTCAACTGCAGCGTCGTCAACAACCGGTCGTCCTCCTCCGCCGCCAGGATGGCGACGCCGTACCACTACTACTCCGGATCCACCGTGCCCGTCGTCGACGAGGTCGCGTCGAGCTGA

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Protein seq

MTIYTFRACLEKKMAGQRVVAAVAVALGVCLLQLPAASRGQLQVGFYNTSCPNAETLVRQAVTNAFANDSGIAAGLIRLHFHDCFVRGCDASVLLTSPNNTAERDAAPNNPSLRGFQVIDAAKAAVEQSCARTVSCADIVAFAARDSVNLTGGVSYQVPSGRRDGNVSVAQDALDNLPQPTFTAAQLVASFANKSLSAEEMVVLSGAHTVGRSFCSSFLARIWNNTTPIVDTGLSPGYAALLRALCPSNASATATTAIDVSTPATLDNNYYKLLPLNLGLFFSDNQLRVNATLGASASSFAANETLWKEKFVAAMVKMGSIEVLTGSQGEVRLNCSVVNNRSSSSAARMATPYHYYSGSTVPVVDEVASS

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_01G0208700 OsMH63_01T0208700-mRNA-2 Chr01 12878955 12885326 + maker
CDS seq

ATGGCCATGAAGTGCCTCCTCGTCTTCTTCCTCGTCGCCTTCTTCCCCGGAGCCGCGGTCAGCGCCGGGCTGAAGGTCGGGTTCTACAACGAGACGTGCCCGTCGGCGGAGGCCCTGGTGCAGCAGGCGGTGGCCGCCGCCTTCAAGAACAACAGCGGCGTCGCCGCCGGCCTCATCCGTCTGCACTTCCATGACTGCTTTGTCAGAGGCTGCGACGCCTCAGTTTTGATCAACGGGAGCACCACCGAGAGAAGCGCCAGCCCCAACGCGAGCCTCCGGGGCTTCGAGGTGATCGACGCCGCCAAGGCCGCCGTCGAGGCCGCGTGCCCGAGCACCGTCTCCTGTGCCGACATCCTCGCCTTCGCCGCCCGCGACGGCATCAAGCTCACCGGCAATGTCGACTACCAGGTCCCCGCCGGCCGCCGCGATGGCAACGTCTCCATCGCCCAGGACGCCCTCGACAACCTGCCCCCACCCACCGCCACGGCGAAGGAGCTCACCGACAAGTTCGCCAACAAGTCCCTCACCCTCGAGGACATGGTCGTCCTCTCCGGCGCCCACACCGTCGGCCGCTCCTTCTGCTCCTCCTTCCTCGACCGCATCTGGAACAACACCACCGCCATCGTGGACACGGGGCTGAGCCCGGGGTACGCGGCGCTTCTGAGGGCGCTGTGCCCGTCGAACGCGAACGCGTCGACGCCGATCACGACGGCGATCGACGTGAGCACGCCGGCGACGCTGGACAACAACTACTACAAGCTGCTGCCGCTCGACCTGGGGCTCTTCTTCTCCGACAACCAGCTGCGGGTGAACGCGACGATGAACGCGCTGGTGACACGGTTCGCGGCGAACGAAACGGAGTGGAAGCAGCGTTTCGCCGACGCCATGGTGAAGATGGGCAACATCGAGGTGCTGACCGGGGGAGCCGGCCAGATCAGGCTCAACTGCAACGTCGTCAACCCTTCGTCGTCGTCCTCGTCGCCGGTGGTCCAGCTGGCCGGCGAGGAGGAGGCCGCCGCCGCCGGCGCCGTCGCGGCGAGCTAG

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Protein seq

MAMKCLLVFFLVAFFPGAAVSAGLKVGFYNETCPSAEALVQQAVAAAFKNNSGVAAGLIRLHFHDCFVRGCDASVLINGSTTERSASPNASLRGFEVIDAAKAAVEAACPSTVSCADILAFAARDGIKLTGNVDYQVPAGRRDGNVSIAQDALDNLPPPTATAKELTDKFANKSLTLEDMVVLSGAHTVGRSFCSSFLDRIWNNTTAIVDTGLSPGYAALLRALCPSNANASTPITTAIDVSTPATLDNNYYKLLPLDLGLFFSDNQLRVNATMNALVTRFAANETEWKQRFADAMVKMGNIEVLTGGAGQIRLNCNVVNPSSSSSSPVVQLAGEEEAAAAGAVAAS

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.072067 2.9611 0.104659

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0327000 RBH 0.108952 0.0 0.395443
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g22336 RBH 0.103383 0.0 0.092711
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0327000 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0015030 RBH 0.0 8.939416 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0014820 RBH 0.0 2.987240 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0015060 RBH 0.0 7.159806 2.204557
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0014530 RBH 0.0 0.484729 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0014600 RBH 0.0 12.688881 1.210539
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_05G0052400 SBH 0.2285215 64.384731 0.102149
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0014520 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0204900 RBH 0.7837265 0.558258 0.283679
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0014540 RBH 0.0 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0013000 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0014530 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0014640 RBH 0.0 0.881135 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0014350 RBH 0.0 6.108673 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G014710 RBH 0.0 7.317316 0.265403
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0014510 RBH 0.0 13.779379 0.829956
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