Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_06g0020330 OGI:06063770 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr06:23671529-23675495
Gene Symbol RLCK213, OsRLCK213
DNA seq

tcaaacacgaagagctgaaaatgcttcttttattgtgatgacttcagcgtaaacatcttggattgctgggcgatcttttggtgtctccatggagcatgagataccaagcttagcaagttgcatgatgcagctcaacattccactcatgacatgattttcagggtcttcaaaatttgggattatattggggtctataatctcgccaatcttgtgagagaaaaatgtgttttccacatatttgcgaatgttcagaccattactgaacatctgatctgttggtgtctttcccgtgatcatttctaggataattattccatagctatagacatcgccttctactgagattttgcttccatagccatactctgcaacattgaatgtaattgttcaaacaagtatctatttgtgctgaaaaaaattataaaaaaaatcatcatttttacaataggtataattttagtttgaatatgagattttcgaaaggtcatattgtttgttcatacttttgatagccaatcgtcttgagtaatttcatgatgtagtacagtatagtaaaatgcatagagttataacactggaattgcaaatgtcaaatttgatgattctatgttcctactaaatgggataatattttgtttttatcagttaatgcacttattttaagatctgccctactgtctaatgcaagtttatgcacttctcttctctattttttttcctgaactaccaagtctagtatatttataagccaaagaagtaaaatctatattccttaataatcagagtccaccaaatgaagaccaatctttatttatattagtataatatctaccatatttaaccttttcatttagcatatgtgaaacattgtaataaaatttttgacataatggaagaaaaggaaaaaaaaaatgtcacctggagcaatgtatccaattgatcctcttggtcctgctaggcttgtagagctattaaactttgaagaactgttactttgtagaaatttagctaacccgaaatcaccaagacgtgcacccatgacatcatccaaaaggatgttgttgggcttcaagtcacagtggaccataggtggaatgcaatagttatgcaaataatccaatgcagaagcaatgtccacagctatttttattctataccccaaacttagtggtttttccaaaccatatttattcacttttggatatagccagctctccaggctaccattagccatatattcaagaataagagctttgaactcacttcctcttggatcacatgttgagcatgcagtaatcacccgaacaagatttcgatgacgagtgttcctcaaagcttcacactcggcaaggaagctcttaggtgctccaacttgatcgagcttgaaaactttgatagcaactggctgctcctcaaactcaaatctacctttatacactgatccatattttccagaaccaactaagttggctaaggcaaaaccattagttgctttgactagatcagcatatgtgaacttcttcaactccttacaggaaggatcagatgcttgcttgactttattcctcttcttcagtagaacgagtactaaacatgaagttagagccagacaaatagctataagtcctactatcttaagtattttagtagcgtgttttccctttgatggctttacattgcagagtggtaactgtagcaatggatatctaccacataacttcttgttcccttggataaaaactgcacttgcattctgaaatatcccttcagttggtaccggtccttcaaaatcattgaaggacaaattgagaagcttcatggacccaaaggattccatgaattcaggtattttaccagatagattgttctgagaaagatctaactcaacaatgcctcttaaatttatgaaagaatcaggaattcgtccatcaagtaggttcccttccatacggagagagcttaagtggacacagtcaccaagagcagagggaatttgtcctgacagtcggttattggaaatatttagaatatcaagattgatcgagccaccaatctctgatggtatttctccatcgagttggttgtgagataagtccaaccattcagaaagagaggaaagagtaatgagttcctttggtatgctactatcaaagctgttacaagacaggtttaaagcttctagattcttgcaactccctaaggaactaggaatcggtccgctcaaattattttcctgtaagtagagctcacttaggtgacttagattaccaattgaaggtggaatttgtcctgaaattttgttttgggataagcttaggataaacaagtttggcagatttccaagtgaatctggaagatttccagtaagtagatttttttccatataaagaagcgtaaggcttgtgagtttctgtatctcttgaggtatggtaccggatatttcatttcctgttagcagcaacacttgtaagcttgttgaaagttttgcgatggaacttggtagggttcctttgaggatgtttttgtccaggcataattgaaccaactgtctgctagttatcaatgaggataagaaagaccagtctccagcttctagtcgattcattccaagattcaattccatcaagtccggcaggttcccaaaagaaggaataataccatgcaatgcattgtcacgaaggttaatcacttggagattttttgcaatgcctagtgaagtgggaatctggccttggaattgatttccttgcaaaatcagtgttttgatatttggaagggtatatcctatgttatctggaatttctccaatgagtttattaatgcccatgccaaggtatacgagattagacatgttgtacagagaagccggaactgtccctgacaagttgttatatgtcaagtccagttctcgcaagtttggtattctgcttaaactggatggaatggtaccctggaagttgttctgtgaaaggtagagtatttcaagggaggagaggttttctatagaggaaggtatgctacctgagagattgttttgggataagctgagataccacagtggtgaggagatatttgagattggtgggatagacccaacaaagttattaactgcaaggcttatgagattaagtgacgagctattaaaaagagcaaaaggaatctcgccgccaagacgattattagttaaatcaagcaatatgagtgatgaactattggctaggagaggtgggatgcctccagtgaggctgttatttgtgagaatgaccacattcagaaaagagttacttccaagtgagagaggaatattgccgcttaggttgttatttgaaagatacaaaaccgaaaggttggagagtgtacctagcccttctggaatgactcctttaagtttgttgtcgtacaagcagataatttgaaggtttgagcatttgttcaagcttgaggggatctcaccatcaattgagttatttgagagatcaatgatttgaaggttagagcatgaagacagagcctctggtatcgtgccagtgaggccattagaggtgaggttcaggtaggtgaggcgacgcaaatgaccaatttcaggtggaatgttgccagtcaactgattaaatggaaggtggattattgtcaagaaagtaagattaccaatgcaaggtggtatttggccatggaggttggatgactctaggttcaattcagtgactcgagatgtgtggctcttgctacaagtgacaccgggccattgacagtattgcgaagaatcatttctccaggaagccatgactccggcattgtcattgagatggagcttgaggcaaagcagagcctgaaaatcggtagtatctgatgcatcatggagtggtgcagtgggaactagggagaatgcagtgatgagaaagcatgagaagcatgccaataagattgtgaccagaacagggatgctgtgggagcccaaaggcgccat

