Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLima_02g0008750 | OGI:02001240 | 16/16 | LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:6482148-6491433 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK59, OsRLCK59, RLCK65, OsRLCK65, LP2, OsLP2 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MIRLFASFPKLIPLLAVFIFSCSLPIAISDDTDTDRGALLCFKSQISDPNGALRSWSNTSLDFCNWQGVSCNNTQTQIRVMGLNISSKGLSGSIPPCIGNLSSIASLNLSNNAFLGKIPAELGHLGQISYLNLSINSLEGHIPDELSLCSKLKVLSLCNNSLQGEIPPSLTQCTHLQQVVLCNNKLQGRIPTKFGMLHELKTLDLSNNALTGDIPPLLGSSPSFVYVDLGGNQLTGGIPEFLANSSSLQVLSLKQNNLTGGIPLALFNSSTLTTIYLNRNNLVGSIPPVTAIAAPLQFLSLALNKLRGGIPSSLGNLSSLVRLSLAVNNLVGSIPGSLSELRKLERLILTYNNLSGPVPQSIFNMSSLQYLEMANNSLISQLPPDIGNRLPNLQSLILSMTHLSGPIPASLANMSKLEMIYLVATGLTGVVPSFGLLPNLRDLDLAYNHLEAGDWSFLSSLANCTQLKKLCLDGNSLEGSLPSSVGNLAPQLEWLWLKQNKIYGTIPSEIGNLRSLTILYMDNNLFSGHIPPSIGNLSNLQVLSFALNDLFGQIPDSIGNLAQLIEFHIDGNNFSGSIPSSLWHWKHLEKLDISDNSFFGYIPPAVGNLSSIRDLIFARNNFFGHIPSTVGNLSNLSILSFAQISLDIFQTKASHSTNSKMIRLFAPCPKLIPLLAIFIISCSLPLAISDDTDTDREALLCFKSQISDPNGALSSWTNTSQNFCNWQGVSCNNTQTQLRVMALNVSSKGLGGSIPPCIGNLSSIASLDLSSNAFLGKIPSELGRLGQISYLNLSINSLEGRIPDELSSCSNLQVLGLWNNSLQGEIPPSLTQCTHLQQVILYNNKLEGRIPTGFGTLRELKTLDLSNNALTGDIPPLLGSSPSFVYVDLGGNQLTGRIPEFLANSSSLQVLRLMQNSLTGEIPAALFNSSTLTTIYLNRNNLAGSIPPVTAIAAPIQFLSLTQNKLTGGIPPTLGNLSSLVRLSLAANNLVGSIPESLSKIPALERLILTYNNLSGPVPESIFNISSLRYLEMANNSLIGRLPQDIGNRLPNLQSLILSTIQLNGPIPASLANMTKLEMIYLVATGLTGVVPSFGLLPNLRYLDLAYNHLEAGDWSFLSSLANCTQLKKLLLDGNGLKGSLPSSVGNLAPQLDWLWLKQNKLSGTIPAEIGNLKSLTILYMDDNMFSGSIPQTIGNLTNLLVLSFAKNNLSGRIPDSIGNLSQLNEFYLDRNNLNGSIPANIGQWRQLEKLNLSHNSFSGSMPSEVFKISSLSQNLDLSHNLFTGPILPEIGNLINLGSISIANNRLTGDIPSTLGKCVLLEYLHMEGNLLTGSIPQSFMNLKSIKELDLSRNRLSGKVPEFLTLFSSLQKLNLSFNDFEGTIPSNGVFGNASRVILDGNYRLCANAPGYSLPLCPESGLQIKSKSTVLKIVIPIVVSAVVISLLCLTIVLMKRRKEEPNQQHSSVNLRKISYEDIAKATDGFSATNLVGLGSFGAVYKGLLAFEDNPVAIKVFNLNKYGAPTSFNAECEALRYIRHRNLVKIITLCSTVDPNGYDFKALVFQYMPNGSLEMWLHPEDHGHGKQRFLTLGERINVALDIAYALDYLHNQCVSPLIHCDMKPSNVLLDLEMTAYVSDFGLARFMCANSTEAPGNSTSLADLKGSIGYIAPEYGMGAQISTKGDVYSYGVLLLEILTGKRPTDEKFKDGRSLHELVDTAFPHRVTEILDPNMLHNDLDGGNFEMMQSCVLPLVKLALMCSMASPKDRLGMAQVSTEIHSIKQEFLDLSSGGKIV |
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLima_02g0008750 | OsLima_02g0008750.01 | Chr02 | 6482148 | 6491433 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MIRLFASFPKLIPLLAVFIFSCSLPIAISDDTDTDRGALLCFKSQISDPNGALRSWSNTSLDFCNWQGVSCNNTQTQIRVMGLNISSKGLSGSIPPCIGNLSSIASLNLSNNAFLGKIPAELGHLGQISYLNLSINSLEGHIPDELSLCSKLKVLSLCNNSLQGEIPPSLTQCTHLQQVVLCNNKLQGRIPTKFGMLHELKTLDLSNNALTGDIPPLLGSSPSFVYVDLGGNQLTGGIPEFLANSSSLQVLSLKQNNLTGGIPLALFNSSTLTTIYLNRNNLVGSIPPVTAIAAPLQFLSLALNKLRGGIPSSLGNLSSLVRLSLAVNNLVGSIPGSLSELRKLERLILTYNNLSGPVPQSIFNMSSLQYLEMANNSLISQLPPDIGNRLPNLQSLILSMTHLSGPIPASLANMSKLEMIYLVATGLTGVVPSFGLLPNLRDLDLAYNHLEAGDWSFLSSLANCTQLKKLCLDGNSLEGSLPSSVGNLAPQLEWLWLKQNKIYGTIPSEIGNLRSLTILYMDNNLFSGHIPPSIGNLSNLQVLSFALNDLFGQIPDSIGNLAQLIEFHIDGNNFSGSIPSSLWHWKHLEKLDISDNSFFGYIPPAVGNLSSIRDLIFARNNFFGHIPSTVGNLSNLSILSFAQISLDIFQTKASHSTNSKMIRLFAPCPKLIPLLAIFIISCSLPLAISDDTDTDREALLCFKSQISDPNGALSSWTNTSQNFCNWQGVSCNNTQTQLRVMALNVSSKGLGGSIPPCIGNLSSIASLDLSSNAFLGKIPSELGRLGQISYLNLSINSLEGRIPDELSSCSNLQVLGLWNNSLQGEIPPSLTQCTHLQQVILYNNKLEGRIPTGFGTLRELKTLDLSNNALTGDIPPLLGSSPSFVYVDLGGNQLTGRIPEFLANSSSLQVLRLMQNSLTGEIPAALFNSSTLTTIYLNRNNLAGSIPPVTAIAAPIQFLSLTQNKLTGGIPPTLGNLSSLVRLSLAANNLVGSIPESLSKIPALERLILTYNNLSGPVPESIFNISSLRYLEMANNSLIGRLPQDIGNRLPNLQSLILSTIQLNGPIPASLANMTKLEMIYLVATGLTGVVPSFGLLPNLRYLDLAYNHLEAGDWSFLSSLANCTQLKKLLLDGNGLKGSLPSSVGNLAPQLDWLWLKQNKLSGTIPAEIGNLKSLTILYMDDNMFSGSIPQTIGNLTNLLVLSFAKNNLSGRIPDSIGNLSQLNEFYLDRNNLNGSIPANIGQWRQLEKLNLSHNSFSGSMPSEVFKISSLSQNLDLSHNLFTGPILPEIGNLINLGSISIANNRLTGDIPSTLGKCVLLEYLHMEGNLLTGSIPQSFMNLKSIKELDLSRNRLSGKVPEFLTLFSSLQKLNLSFNDFEGTIPSNGVFGNASRVILDGNYRLCANAPGYSLPLCPESGLQIKSKSTVLKIVIPIVVSAVVISLLCLTIVLMKRRKEEPNQQHSSVNLRKISYEDIAKATDGFSATNLVGLGSFGAVYKGLLAFEDNPVAIKVFNLNKYGAPTSFNAECEALRYIRHRNLVKIITLCSTVDPNGYDFKALVFQYMPNGSLEMWLHPEDHGHGKQRFLTLGERINVALDIAYALDYLHNQCVSPLIHCDMKPSNVLLDLEMTAYVSDFGLARFMCANSTEAPGNSTSLADLKGSIGYIAPEYGMGAQISTKGDVYSYGVLLLEILTGKRPTDEKFKDGRSLHELVDTAFPHRVTEILDPNMLHNDLDGGNFEMMQSCVLPLVKLALMCSMASPKDRLGMAQVSTEIHSIKQEFLDLSSGGKIV
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.030803 | 0.0 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0211900 | RBH | 0.359565 | 0.246918 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g12040 | RBH | 0.243156 | 0.166073 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0211900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0000650 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.798324 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0008570 | RBH | 0.094195 | 0.633336 | 0.140919 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0008360 | RBH | 0.247614 | 1.312991 | 1.301980 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0000660 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0008390 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 1.090552 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0007000 | RBH | 0.0946105 | 0.2399255 | 0.2444645 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0008280 | RBH | 0.000000 | 0.082765 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0109200 | SBH | 0.037638 | 1.008661 | 0.1829405 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0000660 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0008410 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0008630 | RBH | 0.762375 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0008670 | RBH | 0.0 | 0.064783 | 0.135457 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0008440 | RBH | 0.0 | 0.901031 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G008600 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0024870 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
