Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsLiXu_06g0002740 | OGI:06005820 | 15/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr06:1928743-1949274 | ||||||||
Gene Symbol | SEPK1 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Receptor-like protein EIX2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6JN46] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLiXu_06g0002740 | OsLiXu_06g0002740.03 | Chr06 | 1942415 | 1948149 | - | NAM | ||
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Protein seq | MMQGIMLAALLVLCQLIKNAGKITDAACISSERDALLAFKAGFADPAGGALRFWQGQDCCAWSGVSCSKKIGSVVSLDIGHYDLTFRGEINSSLAVLTHLVYLNLSGNDFGGVAIPDFIGSFEKLRYLDLSHAGFGGTVPPRLGNLSMLSHLDLSSPSHTVTVKSFNWVSRLTSLVYLDLSWLYLAASSDWLQATNTLPLLKVLCLNHAFLPATDLNALSHTNFTAIRVLDLKSNNFSSRMPDWISKLSSLAYLDLSSCELSGSLPRNLGNLTSLSFFQLRANNLEGEIPGSMSRLCNLRHIDLSGNHFSGDITRLANTLFPCMNQLKILDLALNNLTGSLSGWVRHIASVTTLDLSENSLSGRVSDDIGKLSNLTYLDLSANSFQGTLSELHFANLSRLDMLILESIYVKIVTEADWVPPFQLRVLVLYGCQVGPHFPAWLKSQAKIEMIELSRAQIKSKLPDWLWNFSSTISALDVSGNMINGKLPKSLKHMKALELLDMSSNQLEGCIPDLPSSVKVLDLSSNHLYGPLPQRLGAKEIYYLSLKDNFLSGSIPTYLCEMVWMEQVLLSLNNFSGVLPNCWRKGSALRVIDFSNNNIHGEISSTMGHLTSLGSLLLHRNKLSGPLPTSLKLCNRLIFLDLSENNLSGTIPTWIGDSLQSLILLSLRSNNFSGKIPELLSQLHALQILDIADNNLSGPVPKSLGNLAAMQLGRHMIQQQFSTISDIHFMVYGAGGAVLYRLYAYLYLNSLLAGKLQYNGTAFYIDLSGNQLAGEIPIEIGFLSGLTGLNLSGNHIRGSIPEELGNLRSLEVLDLSRNDLSGPIPQCFLSLSGLSHLNLSYNDLSGAIPFGNELATFAESTYFGNAHTTVKKLRAIDRSTRTVHPAGMEVAAAGGGARRRSRRRAEQPPPPCRPTNDDDAAASKLEGSRCCCVHHQREDALLAFKAGLCADSAGELPSWQGHDCCSWGSVSCNKRTGHVIGLDIGQYALSFTGEINSSLAALTHLRYLNLSGNDFGGVAIPDFIAPSAS
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLiXu_06g0002740 | OsLiXu_06g0002740.04 | Chr06 | 1928743 | 1940681 | - | NAM | ||
CDS seq | atgtgcgttgatcatggatatgctgtcatgattccttccgccaaatttgctacagtttatactgatggacgtacatatttggccatacacgtatacactgataaacttgagagttacagctcaacgtacgattacccgctaaactttattgatctatcaagaaatcaatttacaggagaaatccccagagaaataggagcaatatcttttttgcttgccttgaatctatcaggaaatcacatacttgggagtattcctgacgaaattgggaacctcagtcatttagaggcacttgatctctcgtcgaatgatttgtcaggatcaattcctccgagcatcacagatttgattaatctatcggttctgaatttgtcctacaatgatctgtcaggagtgataccatgtagctctcagttttcaactttcacagatgaaccatatctaggcaatgcagatctttgtggaaattgtgggtttgcatatggattatctgtcgtttctgccatcctcatattcagcagaactgcaagaaatgcctacttccagttcactgacaagacattggatgagttccgtgctatacgatcgaccggccggaatggatgcggcggcggcggcggcggcggcgggaggaggaggagggggaggcgtagcgtcgcggcgcggagcagcccggcgtccgtgcaggccaccaacgacgacgccgcggccagcaagctgtcatgtgttaataaaggatacatgaaggatgattatgtgcacttctttgtcagacgaacaacaaaaagggctccaataataaatcgaggaagcttctgcatcagttcctcggtgctggaaatggcagtaatgatcaaaaccggaaacaaatattctcttggtgctggctttgacacgacattcttccagttgcaggacgaaggcattgctccatacctttatgttgagttggatttcaaggagcaaaaggctgccatcattaaccactatagtcaaatgaaggaaaaaaaaggtgaagtgagaagtgcgcattacaagctcttttctgctgatattcgtgatataccaaaacttgattcagttattcagatggctgaaatggaccctaccttgccgacctttataattgcagagtgtgtgctaatttacttagacccagcttcaaccagttctattgttatttgggcatctgataagttctccactgccatatttttcttatatgagcagagtagaggatgccctctccttggtataaatgctacaccaaccctaagtcacaaggaaaatctttttcttgatcacggatggcagagagctgttgcatgggatatgctaaaaatatacaatgatttcattgacagtgaagaaagacgcaggattgaacgattggaattgtttgatgagttcgaagagtggcatatgatgcaggaacactattgtgtggcttatggaataaatgatgccaagcagcagcatgcattggaaaggaagagatgcactattcgacttgaaggccaccctgagagaccctggaggcatgctgtcctcttgggtaggtctaaattgttgcaactggtatggcgtgacttgcaacaacaggactggacatattatcaagctcaacctcgcaaactaaatatcagcaaggaggatgctctaacaggtgacatcagtccatcattggttcatttaactcatttgatgtacctcaatcttcgttcgaatgattttggaggtgcaagaatccctgcgttcataggatctctgaagaacctgaggcatcttgacttctttacttccagtagctctgttgacaatcttctttgggtctctcagctttcttcactggtttaccttgacatgtcattgtggaacctttctgtggcttcagattggctgcagtctttgaacatgcttgcttccctcaaagtgcttcgtttgtctggtaccaatcttccacccactaatcaaaattctctatcccagtctaacttcacaatccttgatttgtcgaacaacaaccttataggtgatattgctgatttggggaaggcaatgacccgctgcatgaagggactatctatgatcaaattggggaataataatctatctggaagtctatccgggtggattggatccttcccaaacctcttctcagtcgatctcagcaaaaactcactatcaggttcttccccactacaatcacaagtcccgcagtggcttcaaacacaagttggaatgcagacattagatttgcacagaacggggactctaggtcaattgcctgattggctttggacgtcattgacctctctcattaacttggatctctctgacaatctgcttactggcatgctaccagcatccctggttcatatgaagtcactgcagttcttggggctcagctcgaaccaattggaaggtcagattcctgatatgccagaaagtctagacctgctagatctctccaacaactctttatctggatcattgcccaatagtgtgggagggaacaagacacgttacattttattgtcaagcaatcgtctaaatagaagcatacctgcgtacttttgcaacatgccatggttgtcagcaatagacctatcaaacaacagcttatcaggcgagctacctaattgttggaagaacagcacagaactatttttggtggatttctcgtacaacaacctggaaggacacataccttcaagtcttggctctcttacttttcttggttccctgcatttgaacaacaataggctatctgggttgttgccttcctctctaagttcatgcgggcttctggttttccttgatattggagataataatttggagggttccatacctgaatggataggagataacatgcaatacctcatgattcttcgtttgcgatcaaatcgtttcactggaagcatcccgtctgaattgtcacagcttcaaggtcttcaagtgttggatcttgccaataacaagctgtcagggcccctgccacaaggtattggaaattttagtgaaatggcttcacagaggtcaagacatattataccgatgcagatttctggtgatagttttggtggatctctctatcacaatgagagtctatacattaccatcaaaggagaagaaagattgtattctaagatcctttatctgatgaagagcattgacctttctaacaattatctaacaggtggaattcctgctgaagttggagatcttggctcaaaacctgaatctctcgaaaatctcctgagtggtcatattccagagacaattggtaatatgagttcattggagtcgcttgatctctcatggaaccgactgtcaggcataattcctgaaagcatgacatcactgcacttgttgagccacctgaacatgtcctacaacaatctgtccgggatggtaccccagggctctcagcttcaaacccttggtgatgaagatccatacatctatgctggcaacaagtatctctgcatccatcttgcttctggcagctgttttgaacagaaagaccatgttgatcaagcagagcataatgatgtccatgatatctggctgtatatattttcaggattgggcttcggagtaggattttcttctgtgtggtggcttcttgtgtgcagcaaggcagtgggcaagaggtatttccagttcgtcgactccacatgtgagaaagttattcactggatgatcctactggagaagaaggtgaataagaaaacagtgggaaaaagttcggtattgtga
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Expression
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Homologues
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os06g0140300 | RBH | None | None | None |
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KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_06g0002870 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.397812 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_06g0002810 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.620030 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_06g0011100 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_06g0011210 | RBH | 12.575239 | 30.748129 | 6.738047 |
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