Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLiXu_06g0002740 OGI:06005820 | 15/16 LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr06:1928743-1949274
Gene Symbol SEPK1
DNA seq

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Function Receptor-like protein EIX2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6JN46]

Transcripts

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OsLiXu_06g0002740 OsLiXu_06g0002740.04 Chr06 1928743 1940681 - NAM
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OsLiXu_06g0002740 OsLiXu_06g0002740.02 Chr06 1928743 1948149 - NAM
CDS seq

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Protein seq

MMQGIMLAALLVLCQLIKNAGKITDAACISSERDALLAFKAGFADPAGGALRFWQGQDCCAWSGVSCSKKIGSVVSLDIGHYDLTFRGEINSSLAVLTHLVYLNLSGNDFGGVAIPDFIGSFEKLRYLDLSHAGFGGTVPPRLGNLSMLSHLDLSSPSHTVTVKSFNWVSRLTSLVYLDLSWLYLAASSDWLQATNTLPLLKVLCLNHAFLPATDLNALSHTNFTAIRVLDLKSNNFSSRMPDWISKLSSLAYLDLSSCELSGSLPRNLGNLTSLSFFQLRANNLEGEIPGSMSRLCNLRHIDLSGNHFSGDITRLANTLFPCMNQLKILDLALNNLTGSLSGWVRHIASVTTLDLSENSLSGRVSDDIGKLSNLTYLDLSANSFQGTLSELHFANLSRLDMLILESIYVKIVTEADWVPPFQLRVLVLYGCQVGPHFPAWLKSQAKIEMIELSRAQIKSKLPDWLWNFSSTISALDVSGNMINGKLPKSLKHMKALELLDMSSNQLEGCIPDLPSSVKVLDLSSNHLYGPLPQRLGAKEIYYLSLKDNFLSGSIPTYLCEMVWMEQVLLSLNNFSGVLPNCWRKGSALRVIDFSNNNIHGEISSTMGHLTSLGSLLLHRNKLSGPLPTSLKLCNRLIFLDLSENNLSGTIPTWIGDSLQSLILLSLRSNNFSGKIPELLSQLHALQILDIADNNLSGPVPKSLGNLAAMQLGRHMIQQQFSTISDIHFMVYGAGGAVLYRLYAYLYLNSLLAGKLQYNGTAFYIDLSGNQLAGEIPIEIGFLSGLTGLNLSGNHIRGSIPEELGNLRSLEVLDLSRNDLSGPIPQCFLSLSGLSHLNLSYNDLSGAIPFGNELATFAESTYFGNAHTTVKKLRAIDRSTRTVHPAGMEVAAAGGGARRRSRRRAEQPPPPCRPTNDDDAAASKLSCVNKGYMKDDYVHFFVRRTTKRAPIINRGSFCISSSVLEMAVMIKTGNKYSLGAGFDTTFFQLQDEGIAPYLYVELDFKEQKAAIINHYSQMKEKKGEVRSAHYKLFSADIRDIPKLDSVIQMAEMDPTLPTFIIAECVLIYLDPASTSSIVIWASDKFSTAIFFLYEQSRGCPLLGINATPTLSHKENLFLDHGWQRAVAWDMLKIYNDFIDSEERRRIERLELFDEFEEWHMMQEHYCVAYGINDAKQQHALERKRCTIRLEGHPERPWRHAVLLGRSKLLQLVWRDLQQQDWTYYQAQPRKLNISKEDALTGDISPSLVHLTHLMYLNLRSNDFGGARIPAFIGSLKNLRHLDFFTSSSSVDNLLWVSQLSSLVYLDMSLWNLSVASDWLQSLNMLASLKVLRLSGTNLPPTNQNSLSQSNFTILDLSNNNLIGDIADLGKAMTRCMKGLSMIKLGNNNLSGSLSGWIGSFPNLFSVDLSKNSLSGSSPLQSQVPQWLQTQVGMQTLDLHRTGTLGQLPDWLWTSLTSLINLDLSDNLLTGMLPASLVHMKSLQFLGLSSNQLEGQIPDMPESLDLLDLSNNSLSGSLPNSVGGNKTRYILLSSNRLNRSIPAYFCNMPWLSAIDLSNNSLSGELPNCWKNSTELFLVDFSYNNLEGHIPSSLGSLTFLGSLHLNNNRLSGLLPSSLSSCGLLVFLDIGDNNLEGSIPEWIGDNMQYLMILRLRSNRFTGSIPSELSQLQGLQVLDLANNKLSGPLPQGIGNFSEMASQRSRHIIPMQISGDSFGGSLYHNESLYITIKGEERLYSKILYLMKSIDLSNNYLTGGIPAEVGDLGSKPESLENLLSGHIPETIGNMSSLESLDLSWNRLSGIIPESMTSLHLLSHLNMSYNNLSGMVPQGSQLQTLGDEDPYIYAGNKYLCIHLASGSCFEQKDHVDQAEHNDVHDIWLYIFSGLGFGVGFSSVWWLLVCSKAVGKRYFQFVDSTCEKVIHWMILLEKKVNKKTVGKSSVL

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.000000 0.000000

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0140300 RBH 0.0 0.0 0.552516
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g04840 RBH 0.0 0.0 0.131063
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0140300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0002940 RBH 0.0 0.0 0.989637
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_06g0002870 RBH 0.0 0.0 0.397812
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0002810 RBH 0.0 0.0 0.620030
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0011100 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0011210 RBH 12.575239 30.748129 6.738047
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0033800 RBH 0.1726675 0.5068755 1.381308
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0010780 RBH 0.0 0.000000 0.232642
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0151000 RBH 3.943083 6.1207495 0.224874
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0011190 RBH 0.000000 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0011040 RBH 2.607627 24.942671 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0011070 RBH 0.000000 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_Ung0025410 RBH 0.0 0.0 0.170022
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0010980 RBH 0.445477 9.713138 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G010880 RBH 0.000000 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0011190 RBH 0.000000 5.689448 1.144959
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