Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_01G0011900 OGI:01003300 | 2/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr01:741852-745996
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

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Function Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q94HW2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_01G0011900 OsMH63_01T0011900.1 Chr01 741852 745996 + maker
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.008217 0.052689 0.017084

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g05370 SBH 0.0 0.000000 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0004460 SBH 0.000000 0.573608 2.310898
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0406900 SBH 0.2410165 0.496788 0.0251355
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0014600 RBH 0.0855625 0.3652045 0.430337
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G004580 SBH 0.272984 2.940498 1.398582
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0004470 SBH 0.976350 0.000000 2.896348
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