Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_01G0022300 | OGI:01004680 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr01:1334145-1361220 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g51860 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGG4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_01G0022300 | OsMH63_01T0022300-mRNA-1 | Chr01 | 1350438 | 1361220 | - | maker | ||
| CDS seq | ATGCGGAAGCTTGTTCATGTTTTTCGACTCTGCGTTTTCTTCAGTTTCAGTGGTTCTAGAGTCTATCCACTCGGAGGGCCATCTATGATGAATAGCGGCAATATGGCTACTTCTTCCATCCTTTTCTTCTTCCTCCTCGGCGGCCTCACCGTCGCCGTCGCCGCCCACGGCACGGCGAACGACGACACCAATACCATACGCCTCCCCAGCGACGGAGCAAAGTCGCCGAAGATGCCGACGGAGAAGAGGCCGTGGAAGTGCTGCGACGACATCGAGGAGCAGCCGGCGAGCATCTTCCCGCCGTTCTGGCGGTGCAACGACGAGCTGGAGCCCAGCCAGTGCGCCGCCCAGTGCGAGGTGTGCCAGGACCAGGAGGCGTCGCCGGGCCGGCTCATCTGCGGCGACGTCTACTGGGGCGCCGACCCGGGCCCCTTCTGCACGCCGAGGCCGTGGGGAGATTGCTGCGACATGGACATCTGCAGCAGGTCTCTCCCGCCGATCTGCCGGTGCGCCGACGAGGTGGAGTCGTGCGCCGCCGCGTGCAAGGATTGCCAGCAGCTGGAGTCGTCGTCGTCGTCGTCGGAGCCTCCTCGCTACGTCTGCCATGATTGGTTCAGAGGCGAGCCAGGTTTCATTAGCATAGACTGTGGTATCCAGCCGAACACGAGCTACGTGCACAACACGACCAAGATATCCTACGTCGCCGACGACGACTTCACCGACGGCGGCTCCAACTACAACGTTTCGCCGGAGTACATCAAACCGCAGCTCTCGCAGCGGTACTACAACTTGCGTGCCTTCCCCGACGGTGCGCGCAACTGCTACACGGCCCGGTCGCTGGCGCCTGGGATCAAGTACCTCATCCGCGCCTCTTTCTTGTATGGCAACTACGACGGCCTCAACAAGCTGCCGGTGTTTCATCTCTACATTGGCGTCAACTTCTGGACCATGGTGAACATCACGAGCCTCGGCCTCGGCGGCTCTCGTTATGAGGAGGCCATCGTGGTGGTGCCCGATGACTTTGTGCAGGTCTGCCTGATCAACACTGGCACCGGCACGCCCTTCATCTCCTCGCTGGAGCTGAGGCCTCTGGACAAAAGGCTCTATCCGCAGGTGAACGCCACGCTGGGCCTCCTCCAGCTCAACCGCCTCAACTTTGGCCCGACTGATAACAGCCTCGTCAGGTACCCAGATGACCCACATGACAGATTTTGGGGAAACTGGGACAGCTATACATCGAGCTTATGGAAGGAGATATCCACGGCGTCGAGGGTAGATAACTTAGACGGAGACATATTCGATGCGCCGACGGCGGTGATGCAGACGGCAGTGACGCCGCGCAACGCGTCAGGTAACATCTACTTCTTTTGGGAGCCTTGGCCGCAGCCAAACGACCCGACGCCGCCGTACACTGTCATCTTCCACTTCTCCGAGCTGGAGATCCTCACCAACAACGCCTCGCGCCAGTTCTACATCAATCTCAACGGCGAACCGTTGATCGATACTGCTTACGAGCCGACATACCTTACAGCGAGATACTTATATGGCTTGGAGCCCCTTGAAAGAACCTCCAGGTACAATATCACCATCAACGCTACCGCCAACTCGACGCTGCCGCCGCTCATCAACGCCGCCGAGATTTTCTCGATCATCTCCACCGCAGTCATCGGCACGGACTCGCAGGATGCATCTTCCATGATGGCGATCAAGGACAAGTACCAAGTCAAGAAGAATTGGATGGGTGACCCGTGTATGCCAAAGACATTTGCGTGGGACAAGCTGACCTGCAGCTATCCCAATTCGAGCGGTGCAAGAATCATAAGCTTAAATCTGTCCTCCAGTGGTTTGAGTGCTGACATATCATCCGCTTTTGGGAATCTCAAGGCTCTTCAATACTTGGATCTATCAAACAACAGTTTGACCGGCTCAATTCCGGATGTCCTCTCACAATTACCTTCCTTGAGAGTTTTAGATCTGACAGGAAATCAACTCAGTGGATCAATTCCATCTGGAATTCTCAAGAGGATTCAAGATGGCTCCTTAAATGTAAGATATGGAAATAATCCAAACCTATGCATCAACGGCAATTCATGCAAGGCAGCTAAAAAGAAGAGCAAGCTAGCCATCTACACAGTTATTCCTGCAGTTCTGGTTGTATTGATAGCATCAGTTACAACACTCTTTTGCCTGCTGAGACGAAAAAAGCAAGGACCAATGAACAATTCTCTAGAGCAGCAAAACGAGATGTCGACATCAACAAGCCACGTGCTGATAAATAGTGGATATGGTGACAATGTATCGCTGCGGCTTGAGAACCGTCGGTTTACATATAAAGAACTAGAGAAGATAACCAACAAATTCAAACGAGTGCTCGGACGGGGAGGGTTCGGATATGTCTACCATGGCTTCTTGGAGGATGGCACAGAAGTGGCGGTCAAGTTGCGATCTGAATCCTCAAGCCAAGGTGCTAAGGAGTTCCTCATAGAGGCTCAAATTTTGACCCGGATTCACCATAAGAATCTTGTATCTATGATCAGTTACTGCAAGGATGGGATATACATGGCTCTTGTCTACGAGTACATGCCAGAAGGAACCCTAGAAGAACATATTGTAGGGGAAAACAAAAAAGGGAAAATACTTAACATGGAGAGAGAGGCTCAATATCGCATTGGAATCTGCACAAGGGATGTGAAGGCGACCAACATCCTACTAAACACAAGGTTGGAGGCAAAGATTGCCGATTTTGGCTTGTCCAAGGCATCCAGCTATGACAACATCACCCATGTATCCACGAACGCTCTCGTTGGCACACTTGGATATGTCGATCCAGAGTACCAGATGACAATGCAAGCAACAACAAAGAGCGATGTCTATAGCTTTGGCGTCGTCTTATTGGAGCTGGTCACTGGGAAGCCGGCTATCTTGCATGAACCAAACCCCATCAGCGTCATCCACTGGACACGACAACGTCTAGCACGGGGTAACATCGAGGATGTTGTGGACACATGCATGCCTAGTGATTATGATGTAAATGGTGTGTGGAAGGCTATGGACATTGCGTTCACGTGCACTGCACAAGCATCGACACAACGACTCACTATGACTGAAGTGGTGATGCAGTTGCAAGAGTGTCTCGAGCTTGAGGATGCACGTTGTGCTATTGGCGATGCACACAACGAGTTCTACCCTGACCCTCGGAGCGACCACAATTTAAGTTATAACACGTATGTCTCGGACCGGTCCAACGATGTGAGTCAAAATAGTGGCGTGTCTATGATGGAGCATAATTTTGGGAGGTCGGTCGATCTCTATCTATAA
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| Protein seq | MRKLVHVFRLCVFFSFSGSRVYPLGGPSMMNSGNMATSSILFFFLLGGLTVAVAAHGTANDDTNTIRLPSDGAKSPKMPTEKRPWKCCDDIEEQPASIFPPFWRCNDELEPSQCAAQCEVCQDQEASPGRLICGDVYWGADPGPFCTPRPWGDCCDMDICSRSLPPICRCADEVESCAAACKDCQQLESSSSSSEPPRYVCHDWFRGEPGFISIDCGIQPNTSYVHNTTKISYVADDDFTDGGSNYNVSPEYIKPQLSQRYYNLRAFPDGARNCYTARSLAPGIKYLIRASFLYGNYDGLNKLPVFHLYIGVNFWTMVNITSLGLGGSRYEEAIVVVPDDFVQVCLINTGTGTPFISSLELRPLDKRLYPQVNATLGLLQLNRLNFGPTDNSLVRYPDDPHDRFWGNWDSYTSSLWKEISTASRVDNLDGDIFDAPTAVMQTAVTPRNASGNIYFFWEPWPQPNDPTPPYTVIFHFSELEILTNNASRQFYINLNGEPLIDTAYEPTYLTARYLYGLEPLERTSRYNITINATANSTLPPLINAAEIFSIISTAVIGTDSQDASSMMAIKDKYQVKKNWMGDPCMPKTFAWDKLTCSYPNSSGARIISLNLSSSGLSADISSAFGNLKALQYLDLSNNSLTGSIPDVLSQLPSLRVLDLTGNQLSGSIPSGILKRIQDGSLNVRYGNNPNLCINGNSCKAAKKKSKLAIYTVIPAVLVVLIASVTTLFCLLRRKKQGPMNNSLEQQNEMSTSTSHVLINSGYGDNVSLRLENRRFTYKELEKITNKFKRVLGRGGFGYVYHGFLEDGTEVAVKLRSESSSQGAKEFLIEAQILTRIHHKNLVSMISYCKDGIYMALVYEYMPEGTLEEHIVGENKKGKILNMEREAQYRIGICTRDVKATNILLNTRLEAKIADFGLSKASSYDNITHVSTNALVGTLGYVDPEYQMTMQATTKSDVYSFGVVLLELVTGKPAILHEPNPISVIHWTRQRLARGNIEDVVDTCMPSDYDVNGVWKAMDIAFTCTAQASTQRLTMTEVVMQLQECLELEDARCAIGDAHNEFYPDPRSDHNLSYNTYVSDRSNDVSQNSGVSMMEHNFGRSVDLYL
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_01G0022300 | OsMH63_01T0022300-mRNA-2 | Chr01 | 1334145 | 1350464 | - | maker | ||
