Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_11g0023100 OGI:11076000 | 3/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:28005738-28018124
Gene Symbol UBP4-7, OsUBP4-7
DNA seq

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CDS seq

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Function Cell number regulator 13 [UniProtKB/Swiss-Prot:B6SJQ0]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_11g0023100 OsKeNa_11g0023100.01 Chr11 28005738 28018124 + NAM
CDS seq

atggcgctgtggggcgggctggggcagacggcgacggtggcgcagctggtcggagtggatgtcggagggctggtctccatgatcatgcacgcggcgttgacggctcggcagaacaagagggagtgcgagcagctggcccgccgcgtcttcatgatcggcgagctgctgccgcacctgcaggactcgtcggtgatgcggcggccggaggtccggcgcccgctgatgctgctcggaggcatgctccgggaggcgcacgagctcgtcgcctcctgccagggcaggagcacggtgtaccagttggtggcagccgggcggcaagctgaaaagttcagagatatccagcgtagaatcgactcctacctcctcctcttccccttcatcagccacatcgacatcactcgccgtctcgatcgaatccacagagagatgattccaagtgatcacccgaagccgacgtccctgccgtctccatctacaggctcccagaatcatgaagcggtggtcattcaagacgtggtaatccatggcggggaagctggtgagaagataaacttggcggggctcgctgtggcgacgaacaacttcgcccccgacagagagatcggtaaaggcggcttcagcacggtgtacatgactaggcttcccgacggacgggaggtggccatcaagcgcatcgacagcgcgtctatggaggaggacaccctgagagaggccaccatgctaccctcgcttcgccacgagcacatcattcgcctctttggctggcatgaagaagggaagggatggtacaagtttgatgatgagtgcgtgagacctataactgaagacagtataaagacacctgctgcttatgtgctgttctacacacgagaatga

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0667000 SBH 0.0 0.143646 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g44520 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0667000 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0023020 SBH 0.0 1.673250 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0023020 SBH 0.028885 0.0 0.072533
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0022740 SBH 0.0 0.000000 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0018470 RBH 0.0 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0022670 SBH 0.0 0.000000 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0403300 SBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0023590 SBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0422800 SBH 0.1928365 6.9440795 0.014992
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0023210 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0023340 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0022930 SBH 4.118145 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0022650 SBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0022450 SBH 0.0 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G022750 SBH 0.0 0.613823 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0023190 SBH 0.0 0.0 0.0
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