Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsAzu_11g0017830 OGI:11010520 | 16/16 Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:21698943-21744460
Gene Symbol RLCK288, OsRLCK288, LRR-RLK2, OsLRR-RLK2, RLCK312, OsRLCK312, XA21, Xa21*, Xa21, OsXA21, OsEnS-147, Gnk2RLK-9, XA3, Xa-3, Xa3 (Xa4b, Xa6, Xa9, Xa w), Xa3, Xaw, Xa4-b, XA26, Xa26(t), Xa26(t)*, Xa26, RKb, MRKb, MRKB, TRKb, Xa3/Xa26
DNA seq

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Function Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R2D5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsAzu_11g0017830 OsAzu_11g0017830.01 Chr11 21698943 21744460 - NAM
CDS seq

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MSGLSRLTLSSNNLTGLIPSSIWNNMSALMAFTVQQNSLSGTIPPNAFSNFPSLQLIGMDHNKFHGSIPTSIANASHLWLVQLGANFLSGIVPPEIGGLRNLKILQLSETFLEARSPNDWKFITALTNCSQFSVLYLASCSFGGVLPDSLSNLSSLTNLFLDTNKISGSIPEDIDNLINLQAFNLDNNNFTGHLPSSIGRLQNLHLLSIGNNKIGGPIPLTLGNLTELYILQLRSNAFSGSIPSIFRNLTNLLGLSLDSNNFTGQIPTEVVSIVSLSEGLNLSNNNLEGSIPQQIGNLKNLVNLDARSNKLSGEIPTTLGECQLLQNIYLQNNMLTGSLPSLLSQLKGLQTLDLSSNNLSGQIPTFLSNLTMLGYLNLSFNDFVGEVPTLGVFLNASAISIQGNGKLCGGVPDLHLPRCTSQAPHRRQKFLVIPIVVSLVATLLLLLLFYKLLARYKKIKSKIPSTTCMEGHPLISYSQLARATDSFSATNLLGSGSFGSVYKGELDKQSGQSKDIIAVKVLKLQTPGALKSFTAECEALRNLRHRNLVKIITACSSIDNSGNDFKAIVFDFMPSGNLEGWLHPATNNPKYLNLLQRVGILLDVANALDYLHCHGPTPVVHCDLKPSNVLLDAEMVAHVGDFGLAKILFEGNSLLQQSTSSMGLRGTIGYAPPEYGAGNTVSTQGDIYSYGILVLETVTGKRPTDKKFIQGLSLREYVELGLHGKMMDVVDTQLSLHLENELRTTDEYKVMIDCLGGLSLASWNTSGHGQHCTWVGVVCGRRRRRHPHRVVKLLLRSSNLSGIISPSLGNLSFLRELDLSDNYLSGEIPPELSRLSRLQLLELSGNSIQGSIPAAIGACTKLTSLDLSHNQLRGMIPREIGASLKHLSNLYLHTNGLSGEIPSALGNLTSLQYFDLSCNRLSGAIPSSLGQLSSSLLTMNLRQNNLSGMIPNSIWNLSSLRAFSVSENKLGGMIPTNAFKTLHLLEVIDMDTNRFHGKIPASVANASHLTRLQIDGNLFSGIITSGFGRLRNLTTLYLWRNLFQTREQEDWGFISDLTNCSKLQTLDLGENNLGGVLPNSFSNLSTSLSFLALDLNKITGSIPKDIGNLIGLQHLYLCNNNFRGSLPSSLGRLRNLGILVAYENNLSGSIPLAIGNLTELNILLLGTNKFSGWIPYTLSNLTNLLSLGLSTNNLSGPIPSELFNIQTLSIMINVSKNNLEGSIPQEIGHLKNLVEFHAESNRLSGKIPNTLGDCQLLRIPSALGQLKGLETLDLSSNNLSGQIPTSLADITMLHSLNLSFNSFMGEVPTIGAFADASGISIQGNAKLCGGIPDLHLPRCCPLLENRKHFPVLPISVSLVAALAILSSLYLLITWHKRTKKGAPSRTSMKGHPLVSYSQLVKATDGFAPTNLLGSGSFGSVYKGKLNIQDHVAVKVLKLENPKALKSFTAECEALRNMRHRNLVKIVTICSSIDNRGNDFKAIVYDFMPSGSLEDWIHPETNDPADQRHLNLHRRVTILLDVACALDYLHRHGPEPVVHCDVKSSNVLLDSDMVAHVGDFGLARILVDGTSLIQQSTSSMGFRGTIGYAAPEYGVGHIASTHGDIYSYGILVLEIVTGKRPTDSTFRPDLGLRQYVELGLHGRVTDVVDTKLILDSENWLNSTNNSPCRRITECIVSLLRLGLSCSQDLPLSRTPTGDIIDELNAIKQNLSGFDDDAAAAAVPTGGAAADELALLSFRSSLVSQGGSSLASWNTTSGHGQHCTWAGVACGGRRDRVVELRLRSFNLSGTISPSLGNLSFLAKLHLGGNHLSGEIPPELGRLSRLRRLNMSGNSLQGSIPAAIGGCFRLIEMDLTINQLEGKIPLQIGASMKNLAYLYLEGNRLSGQIPRSLAELPSIQELSLGSNGLSGEIPPALGNLTGLSFLSLSENSLSGGIPSSLCNLTSLSSLYLNKNTLSGTIPSCLGNLNSLLELALSDNTLSGAIPSSLGRLSRLSSLHLSSNNLSGLIPDPIWNISSLTVFGVQYNMLSGMLPANAFSTLPHLQEVYMDNNQFHGHIPASVANASNISMLTFGVNSFSGVVPEEIGRLRNLGTLVLAETLLEAEGPNDWKFMTALTNCSNLQHVEMGACKFGGVLPDSVSNLSSSLVYLSIGANKISGSLPRDIGNLINLESLVLFNNSLTGSLPSSFSKLKNLHRLILFNNKLSGYLQLTIGNLTQITNLELYGNAFSGTIPSTLGNMTRLFELNLAHNNFIGAIPTEIFSIPTLSETLDVSHNKLEGSIPKEIGELKNIVEFHADSNKLSGEIPSTISGCQLLQHLSLQNNFLNGNIPIALTQLAGLDTLDLSGNNLSGQIPKSLGDMPLLHSLNLSFNSFQGEVPTNGVFANASEIYIQGNANICGGIPELRLPQCSLKSTKKKKHQILLIALTVCLVSTLAIFSLLYMLLTCHKRRKKEVPAMTSIQGHPMITYKQLVKATDGFSPANLLGSGSFGSVYKGELDSQHGESTSSVAVKVLKLETPKAVKSFTAECEALRNMRHRNLVKIVTICSSIDNKGNDFKAIVYDFMPNGSLEDWLHPETNCDQAEQRHLNLHQRVNILLDVACALDYLHCLGPESVVHCDIKSSNVLLDADMVAHVGDFGLARILVKESSLMQQSTSSMGFRGTIGYAAPVSGKRPTDTTFGPGLSLRQYVEPGLHGRLMDVVDRKLVLDSKSWVQTPDISPCKEINECLVSLLRLGLSCSQELPSSRMQTGDVIIVMARAMMLLLFCSYALALVSAGSSSSSNATADELALLSFKSMLSSPSLGLMASWNSSSHFCSWTGVSCSRQQPEKVIALQMNSCGLSGRISPFLGNLSFLKTLDLGNNQLVGQIPSELGHLSKLRMLNLSTNLLRGSIPVEMRGCTKLMTLHLGNNQLQGEIPAEIGSSLKNLINLYLTRNLLSGEIPQSLAELPSLELLSLSHNKLSGEVPSALSNLTNLLNIRFSNNMLSGVIPSSLGMLPNLYELSLGFNNLSGPIPTSIWNISSLRALSVQGNMLSGTIPANAFETLPHLEELYMDHNHLHGKIPVSLGNSSNLSMIILGANLFNGIVPQEIGRLRKLEQLVLTQTLVGAKEQKDWEFITALANCSQLQVLVLGMCEFGGVLPNSLSSLSTSLKYLSLSYNNILGSIPKDIGNLFNLQVLDLAWNSFIGTLPSSLGRLKNLHYFNVYNNDLGGPIPSTIGNLTELITLYLMSNTFSGRLTNSLANLTKLTELDLSSNNFIGPIPSGLFNITTLSIALELSYNKFEGSIPQEIGNLVNLVKFNAESNKLSGEIPSTLGQCQNLQDLTLQNNMLNGNIPEQLSQLKSLQTLDFSRNNLSGEIPIFIENFTMLSYLNLSFNIFTGEVPTTGIFTNSTAISIQHNGRLCGGITTLHLPPCSSQLPKNKHKPVVIPIVISLVATLAVLSLLYILFAWHKKIQTEIPSTTSMRGHPLVSYSQLVKATDEFSIANLLGSGSFGSVYKGELVAQIGESPYYVAVKVLKLQTSGALKSFAAECNALRNLRHRNLVKIITACSSIDNSGNDFKAIVFDFMPNGSLEGWLHPDKDDQIDHKYLNLLERSMVLEIRYGILVLEMVTGKRPIDNKSIQGLSLREYVELGLHGKMMDVVDTQLFLGLENEFQTADDSSCKGRINCLVALLRLGLYCSQEMPSNRMLTGDIIKELSSIKQSFNDATKATVDELALLSIKSMLSSPSSSPLASWNSTSSIHHCSWPGVVCSRRHPGRVAALRMASFNLSGAISPFLANLSFLRELDLAGNQLAGEIPPEIGRLGRLETVNLAANALQGTLPLSLGNCTNLMVLNLTSNQLQGEIPSTIGARMVNLYILDLRQNGFSGEIPLSLAELPSLEFLFLYSNKLSGEIPTALSNLSGLMHLDLDTNMLSGAIPSSLGKLSSLIWLNLANNNLSGTIPSSIWNISSSLWGLNIQQNNLVGVVPTDAFTALPELRTISMDNNRFHGRLPTSLVNVSHVRMLQLGFNFFSGTVPSELGMLKNLEQFLLFATLLEAKEPRDWEFITALTNCSRLKILELGASKFGGVLPDSLSNLSTSLQTLSLQYNTISGRIPKDIGNLIGLQSLTLDDNSFIGTLPSSLGRLQNLNLLSVPKNKISGSVPLAIGNLTKLSSLELQANAFSGEIPSTVANLTKLSALNLARNNFTGAIPRRLFNILSLSKILDISHNNLEGSIPQEIGNLINLEEFHAQSNILSGEIPPSLGECQLLQNVYLQNNFLNGTISSALGQLKGLESLDLSNNKLSGQIPRFLGNISMLSYLNLSFNNFSGEVPDFGVFANITAFLIQGNDKLCGGIPTLHLRPCSSGLPEKKHKFLVIFIVTISAVAILGILLLLYKYLNRRKKNNTKNSSETSMQAHRSISFSQLAKATEGFSATNLLGSGTFGSVYKGKIDGQTDESAEYIAVKVLKLQTPGAHKSFVAECEALKNLRHRNLVKVITACSSIDTRGYDFKAIVFDFMPNGSLEDWLHPKPVDQTEMKYLGLVQRVTILLDVAYALDYLHCRGPAPVVHCDIKSSNVLLDSDMVAHVGDFGLAKILAEGSSSLQHSTSSMGFRGTIGYAAPEYGAGNIVSTNGDIYSYGILVLETVTGKRPTDNRFRQGLSLREYVEQALHGETMDIVDSQLTLELENECALQDSSYKRKIDCLISLLRLGVSCSHELPLSRMRTTDIVNELHAMRESLLREYRIEDGSYVNVTLE

