Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLima_11g0018080 | OGI:11010520 | 16/16 | LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:23436902-23452485 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R2D5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLima_11g0018080 | OsLima_11g0018080.01 | Chr11 | 23436902 | 23452485 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MDFPSILELATVVMERAMMLLLFCSYALALVSAESSSNATADELALLSFKSMLSSPSLGLMASWNSSSHFCSWTGVSCSRQQPEKVIALQMNSCGLSGRISPFLGNLSFLKTLDLGNNQLVGQIPSELGHLSKLQMLNLSTNLLRGSIPVEMRGCTKLMTLHLGNNQLQGEIPAEIGSSLKNLINLYLTRNLLSGEIPQSLAELPSLELLSLSHNKLSGEVPSALSNLTNLLNIRFSNNMLSGVIPSSLGMLPNLYELSLGFNNLSGPIPTSIWNISSLRALSVQGNMLSGTIPANAFETLPHLEELYMDHNHLHGKIPVSLGNSSNLSMIILGANLFNGIVPQEIGRLRKLEQLVLTQTLVGAKEQKDWEFITALANCSQLQVLVLGMCEFGGVLPNSLSSLSTSLKYLSLSYNNILGSIPKDIGNLFNLQVLDLAWNSFIGTLPSSLGRLKNLHYFNVYNNDLGGPIPSTIGNLTELITLYLMSNTFSGRLTNSLANLTKLTELDLSSNNFIGPIPSGLFNITTLSIALELSYNKFEGSIPQEIGNLVNLVKFNAESNKLSGEIPSTLGQCQNLQDLTLQNNMLNGNIPEQLSQLKSLQTLDFSRNNLSGEIPIFIENFTMLSYLNLSFNMFTGEVPTTGIFTNSTAISIQHNGRLCGGITTLHLPPCSSQLPKNKHKPVVIPIVISLVATLAVLSLLYILFAWHKKIQTEIPSTTSMRGHPLVSYSQLVKATDEFSIANLLGSGSFGSVYKGELVAQIGESPYYVAVKVLKLQTSGALKSFAAECNALRNLRHRNLVKIITACSSIDNSGNDFKAIVFDFMPNGSLEGWLHPDKDDQIDHKYLNLLERSMVLEIRYGILVLEMVTGKRPIDNKSIQGLSLREYVELGLHGKMMDVVDTQLFLGLENEFHTADDSSCKGRINCLVALLRLGLYCSQEMPSNRINDATKATVDELALLSIKSMLSSPSSSPLASWNSTSSIHHCSWPGVVCSRRHPGRVAALRMASFNLSGAISPFLANLSFLRELDLAGNQLAGEIPPDIGRLGRLETVNLAANALQGTLPLSLGNCTNLMVLNLTSNQLQGEIPSTIGARMVNLYMLDLRQNGFSGEIPLSLAELPSMEFLFLYSNKLSGEIPTALSNLSGLMHLDLDTNMLSGAIPSSLGKLSSLIWLNLANNNLSGTIPSSIWNISSSLWGLNIQQNNLVGVVPTDAFTALPELRTISMDNNRFHGRLPTSLVNVSHVRMLQLGFNFFSGTVPSELGMLKNLEQFLLFATLLEAKEPRDWEFITALTNCSRLKILELGASKFGGVLPDSLSNLSTSLQTLSLQYNTISGRIPKDIGNLIGLQSLTLDDNSFIGTLPSSLGRLQNLNLLSVPKNKISGSVPLAIGNLTKLSSLELQANAFSGEIPSTVANLTKLSALNLARNNFTGAIPRRLFNILSLSKILDISHNNLEGSIPQEIGNLINLEEFHAQSNILSGEIPPSLGECQLLQNVYLQNNFLNGTISSALGQLKGLESLDLSNNKLSGQIPRFLGNISMLSYLNLSFNNFSGEVPDFGVFANITAFLIQGNDKLCGGIPTLHLRPCSSGLPEKKHKFLVIFIVTISAVAILGILLLLYKYLNRRKKNNTKNSSETSMQAHRSISFSQLAKATEGFSATNLLGSGTFGSVYKGKIDGQTDESAEYIAVKVLKLQTPGAHKSFVAECEALKNLRHRNLVKVITACSSIDTRGYDFKAIVFDFMPNGSLEDWLHPKPVDQTEMKYLGLVQRVTILLDVAYALDYLHCRGPAPVVHCDIKSSNVLLDSDMVAHVGDFGLAKILAEGSSSLQHSTSSMGFRGTIGYAAPEYGAGNIVSTNGDIYSYGILVLETVTGKRPTDNRFRQGLSLREYVEQALHGETMDIVDSQLTLELENECALQDSSYKRKIDCLISLLRLGVSCSHELPLSRMRTTDIVNELHAMRESLLREYRIEDGSYVNIKHQASYWSRILHSHRIRPSPHDGIHSTSSVGRCDKINIKQRQRRAGPRALPALLQCITHRYDTGLAVLID
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
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Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0569300 | RBH | None | None | None |
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| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0018280 | SBH | 0.214398 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0344100 | SBH | 1.287871 | 12.7846285 | 1.149585 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0018090 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0018210 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0017720 | RBH | 5.948813 | 12.354786 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0017570 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0017660 | RBH | 0.123759 | 0.667272 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G017730 | RBH | 0.395918 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0018010 | RBH | 0.080130 | 5.532844 | 0.000000 |
