Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsLaMu_04g0017110 | OGI:04072210 | 16/16 | LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:24643374-24656808 | ||||||||
Gene Symbol | BGLU10, Os4bglu10, Os4BGlu10, BGLU11, Os4bglu11, Os4BGlu11 | ||||||||||
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Protein seq | MAVAGAMVMSGALLLLHLLAFTCVACNGGSELPPISRRSFPKGFIFGTSSSSYQFEGGAVLGGRGPSIWDTFTHQSPDKITDRSNGDVACDSYHLYKEDVRSMKEMGMDAYRFSISWSRILPNGSLSGGVNREGINYYNNLINELLSKGVQPFVTLFHWDSPQALEDKYKGFLSPNIMFMDPLIRGDYPLSMRELVGNRLPEFSKEQSGMVKGAFDFIGLNYYTSSYADNDPPSHGHNNSYNTDSHAKITGICEMLLYVKENYGNPTIYITENGVDEVNNKTMPLEEALKDDTRIEYYHKHLLALLSAMVMSGGVLLLLLAFTCAAYNDAGELPAISRRSFPKGFIFGTSSSSYQFEGAAAKGGRGPSIWDTFTHHGGVNREGINYYNNLINELLSKEVQPFATLFHFDTPQALEDKYKGFLSPNIINDYKDYAEICFKEFGDRVKHWITFNEPWNFCSMGYASGTMAPGRCSSWEKGKCRVGDSGREPYTACHHQLLAHAETVRLYKEKYQFTEEAIRQSPFIRDNNLNQRSAKFMDPLIRGDYPLSMRELVGNRLPEFSKEQSEMAASFWFYIYPEGLRELLLHIKENYGNPTIYITENGVDEINNKTMRLKEALKDDIRIEYYHKHLLALLSAMRDGANVKGYFAWSLLDNFEWSEGYTVRFGINFVDYDNGMKRYPKNSARWFKKFLRK |
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Function | Beta-glucosidase 10 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7F9K4] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLaMu_04g0017110 | OsLaMu_04g0017110.02 | Chr04 | 24643374 | 24656808 | - | NAM | ||
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Protein seq | MAVAGAMVMSGALLLLHLLAFTCVACNGGSELPPISRRSFPKGFIFGTSSSSYQFEGGAVLGGRGPSIWDTFTHQSPDKITDRSNGDVACDSYHLYKEDVRSMKEMGMDAYRFSISWSRILPNGSLSGGVNREGINYYNNLINELLSKGVQPFVTLFHWDSPQALEDKYKGFLSPNIMFMDPLIRGDYPLSMRELVGNRLPEFSKEQSGMVKGAFDFIGLNYYTSSYADNDPPSHGHNNSYNTDSHAKITGICEMLLYVKENYGNPTIYITENGVDEVNNKTMPLEEALKDDTRIEYYHKHLLALLSAMVMSGGVLLLLLAFTCAAYNDAGELPAISRRSFPKGFIFGTSSSSYQFEGAAAKGGRGPSIWDTFTHHGGVNREGINYYNNLINELLSKEVQPFATLFHFDTPQALEDKYKGFLSPNIINDYKDYAEICFKEFGDRVKHWITFNEPWNFCSMGYASGTMAPGRCSSWEKGKCRVGDSGREPYTACHHQLLAHAETVRLYKEKYQFTEEAIRQSPFIRDNNLNQRSAKFMDPLIRGDYPLSMRELVGNRLPEFSKEQSEMAASFWFYIYPEGLRELLLHIKENYGNPTIYITENGVDEINNKTMRLKEALKDDIRIEYYHKHLLALLSAMRDGANVKGYFAWSLLDNFEWSEGYTVRFGINFVDYDNGMKRYPKNSARWFKKFLRK
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLaMu_04g0017110 | OsLaMu_04g0017110.04 | Chr04 | 24643374 | 24649011 | - | NAM | ||
CDS seq | ATGCTAAGATTACTGGCTGCTTCGTTTTGGTTTTACATCTACCCTGAAGGGTTGCGTGAATTGTTGCTTCATATTAAGGAAAACTATGGCAATCCTACCATCTACATCACTGAAAATGgtgttgatgaaatcaataataagaccatgcgactcaaggAGGccctgaaggatgatatcaggattgaatactatcacaagcaccttctcGccctgctaagtgctatgagggatggagcaaacgtgaagggGtacttcgcatggtctctgcttgacaactttgagtggtcagagggctacacagttcggtttgggataaacttTgtggattatgataacggaatgaagagataccccaagaactcagcccgttggttcaagaagttcctccggaaatga
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Protein seq | MLRLLAASFWFYIYPEGLRELLLHIKENYGNPTIYITENGVDEINNKTMRLKEALKDDIRIEYYHKHLLALLSAMRDGANVKGYFAWSLLDNFEWSEGYTVRFGINFVDYDNGMKRYPKNSARWFKKFLRK |
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLaMu_04g0017110 | OsLaMu_04g0017110.03 | Chr04 | 24643374 | 24656782 | - | NAM | ||
