Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_06g0020440 OGI:06063770 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr06:23272475-23276455
Gene Symbol RLCK213, OsRLCK213
DNA seq

tcaaacacgaagagctgaaaatgcttctttgattgtcatgacttcagcgtaaacatcttgcattgctgggcgatcttttggtgtctccatggagcatgagataccaagcttagcaagttgcatgacacaacccagcattccagtcgtcaaatgatttccagggtcaaaattattctcagcatcttcttcaaaatttgggattacattgggatctagaatctcgctaatcttatgagagaaaaatgagctttccacatatttgtgaatgttcagaccattagtaaacatctcatctgttggtcgctttccagtgagcatttctaaaataattattccataactatagacatcaccttctattgagactttacatccatagccatactctgcaacattgaatgtaattgttcaaacaagtatctatttatgctgaagaaactataaaacaaatcatcgtttttacaagaggtaaaattataatttgaatacgagatttttgaaaggccatattgtttgctcatactatctagccaatcgtcttgagtaattctttgatgtagtacagtgtagtaaaatgcatggagttttaatactggaattgaaaatgtcaaatttgaaaaatttattttctaactaaaggggataatattttatttttatcagttaatgcccttattttgagatctgccctactgtatatataatgctagtttatgcacttctcttctctactttttttttcttgaactaccaatatttagtatatttataagccaaagaagtaaaatctatattccttaataatcagaatccaccaaatgaagaccaatctttatttatattagtaaaatatctaccatatttcaccttttcatttagcatatgtgacacattgtaatcaaaattttgacataatggaagaaaagggaaaaaaatgtcacctggggcaatgtatccaattgatcctcttggtcctgctaagcttgtagagctattaaacattgaagaattgttactttgtagaaatttagctaacccgaaatcaccaagacgtgcatccatgacatcatccaaaaggatgttgttgggcttcaagtcacagtggaccataggtggaatgcaatagttatgcagataatccaatgcagaagctatgtccacagctatttttattctataccccaaacttagtggtttttccaaaccatatttgttcacttttggatatagccagctctccaggctaccattagccatatattcaagaataagagctttaaactcacgtcctgttggatcatatgttgagcatgcagtaatcacccgaacaagatttcgatgacgagtgttcctcaaagcttcacactcggcaaggaagctcttaggtgctccaacttgatcaagcttgaaaactttgatagcaactagctgctcctcaaactcaaacctacctttatacactgatccatattttccagaaccaactaagttggctaaggctaaaccattagttgctttgactatatcagcatatgtaaacttcttcaactccttgcaggaaggatcaaatgcttgcttgactttattcctcttcttcaatagaatgagtgctaaacatgaagttagagccagacaaatagctataggccctactatcttaagtattttagtagtgtgctttccctttgatgcctttacattgcagagtggtaactgtagtgatggatatctaccacataacttcttgttcccttggacaaaaacctcacttacattctgaaatatccctccagttggtaccggtccctcaaaatcattgaaggataaattgagaagcttcatggagccaaaggattccataaattctggtattttaccagatagattgttttgagaaagatctaactcaacaatgcctcttaaatttatgaaagaatcaggaattcgtccatcaagaaggttcccttccatacgtagatagcttaagtggatgcaatcgccaagagtggagggaatttgtccgagcaatcggttattggaaatatttagaatatcaagattgatcaagccaccaatctctggtggtatttctccattcagttggttgtgggacaagtccaaccattcagaaagagaggaaagagtaacgagttcctttggtatgccaccatcaaagctattaaaagagaggtttaaagcttctagattcttgcaatgccctaaggaactaggaattggtccactcaaaatattttcctgtaaatagagctcgcttaagtgacttagattaccaactgaaagtggaatttgtccggagagtttgttttgggataagcttaggacaaacaagtttggcagatttccaagtgaatctgggagatctccggtaagcagattttgccccatatgtaaaactgcaaggtttgtgaggtggtctatctcttgtggtatggtaccagatatttcatttcctgttagcatcaattcttctaagctatttgaaagtcttgcaattgaacttggcaaggttcctttaaggttgttcttatctagggctaaactaaccagttggctacaagatgtcaatgaggataagaaagaccagtcccctgcttctagtttattcatcccaagattcagttcgatcaagttatacaggttcccaaaagaaggaacaataccatggaatgcattgtcacgaagatcaatcactttgagatttgttgcgttgcctagtgaagttggaatttggccttggaatttatttccttgcagaaccagtttttcgatacttggaagggtatatcctatggtagatggtatttccccaatgaggttattcctgcccatgccaaggtatgagagtgtggacatgttgtacaaagaagctggaactgttcctgacaagttgttataagtcaagtccaattgttgcaagtttggcattctgcttaaacttgatggaatggttccttggaagttgttttgtgcaagtacaagttgttgaagggaggaaaagttttctatagaggatggtatgctgcctgaaagattgttttgggacagacaaagactcactagtggtgaggagatatttgtgataagtgggatagacccaacaaatttgttaactccaagcattatggattgaagtgatgaattattaaaaagggcaaaggggatctcccctccaagttgattgtttgttaaatcaagtactacgagtgatgagctgttcgctaaaagatgtgggatgcctccagtgaggctgttatttgtgagaatgacaaaattaagaaatgagttgcttccaagtgtcaaaggaatattgccagttaggtggttatttgaaagatacaaaaccgaaagtttggagagtatacctaacccttctgggatgattccgtgtagtttgttgtcaaacaggtagatgccttgcagatttgaacatttgctcaggcttgaggggatatcaccgtcaagagagttgtttgagagatcaatgatttcaaggttagagcataaagacagagtatctggtatagcaccagtgaggccattagaggtaaggtttaagtaggtgaggcgatgcagataaccaaattcggctgggatgttgccagacaaccgattaaatggaaggtggactactgttaggaaagtaagattaccaatgcaacgtggaatttgtccgtggaggttgaatgactctagatccagttcagtgacgcgagatgtgtggctcttgctacaagtgacaccgggccattgacaatattgcgaagaatcatttctccaggaagccatggctccggcattgtctgagaggtggagcttgaggcaaagcagagactgaaaatcggtatccgatgcattttggagtgctgcagtgggaactagggaagatgcagtgcagaggaagcatgccaacacgatggcctcaagaacaagggaatcgagagagccaacaggaggcgacat

