Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsKeNa_11g0018930 | OGI:11067400 | 15/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:23686873-23707645 | ||||||||
Gene Symbol | XA39, Xa39 | ||||||||||
DNA seq | atggagttcatattgggggcaacgcggcctctccttttcaagctcgggaagctgctcaaggaggagtatggcctagagaagaaggtgaggaaaggcatcgagtcactccaagatgagctggagatgatgtacagcgtcctcgacaaggtggacagtgtgccgtgggatcagcttgacgagcaagtgagggtttgggcaagcatgttgagggagctgtcctacaacatggaggatgctatcgatgccttcatggtgcgcgtggagaagggccctgagcccgctgccgaaaacaatctgaacaataaagtcacgaaattcatcaagaggattgtccgcttgttcacaaagagcaaggatctccatcagatctcccacgccatcgaagaagcacaagagctcgccaaacagtatcgcgagctacaacaaaggtacatgtctgactttagctccgtcagggacgtcgacgatggtgctacccttgatcctcgtgtgctggctctgtacaaggatgcaagagagctcgttggcatcgaacaccccaaggacgagataatcgagaagctatttaatggggatgaagagtccaagctgcaattgagaaaaatctcaatcgttgggtttcctgggctcggcaagacaactctcgccaaagcagtgtatgaaaatataaaatcacagtttgattgtgatgcttttgtttcagtttctcagactcctgacataacaagggttttcaagaagatgctctacggacttgacaagcaaaagtttgcaaatatcaatgaagcaactagagatgaagtgcaacttatcgatgaattgagaaacttccttcaagataaaaggtacacttcaccaaatcctatagctgatctattttgtttcatcagaaggtacacctcacacatattatcgatcaattaattgcaaccgtcattctccctcgtttttcttaaggtgatatgaccatcccagttcaatttgaatgtttttatggcacccaaaactttttaaaccatccattatgcactgatccaagagtcaatattctgcttacctctttggatggtaagatgctatttattttatcaacgaagtctataagtattaaactatcgattaaaatactaaaaaaagcaaacaagcaatgtgtcctcttatccattgaacttcataactaatgatacgaataagttttctagtaaaatgaaaattgttacaaaaaaattacaccattgctattgtatttttattacttttgatatgtaatcagaaagaataggtataattttacaagactcctacaaacaataatgtggatattacggtacccggtacccacggagaggcctttgggccatgcggcatagggtggaccaagagccctacgcccatgtggctatcttgtaaataaggaaatagataattccaggatattatcccgaggatcctgcatatcttttatagatggaatagggagatctagttgcaatcaactagatactttccttccttgtaactctcctccctcaacctatataagaggggtaggggtcccgagatgggggaggacggcatcttgcgccattcttcacactttgacatcagatacagatccaatctacacacaactgaactagggtattacctcacatcgagtgtctgaaccggtataaatatctgtgtcaccatctcttcttgatcttgcgcaccctataaattttcttgccgatccaagaaattaatcgacaaataatttagaccacagcccatttttagtctatagtagtcttgtggttttgggcccaaatggcccagaagtggtagtggtggccgtttagtacaactttgtgtaagtttaggatttgtagttgctggttgcaagttgcaacgaagtctgtgttacgggagagtcgatcgatcaagaccaccgaccgcgagcctgtcgcaaagagttacgtgcggccatcgatcatcccctacacctgaggctgcaatcaacagtgattggtttttctaatatattttttcaccgggtgtttctactaatatattaacgtggcatctttttaagcgtttgtaaaaaatgtttgaattagtttggtgattttttaagttttataatctatatgaatttgagagtttcaccactaatacattgttttttattcaatctttagcctgttttggatattttgttgtcgaggaattaaacggtttggcaactttatggattataagaaaactagtcaccaacccgtgcgttgcacagaatgggtttatatactgctattagtattataaatgttaaaataaatatgtcaaatttataagtaaaatattttttaatgtaagtaatgtgtaagtacataagttcctaggaaacagaattagtaattatatataatccattctaatatttattttgttaatttctaatttctaaatttaatggtctgtgatttttacgggcaagatttattattacgtaaattagacattctataatagacatatagcgagcagtaggcacaacccatattaaatgagttttaaaagtgtctgacgatatcaaaatggtgattagtttgctaaattatttttgtcatataaattttgtattgttcgacagaaacataacaaatggtaagatatgtgctaaaaattaatggtgttatctattaaagccggattgagtatgcacttatggttcggtacatcattctattgatagctaattggacaattaactagttgtatggctatttagttagttgttaacgattagcagctaactaagtataaatttttatatagataatagtatgttttgattgccttcgtcgctagtcaaaatatcatatatttatatccttttactgagtgagttctaaacttttttgttgtaatgttgacaacataatatgtttaatatctctaaaattaaataattgagaaaatataaatttgtgtgcatgtcaggaacatgatcttcctcctcacgtcctcagcataccgacaaacgttatttatccctttattatttgtgcatatagcttactacaggcgtgtacccattgaggattcagaggaactatcttcctagctaggcagtaagcgtgtagtccgcgagtgattacgactgagtgctcgcttggtccgatcaagagtccatatccatgttgaaaaaatcttcgattacgaataatttttaaaatatttgtctttgaaatatggtgatatgtatagattagtctaaaaaaaatacttcaataaatcatatatttgttaacacatgcatacatattataataaaaaatagtggtcaaaattatttttttaagaccgtacccttataaaaaacgacaagtattaccaacccggaaagagtatctatttacatatctgacatttgtccatatagagtccaaatatgacatatattcaatcaatctcaaccgttaaaacttgcatttgccacgatcaaacgacataaatatttcttttttctttgattaatgtgagaatttttagcctcaacagtgaacgtggtttattcttttaaggctgttttaataatataataatagatttctagatttttttccctgttcatcggaaggtttacatatgatggctaggagctctttagaggttgtttggtggatctttattataaactaggaaggtagcccgcgcattcgcgcgggcatgcgtcgtacgctaagtatgcgacatttataagagcgaaatattaaccggagatcaactgccacgatttcttcataaattgttttcactggtattagttgcttatataattttctaacctattacttttatgttatatcatatttaaataatatctataagcaattatttataatcttcttcatcatttgaaaaacaatataatctcattttctttagaaaatatgtcaacgaaagtaaaagtaatgtgtttttcttttctttaattgcatatattatcatggtttattagaggatgaattgggtgggacatgaggcttcactaaatgtatgggtttatatagcctaatatgattgatgcagtttgagaggtgatccatccatgaacatttttatttagagtgggtcagaggctccacacaacctaacatgaatatgataatgacgaaatatagttgcgcagtaatatttttgaaatgtgatgtcccatgaatacacgcttgtttactatacaacatagatctaacggttagaaataataatagttccaccagtttaaaatgaatagtagtattccaaaaatgtagcttgaaaattatggttgttttaatatccaatattattgcgaagtgagtgtagctcaactggttatgttccttgtgatggaacatgcccactcggattcaaggcttagacttgacacggatgctcgcatttacggctagttattccttcaatgttgacatatccgttggcagcgagacgctcgtggtgattttgttgatctcaaaatatgtcggcccagtctttaggagatattcataggggtaggatgtgcgtgtgtgtttataggggcgagtgtgcttgtgttgtgagtgcctgcgattgtatggtgtttcttaaacaaatacccaatattatagattgtttatcgctgtgtgttttcataagggtgagtgtgcgcgcattcagagcgcacgcgttgtatagtctttcttaaaaaacgaatattattgaattgtttctcttttagtttaatagctaaaaaatagggaggggacggaccatgttttgtgcatgtgagggtggggaggaagtggaggagattttattcttctactttttctatattatttaagtgaaatccaaaattctttccctttttataggaggtgacacatggcgacttaagattttcttaaaagtagatctaatagttaaaaataatggatacaccaatttaattggattgttttagaattttagtatatgatatacaattagttatgagcgttctggagagcttttttgatttttgttatgtacaataatgatttagtacaacgtgttacatattttcaattattttttcgttgttgtttaattggcatgcaaacgattgtgtctaccttcaaatgatgcatttttaattttgtatagtaaaatatagctaatgcgatcttgatttatttatttagttataaaataaaacaatagctatgactattattatatcatgttagttaaaacaaaatagaatatgggataattgagctggagaggagagcatgggagagtcatagagggagtggatatgacaagattattgtttttcaagatagatcgaatggatcctataaatacaatttatcttacagctattagaaatactttggatattgtattttctaattaaactacttaaatttttctaatttaagtacatgttattaatcagaaggtttaaaaatctatttgattttttcttaaaaatatatggatgagtgaacaatatatatgtcccaaagtaatgaatatctataataatattagctatatgattttaataatatatgtcccaaacttggatcttcaatcttaaaatatattataataagtaatctaatggattgtaccaataaaaaaattagctatatgatttagataatacaattgtttaaaatttgttatcataaaatattttttccatctatctaaaagacgaaaataggagagaaatgaaataggtgtggaggtatgcacgcacgtacgtactggacggccggggatgagatatgcaagccttttttttgtccttttcttcttggctaaataaatatagtgacaaaaaataattggtaaaaatatatatattccacctttctaaaagaggaaaataggatagaaaggacataggtggtattcctttttttacttggacaaataatttaatagtagaaaacaatgggtcagccgtatattacagaaaatcgacagctaaatgttttgtttattctcaaaatttttgtgatttctctagtttattaaaatgtcatgcggcaacttaggagcatttgtaggagtgctacgtggtgtcctaagtacgtttataggatgtttaatggactattaatatataatagacgatattaagaggaagcgggctaatataaaggtataaaataacggatccataaatttaaatatagtgctacgtgagattatactgtactacgtgatggcctaagatcgcttatgaaagcaccacgtaactatatttgtagctaaagtaataaattttattttttatagtatagaagatcctatttaaaaaggaccgtatatttttttccgatggtacgtacatatattttccttcagggctttatagcattttttatcgtgcgttcaccgtacatacgtacgcatgttcctttgtatttttccatccaagtgaacagttatcaaTGttttttttctctataggtttttttttatcgtacacacgtacgttctttgtttcttttttaataaacagtacctgaagattcatatacgtatgtaagtactttcatacatatacgcatataagtatttccatcgtaagtaactattttcatgtatataagtatttccggtaaattcctcagatatagaaagcataaactttttaaatagatttgatccaatggtgtaaaataatgggtccaccaatttaaataaaaatcgatggtgggattgtagaatgccacatggcggcctaggagcacttgtagaagcgccacatggcggcttaggagcgtttataggatgtttaatggacttttagtatataatagatagataatagactagatgatgcccatgctttgctgcgggatatatggatgaatatcatacgaatatatgttgaatgtcgtagaaattatgaatagaattggtttgggttgaaatattatgaaaaataatgcgaagagtcgtaatttagcatgcttgtatgttaaggtttaggcgatgtagtaaatttaccatgcttccacatgttgagtcttaggtgcttagtgggttgctatgacatacttgtatggtagcctttaagatgtactaataattattatgcatgtgtgttgagctttagatattttgtgggttgtagatatatagatggttttgtattgattaaactaaaaagagggtagtgcacgccagtgatgaatttaatccccacattgagcaaactgttgatgattgttcatgacatgctagatcctcaatgctagtaagtttcttggttcgacacaaatatattgtggatcatctctctaatccattcactttctatgaccatatggataggtatttgataattgtcgatgacatatggcagaaatcaatatgggaacggattaaatgtgctttggttgatagtaattgtggaagtagagtgatcacgacaactcgtattcataatgttgccaaagaagttggtgatgtttaccccatggagaaactttctgatgaaaactcaaagagactattcgacaaaagagtgcttggtactgaatacagaagtgtgtccagtaatcaatcggaggaggtgactaaaaaaatactaaagaaatgtgatggtgtaccattgtcagtaattacaatagctagtgtgttggttcataaagatgactggtccgaggtctatgattcagttggtttcgggcctgaagatgggaatgaagttgttcacaacacaaagaagatactttcatttagctactatgatctaccttcgtacctacaacgttgtctattgtacctaagcatctatccagaagatgattcaatagagaaggattgtttgatttggaaatggatagccgaaggttttgtctatgagaaacaagggaagcagttatttgaggttggagagacatacttcaatgagcttataaatagaagcatggtacagcctatagaaggccagatcaacctcggcaccgtggaaggctgccgcatcaatgacacgatgttgtatctcatccgcgacctatcaatggaagtagactttgtaaaaatattggatagagcatgtgaggagcatgattattgtttgcagagcagtactatccacaggatagcggtacatcatggaatgagacaagatcaaaacaataacatagccttgcgcatggcacggttgaggtcattaaatgccattgggtgtcctattagcatgctgccccctgttgagagcttccaggctctacgcgttctagcaatagaatattgcgatgtcagcacaaggggatgccaattgaagtagtatcttggaaagttatgtcagttgaggtacctaggactgagatacacacctgttgttgagcttccaagggaaataggagaccttgtgcaccttcaaacactggatattagagatactggcttggaggaactgccagcgaccgttggcaagcttagcaaactgatgcgcctttgcaccggtgaagatacaaggcttcctttcggtgttgggaacatgacatccctccaagagttgtcgctgtttactctaactgcagactgctgcccaaacttcagtgtggagctgcgcaagctaacgaacctgagggtgctttatattcttgtggttggtaatataaacagtagctcgctaaagactttggtggagtctttttgcagtttgcgcagaatccagcagctggaattgtatttctcttcacatctggggataaccagcttggaaggctgggagcccccgttgcagcttcgcattttctctattgctggcgtcagtatcgctcggctgcctgcatgggggagctgcaagcacatctccaatctgtgctttactgtgctggagttggaaacatgggacctggagatccttgctaatatgtcggagctccactctctcgccatttacatcgtggggagattttcatggaccatcgctggtggcggactgttccccagcctaagagacttcgtcacggacataacagtcacctttctagagggagcgatgccgatgctcactgagatttacctcaagctacaggtgtcaaagggtgatgccgccaaacacgttggcttggggaacctcctgcagctcaatacggtcactattgacctcgagtgcaggggtgcaacaagaagggaggtgaaggaagcggaggtggcggtgagacgcatggtcgacggccaccccaactgtccccgcattcatatcaacaaagaagaagaagtatgattggtttcctttatcatgattaattaatggactatcttattatcctatcggagttctcagttttgatttctttgtcaggctttatttgttagttcaccattttttagttcgttaatggataataaccctttgtcaatttgaaattcaggatctgatggaagcagacgaagatgatggtgatgatgaggagatgtcagattcggatgaagccgagagcgatgatgatgaggaggaagagatttcagatacggatgaagaggtacatcgtttgcctgcagcgtgcaaatatatctcaatcctggctgcgtaactaatttactagctactggtttcattcccgtatacagcctgatagtggcacgagcaaagggcagaagaggctgcgcaccagtagtccacaaactctctctacacaagtgcaggtatacatagcaaaagctgcacccctaatagtaatatagtaatcgtcttgaaaacaatgttcctactttgattatgcaaatttttcaaaaggaagagtttgttttgttagttatgaataattgttgattgggtagttaaatccagctaagaaacgtccagtggtttttcggctagcttcacaaggtggtgagctagacgatctgaattcgaagcatcactccttctaattatttgagattagattcttccctaatattcgtattttttaagttaaatccagcgattgaaatttcagttagaaatctcggacccctagccacaagcaactaccttgcccaaattattttggatttcagtctttttattaatttagtcaagatttcttaaatttgaaataatttcgtccaaaagaacaccgaaaggcctaaaattcacgaaaactcggtgaccaccataattacggaaattttggtggcttttgaaagtgtgagccttggttcattccaccacacaacctcgaagttcaggttcatttcgaagatccataactaatcatcttccttttcatttagcctttaattttcattcctcaattcatatccttctctcaactgtaattctagcatctgaggaatgaagacgaagatgatgagatgatgtcagctaacgaagttgacggaaatgatcatgacgagaacatttcagctacggaccaagaggtacatcacctgtgccgcagtgtgcaaataatacacccgaacctgaacctggttgcataactaattaactagctactggccgtttcttcagcagtgtcagcaggacgacggtgcagccaaagtggaagaggctaggcgacattcttgaaaccaactctgttttgcactcgttcgtttatgcaatcaggtatcagaaagctaaatctacacacatttatatcatcttgatcaaaacatcattcgaacatgatcgttgtatatatgtgaaatttgatttccaggtctaattaatggagcaccggaaacaacagcaggagaagaatttcagactcgatatcgttctttggtggcagcctcctctttggctgtatgaagaatatcagaaggaacggcagccctgagctcctgaacagcagcgactgttcgatgtgtgttctagtttttttttttttttttctttgtcatatctcgaggatttgtatggattgtgctatgcgcatcgatgaggcccaatcataggcccagacaaaaatgctgaaaaattaagacgctatcctgtcacatatgtgacataatagtattgcctgtgcttgctatccgttttttggttgttcccctgtttatcgttcatttctgttgatgtctcaaatgtacatgctctgttttagtctgtttttcacacgggtatccttttaaatatctgcacctcatgtacccttttgcgatttttttctaagcgaataatccttgagcttgtggtgaagtaaagcacactgaacgattgtggttggctgttggagcttttgggcctatttggttgagtgccacgcttagccaaacttgtggcaatcaagtttgaccaaccaaagcttaatgccataaatgagttatgccctactttttttactaagctgccttatcatagaattacttttctgccgtagcttgtcacaactgtgaccaacaaattcttagtcaaacagtgtgtcatgccacgctttgtcaaatatattatggcaaagtatacagccgcccaaacaaccccaaatttgtcacttgtcagttattccaaacatttcatatttaaaaaggagggagttggttatgtgcggcgtcgtcgtcatgctgaccgttggtcaatagtcaagtcaacactcatgaagtttctttcaagaggaggctttgcatgattgcatctgggtgtacctgtatttctatctcctttgttcctcctcatgcctcactccaaactcaatcattcgacgcattgttgatcttgagtgagtaatccatggtggctccacccacctgagtaacaagctctcttgaccgccagcagcctcatgcaaatttgctggcaactttagaaagctataaatgactttaaatttcagggcattttcaaggaacccttttaggtgtgctacatggcggatgcgatggctaattcttatatgcatgttctatcgcagccaaacttgcaggatcaagagcagttagagccagagcgcagaagaatggacagcattcccaatggaaacatgtgctttgtagatgctgcttgggagaatggaatcactggaataggaattttctttcatctcccccttaatcataatgctattttcgttaaatccacttctaagaaatctcaatctgcccttcaagctgaactgttagctctccaattagctttggaatttcccaatttcttcacattgcagggaccacttttctgacggataactccaccattgctgatactgcaaaaaggagaaattttctagaggagccaggtcactggagtttaaggcctttgtggacccaaattatctcttccacttcaattgatcttatacaggttcgatggattctaagagaagttaacaagatggccgacaaattagggaaggaagccaagtccagtactaggaggaacttaatccaaaactgccaaaacattgagcattctgcttatcctcagagaagctgttatgctagacttctgaatgataacttcagatcacttaactgtatgatcaactatgtactctgtttttaagctctaataatattccctggtttcaaaaaaaaaaaaaaacagcctcgtgcaagaacccggctgcctcccttactttcctaaacacccagccatggagcctcctcggaccccttcttgagccaagctgccaagagcaaagcaagaacaagagcttaattggttctttgcttcttttcttctttggcaagtccagctgcattcaattcaagggtaaccatccctctactttgcaagtgtagtttacaggtgatcactttttctattctgagttgttaggcatttgcaatgtagggatggtcatattataggtgtgttctgtgagactagtagttacaaacaatggcacaatcatcttttctttttctgtatttggaagaacatctgaaacatttatagacagtttcctctttgatagtttcagcagtttcaacatttgttcagttttataattgtaggctcttatttctgtgtaaacaagacacaaccagctctcatAaaaaaaattcacattcttaaatatccataaaggctacacttagggtccttgactaaaaaaatgagattgaatcaaaataagatgtatgcacactggtgtattcatatgcatttttagggcccgtttatttcccaaaattttttttccaaaaacatcacatcgaatctttggacacatgcatgaagcattaaatatagataaaatgaaaaactaattgcacagttatggaggaaatcacgagacgaatcttttaagcctaattagtacgtgattagccataagtgctacagtaacacacatgtgctaataacggtttaattagtctcaaaagattcgtctcgcggtttccaggcgagttctgaaattagttttttcattcgtatctgaaaaccctttccgacatccggtcaaacattcgatgtgacatccaaaaatttccttttccccaactaaacacacccttatttttgcaaggttaagcagtggcagtgaacagacatatcatcgttcttagtaaaaaaaaatagaaggaaatggaggcagcaatcataaatgggtacacgtgctagtgctagaacattgtgatgtcaacggaggcttaggtgttgtttggatccagggacttaactttagtccctgtatttagacattaatttagagtattaaatatagactatttacgaaacaaattacataaatgaaacctaattcgcttaacaatttttttaagcctaattaatctataattagagaatgtttactgtagcatcacataggctaatcatggattaattaggctcaatagattcgtctcacgaattagtccaagattatggatgggttttattaatagtctacgtttaatatttataattaatttttaaacatccgatgtgatagggacttaaaagttttagtcccatcaaaacagggtcttacatttaaagcatctcggagagctgtatcagttgaggtacctagtattgagatccataaatgttgttgagctcccaagggaaataggggacctcaagcagctacaggcattggatgtcctatacacgtacttgaaggaactgccagcgaccgtcagcaagctgatgtgtgaatcgaggaacgagattgccggcgggggttgggaatatgaggtcactgcaggagctacaactggactgggaacccatcgatgcgtacaaaaccctcgccatggatgtaggcaattcaagctaacggagctgaggatgctcgagatttctgtagatatggagattgacgagggcattgggaagacactaccgaagtctctgtgcgacttgcacaaaatccagagccaagtgataaactcctcctctgcaagcaagatgaccagacgaacatagctctcgcatttcttccgggagcgatgcgatgctcaacaggcttgtattctggctgcggctctctgaagatggtgccgccagtgacattggcttggggaacctcgctctgctcagttacgtcgagaggttaacctcaactgcagaggtgtgacgggcaggcaggtggcagaagcaaatttaggtggcattgaggcaggtggagcgtactcaccccaacagtcccgccattcgtgtactgttacaaggatgatgaatcgcttgaaaaatgaacaaagcgattcatggtgcaaaggtacgtgtggtttttgtttgttaatcatgattaatcgattgattggtcgattctgttcccctacacgtacgccttcgtagttcagaatctgtaactaattaatcagctttgttctcagttagcgtattactccctccgtcccaaaatagtaatttagagtacttacaaaactaattacataaatgagagctatttcgcgtgataaattttttaagcctaattaatccataattagcacatgtttactgtaacatcacataggctaatcatgaattaattaggctcaagagattcgtctcgcgaattagtccaggattatggaatgggttttgtcaatagtctacgtttaatacttctaattagtgtataaacatccaatgtgacatgaactaaaatgttttagttccatccaaaccctccctaaatgaaggagtttttccctactttgtacttccgctgaactcaaatataggtcgttttagaattgggtataagaaataagaaaactatgaaataaaataactttgttgtctttcaattgtattgcattgggaaagataggctaatcatgattgcttaattacatgtcttgttcaatccgtttgttcttgtgaaataaattgacatctggttgcttaattacatgtctcccctttgtaatgctataccatgcatcctcgtgtaccaagcagtttacccttgtactacaacagaacgcagtgaaaaatacagactagtagtaaatcctttatctccaaggaaattcgaaatccaaaaccgaatcaagaaactatatagatggtggcgggacgcagccatcatggcatctgaatcttgagaaccagcaccgaagcagtaaaccatgctgtgctgcctgcccagggtgagaacttagtgccctgacgacgtaggatttagctaaatctcgttaaaaaatattatggctcggtgtagtcatcaaatttggatcttttatggcattcttccgcgtttggtaattaatgtcatttttggggcttgttttataacacccactaaggttcagatggtgctcacaaatatattatctcttgtgtatacgataagtggagtttcaataaaaattaagattagggacatatcgatggcttccatctgtgctgcatatgtgtttgctgcgtaatcagaaaaaaaatatacaataaagtcactcacatgctcaactcatcacataaaagtcccttgatgcagataatcgagtgttacttatgtgagactcgtgaaatagttctatgaaacccgtgaataatgtccattcagaatcatctaataatgcggccaataaggacattgattaaaggaatctttgtgaccccccacattggcccctaattaaagaaaaacaattgcaataactaccaccagctctattaattaatctcctcttctcttctcccttctctcctattctaccagggagctttattcattcactctgagccggctcatcagtgccgaaagtgttgtgccggttgggaaccgacacagatgaggaattctaactggcacagatggagctttgtgtaccagtgacctgcaagttatccccgccatcaccactctctctagctaccccaaccagcaactgcctgtgcatgaagcccaccgccgccgccgttccctcatttccctagactttaaggtgcccagccatccctgttgaacagcaagcagaggatacacacaccagagtacttgaaagggatgcaagtgggcaagcccactacccatataaaaacccgcttgcgagttcagttttcatatgatagtataaaatttagaagaaaatatgaactagaagtgggataaccggcaaaaaaaaaatccagcttacccacctgacttgcatccctagtacatgatacctgtaattgcgcttccggcttctctctttaatagtttcagcagtctcaacatttattcagtgctatggctatatgttttttttttatttcttttaaatttaccccttatctgtgaacatgatatggctggctcttatgccaaaattttggattcttaaatcttaatgaaggatgcacgtttctacaagacaaactccatcaacctctaactcatgtgtttcatatgttttccattttaccagggcttgttgggatatcaaatgatgaagctatgggatttgtgatgcggttattgcaaatagagattgtaaaagcagctcactgttatagttaacatcatctcatcatcgttttatttggaaaatcaacaaacggagagaggggcacactgaaccattcgaaatggagttcaccacaggggcattgggcatgctacttcccaagttaggcaagctcctcaaggaagagtatgacctgcaaaagagtgtaaaggagggaatcatattcctgaagaccgagcttgagagcatacaagcagccctagagaaggtctcaaaggtgcagctagaccagctagacaagcaaatcaagatatgggctagagacgtgagggagttgtcctacgacattgaggacaacatcgatatctttatgttgcatatcaatgacattgagccaaataagaaatataacttcacatggttaattgataagtgccagaagtcattgtccaaggtaaagatccgccataaaatagccaatgacatcaaagatatcaagcgccaagtcatggaggtgatggaacggcacaaaagatacatgattgatgatattgcaactaagcttccaacaactattgaccctcgcatattgacattatatgagaaggtcaccaagcttgttggcattgataaggcaagtaatgatctaataaagatgttgtctgtggggaacggggtgtccgagaccatgctcaaaatggtctctgttgtcggatttggaggattgggcaagataactcttgccaaagtagtgttcgacaagcttaaagtgcaatttgattgttttggttttattccggttggacagaaccccgacatcaagaaagttctcaaggacatcttaattgaagttaataaggacaggtatatggtacttgatgtatcaacgcaaagtgaaaggcatataattgatgaactccgagaatatattggaaatagaaggtatttatgcagtaccaccaaattagttgttcttcatgacaatcgatcttatgctgatgggagttttattagctactagctgaaaagtattttataagtttctagttgcagtagtttgtacattaagtaaatctgtattggtcttatgtagacatttatccatatgcccttacttttaatgcattttatatattataaatggtagatgtatatgtttaaatgatgtggagataatgatttaacattgcttgcatattgagttctaaaaatatatcaaaattggaaatgatatgtcatatttgcatgatatttaaaatactctatgtaataattgctagtgggtgatgatgtggcacacttgcatgtcgggctttaggacttagtgggcatcaactttatagtaagataggattagagtctcctttaaaaacctttagcttctagcgttacatgagagaaacataaaatgcaaagaattctagtgtttattgcagaggaagagaagatatattttaccatctaacatccaactcgatccaaaatgtactgatgattcataaacttctagagtaataaaatgataattcacatatacatatttgttttaggcactcaaattgactcaatttgagactgaaaaaatgatatttaactagtgatttattccccatattgagcaacttgtgttgacgattgtttatgccactttggatccttgatactcatatgtcttagttacagagatatacactatattgttttactaatccgttccccttttattccattgtggataggtacttgattgttgtcgatgacatatgggagacatcaacatggaatattattaaatgtgcttttctagataataattgtggaagtagagtgattgcaacaactcgtatttctaatgttgctagtgaaattacagaagaatttggtgatgtttacagcatggcgccactttctaatgataactcgaaaaagttgttctatagcagaatatctcttgccgattgcaacagccctactaataatcagttggttgagggaactgaaaagatcttaaagaaatgtggcggcgtaccactttctataattacaatggctagtttattagttcataaaccaatggaggattggtccgaagtgtatgaatctattggttttggggttgcagatcaaaatgaggtagttcagaatacgaggaagatattgtcttttagctactacgatttgccttcacacctaaagacttgtatgcttcacctaagcatatatccagaagatagtttgattgagaaggatggtttgatatggaagtgggtagctgaaggttttgtccatgaggaacaagggaagacgttatttgaggtcggtgagagatacttcatgcagcttataaataaaagcatgattcaaccaatggagagatacggtattgtgaacgggtgtcgtgtccatgacatggtgctagatctcattcgcatcctggcaaccaaagaaaactttgtaaagatattggacagggtacatgtggatcccagctcttcttcacaaagctacacagtccgtaggatagcattgcacaagagatggaaccaagaaagactagacgccagcatgacacgactgaggtcattcaatgccatggagtgttctattagtgtgatgccctcacttattagctttcgagttctacgtgtgctagcactggaaagatgtaatgtcacaggaggatgttgcctcaagcatcttggaaagctgcttcatttgaggtaccttggacttaggtacacacgtgttgctgaaatcccaagcgaaataggtgatctcgtacacctgcaggtactggatgtcctggacacctggttggtgacactaccggccaccattggaaacctaacaaggctaatgcgcctatacatcaacattagaagaagagctcttaccagtgttgggagcctgacgtcactgcaagatctgtctctcggtactgtatccgatgacagctgcccaaacttcattgcagaggtgtgcaaattgacggatctgaggaggattaagattaattggtccaagaaaacagacgagggctcgctagaggcactggtggagtccttgcgcatcctacaccagttacagaacctggagatctggttccctatcccactgcaggtagagtacccagtgatgagcggctgggaaggttgggagcctgcgcggcaactccggcaattctgcatacacaacgtggacctgcctcggctgctggcatgggtgaactccatgcgtgtcccgcacctcacccacctggaccttcgagttgtaggcatggaggcacgagacctggacgtccttgcaatgatgccggcactttgcttcctccgcatagacgtcaaggagagattttcgtggacagccggtggcggcggatcattcccaaacctgagatactgcgacacgaacatagaactcaccttccttcaaggagcgatgcccatgcttctggatgttgttttgatcgtgcgcggatctagggatgatcctgctaacaatgttggcttggggaacctcccactgctcaagaaagtccttattcggctcaattgcgaaggtgagacggccaagcaggttgaagaagtggtggcatgggagcatgccgtccatgctcaccccaaccgtccagtcatttctgtgcaccgatttggggaggtatgattggtttccttaaccatcattaattgattggttagttaatttctagtacagggccttctcaactgtgatttccctctcaaaagtcgctaactaataagcttctttctcagttagccttttatattcctcaatttgtacctgtctcttaatttcaattttcagttcttgatgaaaaaagatgatggtgatgacgaggaggagattttagctacgtatgaagttgatggaagtgatcatgaggaggagatttcagctaccgaccaacaggtattagagcaggtacaatagctagcaggct
More
|
||||||||||
CDS seq | atggagttcatattgggggcaacgcggcctctccttttcaagctcgggaagctgctcaaggaggagtatggcctagagaagaaggtgaggaaaggcatcgagtcactccaagatgagctggagatgatgtacagcgtcctcgacaaggtggacagtgtgccgtgggatcagcttgacgagcaagtgagggtttgggcaagcatgttgagggagctgtcctacaacatggaggatgctatcgatgccttcatggtgcgcgtggagaagggccctgagcccgctgccgaaaacaatctgaacaataaagtcacgaaattcatcaagaggattgtccgcttgttcacaaagagcaaggatctccatcagatctcccacgccatcgaagaagcacaagagctcgccaaacagtatcgcgagctacaacaaaggtacatgtctgactttagctccgtcagggacgtcgacgatggtgctacccttgatcctcgtgtgctggctctgtacaaggatgcaagagagctcgttggcatcgaacaccccaaggacgagataatcgagaagctatttaatggggatgaagagtccaagctgcaattgagaaaaatctcaatcgttgggtttcctgggctcggcaagacaactctcgccaaagcagtgtatgaaaatataaaatcacagtttgattgtgatgcttttgtttcagtttctcagactcctgacataacaagggttttcaagaagatgctctacggacttgacaagcaaaagtttgcaaatatcaatgaagcaactagagatgaagtgcaacttatcgatgaattgagaaacttccttcaagataaaaggtatttgataattgtcgatgacatatggcagaaatcaatatgggaacggattaaatgtgctttggttgatagtaattgtggaagtagagtgatcacgacaactcgtattcataatgttgccaaagaagttggtgatgtttaccccatggagaaactttctgatgaaaactcaaagagactattcgacaaaagagtgcttggtactgaatacagaagtgtgtccagtaatcaatcggaggaggtgactaaaaaaatactaaagaaatgtgatggtgtaccattgtcagtaattacaatagctagtgtgttggttcataaagatgactggtccgaggtctatgattcagttggtttcgggcctgaagatgggaatgaagttgttcacaacacaaagaagatactttcatttagctactatgatctaccttcgtacctacaacgttgtctattgtacctaagcatctatccagaagatgattcaatagagaaggattgtttgatttggaaatggatagccgaaggttttgtctatgagaaacaagggaagcagttatttgaggttggagagacatacttcaatgagcttataaatagaagcatggtacagcctatagaaggccagatcaacctcggcaccgtggaaggctgccgcatcaatgacacgatgttgtatctcatccgcgacctatcaatggaagtagactttgtaaaaatattggatagagcatgtgaggagcatgattattgtttgcagagcagtactatccacaggatagcggtacatcatggaatgagacaagatcaaaacaataacatagccttgcgcatggcacggttgaggtcattaaatgccattgggtgtcctattagcatgctgccccctgttgagagcttccaggctctacgcgttctagcaatagaatattgcgatttgaggtacctaggactgagatacacacctgttgttgagcttccaagggaaataggagaccttgtgcaccttcaaacactggatattagagatactggcttggaggaactgccagcgaccgttggcaagcttagcaaactgatgcgcctttgcaccggtgaagatacaaggcttcctttcggtgttgggaacatgacatccctccaagagttgtcgctgtttactctaactgcagactgctgcccaaacttcagtgtggagctgcgcaagctaacgaacctgagggtgctttatattcttgtggttggtaatataaacagtagctcgctaaagactttggtggagtctttttgcagtttgcgcagaatccagcagctggaattgtatttctcttcacatctggggataaccagcttggaaggctgggagcccccgttgcagcttcgcattttctctattgctggcgtcagtatcgctcggctgcctgcatgggggagctgcaagcacatctccaatctgtgctttactgtgctggagttggaaacatgggacctggagatccttgctaatatgtcggagctccactctctcgccatttacatcgtggggagattttcatggaccatcgctggtggcggactgttccccagcctaagagacttcgtcacggacataacagtcacctttctagagggagcgatgccgatgctcactgagatttacctcaagctacaggtgtcaaagggtgatgccgccaaacacgttggcttggggaacctcctgcagctcaatacggtcactattgacctcgagtgcaggggtgcaacaagaagggaggtgaaggaagcggaggtggcggtgagacgcatggtcgacggccaccccaactgtccccgcattcatatcaacaaagaagaagaactacaggcattggatgtcctatacacgtacttgaaggaactgccagcgaccgtcagcaagctgatgtgtgaatcgaggaacgagattgccggcgggggttgggaatatgaggtcactgcaggagctacaactggactgggaacccatcgatgcgtacaaaaccctcgccatggatgtaggcaattcaagctaacggagctgaggatgctcgagatttctgtagatatggagattgacgagggcattgggaagacactaccgaagcttgtattctggctgcggctctctgaagatggtgccgccagtgacattggcttggggaacctcgctctgctcagttacgtcgagaggttaacctcaactgcagagttaacatcatctcatcatcgttttatttggaaaatcaacaaacggagagaggggcacactgaaccattcgaaatggagttcaccacaggggcattgggcatgctacttcccaagttaggcaagctcctcaaggaagagtatgacctgcaaaagagtgtaaaggagggaatcatattcctgaagaccgagcttgagagcatacaagcagccctagagaaggtctcaaaggtgcagctagaccagctagacaagcaaatcaagatatgggctagagacgtgagggagttgtcctacgacattgaggacaacatcgatatctttatgttgcatatcaatgacattgagccaaataagaaatataacttcacatggttaattgataagtgccagaagtcattgtccaaggtaaagatccgccataaaatagccaatgacatcaaagatatcaagcgccaagtcatggaggtgatggaacggcacaaaagatacatgattgatgatattgcaactaagcttccaacaactattgaccctcgcatattgacattatatgagaaggtcaccaagcttgttggcattgataaggcaagtaatgatctaataaagatgttgtctgtggggaacggggtgtccgagaccatgctcaaaatggtctctgttgtcggatttggaggattgggcaagataactcttgccaaagtagtgttcgacaagcttaaagtgcaatttgattgttttggttttattccggttggacagaaccccgacatcaagaaagttctcaaggacatcttaattgaagttaataaggacaggtatatggtacttgatgtatcaacgcaaagtgaaaggcatataattgatgaactccgagaatatattggaaatagaaggtacttgattgttgtcgatgacatatgggagacatcaacatggaatattattaaatgtgcttttctagataataattgtggaagtagagtgattgcaacaactcgtatttctaatgttgctagtgaaattacagaagaatttggtgatgtttacagcatggcgccactttctaatgataactcgaaaaagttgttctatagcagaatatctcttgccgattgcaacagccctactaataatcagttggttgagggaactgaaaagatcttaaagaaatgtggcggcgtaccactttctataattacaatggctagtttattagttcataaaccaatggaggattggtccgaagtgtatgaatctattggttttggggttgcagatcaaaatgaggtagttcagaatacgaggaagatattgtcttttagctactacgatttgccttcacacctaaagacttgtatgcttcacctaagcatatatccagaagatagtttgattgagaaggatggtttgatatggaagtgggtagctgaaggttttgtccatgaggaacaagggaagacgttatttgaggtcggtgagagatacttcatgcagcttataaataaaagcatgattcaaccaatggagagatacggtattgtgaacgggtgtcgtgtccatgacatggtgctagatctcattcgcatcctggcaaccaaagaaaactttgtaaagatattggacagggtacatgtggatcccagctcttcttcacaaagctacacagtccgtaggatagcattgcacaagagatggaaccaagaaagactagacgccagcatgacacgactgaggtcattcaatgccatggagtgttctattagtgtgatgccctcacttattagctttcgagttctacgtgtgctagcactggaaagatgtaatgtcacaggaggatgttgcctcaagcatcttggaaagctgcttcatttgaggtaccttggacttaggtacacacgtgttgctgaaatcccaagcgaaataggtgatctcgtacacctgcaggtactggatgtcctggacacctggttggtgacactaccggccaccattggaaacctaacaaggctaatgcgcctatacatcaacattagaagaagagctcttaccagtgttgggagcctgacgtcactgcaagatctgtctctcggtactgtatccgatgacagctgcccaaacttcattgcagaggtgtgcaaattgacggatctgaggaggattaagattaattggtccaagaaaacagacgagggctcgctagaggcactggtggagtccttgcgcatcctacaccagttacagaacctggagatctggttccctatcccactgcaggtagagtacccagtgatgagcggctgggaaggttgggagcctgcgcggcaactccggcaattctgcatacacaacgtggacctgcctcggctgctggcatgggtgaactccatgcgtgtcccgcacctcacccacctggaccttcgagttgtaggcatggaggcacgagacctggacgtccttgcaatgatgccggcactttgcttcctccgcatagacgtcaaggagagattttcgtggacagccggtggcggcggatcattcccaaacctgagatactgcgacacgaacatagaactcaccttccttcaaggagcgatgcccatgcttctggatgttgttttgatcgtgcgcggatctagggatgatcctgctaacaatgttggcttggggaacctcccactgctcaagaaagtccttattcggctcaattgcgaaggtgagacggccaagcaggttgaagaagtggtggcatgggagcatgccgtccatgctcaccccaaccgtccagtcatttctgtgcaccgatttggggagttcttgatgaaaaaagatgatggtgatgacgaggaggagattttagctacgtatgaagttgatggaagtgatcatgaggaggagatttcagctaccgaccaacaggtattagagcaggtacaatag
More
|
||||||||||
Protein seq | MEFILGATRPLLFKLGKLLKEEYGLEKKVRKGIESLQDELEMMYSVLDKVDSVPWDQLDEQVRVWASMLRELSYNMEDAIDAFMVRVEKGPEPAAENNLNNKVTKFIKRIVRLFTKSKDLHQISHAIEEAQELAKQYRELQQRYMSDFSSVRDVDDGATLDPRVLALYKDARELVGIEHPKDEIIEKLFNGDEESKLQLRKISIVGFPGLGKTTLAKAVYENIKSQFDCDAFVSVSQTPDITRVFKKMLYGLDKQKFANINEATRDEVQLIDELRNFLQDKRYLIIVDDIWQKSIWERIKCALVDSNCGSRVITTTRIHNVAKEVGDVYPMEKLSDENSKRLFDKRVLGTEYRSVSSNQSEEVTKKILKKCDGVPLSVITIASVLVHKDDWSEVYDSVGFGPEDGNEVVHNTKKILSFSYYDLPSYLQRCLLYLSIYPEDDSIEKDCLIWKWIAEGFVYEKQGKQLFEVGETYFNELINRSMVQPIEGQINLGTVEGCRINDTMLYLIRDLSMEVDFVKILDRACEEHDYCLQSSTIHRIAVHHGMRQDQNNNIALRMARLRSLNAIGCPISMLPPVESFQALRVLAIEYCDLRYLGLRYTPVVELPREIGDLVHLQTLDIRDTGLEELPATVGKLSKLMRLCTGEDTRLPFGVGNMTSLQELSLFTLTADCCPNFSVELRKLTNLRVLYILVVGNINSSSLKTLVESFCSLRRIQQLELYFSSHLGITSLEGWEPPLQLRIFSIAGVSIARLPAWGSCKHISNLCFTVLELETWDLEILANMSELHSLAIYIVGRFSWTIAGGGLFPSLRDFVTDITVTFLEGAMPMLTEIYLKLQVSKGDAAKHVGLGNLLQLNTVTIDLECRGATRREVKEAEVAVRRMVDGHPNCPRIHINKEEELQALDVLYTYLKELPATVSKLMCESRNEIAGGGWEYEVTAGATTGLGTHRCVQNPRHGCRQFKLTELRMLEISVDMEIDEGIGKTLPKLVFWLRLSEDGAASDIGLGNLALLSYVERLTSTAELTSSHHRFIWKINKRREGHTEPFEMEFTTGALGMLLPKLGKLLKEEYDLQKSVKEGIIFLKTELESIQAALEKVSKVQLDQLDKQIKIWARDVRELSYDIEDNIDIFMLHINDIEPNKKYNFTWLIDKCQKSLSKVKIRHKIANDIKDIKRQVMEVMERHKRYMIDDIATKLPTTIDPRILTLYEKVTKLVGIDKASNDLIKMLSVGNGVSETMLKMVSVVGFGGLGKITLAKVVFDKLKVQFDCFGFIPVGQNPDIKKVLKDILIEVNKDRYMVLDVSTQSERHIIDELREYIGNRRYLIVVDDIWETSTWNIIKCAFLDNNCGSRVIATTRISNVASEITEEFGDVYSMAPLSNDNSKKLFYSRISLADCNSPTNNQLVEGTEKILKKCGGVPLSIITMASLLVHKPMEDWSEVYESIGFGVADQNEVVQNTRKILSFSYYDLPSHLKTCMLHLSIYPEDSLIEKDGLIWKWVAEGFVHEEQGKTLFEVGERYFMQLINKSMIQPMERYGIVNGCRVHDMVLDLIRILATKENFVKILDRVHVDPSSSSQSYTVRRIALHKRWNQERLDASMTRLRSFNAMECSISVMPSLISFRVLRVLALERCNVTGGCCLKHLGKLLHLRYLGLRYTRVAEIPSEIGDLVHLQVLDVLDTWLVTLPATIGNLTRLMRLYINIRRRALTSVGSLTSLQDLSLGTVSDDSCPNFIAEVCKLTDLRRIKINWSKKTDEGSLEALVESLRILHQLQNLEIWFPIPLQVEYPVMSGWEGWEPARQLRQFCIHNVDLPRLLAWVNSMRVPHLTHLDLRVVGMEARDLDVLAMMPALCFLRIDVKERFSWTAGGGGSFPNLRYCDTNIELTFLQGAMPMLLDVVLIVRGSRDDPANNVGLGNLPLLKKVLIRLNCEGETAKQVEEVVAWEHAVHAHPNRPVISVHRFGEFLMKKDDGDDEEEILATYEVDGSDHEEEISATDQQVLEQVQ |