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CDS seq

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Protein seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_06g0020330 OsARC_06g0020330.01 Chr06 23671529 23675495 - NAM
CDS seq

atggcgcctttgggctcccacagcatccctgttctggtcacaatcttattggcatgcttctcatgctttctcatcactgcattctccctagttcccactgcaccactccatgatgcatcagatactaccgattttcaggctctgctttgcctcaagctccatctcaatgacaatgccggagtcatggcttcctggagaaatgattcttcgcaatactgtcaatggcccggtgtcacttgtagcaagagccacacatctcgagtcactgaattgaacctagagtcatccaacctccatggccaaataccaccttgcattggtaatcttactttcttgacaataatccaccttccatttaatcagttgactggcaacattccacctgaaattggtcatttgcgtcgcctcacctacctgaacctcacctctaatggcctcactggcacgataccagaggctctgtcttcatgctctaaccttcaaatcattgatctctcaaataactcaattgatggtgagatcccctcaagcttgaacaaatgctcaaaccttcaaattatctgcttgtacgacaacaaacttaaaggagtcattccagaagggctaggtacactctccaacctttcggttttgtatctttcaaataacaacctaagcggcaatattcctctctcacttggaagtaactcttttctgaatgtggtcattctcacaaataacagcctcactggaggcatcccacctctcctagccaatagttcatcactcatattgcttgatttaactaataatcgtcttggcggcgagattccttttgctctttttaatagctcgtcacttaatctcataagccttgcagttaataactttgttgggtctatcccaccaatctcaaatatctcctcaccactgtggtatctcagcttatcccaaaacaatctctcaggtagcataccttcctctatagaaaacctctcctcccttgaaatactctacctttcacagaacaacttccagggtaccattccatccagtttaagcagaataccaaacttgcgagaactggacttgacatataacaacttgtcagggacagttccggcttctctgtacaacatgtctaatctcgtataccttggcatgggcattaataaactcattggagaaattccagataacataggatatacccttccaaatatcaaaacactgattttgcaaggaaatcaattccaaggccagattcccacttcactaggcattgcaaaaaatctccaagtgattaaccttcgtgacaatgcattgcatggtattattccttcttttgggaacctgccggacttgatggaattgaatcttggaatgaatcgactagaagctggagactggtctttcttatcctcattgataactagcagacagttggttcaattatgcctggacaaaaacatcctcaaaggaaccctaccaagttccatcgcaaaactttcaacaagcttacaagtgttgctgctaacaggaaatgaaatatccggtaccatacctcaagagatacagaaactcacaagccttacgcttctttatatggaaaaaaatctacttactggaaatcttccagattcacttggaaatctgccaaacttgtttatcctaagcttatcccaaaacaaaatttcaggacaaattccaccttcaattggtaatctaagtcacctaagtgagctctacttacaggaaaataatttgagcggaccgattcctagttccttagggagttgcaagaatctagaagctttaaacctgtcttgtaacagctttgatagtagcataccaaaggaactcattactctttcctctctttctgaatggttggacttatctcacaaccaactcgatggagaaataccatcagagattggtggctcgatcaatcttgatattctaaatatttccaataaccgactgtcaggacaaattccctctgctcttggtgactgtgtccacttaagctctctccgtatggaagggaacctacttgatggacgaattcctgattctttcataaatttaagaggcattgttgagttagatctttctcagaacaatctatctggtaaaatacctgaattcatggaatcctttgggtccatgaagcttctcaatttgtccttcaatgattttgaaggaccggtaccaactgaagggatatttcagaatgcaagtgcagtttttatccaagggaacaagaagttatgtggtagatatccattgctacagttaccactctgcaatgtaaagccatcaaagggaaaacacgctactaaaatacttaagatagtaggacttatagctatttgtctggctctaacttcatgtttagtactcgttctactgaagaagaggaataaagtcaagcaagcatctgatccttcctgtaaggagttgaagaagttcacatatgctgatctagtcaaagcaactaatggttttgccttagccaacttagttggttctggaaaatatggatcagtgtataaaggtagatttgagtttgaggagcagccagttgctatcaaagttttcaagctcgatcaagttggagcacctaagagcttccttgccgagtgtgaagctttgaggaacactcgtcatcgaaatcttgttcgggtgattactgcatgctcaacatgtgatccaagaggaagtgagttcaaagctcttattcttgaatatatggctaatggtagcctggagagctggctatatccaaaagtgaataaatatggtttggaaaaaccactaagtttggggtatagaataaaaatagctgtggacattgcttctgcattggattatttgcataactattgcattccacctatggtccactgtgacttgaagcccaacaacatccttttggatgatgtcatgggtgcacgtcttggtgatttcgggttagctaaatttctacaaagtaacagttcttcaaagtttaatagctctacaagcctagcaggaccaagaggatcaattggatacattgctccagagtatggctatggaagcaaaatctcagtagaaggcgatgtctatagctatggaataattatcctagaaatgatcacgggaaagacaccaacagatcagatgttcagtaatggtctgaacattcgcaaatatgtggaaaacacatttttctctcacaagattggcgagattatagaccccaatataatcccaaattttgaagaccctgaaaatcatgtcatgagtggaatgttgagctgcatcatgcaacttgctaagcttggtatctcatgctccatggagacaccaaaagatcgcccagcaatccaagatgtttacgctgaagtcatcacaataaaagaagcattttcagctcttcgtgtttga

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.041708 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0587900 RBH 0.422553 0.000000 0.260348
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g38830 RBH 0.260518 0.066984 0.061100
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0587900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0020880 RBH 0.0 0.763936 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_06g0020720 RBH 0.000000 0.313071 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0020820 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0008300 SBH 0.020999 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0020970 RBH 0.0 0.0 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0365900 RBH 0.006022 0.0954195 0.0774335
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0020410 SBH 0.000000 0.115063 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0343100 RBH 0.4664375 0.2077655 0.132618
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0020600 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0020640 RBH 0.000000 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0020250 RBH 0.0 4.595518 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_06g0021190 RBH 0.0 0.000000 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0020400 RBH 0.034371 0.504609 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G020310 RBH 0.000000 0.0 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0020560 RBH 0.0 0.0 0.674161
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