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CDS seq

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Protein seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_06g0020440 OsKeNa_06g0020440.01 Chr06 23272475 23276455 - NAM
CDS seq

atgtcgcctcctgttggctctctcgattcccttgttcttgaggccatcgtgttggcatgcttcctctgcactgcatcttccctagttcccactgcagcactccaaaatgcatcggataccgattttcagtctctgctttgcctcaagctccacctctcagacaatgccggagccatggcttcctggagaaatgattcttcgcaatattgtcaatggcccggtgtcacttgtagcaagagccacacatctcgcgtcactgaactggatctagagtcattcaacctccacggacaaattccacgttgcattggtaatcttactttcctaacagtagtccaccttccatttaatcggttgtctggcaacatcccagccgaatttggttatctgcatcgcctcacctacttaaaccttacctctaatggcctcactggtgctataccagatactctgtctttatgctctaaccttgaaatcattgatctctcaaacaactctcttgacggtgatatcccctcaagcctgagcaaatgttcaaatctgcaaggcatctacctgtttgacaacaaactacacggaatcatcccagaagggttaggtatactctccaaactttcggttttgtatctttcaaataaccacctaactggcaatattcctttgacacttggaagcaactcatttcttaattttgtcattctcacaaataacagcctcactggaggcatcccacatcttttagcgaacagctcatcactcgtagtacttgatttaacaaacaatcaacttggaggggagatcccctttgccctttttaataattcatcacttcaatccataatgcttggagttaacaaatttgttgggtctatcccacttatcacaaatatctcctcaccactagtgagtctttgtctgtcccaaaacaatctttcaggcagcataccatcctctatagaaaacttttcctcccttcaacaacttgtacttgcacaaaacaacttccaaggaaccattccatcaagtttaagcagaatgccaaacttgcaacaattggacttgacttataacaacttgtcaggaacagttccagcttctttgtacaacatgtccacactctcataccttggcatgggcaggaataacctcattggggaaataccatctaccataggatatacccttccaagtatcgaaaaactggttctgcaaggaaataaattccaaggccaaattccaacttcactaggcaacgcaacaaatctcaaagtgattgatcttcgtgacaatgcattccatggtattgttccttcttttgggaacctgtataacttgatcgaactgaatcttgggatgaataaactagaagcaggggactggtctttcttatcctcattgacatcttgtagccaactggttagtttagccctagataagaacaaccttaaaggaaccttgccaagttcaattgcaagactttcaaatagcttagaagaattgatgctaacaggaaatgaaatatctggtaccataccacaagagatagaccacctcacaaaccttgcagttttacatatggggcaaaatctgcttaccggagatctcccagattcacttggaaatctgccaaacttgtttgtcctaagcttatcccaaaacaaactctccggacaaattccactttcagttggtaatctaagtcacttaagcgagctctatttacaggaaaatattttgagtggaccaattcctagttccttagggcattgcaagaatctagaagctttaaacctctcttttaatagctttgatggtggcataccaaaggaactcgttactctttcctctctttctgaatggttggacttgtcccacaaccaactgaatggagaaataccaccagagattggtggcttgatcaatcttgatattctaaatatttccaataaccgattgctcggacaaattccctccactcttggcgattgcatccacttaagctatctacgtatggaagggaaccttcttgatggacgaattcctgattctttcataaatttaagaggcattgttgagttagatctttctcaaaacaatctatctggtaaaataccagaatttatggaatcctttggctccatgaagcttctcaatttatccttcaatgattttgagggaccggtaccaactggagggatatttcagaatgtaagtgaggtttttgtccaagggaacaagaagttatgtggtagatatccatcactacagttaccactctgcaatgtaaaggcatcaaagggaaagcacactactaaaatacttaagatagtagggcctatagctatttgtctggctctaacttcatgtttagcactcattctattgaagaagaggaataaagtcaagcaagcatttgatccttcctgcaaggagttgaagaagtttacatatgctgatatagtcaaagcaactaatggtttagccttagccaacttagttggttctggaaaatatggatcagtgtataaaggtaggtttgagtttgaggagcagctagttgctatcaaagttttcaagcttgatcaagttggagcacctaagagcttccttgccgagtgtgaagctttgaggaacactcgtcatcgaaatcttgttcgggtgattactgcatgctcaacatatgatccaacaggacgtgagtttaaagctcttattcttgaatatatggctaatggtagcctggagagctggctatatccaaaagtgaacaaatatggtttggaaaaaccactaagtttggggtatagaataaaaatagctgtggacatagcttctgcattggattatctgcataactattgcattccacctatggtccactgtgacttgaagcccaacaacatccttttggatgatgtcatggatgcacgtcttggtgatttcgggttagctaaatttctacaaagtaacaattcttcaatgtttaatagctctacaagcttagcaggaccaagaggatcaattggatacattgccccagagtatggctatggatgtaaagtctcaatagaaggtgatgtctatagttatggaataattattttagaaatgctcactggaaagcgaccaacagatgagatgtttactaatggtctgaacattcacaaatatgtggaaagctcatttttctctcataagattagcgagattctagatcccaatgtaatcccaaattttgaagaagatgctgagaataattttgaccctggaaatcatttgacgactggaatgctgggttgtgtcatgcaacttgctaagcttggtatctcatgctccatggagacaccaaaagatcgcccagcaatgcaagatgtttacgctgaagtcatgacaatcaaagaagcattttcagctcttcgtgtttga

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.106719 0.929215 0.629178

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0587900 SBH 0.422553 0.000000 0.260348
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g38830 SBH 0.260518 0.066984 0.061100
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0587900 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0020650 RBH 0.146591 0.757532 0.647906
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0008980 SBH 0.000000 0.0 0.188468
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0020560 RBH 0.551134 0.650744 0.193256
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0020330 SBH 0.041708 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0020980 SBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0361000 RBH 0.9463535 1.501984 0.4159195
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0020420 SBH 0.0 0.162646 0.125249
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0343000 SBH 0.56284 0.471313 0.0964065
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0020590 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0020630 RBH 0.000000 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0020240 RBH 0.000000 5.529106 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_06g0021190 SBH 0.0 0.000000 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0020390 RBH 0.034462 1.618995 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G020300 RBH 0.024920 0.839867 0.152815
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0020550 RBH 4.865308 20.772602 21.573544
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