Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLiXu_Ung0025540 OGI:06005800 | 16/16 LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) ChrUN-Ctg208:23453-44088
Gene Symbol SEPK1, RLP1, OsRLP1
DNA seq

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Function Receptor-like protein EIX2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6JN46]

Transcripts

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

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CDS seq

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GTTGGCAAGCATATACACTCTGTCATTAATTAATTTGGACTATTGTGAGCTGCATGGCTCAATTCCTGAATCTGTGGGAAATTTAACTGCCCTTAATACCCTTTACTTGGCTGACAACAGTTTGATTGGAGCAATTCCAATATCTAAGTTGTGTAACTTGCAGATCCTTGATTTGTCGAACAACAACCTTATAGGTGATATTGCTGATTTGGGGAAGGCAATGACCCGCTGCATGAAGGGACTATCTATGATCAAATTGGGGAATAATAATCTATCTGGAAGTCTATCCGGGTGGATTGGATCCTTCCCAAACCTCTTCTCAGTCGATCTCAGCAAAAACTCACTATCAGGTCATGTACATACCAATATCAGTCAGCTCACAGAGTTAATTGAACTGGACCTTTCTCACAATTCACTCGAAGATGTCTTGTCTGAACAACACCTAACAAATCTAACTAAGCTAAAAAAGCTAGATTTATCTTACAATTCCTTGAGAATTTCTGTGGGAGCAAATTGGTTACCACCCTTTCAACTTTATGAACTCCTTTTAGGTTCTTCCCCACTACAATCACAAGTCCCGCAGTGGCTTCAAACACAAGTTGGAATGCAGACATTAGATTTGCACAGAACGGGGACTCTAGGTCAATTGCCTGATTGGCTTTGGACGTCATTGACCTCTCTCATTAACTTGGATCTCTCTGACAATCTGCTTACTGGCATGCTACCAGCATCCCTGGTTCATATGAAGTCACTGCAGTTCTTGGGGCTCAGCTCGAACCAATTGGAAGGTCAGATTCCTGATATGCCAGAAAGTCTAGACCTGCTAGATCTCTCCAACAACTCTTTATCTGGATCATTGCCCAATAGTGTGGGAGGGAACAAGACACGTTACATTTTATTGTCAAGCAATCGTCTAAATAGAAGCATACCTGCGTACTTTTGCAACATGCCATGGTTGTCAGCAATAGACCTATCAAACAACAGCTTATCAGGCGAGCTACCTAATTGTTGGAAGAACAGCACAGAACTATTTTTGGTGGATTTCTCGTACAACAACCTGGAAGGACACATACCTTCAAGTCTTGGCTCTCTTACTTTTCTTGGTTCCCTGCATTTGAACAACAATAGGCTATCTGGGTTGTTGCCTTCCTCTCTAAGTTCATGCGGGCTTCTGGTTTTCCTTGATATTGGAGATAATAATTTGGAGGGTTCCATACCTGAATGGATAGGAGATAACATGCAATACCTCATGATTCTTCGTTTGCGATCAAATCGTTTCACTGGAAGCATCCCGTCTGAATTGTCACAGCTTCAAGGTCTTCAAGTGTTGGATCTTGCCAATAACAAGCTGTCAGGGCCCCTGCCACAAGGTATTGGAAATTTTAGTGAAATGGCTTCACAGAGGTCAAGACATATTATACCGATGCAGATTTCTGGTGATAGTTTTGGTGGATCTCTCTATCACAATGAGAGTCTATACATTACCATCAAAGGAGAAGAAAGATTGTATTCTAAGATCCTTTATCTGATGAAGAGCATTGACCTTTCTAACAATTATCTAACAGGTGGAATTCCTGCTGAAGTTGGAGATCTTGTAGGGCTCAAAAACCTGAATCTCTCGAAAAATCTCCTGAGTGGTCATATTCCAGAGACAATTGGTAATATGAGTTCATTGGAGTCGCTTGATCTCTCATGGAACCGACTGTCAGGCATAATTCCTGAAAGCATGACATCACTGCACTTGTTGAGCCACCTGAACATGTCCTACAACAATCTGTCCGGGATGGTACCCCAGGGCTCTCAGCTTCAAACCCTTGGTGATGAAGATCCATACATCTATGCTGGCAACAAGTATCTCTGCATCCATCTTGCTTCTGGCAGCTGTTTTGAACAGAAAGATAACCATGTTGATCAAGCAGAGCATAATGATGTCCATGATATCTGGCTGTATATATTTTCAGGATTGGGCTTCGGAGTAGGATTTTCTTCTGTGTGGTGGCTTCTTGTGTGCAGCAAGGCAGTGGGCAAGAGGTATTTCCAGTTCGTCGACTCCACATGTGAGAAAGTTATTCACTGGATGATCCTACTGGAGAAGAAGGTGAATAAGAAAACAGTGGGAAAAAGTTCGGTATTGTGA

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLiXu_Ung0025540 OsLiXu_Ung0025540.04 ChrUN-Ctg208 27849 32919 - IsoSeq
CDS seq

ATCACGTCTCTCGTCTTCCTCTCCCCTTCACGCCGTGACCCAGCGATCGACCGGCCGGAATGGATGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGCGGTAGCGTCGCGGCGCGGAGCAGCCCGGCGTCCGTGCAGGCCACCAACGACGACGCCGCGGCCAGCAAGCTGTCATGTGTTAATAAAGGAT

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Protein seq

ITSLVFLSPSRRDPAIDRPEWMRRRRRRRREEEEGEAVASRRGAARRPCRPPTTTPRPASCHVLIKD

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A5 ChrUN-Ctg208 26433 26956 - OsLiXu_Ung0025540.03 OsLiXu_Ung0025540.01,OsLiXu_Ung0025540.03 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.078079 0.0 1.404008

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0140200 SBH 0.580184 0.255420 2.033834
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g04810 SBH 0.0 0.0 0.047292
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0140200 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0002920 SBH 0.0 1.599792 0.195260
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_06g0002850 SBH 0.0 0.330000 0.196129
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0002790 RBH 0.0 0.0 0.203172
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0002760 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0002770 RBH 0.322301 0.0 0.696281
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0033700 RBH 0.802195 3.5296575 5.3935725
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0002710 RBH 0.000000 0.058883 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0034000 SBH 1.7467815 3.0741775 6.6899185
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0002840 RBH 0.0 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0002710 RBH 0.0 0.543997 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0002730 RBH 0.0 2.317998 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_Ung0025390 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0002600 RBH 0.0 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G002660 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0002830 RBH 0.0 2.294092 0.0
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