Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsCMeo_11g0017770 | OGI:11010520 | 16/16 | CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:20899363-20945520 | ||||||||
Gene Symbol | LRR-RLK2, OsLRR-RLK2, XA21, Xa21*, Xa21, OsXA21 | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MARSLALLMLLFNSSLLLPPASSDDDAAAAAVPTGGAAADELALLSFRSSLVSQGGSSLASWNTTSGHGQHCTWAGVACGGRRDRVVELRLRSFNLSGTISPSLGNLSFLAKLHLGGNHLSGEIPPELGRLSRLRRLNMSGNSLQGSIPAAIGGCFRLIEMDLTINQLEGKIPLQIGASMKNLAYLYLEGNRLSGQIPRSLAELPSIQELSLGSNGLSGEIPPALGNLTGLSFLSLSENSLSGGIPSSLCNLTSLSSLYLNKNTLSGTIPSCLGNLNSLLELALSDNTLSGAIPSSLGRLSRLSSLHLSSNNLSGLIPDPIWNISSLTVFGVQYNMLSGMLPANAFSTLPHLQEVYMDNNQFHGHIPASVANASNISMLTFGVNSFSGVVPEEIGRLRNLGTLVLAETLLEAEGPNDWKFMTALTNCSNLQHVEMGACKFGGVLPDSVSNLSSSLVYLSIGANKISGSLPRDIGNLINLESLVLFNNSLTGSLPSSFSKLKNLHRLILFNNKLSGYLQLTIGNLTQITNLELYGNAFSGTIPSTLGNMTRLFELNLAHNNFIGAIPTEIFSIPTLSETLDVSHNKLEGSIPKEIGELKNIVEFHADSNKLSGEIPSTISGCQLLQHLSLQNNFLNGNIPIALTQLAGLDTLDLSGNNLSGQIPKSLGDMPLLHSLNLSFNSFQGEVPTNGVFANASEIYIQGNANICGGIPELRLPQCSLKSTKKKKHQILLIALTVCLVSTLAIFSLLYMLLTCHKRRKKEVPAMTSIQGHPMITYKQLVKATDGFSPANLLGSGSFGSVYKGELDSQHGESTSSVAVKVLKLETPKAVKSFTAECEALRNMRHRNLVKIVTICSSIDNKGNDFKAIVYDFMPNGSLEDWLHPETNCDQAEQRHLNLHQRVNILLDVACALDYLHCLGPESVVHCDIKSSNVLLDADMVAHVGDFGLARILVKESSLMQQSTSSMGFRGTIGYAAPVSGKRPTDTTFGPGLSLRQYVEPGLHGRLMDVVDRKLVLDSKSWVQTPDISPCKEINECLVSLLRLGLSCSQELPSSRMQTGDVISELHDIKESLSMASIIFLQCYLQQRSYLKVVMARAMMLLLFCSYALALVSAGSSSSSNATADELALLSFKSMLSSPSLGLMASWNSSSHFCSWTGVSCSRQQPEKVIALQMNSCGLSGCISPFLGNLSFLKTLDLGNNQLVGQIPSELGHLSKLRMLNLSTNLLRGSIPVEMRGCTKLMTLHLGNNQLQGEIPAEIGSSLKNLINLYLTRNLLSGEIPQSLAELPSLELLSLSHNKLSGEVPSALSNLTNLLNIRFSNNMLSGVIPSSLGMLPNLYELSLGFNNLSGPIPTSIWNISSLRALSVQGNMLSGTIPANAFETLPHLEELYMDHNHLHGKIPVSLGNSSNLSMIILGANLFNGIVPQEIGRLRKLEQLVLTQTLVGAKEQKDWEFITALANCSQLQVLVLGMCEFGGVLPNSLSSLSTSLKYLSLSYNNILGSIPKDIGNLFNLQVLDLAWNSFIGTLPSSLGRLKNLHYFNVYNNDLGGPIPSTIGNLTELITLYLMSNTFSGRLTNSLANLTKLTELDLSSNNFIGPIPSGLFNITTLSIALELSYNKFEGSIPQEIGNLVNLVKFNAESNKLSGEIPSTLGQCQNLQDLTLQNNMLNGNIPEQLSQLKSLQTLDFSRNNLSGEIPIFIENFTMLSYLNLSFNIFTGEVPTTGIFTNSTAISIQHNGRLCGGITTLHLPPCSSQLPKNKHKPVVIPIVISLVATLAVLSLLYILFAWHKKIQTEIPSTTSMRGHPLVSYSQLVKATDEFSIANLLGSGSFGSVYKGELVAQIGESPYYVAVKVLKLQTSGALKSFAAECNALRNLRHRNLVKIITACSSIDNSGNDFKAIVFDFMPNGSLEGWLHPDKDDQIDHKYLNLLERSMVLEIRYGILVLEMVTGKRPIDNKSIQGLSLREYVELGLHGKMMDVVDTQLFLGLENEFQTADDSSCKGRINCLVALLRLGLYCSQEMPSNRMLTGDIIKELTFICLLLVCLCSHSLALSPPPPPPSSPVSSNDATKATVDELALLSIKSMLSSPSSSPLASWNSTSSIHHCSWPGVVCSRRHPGRVAALRMASFNLSGAISPFLANLSFLRELDLAGNQLAGEIPPEIGRLGRLETVNLAANALQGTLPLSLGNCTNLMVLNLTSNQLQGEIPSTIGARMVNLYILDLRQNGFSGEIPLSLAELPSLEFLFLYSNKLSGEIPTALSNLSGLMHLDLDTNMLSGAIPSSLGKLSSLIWLNLANNNLSGTIPSSIWNISSSLWGLNIQQNNLVGVVPTDAFTALPELRTISMDNNRFHGRLPTSLVNVSHVRMLQLGFNFFSGTVPSELGMLKNLEQFLLFATLLEAKEPRDWEFITALTNCSRLKILELGASKFGGVLPDSLSNLSTSLQTLSLQYNTISGRIPKDIGNLIGLQSLTLDDNSFIGTLPSSLGRLQNLNLLSVPKNKISGSVPLAIGNLTKLSSLELQANAFSGEIPSTVANLTKLSALNLARNNFTGAIPRRLFNILSLSKILDISHNNLEGSIPQEIGNLINLEEFHAQSNILSGEIPPSLGECQLLQNVYLQNNFLNGTISSALGQLKGLESLDLSNNKLSGQIPRFLGNISMLSYLNLSFNNFSGEVPDFGVFANITAFLIQGNDKLCGGIPTLHLRPCSSGLPEKKHKFLVIFIVTISAVAILGILLLLYKYLNRRKKNNTKNSSETSMQAHRSISFSQLAKATEGFSATNLLGSGTFGSVYKGKIDGQTDESAEYIAVKVLKLQTPGAHKSFVAECEALKNLRHRNLVKVITACSSIDTRGYDFKAIVFDFMPNGSLEDWLHPKPVDQTEMKYLGLVQRVTILLDVAYALDYLHCRGPAPVVHCDIKSSNVLLDSDMVAHVGDFGLAKILAEGSSSLQHSTSSMGFRGTIGYAAPEYGAGNIVSTNGDIYSYGILVLETVTGKRPTDNRFRQGLSLREYVEQALHGETMDIVDSQLTLELENECALQDSSYKRKIDCLISLLRLGVSCSHELPLSRMRTTDIVNELHAMRESLLREYRIEDGSYVNVTLE |
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Function | Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R2D5] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsCMeo_11g0017770 | OsCMeo_11g0017770.02 | Chr11 | 20917099 | 20945520 | - | NAM | ||
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Protein seq | MARSLALLMLLFNSSLLLPPASSDDDAAAAAVPTGGAAADELALLSFRSSLVSQGGSSLASWNTTSGHGQHCTWAGVACGGRRDRVVELRLRSFNLSGTISPSLGNLSFLAKLHLGGNHLSGEIPPELGRLSRLRRLNMSGNSLQGSIPAAIGGCFRLIEMDLTINQLEGKIPLQIGASMKNLAYLYLEGNRLSGQIPRSLAELPSIQELSLGSNGLSGEIPPALGNLTGLSFLSLSENSLSGGIPSSLCNLTSLSSLYLNKNTLSGTIPSCLGNLNSLLELALSDNTLSGAIPSSLGRLSRLSSLHLSSNNLSGLIPDPIWNISSLTVFGVQYNMLSGMLPANAFSTLPHLQEVYMDNNQFHGHIPASVANASNISMLTFGVNSFSGVVPEEIGRLRNLGTLVLAETLLEAEGPNDWKFMTALTNCSNLQHVEMGACKFGGVLPDSVSNLSSSLVYLSIGANKISGSLPRDIGNLINLESLVLFNNSLTGSLPSSFSKLKNLHRLILFNNKLSGYLQLTIGNLTQITNLELYGNAFSGTIPSTLGNMTRLFELNLAHNNFIGAIPTEIFSIPTLSETLDVSHNKLEGSIPKEIGELKNIVEFHADSNKLSGEIPSTISGCQLLQHLSLQNNFLNGNIPIALTQLAGLDTLDLSGNNLSGQIPKSLGDMPLLHSLNLSFNSFQGEVPTNGVFANASEIYIQGNANICGGIPELRLPQCSLKSTKKKKHQILLIALTVCLVSTLAIFSLLYMLLTCHKRRKKEVPAMTSIQGHPMITYKQLVKATDGFSPANLLGSGSFGSVYKGELDSQHGESTSSVAVKVLKLETPKAVKSFTAECEALRNMRHRNLVKIVTICSSIDNKGNDFKAIVYDFMPNGSLEDWLHPETNCDQAEQRHLNLHQRVNILLDVACALDYLHCLGPESVVHCDIKSSNVLLDADMVAHVGDFGLARILVKESSLMQQSTSSMGFRGTIGYAAPVSGKRPTDTTFGPGLSLRQYVEPGLHGRLMDVVDRKLVLDSKSWVQTPDISPCKEINECLVSLLRLGLSCSQELPSSRMQTGDVISELHDIKESLSMASIIFLQCYLQQRSYLKVVMARAMMLLLFCSYALALVSAGSSSSSNATADELALLSFKSMLSSPSLGLMASWNSSSHFCSWTGVSCSRQQPEKVIALQMNSCGLSGCISPFLGNLSFLKTLDLGNNQLVGQIPSELGHLSKLRMLNLSTNLLRGSIPVEMRGCTKLMTLHLGNNQLQGEIPAEIGSSLKNLINLYLTRNLLSGEIPQSLAELPSLELLSLSHNKLSGEVPSALSNLTNLLNIRFSNNMLSGVIPSSLGMLPNLYELSLGFNNLSGPIPTSIWNISSLRALSVQGNMLSGTIPANAFETLPHLEELYMDHNHLHGKIPVSLGNSSNLSMIILGANLFNGIVPQEIGRLRKLEQLVLTQTLVGAKEQKDWEFITALANCSQLQVLVLGMCEFGGVLPNSLSSLSTSLKYLSLSYNNILGSIPKDIGNLFNLQVLDLAWNSFIGTLPSSLGRLKNLHYFNVYNNDLGGPIPSTIGNLTELITLYLMSNTFSGRLTNSLANLTKLTELDLSSNNFIGPIPSGLFNITTLSIALELSYNKFEGSIPQEIGNLVNLVKFNAESNKLSGEIPSTLGQCQNLQDLTLQNNMLNGNIPEQLSQLKSLQTLDFSRNNLSGEIPIFIENFTMLSYLNLSFNIFTGEVPTTGIFTNSTAISIQHNGRLCGGITTLHLPPCSSQLPKNKHKPVVIPIVISLVATLAVLSLLYILFAWHKKIQTEIPSTTSMRGHPLVSYSQLVKATDEFSIANLLGSGSFGSVYKGELVAQIGESPYYVAVKVLKLQTSGALKSFAAECNALRNLRHRNLVKIITACSSIDNSGNDFKAIVFDFMPNGSLEGWLHPDKDDQIDHKYLNLLERSMVLEIRYGILVLEMVTGKRPIDNKSIQGLSLREYVELGLHGKMMDVVDTQLFLGLENEFQTADDSSCKGRINCLVALLRLGLYCSQEMPSNRMLTGDIIKELTFICLLLVCLCSHSLALSPPPPPPSSPVSSNDATKATVDELALLSIKSMLSSPSSSPLASWNSTSSIHHCSWPGVVCSRRHPGRVAALRMASFNLSGAISPFLANLSFLRELDLAGNQLAGEIPPEIGRLGRLETVNLAANALQGTLPLSLGNCTNLMVLNLTSNQLQGEIPSTIGARMVNLYILDLRQNGFSGEIPLSLAELPSLEFLFLYSNKLSGEIPTALSNLSGLMHLDLDTNMLSGAIPSSLGKLSSLIWLNLANNNLSGTIPSSIWNISSSLWGLNIQQNNLVGVVPTDAFTALPELRTISMDNNRFHGRLPTSLVNVSHVRMLQLGFNFFSGTVPSELGMLKNLEQFLLFATLLEAKEPRDWEFITALTNCSRLKILELGASKFGGVLPDSLSNLSTSLQTLSLQYNTISGRIPKDIGNLIGLQSLTLDDNSFIGTLPSSLGRLQNLNLLSVPKNKISGSVPLAIGNLTKLSSLELQANAFSGEIPSTVANLTKLSALNLARNNFTGAIPRRLFNILSLSKILDISHNNLEGSIPQEIGNLINLEEFHAQSNILSGEIPPSLGECQLLQNVYLQNNFLNGTISSALGQLKGLESLDLSNNKLSGQIPRFLGNISMLSYLNLSFNNFSGEVPDFGVFANITAFLIQGNDKLCGGIPTLHLRPCSSGLPEKKHKFLVIFIVTISAVAILGILLLLYKYLNRRKKNNTKNSSETSMQAHRSISFSQLAKATEGFSATNLLGSGTFGSVYKGKIDGQTDESAEYIAVKVLKLQTPGAHKSFVAECEALKNLRHRNLVKVITACSSIDTRGYDFKAIVFDFMPNGSLEDWLHPKPVDQTEMKYLGLVQRVTILLDVAYALDYLHCRGPAPVVHCDIKSSNVLLDSDMVAHVGDFGLAKILAEGSSSLQHSTSSMGFRGTIGYAAPEYGAGNIVSTNGDIYSYGILVLETVTGKRPTDNRFRQGLSLREYVEQALHGETMDIVDSQLTLELENECALQDSSYKRKIDCLISLLRLGVSCSHELPLSRMRTTDIVNELHAMRESLLREYRIEDGSYVNVTLE
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsCMeo_11g0017770 | OsCMeo_11g0017770.04 | Chr11 | 20917075 | 20921782 | - | IsoSeq | ||
CDS seq | actcttgcagagatcgacacgcacgcatggcgagatcactcgcgttgctcatgctcctgttcaattcctcgctgctgctccctccggcgagcagcgacgacgacgccgctgctgccgccgttcccacgggcggcgccgccgccgacgagctcgcgctgctctccttcaggtcgtctcttgtgtcccaggggggctcgtcgctggcatcatggaacactacgtccggccacggccagcactgcacatgggcgggtgtcgcgtgcggcggccggcgggacagggtggtcgagctgcggctgcgatcgttcaacctgtccgggaccatctcgccgtcgctgggcaacctctccttcctcgctaagctgcacctcggcggcaaccacctctccggcgagataccgccggagctcggcc