| CDS seq | ATGGTACTCACCCATCACAAGCACCCACACCAACCAAAGATGAGCAACACCACCATGGCTATTTCCACCATCCTTCTCTTCCTCCTCGCCGGCCTCGTCGCCGCCCACGGCGACGGCGACACCATGATCCGTCTCCCAAGCGACGGCGCCGAAGCACCACCACGCCCGCCCAAACCCTGGGACTGCTGCGACAACATCGAGATGTCCCCGCTCGAGATCTTCCCGCCGCTGTACCGCTGCAACGACGAGGTGAAGCAGTGCTCCGCCGCCTGCAAGGAGTGCGTGGAGGCGCCCGGCGACTTCCCCCGCGGCGCCTTCGTGTGCCGCGACTGGTACTCGACGGTGGACCCGGGCCACATGTGCACGGCGCCGGATCAGCCGACGACGAAGAGGCCGTGGAAGTGCTGTGACAGCATCGTGCAGCTGCCGCAGAGGATCTTCCCGCCGTTCTGGCGCTGCGACGACGAGCTGGAGCCCGGCAAGTGCACCGCCGCGTGCAAGTCGTGCAGGGAGGCGCCGGGGCCGTTCCCGGGGCCGCTCATCTGCGAGGACGTCTACTGGGGCGCCGACCCGGGCCCCTTGTGCACGCCGCGGCCATGGGGGAAATGCTGCGACAAGGCCTTCTGCAACAAGATGAACCCGCCGACCTGCCGCTGCATGGACGAGGTGAACAAGTGCGCCGCCGCGTGCAAGGATTGCCAGCGTGTGGAGTCGTCAGAGCCGCCTCGCTACGTCTGCAAGGACCGCTTCACCGGCCAGCCCGGGCCCATCATGGCTACTTCCACCATCCTGCTCTTCCTCCTCGCCGTCGGCGGCCTCGCCGCCGCCCACGGCGACACCATCCGTCTCCCCAGCGAAGGCGACGCACCACCGCAGCCCGCCAAACCCTGGGACTGCTGCGACGATATCGAGATGTCCCCGCTAAAGATCTTCCCGCCGCTTTACCGCTGCAACGACGAGGTCAAGCAGTGCTCGGCCGCCTGCAAGGAGTGCGTGGCGGCGCCGGCGGCCGGAGACTCCCCCTGCGGCGGCGGCGCCGCCCTCGTCTGCCGCGACTGGTACTCGACGGAGGACCCCGGCAAGCCGTGCACGCCGGAGCGGGAATGGCCGGAGCGGACGACGAAGAAGAGGCCGTGGAAGTGCTGCGACAACATCCGGCGGCTGCCGCCGAGGATCCACCCGCCGTTCTGGCGCTGCGACGACGAGCTCAAGCCCGGCCAGTGCTTCGCCGCGTGCAAGGCTTGCCGGGAGGCGCCGGGGCCATTCCCGGGGCCGCTCATCTGCGACGACGTCTACTGGGGCGCCGACCCGGGTCCCTTCTGCACGCCGCGGCCGTGGGGGGATTGCTGCGACAACACCACCTGCACCAAGTCGATCCCTCCAATCTGCAGCTGCGGCGACAAGGTGGCGGCATGCGACGGCGCGTGCAAGGATTGCCAGCCGGTGGCGTCGTCGTCGGAGCCGCCTCGCTTCGTCTGCAAGGATCAGTTCACCGGACAGCCAGGGCCCAACTCCAAGGCTCCAAGCAAAGTAATTAAGATGACCATGAAAGTGAAGAGCACCATGATGGCTGCTTCCATGCTGCTCTTCCTCCTCGTCCTCGCCGGCATCGTCACCGCCACCACCACCACCACCGACAGCAACATTCGCCTCCCCAGCAACGGCGCCGCCGGCGAAACCGATGGAAACAAACAGGCGAAATCCAGACCGTGGGAGTGCTGCGACAACATCGAGATGTCCGTGCTCAAGATCTACCCGCCGCGGTGGCGTTGCAACGACGAGGTGAAGCAGTGCGCCGCCGCCTGCGAGAACTGCCTGCAGCTGGTGCCCGGGGCCGGCGGCGAAGATGTCGTCTTCGTCTGCGACGACTGGTACCCGACCACCAACCCTGGCCCCGTCTGCACGCCGCGGCCGTGGGGCGATTGCTGCGACAAGGCCTTCTGCACCAGGTCTCTCCCACCGATCTGCCACTGCGCCGACGAGGTGGCGTCGTGCGCCGCCGCCTGCAAGGAGTGCGACATGGTGAATTCGTCGTCGGAGCCGCCTCGCTATATCTGCCGCGACCACTTCACCGGCGAGCCCGGGCCCATCAAGACGTCCATGAAGATGAAGCGCACCATGGCTGCTACTTCCATCCTGTTCTTCTTCCTCGCCGGCCTCGCCGCCGCCCACGGCAGCACAGCGGACGACACCACGACCACCACCACCAACACCATACGCCTCCCGATCGACGGAGCAGTGGCGGCGCGAAGGAGGACGAGGCCGTGGAAGTGCTGCGACAACATCGTGAGGCTGCCGGAGAGGATCAACCCGCCGTTCTGGCAGTGCGACGACGAGCTGGAGCCCGGGCAGTGCTTCCGCCAGTGCGAGGCGTGCCGGGATCCGCCGGGGCGGCCGTTCCCCGGCCGGCCGCTCATCTGCGACGACGTCTTCTGGGGCGACGACCCGGGCACCTCGTGCGCGCCGTCGTCGGAGTGGCCGTGGGGCCCGTGCTGCGACATCGCCGTCTGCACCAAGTCGCTCCCTCCCATCTGCCACTGCTCCGACGAGGTGGAGTCGTGCGCCGCCGCGTGCGGGCAGTGCGAGATGGTGGACTCGTGGTCGTGGCGCCCTCTCTTCGTCTGCCGTGACTCCTTCACCGGGGACCCAGGCCCCAGGTGCACACCTGAAATGCACAACTAA
