Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsAzu_01g0016990 OGI:01046210 | 16/16 Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:15279487-15301865
Gene Symbol RLCK35, OsRLCK35
DNA seq

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Function Wall-associated receptor kinase 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMN8]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsAzu_01g0016990 OsAzu_01g0016990.01 Chr01 15279487 15301865 - NAM
CDS seq

ATGCGCCTCCTCGTTCTCATGTGTCTGGTCATCGCGGCCGCCATGCAGATGCAGGCTGCATCAGGAGCGCCTCCCACGGCCGCCAAGCTTGCTCACTGCCTCAAATCCTGCGGGGGCGCCAACATCTCCTATCCTTACGGCGTTGGGGCCGGCTGTTTCCGCCCCGGCTTCGAGCTCACTTGCGACCATTCCACCAAACCCCCAAAGCTCCTCTTATTGGGTGTTGCCACCAACACTAACACCACCACCACCAAGATCGTGGATCAATATAGAGATGGGTATGTTCAAGCCTATGTTTCTTTCAACATAGCCACCACACCGGGTGTGCTCGGCACCTACAACAGGACATGGGAGTCCCCAGGGAGAATCCTTAGCATCGGGCCGGATTATTATGCTTTGGTGGCTGTCGGTTGCGGAATTGAGGTCTACTTGGTCGACCCTGATACGGAAGATATGCTGGGCTATTGCTTCAGCATGTGTACTGACATGGCGATGATGCACAAGGAAGCAGAGGGGAAAGCTTGCAGTGGCATGGGCTGCTGCGTCGTCACCTTCCGGAGACCTGTCCGGGCTTTCAGAGTTTCCATCACTCAGAGAGAAGCAACGCAGCCTTTCCAAGTTGCTAATGCTAGTACTATCAAGGTTTTCTTATCAGAAGAGAGTACGACCTACCATTACAATTTTACAATAGGAGATCTCCTCTCCGATGAGATAAATGAAACCACTGTTGCATCTACTTCGGCGTACCTATCAACCTTTATCGCAGACCAACCAAACTGTACAATAGCGCAGAAGGATCCTGAGCGGTATGCTTGTGGTGATAACAAATGTTTGGATGCGGATGACGAAAATGGAGGCTACCGTTGTGCATGCATCAAATATACTAATAGCAATCCCTACCTCGACGGGTATGAACCCACTCGAAACAGGCAGAATTGTTCTAGGTCATGTGGCAATATGACTATTCCTTTCCCCTTCGGGCTCCAAGAAGAATGCTCCGCAAATAGAAAATTCCTTCTGAATTGTACTTCCAAGCAAGCATTTATTGGAGGATCATACACGCAATATCAAGTGACGAATATTTCACTAGATCAAGGGCTTCTGTTTGTCAACTTTTCTCAGCACGAAGAGGCCTACTCAGAATTGGTAGAAATAAGCAGAGATAACATCTCACAGTGGGTGGAGTCCTGGATTGACGAATTCAACGATTTTGACGTCTCTCAGCATTACGGTATTTGGAAGTGGTTTGTGACCAACATGACTTGTGAAAAGGCTAAAAAATCATCTGCTTATGCCTGCATTAGCACCAACGATATTGACGAGTGCTCGATACCCAATGATTGTAAGGGAATGTGCCACAACCAAGCAGGAGGCTACAGTTGCACTCGTTGCCCTCATGGCACATCTTTCGATCCAGCCGAAAGGAAATGCACTTCCACCAAGCAACATAATATTGTCTTGGGTATTTCTCACTTTAACCGATCCCTTTTCAATAAGATCACAGTCAAGTGGAAGAGAGGCATTCAAAAGAAAATTAGAAGGGATTACTTCCATAAAAATAAAGGTTTACTATTGGAACAATTGATTTCTTGTGATGACAGTGTTGCGCATAAGACAAAGATATTTTCTTTAGATGAATTAGAGAAGGCAACAAACAATTTTGACTCAACACGGATTCTCGGTAGTGGAGGCCATGGCACTGTTTACAAGGGCATTTTATCTGACCAACGCGTAGTAGCAATAAAAAAATCCAAAATTGTGGAGCAGAGTGAGATTGATCAGTTTGTCAATGAAGTTGCTATGTTATCTCAAATCATCCATCGTAATGTGGTCAAGCTTTTTGGCTGTTGCTTAGAATCCGAGGTTCCTCTACTTGTTTATGAGTTCATATCAAATGGGACACTATATGATCTTCTCCATGGTAATTTGCAAAGCAAATGTGTATTAACATGGTGGAATCGCATCAGAATTGCCCTTGAGGCTGCAAGCGCTCTTGCCTATCTCCATTGTGCTGCCTCGGTACCAATATTTCATAGAGATGTGAAATCTGCCAATATACTTCTCGATGATAATTTCACTACAAAGGTTTCAGATTTTGGTGCTTCAAGATCTGTTTCTATTGATGAAACTCACGTGGTCACAATAGTGCAAGGTACATTTGGATACTTGGATCCTGAATATTATCATACAGGACAATTAAATGAGAAGAGTGACGTTTACAGTTTTGGTGTAATACTTATTGAGCTTATAACAAGGAAAAGGCCAATCTTCCTCAATTCAATTGGAGAAAAGCAGAACCTGTGTCATCACTTTCTTCAAAGACAGCAAAACAATACCACATCAGAAATAGTAGATGTACAGGTTTTGGAAGAAGCAGACCAGTGGGAAATTGATGAGATTGCTTCGCTTGCAGAGATATGCTTGAGGCTTAGAGGAGAACAGAGACCAAAAATGAAAGAAGTGGAGCTAAGGCTGCAACTTCTGAGGAGTAAAGTAGCAAAGAAGAAGAATAGAGTAGAAGTAAGCAGGGAAAATGAAATTGATCCATTACTGCTTTATACGCCCAGCTCTAGTTCCGTGAACCCAAGGGATTTTAATTCGGCAAGTCACAATGATGCCACTCGATGCTACACCATGGAGCAAGAATTGGTTTCTTGGACCAATTTACCTCGCTAA

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.319395 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0364400 RBH 0.703322 1.131324 0.945223
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g26210 RBH 0.000000 0.320759 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0364400 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0017030 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0016650 RBH 0.000000 0.0 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0016890 RBH 1.403351 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0016340 RBH 0.000000 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0016390 RBH 0.867338 0.0 1.817355
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0253200 RBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0016460 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0252200 SBH 0.2386955 1.5255565 0.0538805
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0016390 RBH 0.182340 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0016360 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0016610 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0016410 RBH 0.817583 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0016240 RBH 0.030456 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G016650 RBH 1.331603 0.0 0.297437
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0016460 RBH 0.0 0.0 0.0
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