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Protein seq | TLAEIDTHAWRDHSRCSCSCSIPRCCSLRRAATTTPLLPPFPRAAPPPTSSRCSPSGRLLCPRGARRWHHGTLRPATASTAHGRVSRAAAGGTGWSSCGCDRSTCPGPSRRRWATSPSSLSCTSAATTSPARYRRSSA |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
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A3 | Chr11 | 20944902 | 20945321 | - | OsCMeo_11g0017770.02 | OsCMeo_11g0017770.02,OsCMeo_11g0017770.01 | All |
A5 | Chr11 | 20917685 | 20921249 | - | OsCMeo_11g0017770.04 | OsCMeo_11g0017770.01,OsCMeo_11g0017770.02,OsCMeo_11g0017770.04 | All |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.164332 | 9.540369 | 4.595458 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0570000 | RBH | 1.042240 | 0.694925 | 1.137008 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g36160 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.170626 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0570000 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0017790 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.416277 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0017970 | RBH | 0.313666 | 0.0 | 0.250769 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0017730 | RBH | 0.0 | 0.732895 | 2.030220 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0017420 | RBH | 0.0 | 0.033064 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0017810 | RBH | 0.954121 | 0.0 | 1.531730 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0332100 | RBH | 0.2682155 | 5.703463 | 2.0130555 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0018330 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0336100 | RBH | 0.248729 | 0.0105775 | 0.059124 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024680 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0018160 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0017720 | RBH | 5.948813 | 12.354786 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0017510 | RBH | 0.125744 | 0.0 | 0.043038 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0017720 | RBH | 0.000000 | 1.564580 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G020520 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0018010 | RBH | 0.080130 | 5.532844 | 0.000000 |