Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLiXu_Ung0050880 | OGI:99050740 | 1/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | ChrUN-Ctg389:123004-130675 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK268, OsRLCK268 | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | Putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g19210 [UniProtKB/Swiss-Prot:O65924] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_Ung0050880 | OsLiXu_Ung0050880.01 | ChrUN-Ctg389 | 123004 | 130675 | - | NAM | ||
| CDS seq | atgcatgggaactacgacggcaagggccatgatctagtcaggtcgccactggcttttgatgtgcatatgggccttcatttttgggaccggatcagtgttgatgaaacagctaagacttacagcacggaggtgatcgttgtcgctaaggtgaactcgataccagtttgcttgatggacattggcagtgggactcccttcatatcatcactggagatgagaccgattaagacttcactgtatccagccgccatggacaaccaatccattgcacttcaggaacgaagtagcatgggtgcaagcactctactgaggtatccagatgattcctatgatcgattgtggtggccatggcaaggtagctcaggtgtgcttaatgtattcacaactgggacaatcaaacgttacccgaatgacaaatttgaggttccagatagagtcctccaaaccgccgttacctcaccttccacctttatccctctcaacatctcatggactgttcctgccagctggccggccacgacggccgttcctgggtactatctcaatctccactacactgatttccagatgcagcagaagcgtgagtatgatatatacttcaatggccgtgtatgggagaaaaacaacgagtctgtccacccaggctatctcttcgcacaatatacgtatgccacttcctatgctacaatcactaacaatggcttctacaacgtcagtctggtcgctaccaacatctctaagctgcctccaatgctctgtgcctacgagatatattacctcattcaacaagatggtgaaacaacatctccagaagatgttaatgctatgatgactatcaaaactgagtatcaagttaagaagaactggatgggtgatccatgtctaccagaaaaccataaatggacaggcttaacatgtcaaagtgatggagtcacatcaacagtaacatctctgtatgacatcacgaatggagatccatgcaatggaaaatcaccaaagaagaaaaacactgttgtcctatttattgccatattggtcccagtgctgatggtggtacttctagttcctactttgctggtgttttatttctgcagaaaacgagatatgctacttggacgcactgaagttccagattctagaagtaaagaagactataaagatcacatacacatatctgatggtcgtgaattcacatacaaggagctggtggcaataacaaataatttctcagtgtgcataggtgaaggaggatttgggcctgtcttccatggctgcctaaaagaaggtactcaggttgctgtcaagatgcattctccaatgtcagcaattgggaaaggaacgtcggagtttttcgctgaggttgagagcttaacaactgtgcaccataggcatcttgtttttcttgttggttactgcactaataagaatcatttagctcttatttacgagtacatgccaaatggaagtctttacgatcatgcaaaaaagcaattgttcagacattgcgatggcatgatcgagcatgaattggacttgaagccgcacaagtcacacaacattcttcttgggcatgacatggttgccaaaatatccgattttggattgtccaaatcttgtcttaatgctgcacaaagccacatatctgtcacagctgctggaactctaggctacattgatccagagtactgtcttagtggccgactcactgtaagtagtgatgtcttcagctttggagtggttttgctagagattgtaacaggtgaacctccgattataccgagcaccgtccacattgtgcaacgtgtgaaggagaaggctgttatgggcaatatcgaggcaattgttgatccacgatttggtgctgagtacgatcccagttcaatatggaaggtcgtggacatagcactgctgtgcacaaaggaagcatctcatgaaaggccaacaatgagtacagtggtggcacagctcaaggatgccttagcattggaagaagctcgtgcaagcagtagcataagtgacattagccaaggaggtgccaattttgagctgtcgattaactctctaccatcatcaagatga
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| Protein seq | MHGNYDGKGHDLVRSPLAFDVHMGLHFWDRISVDETAKTYSTEVIVVAKVNSIPVCLMDIGSGTPFISSLEMRPIKTSLYPAAMDNQSIALQERSSMGASTLLRYPDDSYDRLWWPWQGSSGVLNVFTTGTIKRYPNDKFEVPDRVLQTAVTSPSTFIPLNISWTVPASWPATTAVPGYYLNLHYTDFQMQQKREYDIYFNGRVWEKNNESVHPGYLFAQYTYATSYATITNNGFYNVSLVATNISKLPPMLCAYEIYYLIQQDGETTSPEDVNAMMTIKTEYQVKKNWMGDPCLPENHKWTGLTCQSDGVTSTVTSLYDITNGDPCNGKSPKKKNTVVLFIAILVPVLMVVLLVPTLLVFYFCRKRDMLLGRTEVPDSRSKEDYKDHIHISDGREFTYKELVAITNNFSVCIGEGGFGPVFHGCLKEGTQVAVKMHSPMSAIGKGTSEFFAEVESLTTVHHRHLVFLVGYCTNKNHLALIYEYMPNGSLYDHAKKQLFRHCDGMIEHELDLKPHKSHNILLGHDMVAKISDFGLSKSCLNAAQSHISVTAAGTLGYIDPEYCLSGRLTVSSDVFSFGVVLLEIVTGEPPIIPSTVHIVQRVKEKAVMGNIEAIVDPRFGAEYDPSSIWKVVDIALLCTKEASHERPTMSTVVAQLKDALALEEARASSSISDISQGGANFELSINSLPSSR
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0361100 | SBH | 2.755226 | 2.592065 | 6.849056 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g19160 | SBH | 1.045942 | 1.082684 | 0.263534 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0361100 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0007100 | SBH | 0.360081 | 0.761381 | 0.485566 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0007100 | SBH | 0.021575 | 0.000000 | 0.095482 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0007260 | SBH | 0.469337 | 1.515820 | 3.716561 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0007230 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0007310 | SBH | 6.471702 | 2.985442 | 1.707986 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0198300 | SBH | 0.8216335 | 3.8622105 | 2.9796045 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_09g0007310 | SBH | 0.092096 | 0.000000 | 0.178028 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0176600 | SBH | 2.5580595 | 32.6664675 | 6.983884 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0007260 | SBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0007080 | SBH | 0.250459 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0007000 | SBH | 2.452066 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0006980 | SBH | 0.158854 | 0.0 | 0.309899 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0006990 | SBH | 0.096361 | 0.453330 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G007620 | SBH | 0.057655 | 0.738811 | 0.451217 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0007420 | SBH | 0.0 | 2.478537 | 0.366360 |
