Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_04g0029570 OGI:04004540 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:31654339-31681850
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

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Function Receptor-like protein 15 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C6A8]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_04g0029570 OsKeNa_04g0029570.01 Chr04 31654339 31681850 + NAM
CDS seq

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Protein seq

MSCSFPWGFFCFFLVVLCLPDSNISTPSHGFFVEERTALMDIGSSLTRSNGTAPRSWGRGDDCCLWEHVKCSNITGRVSHLYFSNLYDSNEVLDAHGHSFWRFDTTVFSSFPELQFLDLSMNNATFQSWDVFESFRNLRELDLSSNRLNGSIPTSLFSLPRLEHLSLSQNLFEGSIPVTPSSNITSALKTFNFSMNNLSGEFSFFWLRNLTKLQKIDVSGNANLVVAVNFPSWSPSFQLKVLVLSGCNLDKNIVREPIFLRTQHQLEVLDLSNNSLSGSMPNWLFTEQTTLVYLNLGNNSLTGSLGPIWYPQMNLQAISLPMNRISGHLPANISSVFPNMSFLDVSSNTISGEIPSSLCNITRMEYLDLSNNSLSGELPNCLLTEYPILTTLKVSNNKLGGPIFGGTNHLSIKDALYLDGNKFEGTLPRYLTADFDGHGTLDLHDNNLSGAIPNCMTALELDFFIVSHNSLSGHIVPFSFFNSSTVMALDLSHNQFNGNIEWVQYLGEIKYLSLGSNKFEGQISPSLCQLQSLRILDFSHNSLSGPLPSCIGNLSFGQNPVGIPLWSLICENHFRYPIFDYIGCYEDRGFSFRTKGNIYIYKHNFINWMSGIDLSANMLSGQIPRELGNLGHIKALNLSYNFFDGPIPATFANMSSIESLDLSHNKLSGAIPWQLTRLSSLSVFSVMYNNLSGCIPDSGQFGSFDMDSYQGNNLLHPASEGSECAPSSGHSLPDDGDIYMPCGCFVEERAALMDIGSSLTSSNSTAPRSWGRGDDCCLWERVKCSNITGRVSHLYFSNLYDVLKVPAGGAMFWRFNTTVFSAFPELQFLDLSSIYLSSLGSDGLVGLKLPKLQHLNLTHNRLRESIFAPLGELVTLEVLDVSHNYIQGVLPTAVLKELTNLQELYLNNNHFNGSLPKSLLTLPHLRILDLSTNSLAGGIPISSSSEPVSVEVLNLSNNNMSGTLPTEQAVDVTISGWVPLFQLKQLALSGCDLDKGIIAEPHFLRTQYRLQELDLSGNNLSGSMPNWLFTKEATLINLNLGNNLLTGSLDPIWHPQTALKSFITPTNLIAGKLPANFSSIFPSLSTLDLSGNKFFGEIPISLCHINQMQNLYLSNNNFSGEMPACVFTDFPELWTLRASNNLLEGLVLGGMKNLSVGFAIDLGRNKLKGTLPHDLSGALRFLDLQDNKLSGNHITGNVPKNLCNLASVQILDLSGNNLIGSIPRCSSASLSSLNLSGNSLSGDISDDLFNTSNLMALDMRCNKLTGNLNWLKHFNNIKILSLGWNEFEGQITPNLCKLNCPRIIDFSHNKLSGPLPPCVGNISCVDNRVAQNISPFFLLGLLLTEVSISVYNPRVFTFATKGARYTYGLNFFDLMSGIDLSENMLSGEIPLDIGNLNNTKSLNLSNNFFTGQIPASFVNMSEIESLDLSHNELSGSIPWQLTKLSSLAVFSVAYNNLSGCIPNSGQFGTFSMDSYQGNSYLRNMPKGNICSPDSEAGDLPSEGRDSMADDPVLYAVSAASFVLAFWATIAFLFFHPLGWHAILAIGNLERAALMDIKSSLTRANSMVVLDSWGQGDDCCVWELVVCENSTRRISHLHLSGIYYPPISTPSLVGLKKLQYLDFTYCSLEGSFPVFNGEFGALEVLVLNHNHLNRGLSAQAFQNLQNLRQLNLSLNHFGGELPTWLFELPHLKILDLSNNLFEGKPLLLEVLNLQNNRMSGSLCLWSERAFGNLQNLRELYLSSNQFSGSLPTFLFSLPHIELLDLSANLLEGPIPISISSNLSLSFKNIRFSQNNLSGTFPFIWLRNLTKLEEIDFSGNPNLAVDINFPGWIPPFQLKRLVLSSCELDKSTLSEPYFLHTQHHLKVLDLSDNNLTGNMPNWLFTKETALVRLNLGNNLLTGSFAPVCRTCEFFQYLNLSMNRIEGQLPSNISSMFPILSILDFSNNNFSGQIPTSFCQIGSMDYLDLSDNRISGKLPACMFTNYMLVTLKVSNNELSGLIFDGVNDLSIISQLYLDNNKFEGTIPHNLSGQLKIIDLHGNRLSGKLDASFWNLSSLRALNLADNHITGEIHPQICKLTGIVLLDLSNNNLTGSIPDFSCTSELRFLNLSRNYLSGNLSESYFNTSNLIALDITYNQFTGNLNWVGYLGNTRLLSLAGNNFEGQITPNLCKLQYLRIIDFSHNKLSGSLPACIGGLSLIGRANDQTLQPVFETISDFYDTRYSLRGFNFATKGHLYTYGGNFFISMSGIDLSANMLDGEIPWQLGNLSHIRSLNLSYNFFTGQIPATFASMNEIESLDLSHNNLSGPIPWQLTQLASLGAFSVAYNNLSGCIPNYGQLSSFSIDSYLGNNNLHKISQGKRCSPSPGAVAKEDVGERYDDPVLYIVSAASLVMAFWATVAFSFCHSYRQSLWISDIISSLASGNLSWAYSPKINILSLGGNNFEGQISPDICNLQFLRIIDFSHNKLSGSVLACIGSILFNNVEDGDDRIFLNRFRLADIEMHDSDLSTTYYDLGFAFSTKWYQYAYGFNFVTMMSGIDLSANMLDGEIPWQLGNLSHIKSLNLSYNFFTGQIPATFANMKEIESLDLSHNNLSGPIPWQLTQLSSLGAFSVAYNNLSGCIPNYGQLASFSMERYVGNNNLYNTSQGSRCSPSGHVSKEEDVEERYDDPVLYIVSAASFVLAFCATVAFSFCHSYGRSVILKM

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.147078 0.258064

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0648200 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g55440 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0648200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0028770 RBH 0.000000 1.677204 0.202339
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_03g0022880 RBH 1.033957 13.479699 8.436419
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0029150 RBH 0.000000 0.890891 0.561121
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0029000 RBH 0.041309 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0029240 SBH 0.0 0.804663 0.816257
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0520300 RBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0027880 RBH 0.086610 0.224170 0.157804
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0525300 RBH 0.134531 0.0348085 0.042057
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0028320 RBH 0.0 0.038165 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0028150 RBH 0.0 0.720277 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0028260 RBH 1.255963 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0028860 RBH 0.044829 0.076417 0.122183
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0028830 RBH 0.075462 0.631338 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G028260 RBH 0.647105 0.000000 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0028080 RBH 0.355491 2.867533 0.443310
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