Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLaMu_04g0017110 OGI:04072210 | 16/16 LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:24643374-24656808
Gene Symbol BGLU10, Os4bglu10, Os4BGlu10, BGLU11, Os4bglu11, Os4BGlu11
DNA seq

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Function Beta-glucosidase 10 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7F9K4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLaMu_04g0017110 OsLaMu_04g0017110.04 Chr04 24643374 24649011 - NAM
CDS seq

ATGCTAAGATTACTGGCTGCTTCGTTTTGGTTTTACATCTACCCTGAAGGGTTGCGTGAATTGTTGCTTCATATTAAGGAAAACTATGGCAATCCTACCATCTACATCACTGAAAATGgtgttgatgaaatcaataataagaccatgcgactcaaggAGGccctgaaggatgatatcaggattgaatactatcacaagcaccttctcGccctgctaagtgctatgagggatggagcaaacgtgaagggGtacttcgcatggtctctgcttgacaactttgagtggtcagagggctacacagttcggtttgggataaacttTgtggattatgataacggaatgaagagataccccaagaactcagcccgttggttcaagaagttcctccggaaatga

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLaMu_04g0017110 OsLaMu_04g0017110.03 Chr04 24643374 24656782 - NAM
CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLaMu_04g0017110 OsLaMu_04g0017110.01 Chr04 24643374 24656808 - NAM
CDS seq

atgaaggagatggggatggatgcatacagattctccatctcatggtcaagaAttcttccaaatggaagtctgagcggtggagtcaacagagaaggcatcaactactacaacaatttgatcaatgagctattatcgaaaggggtgcaaccatttgttacccttttccactgggactcacctcaggcgttggaagataaatataaaggatttcttagccctaatatcatgtttatggatcctctcattagaggagactaccCactaagcatgagagaattggttggaaatcgcttgccagagttcagcaaagagcaatctggaatggtcaagggtgcattcgatttcattggactcaactactacacttcaagctatgctgataatgatcctccatcgcatggccataacaacagctataatactgattcacatgctaagattactgggatctgtgaaatgttgctttatgttaaggagaactatggcaatcctaccatctacatcactgaaaatggtgttgatgaagtcaataataagaccatgccgctcgaggaagccctgaaggatgataccaggatcgaatactatcacaagcaccttctcgccctgctaagtgcaatggtgatgtcaggtggcgtgctccttctcctcttggctttcacctgcgccgcctacaatgacgccggcgagctgccggcgatcagccggagaagcttccccaaggggttcatctttgggacgtcctcgtcgtcatatcagtttgagggtgccgcggcgaagggtggcagaggaccaagcatctgggacaccttcacacatcacggtggagtcaacagagaaggcatcaactactacaacaatttgatcaatgaactattatcaaaagaggtccaaccatttgctaccctattccattttgatacacctcaggcactggaagataaatataaAggatttcttagccctaatatcataaatgactataaggactatgctgaaatatgcttcaaagagtttggtgaccgggtgaaacattggatcaccttcaatgagccttggaacttctgctctatgggctatgcatctggcaccatggcaccaggccggtgttcatcctgggagaagggaaaatgcagagttggagattcaggaagggagccttacactgcatgccatcaccaactacttgctcatgcagaaactgttcggctttataaagagaaatatcagttcactgaagaagctatcaggcagtcgccgttCatccgtgataataatttaaatcaaagatctgcaaaGtttatggatcctctcattagaggagactacccactaagcatgagagaattggttggaaatcgcttgccagagttcagcaaagagcaatctgaaatgGCTGCTTCGTTTTGGTTTTACATCTACCCTGAAGGGTTGCGTGAATTGTTGCTTCATATTAAGGAAAACTATGGCAATCCTACCATCTACATCACTGAAAATGgtgttgatgaaatcaataataagaccatgcgactcaaggAGGccctgaaggatgatatcaggattgaatactatcacaagcaccttctcGccctgctaagtgctatgagggatggagcaaacgtgaagggGtacttcgcatggtctctgcttgacaactttgagtggtcagagggctacacagttcggtttgggataaacttTgtggattatgataacggaatgaagagataccccaagaactcagcccgttggttcaagaagttcctccggaaatga

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MKEMGMDAYRFSISWSRILPNGSLSGGVNREGINYYNNLINELLSKGVQPFVTLFHWDSPQALEDKYKGFLSPNIMFMDPLIRGDYPLSMRELVGNRLPEFSKEQSGMVKGAFDFIGLNYYTSSYADNDPPSHGHNNSYNTDSHAKITGICEMLLYVKENYGNPTIYITENGVDEVNNKTMPLEEALKDDTRIEYYHKHLLALLSAMVMSGGVLLLLLAFTCAAYNDAGELPAISRRSFPKGFIFGTSSSSYQFEGAAAKGGRGPSIWDTFTHHGGVNREGINYYNNLINELLSKEVQPFATLFHFDTPQALEDKYKGFLSPNIINDYKDYAEICFKEFGDRVKHWITFNEPWNFCSMGYASGTMAPGRCSSWEKGKCRVGDSGREPYTACHHQLLAHAETVRLYKEKYQFTEEAIRQSPFIRDNNLNQRSAKFMDPLIRGDYPLSMRELVGNRLPEFSKEQSEMAASFWFYIYPEGLRELLLHIKENYGNPTIYITENGVDEINNKTMRLKEALKDDIRIEYYHKHLLALLSAMRDGANVKGYFAWSLLDNFEWSEGYTVRFGINFVDYDNGMKRYPKNSARWFKKFLRK

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr04 24655353 24655568 - OsLaMu_04g0017110.01,OsLaMu_04g0017110.02 OsLaMu_04g0017110.01,OsLaMu_04g0017110.03,OsLaMu_04g0017110.02 All
RI Chr04 24655568 24655772 - OsLaMu_04g0017110.01 OsLaMu_04g0017110.01,OsLaMu_04g0017110.02 All
RI Chr04 24655568 24655772 - OsLaMu_04g0017110.01 OsLaMu_04g0017110.01,OsLaMu_04g0017110.03 All
SE Chr04 24644338 24644921 - OsLaMu_04g0017110.03 OsLaMu_04g0017110.04,OsLaMu_04g0017110.03 All
A5 Chr04 24644338 24645043 - OsLaMu_04g0017110.04 OsLaMu_04g0017110.04,OsLaMu_04g0017110.01,OsLaMu_04g0017110.02 All
A5 Chr04 24655626 24655703 - OsLaMu_04g0017110.03 OsLaMu_04g0017110.03,OsLaMu_04g0017110.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.164023 5.571730 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0474500 RBH 0.241777 0.390373 2.659999
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g39840 RBH 0.026260 0.373745 0.516790
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0474500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0016860 RBH 0.580800 1204.014648 17.229502
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0017620 RBH 0.108017 1.362518 1.417716
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0017350 RBH 0.403977 4.460511 4.238048
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0017060 RBH 0.029187 0.036088 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0017310 RBH 2.662956 131.483566 73.363663
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0370300 SBH 34.2057305 25.1759225 6.9857765
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0016090 RBH 0.073161 0.292588 0.478872
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0368600 RBH 12.3939305 2.955911 6.4453255
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0016660 RBH 0.757983 1.589064 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0016520 RBH 0.765130 123.291840 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0016530 RBH 0.754512 2.053615 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0017020 RBH 0.930369 0.861543 1.344414
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G016340 RBH 0.170521 0.615946 1.179078
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0016370 RBH 6.220611 167.321060 29.707485
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