||||||||||
Function | Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R8L1] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKeNa_11g0018930 | OsKeNa_11g0018930.01 | Chr11 | 23686873 | 23707645 | + | NAM | ||
CDS seq | atggagttcatattgggggcaacgcggcctctccttttcaagctcgggaagctgctcaaggaggagtatggcctagagaagaaggtgaggaaaggcatcgagtcactccaagatgagctggagatgatgtacagcgtcctcgacaaggtggacagtgtgccgtgggatcagcttgacgagcaagtgagggtttgggcaagcatgttgagggagctgtcctacaacatggaggatgctatcgatgccttcatggtgcgcgtggagaagggccctgagcccgctgccgaaaacaatctgaacaataaagtcacgaaattcatcaagaggattgtccgcttgttcacaaagagcaaggatctccatcagatctcccacgccatcgaagaagcacaagagctcgccaaacagtatcgcgagctacaacaaaggtacatgtctgactttagctccgtcagggacgtcgacgatggtgctacccttgatcctcgtgtgctggctctgtacaaggatgcaagagagctcgttggcatcgaacaccccaaggacgagataatcgagaagctatttaatggggatgaagagtccaagctgcaattgagaaaaatctcaatcgttgggtttcctgggctcggcaagacaactctcgccaaagcagtgtatgaaaatataaaatcacagtttgattgtgatgcttttgtttcagtttctcagactcctgacataacaagggttttcaagaagatgctctacggacttgacaagcaaaagtttgcaaatatcaatgaagcaactagagatgaagtgcaacttatcgatgaattgagaaacttccttcaagataaaaggtatttgataattgtcgatgacatatggcagaaatcaatatgggaacggattaaatgtgctttggttgatagtaattgtggaagtagagtgatcacgacaactcgtattcataatgttgccaaagaagttggtgatgtttaccccatggagaaactttctgatgaaaactcaaagagactattcgacaaaagagtgcttggtactgaatacagaagtgtgtccagtaatcaatcggaggaggtgactaaaaaaatactaaagaaatgtgatggtgtaccattgtcagtaattacaatagctagtgtgttggttcataaagatgactggtccgaggtctatgattcagttggtttcgggcctgaagatgggaatgaagttgttcacaacacaaagaagatactttcatttagctactatgatctaccttcgtacctacaacgttgtctattgtacctaagcatctatccagaagatgattcaatagagaaggattgtttgatttggaaatggatagccgaaggttttgtctatgagaaacaagggaagcagttatttgaggttggagagacatacttcaatgagcttataaatagaagcatggtacagcctatagaaggccagatcaacctcggcaccgtggaaggctgccgcatcaatgacacgatgttgtatctcatccgcgacctatcaatggaagtagactttgtaaaaatattggatagagcatgtgaggagcatgattattgtttgcagagcagtactatccacaggatagcggtacatcatggaatgagacaagatcaaaacaataacatagccttgcgcatggcacggttgaggtcattaaatgccattgggtgtcctattagcatgctgccccctgttgagagcttccaggctctacgcgttctagcaatagaatattgcgatttgaggtacctaggactgagatacacacctgttgttgagcttccaagggaaataggagaccttgtgcaccttcaaacactggatattagagatactggcttggaggaactgccagcgaccgttggcaagcttagcaaactgatgcgcctttgcaccggtgaagatacaaggcttcctttcggtgttgggaacatgacatccctccaagagttgtcgctgtttactctaactgcagactgctgcccaaacttcagtgtggagctgcgcaagctaacgaacctgagggtgctttatattcttgtggttggtaatataaacagtagctcgctaaagactttggtggagtctttttgcagtttgcgcagaatccagcagctggaattgtatttctcttcacatctggggataaccagcttggaaggctgggagcccccgttgcagcttcgcattttctctattgctggcgtcagtatcgctcggctgcctgcatgggggagctgcaagcacatctccaatctgtgctttactgtgctggagttggaaacatgggacctggagatccttgctaatatgtcggagctccactctctcgccatttacatcgtggggagattttcatggaccatcgctggtggcggactgttccccagcctaagagacttcgtcacggacataacagtcacctttctagagggagcgatgccgatgctcactgagatttacctcaagctacaggtgtcaaagggtgatgccgccaaacacgttggcttggggaacctcctgcagctcaatacggtcactattgacctcgagtgcaggggtgcaacaagaagggaggtgaaggaagcggaggtggcggtgagacgcatggtcgacggccaccccaactgtccccgcattcatatcaacaaagaagaagaactacaggcattggatgtcctatacacgtacttgaaggaactgccagcgaccgtcagcaagctgatgtgtgaatcgaggaacgagattgccggcgggggttgggaatatgaggtcactgcaggagctacaactggactgggaacccatcgatgcgtacaaaaccctcgccatggatgtaggcaattcaagctaacggagctgaggatgctcgagatttctgtagatatggagattgacgagggcattgggaagacactaccgaagcttgtattctggctgcggctctctgaagatggtgccgccagtgacattggcttggggaacctcgctctgctcagttacgtcgagaggttaacctcaactgcagagttaacatcatctcatcatcgttttatttggaaaatcaacaaacggagagaggggcacactgaaccattcgaaatggagttcaccacaggggcattgggcatgctacttcccaagttaggcaagctcctcaaggaagagtatgacctgcaaaagagtgtaaaggagggaatcatattcctgaagaccgagcttgagagcatacaagcagccctagagaaggtctcaaaggtgcagctagaccagctagacaagcaaatcaagatatgggctagagacgtgagggagttgtcctacgacattgaggacaacatcgatatctttatgttgcatatcaatgacattgagccaaataagaaatataacttcacatggttaattgataagtgccagaagtcattgtccaaggtaaagatccgccataaaatagccaatgacatcaaagatatcaagcgccaagtcatggaggtgatggaacggcacaaaagatacatgattgatgatattgcaactaagcttccaacaactattgaccctcgcatattgacattatatgagaaggtcaccaagcttgttggcattgataaggcaagtaatgatctaataaagatgttgtctgtggggaacggggtgtccgagaccatgctcaaaatggtctctgttgtcggatttggaggattgggcaagataactcttgccaaagtagtgttcgacaagcttaaagtgcaatttgattgttttggttttattccggttggacagaaccccgacatcaagaaagttctcaaggacatcttaattgaagttaataaggacaggtatatggtacttgatgtatcaacgcaaagtgaaaggcatataattgatgaactccgagaatatattggaaatagaaggtacttgattgttgtcgatgacatatgggagacatcaacatggaatattattaaatgtgcttttctagataataattgtggaagtagagtgattgcaacaactcgtatttctaatgttgctagtgaaattacagaagaatttggtgatgtttacagcatggcgccactttctaatgataactcgaaaaagttgttctatagcagaatatctcttgccgattgcaacagccctactaataatcagttggttgagggaactgaaaagatcttaaagaaatgtggcggcgtaccactttctataattacaatggctagtttattagttcataaaccaatggaggattggtccgaagtgtatgaatctattggttttggggttgcagatcaaaatgaggtagttcagaatacgaggaagatattgtcttttagctactacgatttgccttcacacctaaagacttgtatgcttcacctaagcatatatccagaagatagtttgattgagaaggatggtttgatatggaagtgggtagctgaaggttttgtccatgaggaacaagggaagacgttatttgaggtcggtgagagatacttcatgcagcttataaataaaagcatgattcaaccaatggagagatacggtattgtgaacgggtgtcgtgtccatgacatggtgctagatctcattcgcatcctggcaaccaaagaaaactttgtaaagatattggacagggtacatgtggatcccagctcttcttcacaaagctacacagtccgtaggatagcattgcacaagagatggaaccaagaaagactagacgccagcatgacacgactgaggtcattcaatgccatggagtgttctattagtgtgatgccctcacttattagctttcgagttctacgtgtgctagcactggaaagatgtaatgtcacaggaggatgttgcctcaagcatcttggaaagctgcttcatttgaggtaccttggacttaggtacacacgtgttgctgaaatcccaagcgaaataggtgatctcgtacacctgcaggtactggatgtcctggacacctggttggtgacactaccggccaccattggaaacctaacaaggctaatgcgcctatacatcaacattagaagaagagctcttaccagtgttgggagcctgacgtcactgcaagatctgtctctcggtactgtatccgatgacagctgcccaaacttcattgcagaggtgtgcaaattgacggatctgaggaggattaagattaattggtccaagaaaacagacgagggctcgctagaggcactggtggagtccttgcgcatcctacaccagttacagaacctggagatctggttccctatcccactgcaggtagagtacccagtgatgagcggctgggaaggttgggagcctgcgcggcaactccggcaattctgcatacacaacgtggacctgcctcggctgctggcatgggtgaactccatgcgtgtcccgcacctcacccacctggaccttcgagttgtaggcatggaggcacgagacctggacgtccttgcaatgatgccggcactttgcttcctccgcatagacgtcaaggagagattttcgtggacagccggtggcggcggatcattcccaaacctgagatactgcgacacgaacatagaactcaccttccttcaaggagcgatgcccatgcttctggatgttgttttgatcgtgcgcggatctagggatgatcctgctaacaatgttggcttggggaacctcccactgctcaagaaagtccttattcggctcaattgcgaaggtgagacggccaagcaggttgaagaagtggtggcatgggagcatgccgtccatgctcaccccaaccgtccagtcatttctgtgcaccgatttggggagttcttgatgaaaaaagatgatggtgatgacgaggaggagattttagctacgtatgaagttgatggaagtgatcatgaggaggagatttcagctaccgaccaacaggtattagagcaggtacaatag
More
|
|||||||
Protein seq | MEFILGATRPLLFKLGKLLKEEYGLEKKVRKGIESLQDELEMMYSVLDKVDSVPWDQLDEQVRVWASMLRELSYNMEDAIDAFMVRVEKGPEPAAENNLNNKVTKFIKRIVRLFTKSKDLHQISHAIEEAQELAKQYRELQQRYMSDFSSVRDVDDGATLDPRVLALYKDARELVGIEHPKDEIIEKLFNGDEESKLQLRKISIVGFPGLGKTTLAKAVYENIKSQFDCDAFVSVSQTPDITRVFKKMLYGLDKQKFANINEATRDEVQLIDELRNFLQDKRYLIIVDDIWQKSIWERIKCALVDSNCGSRVITTTRIHNVAKEVGDVYPMEKLSDENSKRLFDKRVLGTEYRSVSSNQSEEVTKKILKKCDGVPLSVITIASVLVHKDDWSEVYDSVGFGPEDGNEVVHNTKKILSFSYYDLPSYLQRCLLYLSIYPEDDSIEKDCLIWKWIAEGFVYEKQGKQLFEVGETYFNELINRSMVQPIEGQINLGTVEGCRINDTMLYLIRDLSMEVDFVKILDRACEEHDYCLQSSTIHRIAVHHGMRQDQNNNIALRMARLRSLNAIGCPISMLPPVESFQALRVLAIEYCDLRYLGLRYTPVVELPREIGDLVHLQTLDIRDTGLEELPATVGKLSKLMRLCTGEDTRLPFGVGNMTSLQELSLFTLTADCCPNFSVELRKLTNLRVLYILVVGNINSSSLKTLVESFCSLRRIQQLELYFSSHLGITSLEGWEPPLQLRIFSIAGVSIARLPAWGSCKHISNLCFTVLELETWDLEILANMSELHSLAIYIVGRFSWTIAGGGLFPSLRDFVTDITVTFLEGAMPMLTEIYLKLQVSKGDAAKHVGLGNLLQLNTVTIDLECRGATRREVKEAEVAVRRMVDGHPNCPRIHINKEEELQALDVLYTYLKELPATVSKLMCESRNEIAGGGWEYEVTAGATTGLGTHRCVQNPRHGCRQFKLTELRMLEISVDMEIDEGIGKTLPKLVFWLRLSEDGAASDIGLGNLALLSYVERLTSTAELTSSHHRFIWKINKRREGHTEPFEMEFTTGALGMLLPKLGKLLKEEYDLQKSVKEGIIFLKTELESIQAALEKVSKVQLDQLDKQIKIWARDVRELSYDIEDNIDIFMLHINDIEPNKKYNFTWLIDKCQKSLSKVKIRHKIANDIKDIKRQVMEVMERHKRYMIDDIATKLPTTIDPRILTLYEKVTKLVGIDKASNDLIKMLSVGNGVSETMLKMVSVVGFGGLGKITLAKVVFDKLKVQFDCFGFIPVGQNPDIKKVLKDILIEVNKDRYMVLDVSTQSERHIIDELREYIGNRRYLIVVDDIWETSTWNIIKCAFLDNNCGSRVIATTRISNVASEITEEFGDVYSMAPLSNDNSKKLFYSRISLADCNSPTNNQLVEGTEKILKKCGGVPLSIITMASLLVHKPMEDWSEVYESIGFGVADQNEVVQNTRKILSFSYYDLPSHLKTCMLHLSIYPEDSLIEKDGLIWKWVAEGFVHEEQGKTLFEVGERYFMQLINKSMIQPMERYGIVNGCRVHDMVLDLIRILATKENFVKILDRVHVDPSSSSQSYTVRRIALHKRWNQERLDASMTRLRSFNAMECSISVMPSLISFRVLRVLALERCNVTGGCCLKHLGKLLHLRYLGLRYTRVAEIPSEIGDLVHLQVLDVLDTWLVTLPATIGNLTRLMRLYINIRRRALTSVGSLTSLQDLSLGTVSDDSCPNFIAEVCKLTDLRRIKINWSKKTDEGSLEALVESLRILHQLQNLEIWFPIPLQVEYPVMSGWEGWEPARQLRQFCIHNVDLPRLLAWVNSMRVPHLTHLDLRVVGMEARDLDVLAMMPALCFLRIDVKERFSWTAGGGGSFPNLRYCDTNIELTFLQGAMPMLLDVVLIVRGSRDDPANNVGLGNLPLLKKVLIRLNCEGETAKQVEEVVAWEHAVHAHPNRPVISVHRFGEFLMKKDDGDDEEEILATYEVDGSDHEEEISATDQQVLEQVQ
More
|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.895418 | 0.0 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0590400 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g37850 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0590400 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0018830 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0018720 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0018460 | RBH | 0.0 | 0.124873 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0018750 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0344300 | RBH | 0 | 2.21536 | 0.0045615 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0019310 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0357400 | RBH | 0.014978 | 13.5441255 | 0.0063985 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0019110 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0019250 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0018750 | SBH | 0.0 | 4.188165 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0018450 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0018610 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G018770 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0019010 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |