Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLiXu_04g0023500 | OGI:04085100 | 11/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:30684295-30697184 | ||||||||
| Gene Symbol | DWF1, DIM/DWF1, DIM, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Cytochrome P450 87A3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XU38] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_04g0023500 | OsLiXu_04g0023500.02 | Chr04 | 30684295 | 30697184 | - | NAM | ||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_04g0023500 | OsLiXu_04g0023500.01 | Chr04 | 30684295 | 30697184 | - | NAM | ||
| CDS seq | atgtacgcctacgtggggctcgtgggcgccgcagctgcgctcgtgctgctgctgcggcaccaggcgcgcaggtggaggaaccctcgctgcggcggccaactcccgccgggctccatgggcctcccgctcgttggcgagacgttccagttcttctcctccgacgcctccttggacatccctcccttcatccggcacaggctggctagatatgggccgatattcaagaccagcctggtggggcacccggtggtggtgtcggccgacgaggagctgaaccacatggtgttccagcaggaggggcagctgttccagagctggtacccggactcgttcgtggagatcctggggaaggacaacgtcggggagcagcagggcgccatgttcaggtacctcaagaacatggtgctcaggtacttcggccccgagagcctcaaggaaggcatcatccgcgacgtcgagcgcgccgtctccagctccctctgcacctggtccaccttgccggccgtcgagctcaaagaagccgtctccactatggtgttcgatcttgctgcaagcaagctgctcggcctggagccgtcgaggtcaaagattttgcggaagagcttcttcgacttcgttcgagggctcatctccttcccgctgtatctgccagggacagcttactactcatgcatgcaggggcggaggcgcgcgatggtggtgctagagcaagttctggaggagaggaagcaatcgacaggattgcagcgaggaggagaagcgcagcagcacggcgacttcctggattatgtgatccaggagatcacgaaggaaaagccggtcatgacagagaagatggcgctcgacctgatgttcgtgctcctcttcgccagcttccacacgacgtcgctggcgctcaccctggccgtcaagctgctcgccgaccaccctctcgtcctggaggagctcacggtggagcatgaaacgattctgaaggaccgtgaggcaggcagcgagctagatagaatcacatggaaggagtacaaatccatggcattcacatctcaggtcataaacgagacggtccgtttggccaacatcgctcctgtcatcttcagaaaggcacttaaagacatacggttcaatgtgcacttaaatccatatatttatccggatcctctcaccttcatcccttcaaggtttaaggataaaccagagataaaccgtggatcaaaacacttcatggcattcggcggaggactacggttctgcgttggagcagacttcagcaagctacaattggctattttcctccatttccttgtgacaaaatacaggtggataccgctgggagcaagcagggtagtccgaactccaggactagaatttcctgatggctatcggatcaaagacatggaaaagtctgagctcttgctaggatcgtattcatatgcagctctatgtggtgtcacactcatcataggatggttagctcactggatatacaaatggatgaatcctccatgcattgggaggcttcctcctggctccatgggcttccctattattggtgagaccttccagttcttcagagcaagcccatcaatagacatgccaagctactacaagcaaagactggagaggtatgggcctctattcaagactagcttagttggacggccagtgatcatttcccttgacccagaggtgaaccgattcatatttcaacaagagggtaaattgttccaaagttggtatccagaaactgcaattaatatctttggcaagaagagcctcaccacatacaacggaaccattcacaagtttatccggggtgttgcggccaagctctttggccttgaaaacctgaaagaatcactccttcctgagctagaaaactctatgagggagagcttcgcatcatggactgggaaacccagcgtcgaggtacaggacggcgtgtcagatggtaggagaaatgtgcggaacacacttactgatataatgaaagagaggctaagtgcacctggaaagaagtatggtgaccttgtagacctcattgttgaagagctacagagcgaaaagccaatgatcgatgaaaactttgctatagacgcacttgctgcgctcttgtttacgagctttgcaacactgtcatcaaccttgactgtagcttttaagtacctaaccgacaatccaaaagttgttgaagagctcaaggaggagcacgggacaattctaaagaagcgagaaggtgtgaattccgggttcacatgggaggagtacaggtccttgaaattcagtactcaggttatgaatgaaattactcgaattagtaacgtcacacctggagttttcaggaaaacattaacagatgtgcaagtgaaaggatatacaattccatccgggtggttagtcatgataagccccatggcagttcacctaaacccaaaattgttcgaggatccacttaaatttgatccatggaggtggagggaggagaagagaagctcgatgctgaaaaattacatgccatttggaggaggcgtcaggctgtgtctcggggcagagtttagcaagcttttcattgcactcttcctccacatcttggtgaccgagtatagttggacggagattgaaggaggggaagtactgcgcatatcagagatcatgttcccccaaggctatcacatccaactagttcctcagacttaa
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| Protein seq | MYAYVGLVGAAAALVLLLRHQARRWRNPRCGGQLPPGSMGLPLVGETFQFFSSDASLDIPPFIRHRLARYGPIFKTSLVGHPVVVSADEELNHMVFQQEGQLFQSWYPDSFVEILGKDNVGEQQGAMFRYLKNMVLRYFGPESLKEGIIRDVERAVSSSLCTWSTLPAVELKEAVSTMVFDLAASKLLGLEPSRSKILRKSFFDFVRGLISFPLYLPGTAYYSCMQGRRRAMVVLEQVLEERKQSTGLQRGGEAQQHGDFLDYVIQEITKEKPVMTEKMALDLMFVLLFASFHTTSLALTLAVKLLADHPLVLEELTVEHETILKDREAGSELDRITWKEYKSMAFTSQVINETVRLANIAPVIFRKALKDIRFNVHLNPYIYPDPLTFIPSRFKDKPEINRGSKHFMAFGGGLRFCVGADFSKLQLAIFLHFLVTKYRWIPLGASRVVRTPGLEFPDGYRIKDMEKSELLLGSYSYAALCGVTLIIGWLAHWIYKWMNPPCIGRLPPGSMGFPIIGETFQFFRASPSIDMPSYYKQRLERYGPLFKTSLVGRPVIISLDPEVNRFIFQQEGKLFQSWYPETAINIFGKKSLTTYNGTIHKFIRGVAAKLFGLENLKESLLPELENSMRESFASWTGKPSVEVQDGVSDGRRNVRNTLTDIMKERLSAPGKKYGDLVDLIVEELQSEKPMIDENFAIDALAALLFTSFATLSSTLTVAFKYLTDNPKVVEELKEEHGTILKKREGVNSGFTWEEYRSLKFSTQVMNEITRISNVTPGVFRKTLTDVQVKGYTIPSGWLVMISPMAVHLNPKLFEDPLKFDPWRWREEKRSSMLKNYMPFGGGVRLCLGAEFSKLFIALFLHILVTEYSWTEIEGGEVLRISEIMFPQGYHIQLVPQT
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_04g0023500 | OsLiXu_04g0023500.03 | Chr04 | 30684332 | 30688354 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | atgtggtgtcacactcatcataggatggttagctcactggatatacaaatggatgaatcctccatgcattgggaggcttcctcctggctccatgggcttccctattat |
|||||||
| Protein seq | MWCHTHHRMVSSLDIQMDESSMHWEASSWLHGLPYY |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| SE | Chr04 | 30685752 | 30687605 | - | OsLiXu_04g0023500.02 | OsLiXu_04g0023500.02,OsLiXu_04g0023500.01 | All |
| SE | Chr04 | 30685752 | 30687605 | - | OsLiXu_04g0023500.03 | OsLiXu_04g0023500.01,OsLiXu_04g0023500.03 | All |
| A5 | Chr04 | 30685752 | 30687350 | - | OsLiXu_04g0023500.03 | OsLiXu_04g0023500.02,OsLiXu_04g0023500.03 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.077800 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0570500 | RBH | 0.0 | 0.0 | 2.210642 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g48200 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.498431 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0570500 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0023520 | RBH | 0.0 | 0.0 | 2.037433 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0024250 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.199900 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0023990 | RBH | 0.0 | 0.0 | 10.825400 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0023730 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0023870 | RBH | 0.0 | 0.0 | 5.113295 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0449900 | RBH | 0.815468 | 0.0396325 | 0.374478 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0022640 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.033752 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0453700 | RBH | 1.103369 | 0.005544 | 0.012879 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0023140 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0022970 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0023090 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0028440 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0023690 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G022940 | RBH | 0.0 | 0.0 | 5.763032 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0022840 | RBH | 0.0 | 0.0 | 1.072739 |