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsAzu_11g0017830 OsAzu_11g0017830.04 Chr11 21718272 21721372 - IsoSeq
CDS seq

TCGATAGCTACTCTTGCAGAGATCGACACGCACGCATGGCGAGATCACTCGCGTTGCTCATGCTCCTGTTCAATTCCTCGCTGCTGCTCCCTCCGGCGAGCAGCGACGACGACGCCGCTGCTGCCGCCGTTCCCACGGGCGGCGCCGCCGCCGACGAGCTCGCGCTGCTCTCCTTCAGGTCGTCTCTTGTGTCCCAGGGGGGCTCGTCGCTGGCATCATGGAACACTACGTCCGGCCACGGCCAGCACTGCACATGGGCGGGTGTCGCGTGCGGCGGCCGGCGGGACAGGGTGGTCGAGCTGCGGCTGCGATCGTTCAACCTGTCCGGGACCATCTCGCCGTCGCTGGGCAACCTCTCCTTCCTCGCTAAGCTGCACCTCGGCGGCAACCACCTCTCCGGCGAGATACCGCCGGAGCTCGGCC

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Protein seq

SIATLAEIDTHAWRDHSRCSCSCSIPRCCSLRRAATTTPLLPPFPRAAPPPTSSRCSPSGRLLCPRGARRWHHGTLRPATASTAHGRVSRAAAGGTGWSSCGCDRSTCPGPSRRRWATSPSSLSCTSAATTSPARYRRSSA

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr11 21743842 21744261 - OsAzu_11g0017830.01 OsAzu_11g0017830.01,OsAzu_11g0017830.02 All
SE Chr11 21743408 21744261 - OsAzu_11g0017830.01 OsAzu_11g0017830.03,OsAzu_11g0017830.01 All
SE Chr11 21743408 21744261 - OsAzu_11g0017830.02 OsAzu_11g0017830.03,OsAzu_11g0017830.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.128877 6.788608 1.696541

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0695800 RBH 0.068483 0.0 0.167381
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g36180 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0568800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0017790 RBH 0.000000 0.0 0.416277
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0017540 RBH 0.023507 0.0 0.379464
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0017730 RBH 0.0 0.732895 2.030220
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0024070 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0017780 RBH 0.347210 0.0 0.746363
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0332200 RBH 0.009196 0.9433155 3.2579865
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0018330 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0344000 RBH 0.5304765 0.352867 0.0268395
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0018120 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0018210 RBH 0.000000 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0017340 RBH 0.0 1.023452 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0017520 RBH 0.350358 0.0 0.366629
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0017660 RBH 0.123759 0.667272 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G017790 RBH 0.0 0.0 0.329270
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0017920 RBH 0.0 0.0 0.0
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