Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLaMu_01g0016250 OGI:01046210 | 16/16 LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:15393420-15403175
Gene Symbol RLCK35, OsRLCK35, WAK7/8, OsWAK7/8, OsWAK7, OsWAK8, -
DNA seq

tcaaattgggatttcacaacaatacgaaatggggacggtgaacaagcagaagactggtgtaccttgacagccgttcttgacgtacggatttccttgatagccggcactgcacttgcaacgataaccaacacgtacgcggccacttccagtggtgacaattagacattcgctcatagcactgacgcaggcatatgaatcagtatcactcttcgccttttcacaggttacattggtgatagcccacttccaaaccccatactgttcagagaaatcgaagctttccaagtcttcaatgagtgatacagtccatcctccagaaatgttgtcttcgacttcatacacatgcgtcctattgtccccaaggctcgaaggcctgccaacaaccagctctgcatcgtccagtgagatatttgtcactaggtattgcgttggtgatgttccgatgcgagtttgattggctacacagctcagctgaaatctcttgtttccagaacagccctcctcgaggccaaatggaaagggaatagatgcgttgccacatattctagagcaattcttcctgtcccgagtagggctgtactctgtttctgtaaagaaatgcaggcttgctatttgtcagTCAtctcaatttttttattgttattcaattaatcttactggtcatctactagggcattcatatacagttaccaacatagacaactccctccatttcatattataaattaTttgactttttttagttaaattttttgagtttgaccaaatttatagaaaaaatatagtactcatgtgctaaggctgctcccgcatttacatgactagctgtaatacttctaccccctccattttatAaaaaaaataaacctaatacagaatatgacacatcataatactatatatgaatctcttactaggtttgttctgtatgagatggagggagtatgggctactttgttgctacatgacatgctaggtagattttgataggactacacttgagtggtactaccttcgtccaaaaatattgcaatctgcgataggatttgatccatcctatgacaataaatcgatttgatttatcctaaaacaacgaatctagacagtgaactagctcacctagtcttcttttctctatggatactgcacttttgagataggctgaaattttttaattttttttacttgaatcactttgacatatcttttccgagcatggagactgtaggatgaatagatgacaatatacgtactcctcttatatcaaaaggtaccgtattagttacctttaTttatcatatttgatgtacgtatacatcattgtatcagacatgATatataggtattagagctggtactctgtatgtgtattgtcttacatcaggtatcatgatataccttcagttatcatggagttattaaggtatagtaaggtcgggtaactttagttattatcatggttatcatggggtataagatatcatcaatgtgtttcatgactttttttttttgaaacaaagactaccgggacttaaccagtagttagatctttattaaatataaacaaagaaaacaaaaaggtccagaattacaatgtttgtaaccagctaagaaccgaagaaagaagaggttcattcatcctacaactatgcaggagaatctcatttctaaaattaacaaaccaaaaataatctagatattacgcaccatggtacctttaggtatcatctagatatttagtatgatgtaccttcaggtaccaggtatcgttgtaccttcAaatatgtgaaggtatcggatacattcatgcattatggaggtagtggatgccatatcatgaattataaatgtgttagataatatgacaactttaggtatcatgatatttgctggatatatcatgctactctattatagcattgatgacactacatgatattatggtcagatttcataaagataaacttatgatggtatcatcacgaTatatttaatagatcatagtatcactgaattttagtggtataatattggttggatttcataaagatgcaaggtataattgattttaatagttgtatcatgcatttgtctcaaaATaaaataatttctagtatcttaggaaaaaataatagtgatgtaggatagcagtcactggtggagaaaccatctttggtcggtcgacctaaatccacaatagtcccggttccattaaaaatcgggactaaaaacgatttttagtcccggtttataagaacagcaggactagatgatctttattcctggttggtgttaccaaccgggactaaaaatgatctttaatcccggttggtaacaccaatcgggactaaaaatcatctttagttccgattggttccatgtcagaccgtgtcaggcgccgaggatctttagtcccggtttgtaacaccaaccgggactaaagatctatctttagtcccgattggtgttactaaccgggaataaaaatcaacacgtactatataatccctattacttatcctcttctctcgtccacacgacaaactctatctttttctttctttcttcctctctaactcctgccttatctctttcttccttcctcTttttttgattgagcgagatcgagcgcgagagcgggccggcCGggcggcgcggccggtgcggtcgcGggcggcggcgtgcaggccgcgcggcggggcggcggcctgcgcggcaggggggcagcgcggcggcggcggagggcggcagcgcggagggcggcgcggcggtggctggccggcacggagagGAggcggcagcggccagccGggcggcgcctctgtggTttttttttttttgaatttgtgatttattgcatgatcctgtgatgtatttgatttctgtgcgatgtgaacttgtgatgtaTttgtgatgaattttgtagaacttgtgatgtaatttgatttgtgtgtaacttttttaggatttgcgatgtatttgatttatgtgtataagtaactttaagatttatgatgtagatttgggatgtttattttgatttggaatttggggatatgcataccacttgattcgggagaaaatAaaaaagaaaaaaaaagttgagagttgagagttgtcaaaacctagttaactagcttgctggattgagagactgacacagcgaatccatcTAatcaatctcacggcagaactctgatccaacggtgaaaaatatttcagatgacgtggaacaaccacagcacaggaaattagttttaattgcacttagtggggatgactcgtatagatatataggatatgagagatacaaatgtcgcgctctttcagtaaaaaaaagaaaaaaagggtctaaggtgggcctaatgggcttgcttcctaatctaggactgtcctggtcttattttcgttctctgaacattcaggtttgtttcagaactgatcagtctagtcagcggtcagtttatacattttattgattatctggtgatcttagaggcaatgttctagctttctaatgtatcaatgttcagggaaatccgatgcctacaaagcgaTtttggcttcttaaagttggctgtcctatggacaggcgaaattcctattaatttttcagattggaatttggtggtcaaaatgacaaatctggatgttgtgctgaactgatcttagtttgtaaagttagtgtagcaaataatggaataatcctatgccctctgtttttttgagtgtcagagtcttcattactgctacatatagggcaaatgatgtagctatgcataatcaaatgtttcctttcctgtttcttgacaaatggtaacttatatgcgaggtgctaacgaagctattaagttgttgcatcgtcttcgcaagttcacagccaccgtgcctagaggcaaaaagtaccataccggtgtacaataatgcactattgctaattgttatccttgtttaatggtgggaagggatgtgtggcgatggagtatgttatttcaatggtggatcaagcatttacggtgtttttatctatgaccatttcatacctgcatcatgcataaattcattgcctgtctcgcgaggggggctgtaggtaacttggagttattgtgctattgtgtgcATatatgcgtaaatacattaacaggaaatgactgacgatgatgctgctgtgagaattatgttttatggaccttcgttgattatatgtatttcttttattaaccaatgtacaaccggtgctctaattattacttaatgagattaactagtagggtggaccatgcaattacatgactagcaccaaaacaaaatttaaaaatatattatgatgcaaaattatctacatttgttgaacttgaaatctttaaaaattaatttagttgactcgctagctatgtttgtcatcaatggtatcgtattgtatgtatatagacatacgcgggtgctccaccatgacagagaccgccatcaccaccatcaccgccgtccactctctcacgtcggccgagattggattggggaggctagggaagaaaggggataagggttagggttttcggacccttcccctttccgtccgtcgatttcatctacgcgagaccgatccgacccgtccattagattggccctgtgtcgggcctgcgtacgctaattgggctggacatgcttgccagcgccagggcctcatgcgctcaccccgcgcatgacgggcagcgcctcgcacctcacgggccggcatgccgtttgggccactactagcctctgggccaaaaattcatttctcatttattttccccccaaaatcacttattgttttatttaattaataaataattttagtcaccttgagccatcattttaagctatAaaatttcagtaaattttgtatacgcatcttaatttatttctaactaaatggaacaaacgggaagtttagttagaatatttaatgatttttttatcatctcagcccaatagagttacgatttaggaatagtttt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CDS seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.071538 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0364400 RBH 0.703322 1.131324 0.945223
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g26240 RBH 0.299334 0.325837 0.135796
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0364400 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0016990 SBH 0.319395 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0016690 SBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0016890 SBH 1.403351 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0016350 RBH 0.043340 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0016390 RBH 0.867338 0.0 1.817355
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0253200 RBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0016560 RBH 1.524353 0.0 0.318660
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0252200 SBH 0.2386955 1.5255565 0.0538805
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0016390 SBH 0.182340 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0016360 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0016610 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0016440 SBH 0.0 0.0 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0016280 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G016650 SBH 1.331603 0.0 0.297437
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0016460 RBH 0.0 0.0 0.0
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