Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsLiXu_Ung0001840 | OGI:01011200 | 6/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | ChrUN-Ctg35:4396-21112 | ||||||||
Gene Symbol | KEAP1, OsKEAP1 | ||||||||||
DNA seq | ACAAGTAATCTTACATACAGAGAACTTTTTTCCAAAACGGAAATCTGCTGTCTTGGGACCTTTTCTTGATGCGGATTCCCCATGTCACAACGATTATAACTGCAAAGCCGATGCCAACTCCAAGTCCAACAAAGAGGAACAGTATAACATCCACATGTTTTTCCTCTGAAGGATGTGAGCTTGGTGGTGTTGTCATGTTGCTGCATTCCTTGGACAATGGAAACCCACATAGACCAATGTTCCCCAGATAGGAGAGATTGTTCGAGAACTGGGGTGAATCTGGTATTCTCCCAACCAAACCGTTGTAGGACAGGTTCAGCACTGAGAGGAAGTGTAGCTGTGCTAACTCCTGTGGAATCTCCCCTGAAAGATCATTTGATGAGAGGTCCAATGACTCGAGTTCATGCAGAGCACCAAGCTGAGATGGAATTGGTCCTGTGAGGGCATTATGTGACATGTTTAGCCCACGGAGGAGAACGAGCTCTCCAATTGACTTGGGAATGCTACCATGGAGTGCATTGTCTGAAACATCGATGACTACAAGGGTCCTCAAGATTTTTGTAAATGTGACTTCATACCCTTTATATGCGATTGAAGTAGAAAACTGATATGTTGTACTATGCACGTTGTGCTGATATTGCATAAGCAATGTCGCACTAGAAGATGTCTCCATCATGGATTTTAACCTTTTCAACCACTTGTGATGTAGAGTACCAGAAAAGTTGTTTGAAGCCAAATCAAGAATCCGTAGATTTGCAAATTCGCAAGTGTTATCTTTTTCGATGGCAGAAGACCCCACCTCTCCGGTGAACTTGTTGGACTTCAGGACAAGAACCTGAAGTTTAGGAAGCATACTAGCCCAACATGGAAAACCACCGCTAATCTGATTATTTCCAATGTCTAAAACCTCCAAATCTCTGCAAGCAACTAGAGATGTAGGTAGTTGTCCTTCAAACATGTTCTCACTGAAATCTAATGCCTCTAATGCACATCCTTTCTTGATATTACGAGGTAACTCACCATGAAGTTGATTTGCTTTCAAGTTGAACACACTAAGGGAATTGATATCCTCCAGTAAACAAAGTGGAATCAAGCCACTTAAATTGTTGTAAGAAAGATCAAGGAGCAGAATGTCCCTTGCATCACAAATTGAGAGTGGAATTTCTCCAGATAGGTTGTTTCTGGAGGCCATGAGATAGGACATTCCACTAAGCTGGGAACTGAAGTTAAATGGCATGGATGAGAACCGGTTGTTTGAGCAATCGAGCAACCAAGTGTCAGGTCCAGTTATAGGTATGGGTCCTTGGAATAAGTTATAACTGAGATCAACAATCTCTAAGTAAAATGGAAGATAATTATATCCTATATTGTCGAATTTGTTGTGTGATAAGTTGAGGATAAACAACTCGCTCGAAGTTTCCCACGCCCACTGAGGTATAGTACCATGGATCTGATTTCCTGAAAGATCAAGATTTCCAACCCAAGGCATGAGACTCAAGGCACTAGGGAAATTGGATATGTTACAATATGCTAGGCGCAAGGTGTAGAAATAGTTTATGGACACCCATGAAGAATTATTTTTCTCACCATCTACAACTGATAGTTTGTTGTTGGAAAGATTCAAAGAAAATAGGTCTGGTAGTTTCCAAAATGAGCTGAGCTCCAACGTACCAATGAAGTTATTATATTGAAGATATATGACTCTCAATTGAGTTAGGTTAAATAGATCTTGAGGTATTTGGCCAGAAAAGTTACATTTGTATAACGCTAACCTCTTCAGATTCTTGATAGCACCTATCGCAGATGGTATCTTCCCAGATAAGCCACAGTTCGAGAAGTCGAGAAGGGTCAATGAAGTCAAATTTGCAATCCAAGATGGTACTGCTCCTACTACACCAGCCCCTGTAATCTCTAACGAATTCAACGATCTCAGCTGGCCAATAGAAGAGGGAAGCTCTTGGGAGAAGTCACTTGATGCAACACCCAAATTTTCCAAGGATTTGATGTTGCCTACTGAGTTAGGGATTGGACCAGAGAAGTTAGTACTGCTAACAAGAAGATCTACCAAAATGTCATTTGATGAGATATTTTTTGGCAACGAACCGGAGAGTTCGAAGTTGTACCTAACATCAACAGAGGTTAAGTTTTTGTTCTGGAAGATTCTACTTGGGAAGCTCCCTTCTAGACTGTTGTGTGTAAGACTAAGAACACTTAGGGAAGGTAAATCTCCAAAGGACTCTGGAATGGGACCGTGTATGAAGTTGTACTGTAGGTTAATCTCACTCAGTGAGCGTATACCCGACAATGATTCACAAATGGGAACCTCGAGGTAGCAATATGGTAAGCTAAGGACCTGAAGTTGAGGGGTAGTGGAGTTTGAAAAGGCACTGCACCAAATTGTTACGATTAGAAGAAGCACGCGGGACTGCGTGAGAGTGCCGTCGGCCACCTCGGCCGCGGCGGCCATCCCTGTGCCGGAGGCCATCCAACTTCAACCATGTCTCGCTTTGGGGCGCAATCTTGGAGCGAAGTGGTCCGCAAAGAGCCGACACGGACGGCACATCCCAAGCAGCTCGAGGACGCGGAGGGTCACTGGACTGAGGTCCGGCGCAAGGGCAGACAGCATTCATGGCGGTCCAGCGACCTCCAATTTTCCACCCACCAGCGGCCGGCATTGAAGGCGTCAAAACCCGTTCCTCGCTGGCTACAAGGGCGGTGTTTCAAGTGCCTAGGTCTAGGCCATCAGAAGACAACTTGCTTCAGGCAGACACGGTGCTACAACTGTTGGTTCACCGGCCATCTCGCTCGCAGCTGTCCGAGCAGCCATCCGGCCGAAAGGGAGCGCGACAAGGGGAAGGGAAGGGAGGAGCCAAAGCCTGCTGGCGGGGTGACTGTCAAGGCGGCGGCGAGGCCCCAGCAGGCGCGTGTGACGCTCCCTGCCGCTGCGGGGCGTCGGGTGATCCTCGCGCGCGCGGCGGGCGACGGACCGGCGAGGGAGGCGGCGGGTGCTGTCAGGAAGGCAGCGCCGGCGGAGGAGACGAGGTCGACGCCGACTGCATCGCAGGCCACTGCCGCGACCGCCGTGCACGCCGACCGCGACGCAGGACAACCTGCCGCGGTCACCGACATGGCTGGTTTCCAGATCTGCGTGCGGCAGCCTTCGTACCTCAGGAAGGAGTGTCGCACGGGGGATCCGGATCTGCGTCCCGGGAGAGGTCATTGCACGATCTCGTGGACGTCGAGGATGGTGGAGAACGAGACCATGCTGGAGAGGAAGGGCCTCCTCGCCTCGGTACTTGGCACACAACCGCACGTCTCCCCTCAGGAGATGGTCGAGGTGGTGGTGAACTGCGGCGTCCTCCCGTCCAACTTCCGTGTCGAGGTCACCACCCCAGAAGACTACCTCATCATGTTCCGCAACACTAGGGATCGTGACTGGGTGCTTAGCCGATCCAAGGAGGTCTTCTGCAAGGAGGCGGCCATCTCCTTCAAGCGATGGGATAGGCGGTTGCAGGCGGATAGCACCAAGATGCAATTCTTCACCAAGTTATCGCTGGAGGGGCTGCCACAGCACGCCTGGGAAGAGGAAGCGGTCGCTCAGATCGTGCGCGAGCTCAGGGGTGAGCTGGTGGAGATGGTCACGCCGGCGGACGCTAGGGTGCTCACGTTATTTGCGTGGCTCTCCAACCCTAGCATGGTGCCGTCGGTGCTGGAGGTGGAAATCCCAGAGTGGGCGGCCGGCGGGCCGCCGCGCTGGGAGAGGTTCCTAGGTCGCACTTCGATCCCCAGAGCGCCGCTCTACAAGAAATCCCTAACTTATGCGCTCATCATGCACATCGAGGAGATCATCGACCCCACGCCACTCCACTACACCTCCTACATGGGTTCCGATGATGATGACAACGGCGACGTGCCGCGGCGCGTGACCTTCTCCTGTTGGGCGGGTCGAACAGACGGCACAGGCCCCTGGTCGTCTGAACAAGGCGGCGGTCGTTCTTTCGGTGGTGCATCTGGGGCTGCGGGCGGACTTCCAGGGCGCGTCTGGTCCACGACGGATCGGATTGCCGCCAAACCGGCGGAGGCAGTGAGGGTAGACGAAGTCGTGGTGGCGGGGCTGGCGCAGGGGACGGGGATCGATGTTGGGGATGGTGGACTGGCGGCGGCGGACGCTGCGGCGAGCGACATTGCGACGAGAGACCCTGTGCAGATGAGGCCAGGTTCCCTGGAACTGACTGGTGGTGGTGGAGGGATCTGGTTCTCGCCACAGTTGTTGCCGCGGACGCAAGCGGACTCGCGGCTGGGAGACGAGTCCGTGCCGGCGACATGTCAAACTGCTGGAGATGCGCCGGAGGCTGCTCTTTTGCTGGCTGCTCAATCAAACATGGCAGATGACTCTTGGGGCCTTCCGACGGTGGTGATCCCAGGAGGAAGCCCTATTTCGCTTTCCATGGAGGAGCACGAAGGCGGTGGCGTCGCTGTGTCGCAGACCTCGTCGGCGGCACCGGTGACTGAGGGGGGGCACGGAGTCGGTGTTCAACCACCTGCTGACGAGGCGAATGGGGAGCCAACGGGGATGGATCCATCTGTGGTTTCAGTGGACGCGGTGCAGGGCGCGCCACACGAGGAGCCTGTCATGAGCGGCATGGGCATGCAACCTGCGTCTGCACCTGCCGGTCTGTGTTCACATTGGTCTGCAGCACTGGGCGCTGTAGCCAAGAAGCTACAGTTTGAAGATCTTGTCAAGGATACGCAGGAGAATGGGGCTGCATTAATGGCGGTCTCGGCGGTGCTGGAGGATGGGGAACCGGAGAGCGTTGGCGGGAACGCTGAACGGGCGATGCCGCTTGAAGAACTGAATCCTCCGTGTAAGGAGTCGTCGGCTTCTGGGCCAGAACGTGCCCTGGGCCCAGACGCTGACCAGGGACAAAACGGCCCGTGGCCAGGAGGCGATAGCGGGTCGGCTGAGCTGGCCTCTCGACCGCTAGCTGGGCCGCAAGACC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More
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Protein seq | MSSPIAIGRHEPPPLLVLYLLFHLLLGFQQLCYSLGTHSNNRITAAMPVPCLPDQSAALLRLKRSFTITNDSQCTLASWRAGTDCCRWEGVRCGGANGDGRVRSLDLARCFLESAAIDPALFDLTSLRYLNLARNDFNGSELPATGFERLKHLTHLNLSDASIQGKIPVGIRHLTNLVSLDLSTTFYLIDQDDYYLSFDTWSDPSWWVVEPNIGSLVANLSSLRELYLGRVDLSDNGEDWCTALTNSSTPQLQVLSLRHCRLFGPICTSLSSIHSLTEINLQYNDLYGPVPDSFADLHFLRVLDLADNDLEGLFPKRILQNRNLTTVHISYNTNIYGSLPNFSPDSSLTTLIVSSTNFSGPIPSSIGNLKSLNELGVASNDFRQELPSSIGQLTSLKLLEATGAGIVGTIPSWIANLTSLVLLRFSNCGLSGPIPSSIGNLKNLTRLELYRCNFYGTISPHIFNLTHLKVMYLHSNNLTGTVELSSFWKLPHLFSLNLSGNRLTVVDGDVNSSHVNNMDMLRLASCNMSKFPDALRHMSFIHYLDLSDNKIPGAIPQWAWETWSQLVLLNISHNKFSSVGCNALPVDIESVDLSFNQFEGPIPTPAPDLASLDCSNNQFSSMPFNFSYQLSGICYFMASRNNLSGEIPSSICDARSLVLLDLSYNNLSGSIPSCLIENTNSLSALNLEGNQLTGKLPHNIKKGCSFEELDFSKNSIEGQLPRSLVECRGLQVFDIGDNQISDTFPCWMSVLPKLQVLVLKSNKFFGMVGPSVLGEQNNCDFMKLRILSLASNSFSGTLPIKWFKTFKSMMVKSSDESLSMENQYSRFSQTYQFTAAITYKGYDVTFSKILRTLVTIDVSDNALNGTIPKSIGELALLRGLNMSHNALTGPIPSQLGALQELESLDLSSNDLSGEIPQELAQLNFLSVLNLSYNALVGRIPDSPQFSNNLSYLGNIGLCGFPLSKECSNMTTPPSSHPSEEKHVDVILFLFVGLGVGIGFAVIIVVTWGIRTKKSNRSTAAMPAPCLPDQAAALLRLKHSFNMTNKSECTLASWRAGTDCCRWEGVRCGVGIGVGHVTSLDLGECGLESAALDPALFELTSLRHLNLAWNNFSGSHIPTIGFERLTELTYLNLSNSKFAGQIPNTIGRLTNLISLDLSTDFFLIDLDDEFLSVATYSPAWLLVAPNIVSIVANLHNLKELYMGTIDLSSNSMVQWCSAFSAGTAKGMAAAAEVADGTLTQSRVLLLIVTIWCSAFSNSTTPQLQVLSLPYCYLEVPICESLSGIRSLSEINLQYNFIHGPIPESFGDLPSLSVLSLTHNSLEGSFPSRIFQNKNLTSVDVRYNFELSGSLPKNISSNDILVDLLVSSTNFSGPIPNSVGNIKSLENLGVASSDFSQELPSSIGQLRSLNSLEITGAGVVGAVPSWIANLTSLTLLDFSNCGLSGKIPSAIGAIKNLKRLALYKCNFSGQIPQDLFNLTQLRVIYLQYNNFIGTLELSSFWKLPDLFSLNLSNNKLSVVDGEKNNSSWVSINYFYTLRLAYCNISNFPSALSLMPWVGNLDLSGNQIHGTIPQWAWETSSELFILNLSHNKFDNIGYNYLPFYLEIVDLSYNLFQGPIPITGPDTWLLDCSNNRFSSMPFNFSSQLSGMSYLMASRNNLSGEIPLSICDARDILLLDLSYNNLSGLIPLCLLEDINSLSVFNLKANQLHGELPRNIKKGCALEALDFSENMFEGQLPTSLVACRDLEHNVHSTTYQFSTSIAYKGYEVTFTKILRTLVVIDVSDNALHGSIPKSIGELVLLRGLNMSHNALTGPIPSQLGALHELESLDLSSNDLSGEIPQELAQLHFLSVLNLSYNGLVGRIPDSPQFSNNLSYLGNIGLCGFPLSKECSNMTTPPSSHPSEEKHVDVILFLFVGLGVGIGFAVIIVVTWGIRIKKRSQDSRFPFWKKVLCM |
||||||||||
Function | Receptor-like protein 34 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SRL2] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLiXu_Ung0001840 | OsLiXu_Ung0001840.01 | ChrUN-Ctg35 | 4396 | 21112 | - | NAM | ||
CDS seq | ATGTCGTCCCCAATTGCAATTGGTCGTCATGAGCCACCGCCATTGCTAGTACTATACCTGTTGTTCCATCTCCTGTTAGGCTTCCAACAGCTCTGCTACTCCCTTGGCACGCACAGCAATAACCGGATTACTGCTGCCATGCCGGTCCCGTGCTTGCCGGACCAGTCGGCGGCGCTGCTCCGGTTGAAGCGCTCCTTCACCATCACAAACGACTCCCAGTGCACCCTCGCGTCGTGGCGGGCCGGCACGGACTGCTGCCGCTGGGAGGGCGTCCGCTGCGGCGGCGCCAACGGCGACGGCCGCGTGAGAAGCCTCGATCTGGCAAGGTGTTTCTTGGAGAGTGCAGCAATTGACCCTGCACTTTTCGATCTAACTTCACTCAGGTATCTTAACCTCGCACGTAATGACTTCAATGGCTCGGAGCTCCCAGCTACTGGGTTTGAGCGCCTCAAGCATCTCACCCATCTCAACCTGTCCGATGCGAGCATCCAAGGCAAGATACCAGTTGGGATAAGGCACCTGACCAATTTGGTATCTCTTGACCTCTCCACAACATTTTATCTTATAGATCAGGACGACTATTACCTCTCATTCGATACATGGTCAGATCCTTCTTGGTGGGTCGTAGAACCAAACATTGGGTCGCTAGTAGCAAATCTCAGCAGTTTGAGAGAGCTTTATCTCGGCAGGGTGGACTTGTCTGACAACGGTGAAGATTGGTGCACTGCCTTAACAAACTCCAGTACTCCTCAACTCCAGGTTCTGAGTTTACGGCATTGCAGACTCTTTGGTCCCATCTGCACATCTCTCTCTAGCATACATTCACTCACTGAGATTAATCTACAGTATAATGACCTGTATGGTCCAGTTCCAGACTCCTTCGCTGATTTGCACTTCTTACGCGTTCTTGATCTTGCTGATAATGATCTTGAAGGATTGTTTCCAAAAAGAATATTACAAAACAGGAACTTAACAACTGTTCATATCAGCTATAATACCAACATCTACGGTTCTTTGCCCAATTTCTCACCAGACAGTAGCTTGACAACTTTGATTGTTAGCAGCACAAACTTCTCTGGTCCTATTCCCAGTTCCATAGGCAATCTCAAATCGTTGAACGAGTTGGGCGTTGCATCAAATGACTTTAGACAAGAGCTTCCCTCTTCAATTGGACAACTCACATCCTTAAAATTATTAGAGGCAACAGGAGCTGGTATAGTAGGAACTATACCATCTTGGATCGCAAATTTAACCTCCTTGGTACTTCTCCGGTTCTCTAATTGTGGTCTATCTGGACCGATACCTTCTTCAATAGGTAATCTCAAGAACCTAACTAGATTAGAATTGTATAGGTGCAATTTTTATGGTACAATATCGCCACACATTTTCAATCTAACTCACTTAAAAGTAATGTATCTCCATTCGAACAACCTCACTGGTACTGTGGAGCTCAGCTCATTCTGGAAACTACCTCACCTCTTTAGTTTGAATCTTTCAGGCAACAGACTCACCGTAGTAGATGGTGACGTTAACTCTTCGCATGTTAATAATATGGACATGTTGCGTCTAGCATCATGTAACATGTCCAAGTTCCCTGATGCCTTGAGGCACATGAGTTTTATTCATTATCTTGACCTTTCAGACAATAAAATCCCTGGCGCTATACCTCAATGGGCATGGGAAACCTGGAGCCAGTTGGTTCTCCTAAACATATCACACAACAAATTCAGCAGCGTAGGATGCAACGCTCTTCCCGTTGATATAGAGTCTGTTGATCTCAGTTTTAACCAATTCGAAGGGCCTATACCCACACCTGCACCAGACCTTGCGTCGCTTGATTGCTCAAATAACCAGTTCTCATCCATGCCATTTAATTTTAGTTATCAACTTAGCGGTATTTGCTATTTCATGGCCTCTAGGAATAACCTGTCCGGAGAAATTCCATCATCGATTTGTGATGCAAGAAGCCTTGTGCTCCTTGATCTCTCTTACAACAATTTGAGTGGTTCTATCCCATCATGCTTGATTGAGAATACGAATTCCTTGAGCGCATTAAACTTGGAAGGGAATCAACTCACTGGAAAGTTACCACATAATATCAAGAAAGGCTGTTCATTTGAGGAATTGGATTTTAGCAAAAACTCAATCGAAGGACAGCTTCCCAGATCTCTAGTTGAATGCAGAGGCTTGCAGGTTTTCGACATCGGAGACAATCAGATCAGTGACACTTTTCCATGTTGGATGAGTGTGCTTCCTAAACTTCAAGTCCTTGTTCTGAAGTCTAACAAGTTCTTCGGGATGGTTGGGCCTTCTGTTTTGGGAGAGCAAAACAATTGTGATTTCATGAAACTACGGATCCTTTCTTTGGCCTCAAATAGTTTCTCTGGCACACTGCCTATTAAGTGGTTCAAGACATTCAAATCCATGATGGTCAAATCTTCTGATGAATCACTGTCAATGGAAAATCAGTACAGTCGATTTTCACAGACATACCAGTTTACTGCTGCGATCACATATAAAGGGTATGACGTGACATTTTCAAAAATCTTGAGGACCCTTGTAACCATCGATGTTTCTGACAATGCACTCAATGGTACCATTCCCAAGTCGATCGGAGAGCTTGCTCTCCTCCGTGGGCTAAACATGTCACACAATGCCCTCACAGGACCAATTCCATCTCAGCTTGGTGCTCTGCAGGAACTCGAGTCATTGGACCTCTCATCAAATGATCTTTCAGGGGAGATTCCACAGGAGTTAGCACAGCTAAACTTCCTCTCAGTGCTGAACCTGTCCTACAACGCTTTGGTTGGGAGAATACCAGACTCACCCCAGTTCTCGAACAATCTCTCCTATCTGGGAAACATTGGCCTGTGTGGGTTTCCATTGTCCAAGGAATGCAGCAACATGACAACACCACCAAGCTCACATCCTTCAGAGGAAAAACATGTGGATGTTATACTGTTTCTCTTTGTTGGACTTGGAGTTGGCATCGGGTTTGCAGTTATAATCGTTGTGACATGGGGAATCCGCACCAAGAAAAGCAACCGAAGTACTGCTGCCATGCCGGCCCCGTGCTTGCCCGACCAGGCAGCGGCGCTGCTCCGCCTGAAACATTCCTTCAACATGACCAACAAGTCCGAGTGCACCCTTGCATCATGGCGCGCCGGCACGGACTGCTGCCGCTGGGAGGGCGTCCGCTGCGGCGTCGGCATCGGCGTTGGCCATGTGACCTCGCTTGACCTCGGTGAGTGCGGATTGGAGAGCGCTGCTCTTGACCCTGCGCTTTTCGAGCTCACTTCGCTCAGGCACCTTAACCTCGCGTGGAACAATTTCAGCGGGTCTCATATTCCCACCATTGGGTTCGAACGGCTCACTGAGCTCACCTACCTCAATCTCTCCAACTCCAAATTTGCAGGCCAGATACCAAATACAATAGGACGTCTCACTAATTTGATATCCCTTGACCTCTCCACTGATTTTTTCCTTATTGATCTAGATGATGAGTTCTTATCAGTTGCCACCTATTCACCCGCTTGGTTACTTGTGGCACCAAACATTGTGTCAATAGTCGCAAACCTCCACAACCTGAAGGAACTTTATATGGGCACAATAGACTTGTCCAGCAACAGCATGGTACAGTGGTGCAGTGCCTTTTCTGCCGGGACGGCCAAAGGGATGGCCGCCGCGGCCGAGGTGGCCGACGGCACTCTCACGCAGTCCCGCGTGCTTCTTCTAATCGTAACAATTTGGTGCAGTGCCTTTTCAAACTCCACTACCCCTCAACTTCAGGTCCTTAGCTTACCATATTGCTACCTCGAGGTTCCCATTTGTGAATCATTGTCGGGTATACGCTCACTGAGTGAGATTAACCTACAGTACAACTTCATACACGGTCCCATTCCAGAGTCCTTTGGAGATTTACCTTCCCTAAGTGTTCTTAGTCTTACACACAACAGTCTAGAAGGGAGCTTCCCAAGTAGAATCTTCCAGAACAAAAACTTAACCTCTGTTGATGTTAGGTACAACTTCGAACTCTCCGGTTCGTTGCCAAAAAATATCTCATCAAATGACATTTTGGTAGATCTTCTTGTTAGCAGTACTAACTTCTCTGGTCCAATCCCTAACTCAGTAGGCAACATCAAATCCTTGGAAAATTTGGGTGTTGCATCAAGTGACTTCTCCCAAGAGCTTCCCTCTTCTATTGGCCAGCTGAGATCGTTGAATTCGTTAGAGATTACAGGGGCTGGTGTAGTAGGAGCAGTACCATCTTGGATTGCAAATTTGACTTCATTGACCCTTCTCGACTTCTCGAACTGTGGCTTATCTGGGAAGATACCATCTGCGATAGGTGCTATCAAGAATCTGAAGAGGTTAGCGTTATACAAATGTAACTTTTCTGGCCAAATACCTCAAGATCTATTTAACCTAACTCAATTGAGAGTCATATATCTTCAATATAATAACTTCATTGGTACGTTGGAGCTCAGCTCATTTTGGAAACTACCAGACCTATTTTCTTTGAATCTTTCCAACAACAAACTATCAGTTGTAGATGGTGAGAAAAATAATTCTTCATGGGTGTCCATAAACTATTTCTACACCTTGCGCCTAGCATATTGTAACATATCCAATTTCCCTAGTGCCTTGAGTCTCATGCCTTGGGTTGGAAATCTTGATCTTTCAGGAAATCAGATCCATGGTACTATACCTCAGTGGGCGTGGGAAACTTCGAGCGAGTTGTTTATCCTCAACTTATCACACAACAAATTCGACAATATAGGATATAATTATCTTCCATTTTACTTAGAGATTGTTGATCTCAGTTATAACTTATTCCAAGGACCCATACCTATAACTGGACCTGACACTTGGTTGCTCGATTGCTCAAACAACCGGTTCTCATCCATGCCATTTAACTTCAGTTCCCAGCTTAGTGGAATGTCCTATCTCATGGCCTCCAGAAACAACCTATCTGGAGAAATTCCACTCTCAATTTGTGA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|||||||
Protein seq | MSSPIAIGRHEPPPLLVLYLLFHLLLGFQQLCYSLGTHSNNRITAAMPVPCLPDQSAALLRLKRSFTITNDSQCTLASWRAGTDCCRWEGVRCGGANGDGRVRSLDLARCFLESAAIDPALFDLTSLRYLNLARNDFNGSELPATGFERLKHLTHLNLSDASIQGKIPVGIRHLTNLVSLDLSTTFYLIDQDDYYLSFDTWSDPSWWVVEPNIGSLVANLSSLRELYLGRVDLSDNGEDWCTALTNSSTPQLQVLSLRHCRLFGPICTSLSSIHSLTEINLQYNDLYGPVPDSFADLHFLRVLDLADNDLEGLFPKRILQNRNLTTVHISYNTNIYGSLPNFSPDSSLTTLIVSSTNFSGPIPSSIGNLKSLNELGVASNDFRQELPSSIGQLTSLKLLEATGAGIVGTIPSWIANLTSLVLLRFSNCGLSGPIPSSIGNLKNLTRLELYRCNFYGTISPHIFNLTHLKVMYLHSNNLTGTVELSSFWKLPHLFSLNLSGNRLTVVDGDVNSSHVNNMDMLRLASCNMSKFPDALRHMSFIHYLDLSDNKIPGAIPQWAWETWSQLVLLNISHNKFSSVGCNALPVDIESVDLSFNQFEGPIPTPAPDLASLDCSNNQFSSMPFNFSYQLSGICYFMASRNNLSGEIPSSICDARSLVLLDLSYNNLSGSIPSCLIENTNSLSALNLEGNQLTGKLPHNIKKGCSFEELDFSKNSIEGQLPRSLVECRGLQVFDIGDNQISDTFPCWMSVLPKLQVLVLKSNKFFGMVGPSVLGEQNNCDFMKLRILSLASNSFSGTLPIKWFKTFKSMMVKSSDESLSMENQYSRFSQTYQFTAAITYKGYDVTFSKILRTLVTIDVSDNALNGTIPKSIGELALLRGLNMSHNALTGPIPSQLGALQELESLDLSSNDLSGEIPQELAQLNFLSVLNLSYNALVGRIPDSPQFSNNLSYLGNIGLCGFPLSKECSNMTTPPSSHPSEEKHVDVILFLFVGLGVGIGFAVIIVVTWGIRTKKSNRSTAAMPAPCLPDQAAALLRLKHSFNMTNKSECTLASWRAGTDCCRWEGVRCGVGIGVGHVTSLDLGECGLESAALDPALFELTSLRHLNLAWNNFSGSHIPTIGFERLTELTYLNLSNSKFAGQIPNTIGRLTNLISLDLSTDFFLIDLDDEFLSVATYSPAWLLVAPNIVSIVANLHNLKELYMGTIDLSSNSMVQWCSAFSAGTAKGMAAAAEVADGTLTQSRVLLLIVTIWCSAFSNSTTPQLQVLSLPYCYLEVPICESLSGIRSLSEINLQYNFIHGPIPESFGDLPSLSVLSLTHNSLEGSFPSRIFQNKNLTSVDVRYNFELSGSLPKNISSNDILVDLLVSSTNFSGPIPNSVGNIKSLENLGVASSDFSQELPSSIGQLRSLNSLEITGAGVVGAVPSWIANLTSLTLLDFSNCGLSGKIPSAIGAIKNLKRLALYKCNFSGQIPQDLFNLTQLRVIYLQYNNFIGTLELSSFWKLPDLFSLNLSNNKLSVVDGEKNNSSWVSINYFYTLRLAYCNISNFPSALSLMPWVGNLDLSGNQIHGTIPQWAWETSSELFILNLSHNKFDNIGYNYLPFYLEIVDLSYNLFQGPIPITGPDTWLLDCSNNRFSSMPFNFSSQLSGMSYLMASRNNLSGEIPLSICDARDILLLDLSYNNLSGLIPLCLLEDINSLSVFNLKANQLHGELPRNIKKGCALEALDFSENMFEGQLPTSLVACRDLEHNVHSTTYQFSTSIAYKGYEVTFTKILRTLVVIDVSDNALHGSIPKSIGELVLLRGLNMSHNALTGPIPSQLGALHELESLDLSSNDLSGEIPQELAQLHFLSVLNLSYNGLVGRIPDSPQFSNNLSYLGNIGLCGFPLSKECSNMTTPPSSHPSEEKHVDVILFLFVGLGVGIGFAVIIVVTWGIRIKKRSQDSRFPFWKKVLCM
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0160200 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g06670 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0160200 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0004530 | SBH | 0.0 | 1.509433 | 0.000000 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0024050 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0024360 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0004010 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_06g0011210 | SBH | 12.575239 | 30.748129 | 6.738047 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0057600 | SBH | 0 | 0 | 0 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024950 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0057800 | SBH | 0 | 0 | 0.0139485 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0004150 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0004180 | SBH | 0.030873 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0004290 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0004280 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_06g0010980 | SBH | 0.445477 | 9.713138 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G004250 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0004160 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |