Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsARC_09g0007230 | OGI:09034320 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr09:12458638-12464942 | ||||||||
Gene Symbol | D305, OsD305, RLCK268, OsRLCK268 | ||||||||||
DNA seq | TTACCATTTATACACTGCTCAAGTGGTACTCACTTCTACATCTTCACAGTTGAGGACTTCATAAGCATCGACTGCGGCCTTCCCAGTGGCTCTAGCTATGTGGATGAGAAGACGAATATCACATATATTTCAGATGATCAGTACATACACACAGGGGAAAACCACAAAATTTCTTCAGAACACCAAGGTGCCGAACAATTCAGATCGGGTTTAAATCTCAGAAGTTTTCCTACCGGAGGTAGAAATTGCTATACTCTTTATCCTGCCATAAAAGGTCAGAAGTATCTTATAAGAGGAATGTTCATGCATGGGAATTATGACAACAAAAGCCAGAATCTCGTTAGCTCACCACTGCTCTTCGATATCCGCATCGGACTGAACTTCTGGAACCAGGTCAACATTAGTAGTGCAACCATGACTTACACGTCTGAGGCTATAGTTCTTGCCACTGAAAATTCAGTATCAGTTTGCTTGCTTGATAATGGAAAAGGATCTCCTTTCATATCATCGTTAGAAATGAGGCCAATGAAGAGTTCAAATTATCCCGCAGTTACACCAAATCATCCTCTTTTGCTCCAGGATCGACGAAGCATGGGCAAGTAGCACAATTAGGTGATCCTTCTTTACCGACTAAAAATTTCTGCACACCCAATAATTTATATTATATTTCTACATAAACATCGTGTAATTTCTGTCAGCAGGTATCCGGATGATCCCTATGACCGTTTGTGGTGGCCATCACAGAATACATCTGAGTGGATAAATATTTCCACAACAAGCATGATCAGGCGCTACCCTGATGATGTATATGAGGTGCCAGCTGCAGTCCTGAAGACGGCTGCCACAACATCATCCAACTCTACCGCCCTGAATTTCTTGTGGCTGGCTCCGGCCAGCTGGGCTGCAGCACCTGGACACTTGCTTGGCTTACACTTCACTGACTTCCAGCAGGATCAGCTGCGAGAGTTCCACATATACTACAATGGTGAGTCCATTGTTCCTGATGGTAAGTCATACAGCCCACCTTACCTCCTCGCAAACTACTGGAATAGCAGCAGTCCAACTGTATCGGACAATGGCCAATCATACAAAATCTCCATCATCGCTACCAACGCATCTGTGCTGCCACCCATGCTCAACGCCATCGAAGTATACTACCAAGTCCAACAGGATGAAAAGATAACCTCCTCAGAAGATGGTATGCATGTGCCCTTGTTTTTGTTTGAATTGAAACCACTAGACTAGTTTCTAATCATTAGCAAGGCCATGCAGATTGTTGCAACTATAAACATACGAAATGTGCACAACTTGTGTATTAACTTAAACAATGAGCGGATACAAATACTCCCTCCTTTTCATATTTCTAAGTCATTTTATTTTTTTTTCTAGTCAAACTTCTGTAGGTTTGATCAAATTTATAGAAAAAATTAACGAAATCCATAAGACCAAATCAATTTAATTAAATGTAACATTGAATATATTTTGATAATATATATGTTTTCTGTTGGAAATGTTACTATATTTTTCTATAAACTCGGTCAAACTTAAAAAAGTTTGACTACGAAAAAAGTCAAAACAACTATGAAACAGAGGGAGTACATGTTTTTGCATCAAAGGATCATTTCCCTCATTCCCTCTTTTTGTTTAAGAAGTATTGCTTTTTTTCTCTTGCTGGACAGTTTTTTTAACATCAGTTTATCCATCGGTTGCTCTTTTGATTTTAACTACTATACCTTATTAAAGAGGAAAATAACAAAACTTAAAACTTCAAAAGATTTATGCATCATACATGAGCATGTCCTGTTTGGGATGGACGAACTGCAAAGAAAATGGTGCACATCAGTACATCACATATAGAACTCAGCAAAGATTAGTGCATTGCATATGAACACGCCATAAACCACATACTAATTCATTGCTTCCCTCTATCGATTTCCATATTTTGCTTAGTTGATGCTATGATGACTATAAAAATTGAGTACCAAGTGAAGAAGAATTGGATGGGTGACCCATGTTTACCAGAAAAGTATACATGGAATGGCTTGAAATGTAGAAGTCAAGGAGATACATCAAGAATTATATCCTTGTAAGTGCAGTGTTTGAGCGATTATGTCCTTTATGCACTTATTTATTAGATTGGTGGCTCTTTTATGTTAAGTACCCTAAATATTTGGCAGAGACTTGTCTGGTAGTGATTTGCAAGGCGCAATATCTGAAAAAATTTTCCATGCTCAGATCACTTGAATACTTGTGAGTATAGTCATCTACAAAACTATCCAGCAATGTTAAACATTATCGGAATTTCACAGTTTTCTATTTTCAGGAACTTGTCGCACAATGGTTTAACTGGATCAGTACCTGAGTCCTTGACAAACTTACCAAATATCCTTGTTTTGTACGTGTAAATGTGATCCTATCATTTCAGGGGAAAAAAACACTCAGATGTGCAGATCAATAAGACAATTCTTTGGTTAATGTTGTTTATGCAGAGATCTATCAGGAAACCATCTAAATGGTACATTCCCTGAAGGACTATGCAAAAATCGAGCACTCACATTGAGGTATCATGGTCTTTGATTTTTCTAGTTCATTATAACTACTGAAATCCTGGAAAATCAACATGTAATGTGAAATAACATTGGCCAAACTAATGCAACTTTTCTGCAAAAGAATCATAAACAGTAATGAACACACTTGTCATGATATGTAGGTCTATATCAGTTCAATGATGAATCATGTACTTGGACTGTTTTTCCATCAAAAGAACTATGTAATCTAACTGATCGGAAACCTTAGAAGAAATTACACTGTGTAATCTTTCAGGAGAAAAGGTAGACTAAAATGTTGGCACAATGCATAATAAAAAATTGTAGCAGTGCATATATGTGAAAATTTATTATTAAGAAAAGTATTTTTTTCTCATGTAGGTTTTTAATATTTAATTAGAAATCAATCTACAGAATAATACACACCAAATCAAGGTGTAGTTCTTTCCCATCTGGCCCTATTAATATGAGAGTTTTCCGATCTTAAGAATGAACTCATTGCCACAAATTTCAATAAACTGTTATTATCCATTGGATCAAACCAGACAGATATGTTTTTCTTGCTTTAAGGTACGACACTGCAAATGGAGATCCATGCAGTTCAAGATCATCGAAGAAGAAAAAGAAAACAGTCCTAGCAGTTGCCATAGTGGTTCCAGTGGTGATTGTATCTGCTATACTGATGTTTATTTTCTGCAAAAAGCAAAGTATGCATCTTCTCTGTAAATTCTTAAACATACATCTATATCAGTAACTGTATAATACTATCACCATTCGAAAATAGTTATTTTAGAAAGTTAGGACCTTTAGTGTTTATAATACAGTACTTGTTACCGTTTTGGTTAATGTGATTCGATTTGGATTTCATCTCTACCCGTACCCAACTTGATTGGGACTAAAGGCTGATTCTTTTGTGTCAAGATAGTATATCCCACTTTTCTGCGGGTTACTTCAACAATGTTACTTCTAGTCAGTACATGAGTTCCTAAACAATGCATATACTTCCCTACAGGCACAATGCAAATATATCTTTCCATGGAAAGATGTTCTTTTCTTTTATGAAACAGTGCATTCTGTTTCACGAAAATCCACCTTTTCACCTAGCATTTAACAATTGATCTTTAATGAGTTCAATCCATTGGCTTTGATTTTTAGTTGACATGGCATTATGAGGTTAGTCATCTTCAAAGAAAGTTTCAGTAAAGATGGATTTGTACAGGCAAATTATGTTAGGAACTAGGAATTATATCAGAAGCAATTCAGCAAATTGACCAGAACAGAGTAGACAAAAAAAAGGGACATTTTCAAAATTTTCCAATTATATAGAATACTTGATTTCTTAAGCTATTGCTGAGTGTTCTTATTATGGGTGCAGGCATTGTGAAGTCTAGAGGTCAAGAACATCGTGGAGATCATGTGCATATTCCAGACAACCGTGAGTTCACGTATGATGAGTTAGCGAAAATTACAAACAATTTCTCAACATTCATAGGTGAAGGAGGATTTGGGCCTGTTTTCCATGGCCAGTTAAAAGATGGCACTCAGTTAGCCATTAAGATGCGTTCTCCAACATCAACACCAGGGAAGGGAATGCCAGAATTTTTAGCTGAGGTACTAAATTTGATTGATGAAAATTTAAGACGGATTTCAACATTAGACTATTAGATGGTCTTGAACTTAAAAAAGTTTACCTTTTAAAAGATTCAATATAAAATAATATTGTTCTTGTACAATGCTATGTTGTCAAGTTTGTGTTCAGAAACATAGCATTCTGAAGGTATTGTCTTCCTCTTCCCTTCTGTAGGTTGAGAGCTTAACAACTGTGCACCACAGGTATCTGGTTTTATTGGTTGGATACTGCAATGACAAGGATCATTTAGCTCTTGTTTATGAGTATATGCCTAACGGGAGTCTTTATGATCATCTGAGAGGTATGTGACTATGCACACTGACGAACATTAAAATCCCATATTATACCTGTGCAAAGAAAACGAATTTCCTCTACTTGGTTATTAACTTATTATGTACCTCAAAGAGAACATTAGTCTTTATATGATTAATCATCTTGTTGTAAGCAAAAAAGGCCAAATGAATCAAGATGCAATTATTAATGCATTTCAAGCAATATAAAAAAGATTACATTGATTCCAAAAAAGAGCCTTTTAAAGTCCTTGAGAAAGTATTGTACTACCGTGAGATACCACTGTTCATAGTGTTAATTATGACATTTCTACATTAGGACTTAGGAAGGTAGCAGGAGGTAACAAAAATTGACAACATGAAGTGAGGCACCTTGTGTTACCTCGTTGAAATAAGGTGGAAGAGCTAGAGAGGAGTTGGACAGTGGGTCAGGAGTGTTGTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTTGGCTTGGTGAACCCTGCTTGAACATCAGTTTTTTATCCAAATGTGAATTATTTATTACTATCATTTC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||||||||||
Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g51880 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FZB1] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsARC_09g0007230 | OsARC_09g0007230.01 | Chr09 | 12458638 | 12464942 | + | NAM | ||
CDS seq | ATGATCAGGCGCTACCCTGATGATGTATATGAGGTGCCAGCTGCAGTCCTGAAGACGGCTGCCACAACATCATCCAACTCTACCGCCCTGAATTTCTTGTGGCTGGCTCCGGCCAGCTGGGCTGCAGCACCTGGACACTTGCTTGGCTTACACTTCACTGACTTCCAGCAGGATCAGCTGCGAGAGTTCCACATATACTACAATGGTGAGTCCATTGTTCCTGATGGTAAGTCATACAGCCCACCTTACCTCCTCGCAAACTACTGGAATAGCAGCAGTCCAACTGTATCGGACAATGGCCAATCATACAAAATCTCCATCATCGCTACCAACGCATCTGTGCTGCCACCCATGCTCAACGCCATCGAAGTATACTACCAAGTCCAACAGGATGAAAAGATAACCTCCTCAGAAGATGTTGATGCTATGATGACTATAAAAATTGAGTACCAAGTGAAGAAGAATTGGATGGGTGACCCATGTTTACCAGAAAAGTATACATGGAATGGCTTGAAATGTAGAAGTCAAGGAGATACATCAAGAATTATATCCTTGAACTTGTCGCACAATGGTTTAACTGGATCAGTACCTGAGTCCTTGACAAACTTACCAAATATCCTTGTTTTAGATCTATCAGGAAACCATCTAAATGGTACATTCCCTGAAGGACTATGCAAAAATCGAGCACTCACATTGAGGTATCATGGCATTGTGAAGTCTAGAGGTCAAGAACATCGTGGAGATCATGTGCATATTCCAGACAACCGTGAGTTCACGTATGATGAGTTAGCGAAAATTACAAACAATTTCTCAACATTCATAGGTGAAGGAGGATTTGGGCCTGTTTTCCATGGCCAGTTAAAAGATGGCACTCAGTTAGCCATTAAGATGCGTTCTCCAACATCAACACCAGGGAAGGGAATGCCAGAATTTTTAGCTGAGGTTGAGAGCTTAACAACTGTGCACCACAGGTATCTGGTTTTATTGGTTGGATACTGCAATGACAAGGATCATTTAGCTCTTGTTTATGAGTATATGCCTAACGGGAGTCTTTATGATCATCTGAGAGGAAAAAATGCTATTATTCAGAAATTAAGTTGGCAACATCGAGCACGAATTGCACTTGAAGCTGCTCAAGGTCTGGACTACTTGCACACAGGATGTGTGCTGCCTATAGTTCACAGAGATGTTAAGTCACACAACATTCTTCTAGGATGTGACCTGAATGCAAAGATATCTGATTTTGGACTGTCAAAGTCATACCTGCATGTTGCACAGAGTCACATAACAGCAACTGCTGCTGGCACTCCAGGCTACATCGACCCAGAGTACTGTCGTAGTGGAAGACTTACCGTTAGCAGTGATGTCTACAGCTTTGGAGTAGTTCTGCTAGAGATTGTAACAGGTGAGCCTCCCGTCATACCTACAACCGGACATATTGTGCAACGCATAAAGGAGACGGTTAATATGGGAAATATTGAAGCAATTGCTGATCCACGACTTCACGATGAGTTTGATGTTAGTTCAATTTGGAAGGTTGTTGACACAGCACTGATGTGTACAAAGGAGGCATCTAGTGAAAGGCCAACGATGAGTATGGTAGTAGCACAGCTTAAGGATGCATTAGCGTTGGAACAAGCCCGTTTAAGATACAGCATCAGTGACATTAGCCAAGGTGGTGCCAATGCTGAATTGTCATACTCCATGCCAACGCCAAGATAA
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Protein seq | MIRRYPDDVYEVPAAVLKTAATTSSNSTALNFLWLAPASWAAAPGHLLGLHFTDFQQDQLREFHIYYNGESIVPDGKSYSPPYLLANYWNSSSPTVSDNGQSYKISIIATNASVLPPMLNAIEVYYQVQQDEKITSSEDVDAMMTIKIEYQVKKNWMGDPCLPEKYTWNGLKCRSQGDTSRIISLNLSHNGLTGSVPESLTNLPNILVLDLSGNHLNGTFPEGLCKNRALTLRYHGIVKSRGQEHRGDHVHIPDNREFTYDELAKITNNFSTFIGEGGFGPVFHGQLKDGTQLAIKMRSPTSTPGKGMPEFLAEVESLTTVHHRYLVLLVGYCNDKDHLALVYEYMPNGSLYDHLRGKNAIIQKLSWQHRARIALEAAQGLDYLHTGCVLPIVHRDVKSHNILLGCDLNAKISDFGLSKSYLHVAQSHITATAAGTPGYIDPEYCRSGRLTVSSDVYSFGVVLLEIVTGEPPVIPTTGHIVQRIKETVNMGNIEAIADPRLHDEFDVSSIWKVVDTALMCTKEASSERPTMSMVVAQLKDALALEQARLRYSISDISQGGANAELSYSMPTPR
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.0 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0355400 | RBH | 8.814496 | 8.050460 | 5.618421 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g18594 | RBH | 5.897170 | 5.406943 | 1.445080 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0355400 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0007050 | RBH | 0.654087 | 0.0 | 3.215554 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0007050 | RBH | 0.884784 | 0.0 | 3.090161 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0007260 | SBH | 0.469337 | 1.515820 | 3.716561 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0007200 | RBH | 0.056733 | 0.000000 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0007310 | SBH | 6.471702 | 2.985442 | 1.707986 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0199300 | RBH | 0.4295035 | 1.904256 | 1.9694425 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_09g0007320 | RBH | 0.013650 | 0.238977 | 0.105249 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0179500 | SBH | 0.066574 | 0 | 0.014286 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0007260 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0007110 | RBH | 0.142830 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0007010 | RBH | 0.0 | 18.956060 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0007010 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0006990 | SBH | 0.096361 | 0.453330 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G007620 | RBH | 0.057655 | 0.738811 | 0.451217 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0007420 | RBH | 0.0 | 2.478537 | 0.366360 |