CDS seq | atggcggttgcaggggcaatggtgatgtcaggtgctcttctccttctccacctcttagcttttacctgcgtcgcctgcaatggcggcagcgagctgccgccgatcagccggaggagcttccccaaggggttcatttttgggacgtcctcgtcgtcatatcagttcgagggtggcgcagtgttgggtggcagaggaccaagcatctgggacaccttcacacatcagtctccaggcatgttaactacaaaAtcactgacagaagcaatggcgatgtggcttgcgacagctaccatctctacaagtatgaaggagatggggatggatgcatacagattctccatctcatggtcaagaAttcttccaaatggaagtctcagcggtggagtcaacagagaaggcatcaactactacaacaatttgatcaatgaactattatcaaaagaggtccaaccatttgctaccctattccattttgatacacctcaggcactggaagataaatataaAggatttcttagccctaatatcataaatgactataaggactatgctgaaatatgcttcaaagagtttggtgaccgggtgaaacattggatcaccttcaatgagccttggaacttctgctctatgggctatgcatctggcaccatggcaccaggccggtgttcatcctgggagaagggaaaatgcagagttggagattcaggaagggagccttacactgcatgccatcaccaactacttgctcatgcagaaactgttcggctttataaagagaaatatcagttcactgaagaagctatcaggcagtcgccgttCatccgtgataataatttaaatcaaagatctgcaaaGtttatggatcctctcattagaggagactacccactaagcatgagagaattggttggaaatcgcttgccagagttcagcaaagagcaatctgaaatggtcaagggtgcattcgattttattggactcaactactacgcttcaagctatgctgataatgatcctccatcatatggccataacaAACAGCTATAA
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Protein seq | MAVAGAMVMSGALLLLHLLAFTCVACNGGSELPPISRRSFPKGFIFGTSSSSYQFEGGAVLGGRGPSIWDTFTHQSPGMLTTKSLTEAMAMWLATATISTSMKEMGMDAYRFSISWSRILPNGSLSGGVNREGINYYNNLINELLSKEVQPFATLFHFDTPQALEDKYKGFLSPNIINDYKDYAEICFKEFGDRVKHWITFNEPWNFCSMGYASGTMAPGRCSSWEKGKCRVGDSGREPYTACHHQLLAHAETVRLYKEKYQFTEEAIRQSPFIRDNNLNQRSAKFMDPLIRGDYPLSMRELVGNRLPEFSKEQSEMVKGAFDFIGLNYYASSYADNDPPSYGHNKQL
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLaMu_04g0017110 | OsLaMu_04g0017110.01 | Chr04 | 24643374 | 24656808 | - | NAM | ||
CDS seq | atgaaggagatggggatggatgcatacagattctccatctcatggtcaagaAttcttccaaatggaagtctgagcggtggagtcaacagagaaggcatcaactactacaacaatttgatcaatgagctattatcgaaaggggtgcaaccatttgttacccttttccactgggactcacctcaggcgttggaagataaatataaaggatttcttagccctaatatcatgtttatggatcctctcattagaggagactaccCactaagcatgagagaattggttggaaatcgcttgccagagttcagcaaagagcaatctggaatggtcaagggtgcattcgatttcattggactcaactactacacttcaagctatgctgataatgatcctccatcgcatggccataacaacagctataatactgattcacatgctaagattactgggatctgtgaaatgttgctttatgttaaggagaactatggcaatcctaccatctacatcactgaaaatggtgttgatgaagtcaataataagaccatgccgctcgaggaagccctgaaggatgataccaggatcgaatactatcacaagcaccttctcgccctgctaagtgcaatggtgatgtcaggtggcgtgctccttctcctcttggctttcacctgcgccgcctacaatgacgccggcgagctgccggcgatcagccggagaagcttccccaaggggttcatctttgggacgtcctcgtcgtcatatcagtttgagggtgccgcggcgaagggtggcagaggaccaagcatctgggacaccttcacacatcacggtggagtcaacagagaaggcatcaactactacaacaatttgatcaatgaactattatcaaaagaggtccaaccatttgctaccctattccattttgatacacctcaggcactggaagataaatataaAggatttcttagccctaatatcataaatgactataaggactatgctgaaatatgcttcaaagagtttggtgaccgggtgaaacattggatcaccttcaatgagccttggaacttctgctctatgggctatgcatctggcaccatggcaccaggccggtgttcatcctgggagaagggaaaatgcagagttggagattcaggaagggagccttacactgcatgccatcaccaactacttgctcatgcagaaactgttcggctttataaagagaaatatcagttcactgaagaagctatcaggcagtcgccgttCatccgtgataataatttaaatcaaagatctgcaaaGtttatggatcctctcattagaggagactacccactaagcatgagagaattggttggaaatcgcttgccagagttcagcaaagagcaatctgaaatgGCTGCTTCGTTTTGGTTTTACATCTACCCTGAAGGGTTGCGTGAATTGTTGCTTCATATTAAGGAAAACTATGGCAATCCTACCATCTACATCACTGAAAATGgtgttgatgaaatcaataataagaccatgcgactcaaggAGGccctgaaggatgatatcaggattgaatactatcacaagcaccttctcGccctgctaagtgctatgagggatggagcaaacgtgaagggGtacttcgcatggtctctgcttgacaactttgagtggtcagagggctacacagttcggtttgggataaacttTgtggattatgataacggaatgaagagataccccaagaactcagcccgttggttcaagaagttcctccggaaatga