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| Protein seq | MVLTHHKHPHQPKMSNTTMAISTILLFLLAGLVAAHGDGDTMIRLPSDGAEAPPRPPKPWDCCDNIEMSPLEIFPPLYRCNDEVKQCSAACKECVEAPGDFPRGAFVCRDWYSTVDPGHMCTAPDQPTTKRPWKCCDSIVQLPQRIFPPFWRCDDELEPGKCTAACKSCREAPGPFPGPLICEDVYWGADPGPLCTPRPWGKCCDKAFCNKMNPPTCRCMDEVNKCAAACKDCQRVESSEPPRYVCKDRFTGQPGPIMATSTILLFLLAVGGLAAAHGDTIRLPSEGDAPPQPAKPWDCCDDIEMSPLKIFPPLYRCNDEVKQCSAACKECVAAPAAGDSPCGGGAALVCRDWYSTEDPGKPCTPEREWPERTTKKRPWKCCDNIRRLPPRIHPPFWRCDDELKPGQCFAACKACREAPGPFPGPLICDDVYWGADPGPFCTPRPWGDCCDNTTCTKSIPPICSCGDKVAACDGACKDCQPVASSSEPPRFVCKDQFTGQPGPNSKAPSKVIKMTMKVKSTMMAASMLLFLLVLAGIVTATTTTTDSNIRLPSNGAAGETDGNKQAKSRPWECCDNIEMSVLKIYPPRWRCNDEVKQCAAACENCLQLVPGAGGEDVVFVCDDWYPTTNPGPVCTPRPWGDCCDKAFCTRSLPPICHCADEVASCAAACKECDMVNSSSEPPRYICRDHFTGEPGPIKTSMKMKRTMAATSILFFFLAGLAAAHGSTADDTTTTTTNTIRLPIDGAVAARRRTRPWKCCDNIVRLPERINPPFWQCDDELEPGQCFRQCEACRDPPGRPFPGRPLICDDVFWGDDPGTSCAPSSEWPWGPCCDIAVCTKSLPPICHCSDEVESCAAACGQCEMVDSWSWRPLFVCRDSFTGDPGPRCTPEMHN
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 27.8467865 | 69.9584235 | 304.7526475 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0124600 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g03380 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0124600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0001820 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0001700 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0001820 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0001740 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0001820 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0022500 | RBH | 12.2048265 | 23.5406925 | 17.7103855 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0001750 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0022500 | SBH | 61.9955875 | 122.357986 | 0.8228405 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0001640 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0001820 | RBH | 0.0 | 1.178025 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0001860 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0001810 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0001710 | RBH | 0.0 | 20.865931 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G001900 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0001770 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
