Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLima_04g0016660 OGI:04072210 | 16/16 LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:25155757-25178706
Gene Symbol BGLU9, Os4bglu9, Os4BGlu9, BGLU10, Os4bglu10, Os4BGlu10, BGLU11, Os4bglu11, Os4BGlu11, BGLU12, Os4bglu12, Os4BGlu12, 4BGlu12, OsTAGG2, TAGG2
DNA seq

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Function Beta-glucosidase 11 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XKV5]

Transcripts

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OsLima_04g0016660 OsLima_04g0016660.04 Chr04 25155757 25169255 - NAM
CDS seq

atgaaggagatggggatggatgcatacagattctccatctcatggtcaagaattcttccaaatggaagtctgagcggtggagtcaacagagaaggcatcaactactacaacaatttgatcaatgagctattatcgaaaggggtgcaaccatttgttacccttttccactgggactcacctcaggcgttggaagataaatataaaggatttcttagccctaatatcataaatgactataaggaatacgctgaaacatgcttcaaagagtttggtgaccgggtgaaacattggatcaccttcaatgagccttggaccttctgctctatgggctatgcatctggcatcatggcaccaggccggtgttcatcctgggaggtgggaaaatgcagagttggagattcaggaagggagccttacactgcatgccatcaccaactacttgctcacgcagaaaccgttcggttgtacaaagagaaatatcagttcactgaaggaaatgtcaggcagttgcagttcatccgtgataataatttaaatcgaagatccgcaaagtttatggatcctctcattagaggagactacccactaagcatgagagaattggttggaaatcgcttgccagagttcagcaaagagcaatctggaatggtcaagggtgcattcgatttcattggactcaactactacacttcaagctatgctgataatgatcctccatcgcatggccataacaacagctataatactgattcacatgctaagattactgggatctgtgaaatgttgctttatgttaaggagaactatggcaatcctaccatctacatcactgaaaatggtgttgatgaagtcaataataagaccatgccgctcgaggaagccctgaaggatgataccaggatcgaatactatcacaagcaccttctcgccctgctaagtgctatgagggatggagcaaacgtgaaggggtactttgcatggtctctgcttgacaactttgagtgggcagagggctacacagttcggtttgggataaactttgtggattacgatgacggaatgaagagataccccaagaactcggcccgttggttcaagaagttcctccagaaatcaaacagagatggaaacaaaaggttgaaaagagtcatggcggttgcaggtgcaatggtgatgtcaggtggcgtgctccttctcctcttggctttcacctgcgccgcctacaatgacgccggcgagctgccggcgatcagccggagaagcttccccaaggggttcatctttgggacgtcctcgtcgtcatatcagtttgagggtgccgcggcgaagggtggcagaggaccaagcatctgggacaccttcacacatcatctcagcggtggagtcaacagagaaggcatcaactactacaacaatttgatcaatgaactattatcaaaagaggtccaaccatttgctaccctattccattttgatacacctcaggcactggaagataaatataaaggatttcttagccctaatatcataaatgactataaggactatgctgaaatatgcttcaaagagtttggtgaccgggtgaaacattggatcaccttcaatgagccttggaacttctgctctatgggctatgcatctggcaccatggcaccaggccggtgttcatcctgggagaagggaaaatgcagagttggagattcaggaagggagccttacactgcatgccatcaccaactacttgctcatgcagaaactgttcggctttataaagagaaatatcagttcactgaagaagctatcaggcagtcgccgttcatccgtgataataatttaaatcaaagatctgcaaagtttatggatcctctcattagaggagactacccactaagcatgagagaattggttggaaatcgcttgccagagttcagcaaagagcaatctgaaatggtcaagggtgcattcgattttattggactcaactactacgcttcaagctatgctgataatgatcctccatcatatggccataacaacagctataatactgattcccatgctaagattactggtagtcgaaacgggattcccatagggcctcaggctgcttcgttttggttttacatctaccctgaagggttgcgtgaattgttgcttcatattaaggaaaactatggcaatcctaccatctacatcactgaaaatggtgttgatgaaatcaataataagAccatgcgactcaaggaggccctgaaggatgatatcaggattgaaTActatcacaagcaccttctcgccctgctaagtgctatgagggatggagcaaacgtgaagggGtacttcgcatggtctctgcttgacaactttgagtggtcagagggctacacagttcggtttgggataaactttgtggattatgataacggaatgaagagataccccaagaactcagcccgttggttcaagaagttcctccggaaatga

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OsLima_04g0016660 OsLima_04g0016660.03 Chr04 25155757 25169255 - NAM
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
RI Chr04 25168014 25168218 - OsLima_04g0016660.04 OsLima_04g0016660.03,OsLima_04g0016660.04 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.757983 1.589064 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
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ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0017060 RBH 0.029187 0.036088 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0017310 RBH 2.662956 131.483566 73.363663
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0370300 RBH 34.2057305 25.1759225 6.9857765
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0016090 RBH 0.073161 0.292588 0.478872
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0368700 RBH 5.4672165 0.1049895 0.7460665
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0016670 RBH 0.129108 0.620274 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0016520 RBH 0.765130 123.291840 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0016530 RBH 0.754512 2.053615 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0017030 RBH 2.897782 18.298510 5.654611
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0017110 RBH 0.164023 5.571730 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G016340 RBH 0.170521 0.615946 1.179078
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0016370 RBH 6.220611 167.321060 29.707485
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