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Protein seq | MKEMGMDAYRFSISWSRILPNGSLSGGVNREGINYYNNLINELLSKGVQPFVTLFHWDSPQALEDKYKGFLSPNIMFMDPLIRGDYPLSMRELVGNRLPEFSKEQSGMVKGAFDFIGLNYYTSSYADNDPPSHGHNNSYNTDSHAKITGICEMLLYVKENYGNPTIYITENGVDEVNNKTMPLEEALKDDTRIEYYHKHLLALLSAMVMSGGVLLLLLAFTCAAYNDAGELPAISRRSFPKGFIFGTSSSSYQFEGAAAKGGRGPSIWDTFTHHGGVNREGINYYNNLINELLSKEVQPFATLFHFDTPQALEDKYKGFLSPNIINDYKDYAEICFKEFGDRVKHWITFNEPWNFCSMGYASGTMAPGRCSSWEKGKCRVGDSGREPYTACHHQLLAHAETVRLYKEKYQFTEEAIRQSPFIRDNNLNQRSAKFMDPLIRGDYPLSMRELVGNRLPEFSKEQSEMAASFWFYIYPEGLRELLLHIKENYGNPTIYITENGVDEINNKTMRLKEALKDDIRIEYYHKHLLALLSAMRDGANVKGYFAWSLLDNFEWSEGYTVRFGINFVDYDNGMKRYPKNSARWFKKFLRK
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
A3 | Chr04 | 24655353 | 24655568 | - | OsLaMu_04g0017110.01,OsLaMu_04g0017110.02 | OsLaMu_04g0017110.01,OsLaMu_04g0017110.03,OsLaMu_04g0017110.02 | All |
RI | Chr04 | 24655568 | 24655772 | - | OsLaMu_04g0017110.01 | OsLaMu_04g0017110.01,OsLaMu_04g0017110.02 | All |
RI | Chr04 | 24655568 | 24655772 | - | OsLaMu_04g0017110.01 | OsLaMu_04g0017110.01,OsLaMu_04g0017110.03 | All |
SE | Chr04 | 24644338 | 24644921 | - | OsLaMu_04g0017110.03 | OsLaMu_04g0017110.04,OsLaMu_04g0017110.03 | All |
A5 | Chr04 | 24644338 | 24645043 | - | OsLaMu_04g0017110.04 | OsLaMu_04g0017110.04,OsLaMu_04g0017110.01,OsLaMu_04g0017110.02 | All |
A5 | Chr04 | 24655626 | 24655703 | - | OsLaMu_04g0017110.03 | OsLaMu_04g0017110.03,OsLaMu_04g0017110.02 | All |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.164023 | 5.571730 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0474500 | RBH | 0.241777 | 0.390373 | 2.659999 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g39840 | RBH | 0.026260 | 0.373745 | 0.516790 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0474500 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0016860 | RBH | 0.580800 | 1204.014648 | 17.229502 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0017620 | RBH | 0.108017 | 1.362518 | 1.417716 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0017350 | RBH | 0.403977 | 4.460511 | 4.238048 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0017060 | RBH | 0.029187 | 0.036088 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0017310 | RBH | 2.662956 | 131.483566 | 73.363663 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0370300 | SBH | 34.2057305 | 25.1759225 | 6.9857765 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0016090 | RBH | 0.073161 | 0.292588 | 0.478872 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0368600 | RBH | 12.3939305 | 2.955911 | 6.4453255 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0016660 | RBH | 0.757983 | 1.589064 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0016520 | RBH | 0.765130 | 123.291840 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0016530 | RBH | 0.754512 | 2.053615 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0017020 | RBH | 0.930369 | 0.861543 | 1.344414 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G016340 | RBH | 0.170521 | 0.615946 | 1.179078 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0016370 | RBH | 6.220611 | 167.321060 | 29.707485 |