Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_04g0027710 OGI:04092830 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:30162161-30177764
Gene Symbol PI63, Pi63, Pikahei-1(t), RGA3, RGA1-NB, RGAa, RGAb
DNA seq

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Function Disease resistance protein RGA2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XBQ9]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_04g0027710 OsKeNa_04g0027710.03 Chr04 30166006 30177226 + NAM
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_04g0027710 OsKeNa_04g0027710.02 Chr04 30162323 30166947 + NAM
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OsKeNa_04g0027710 OsKeNa_04g0027710.01 Chr04 30162323 30177764 + NAM
CDS seq

atgatgtggttagttggcagtgtggtggatgctgcgataggatgcctggtgcaaagcatccttgggagcttcttcactgaacagatggaagcctggactcatgaaattgggcttgctgaagatatcgagaagcttgagtttgagatgaaggctgtggagagggtgcttgctgctgccgaaggaagaagtattgacaacaagctactagcccaatcactgggaagtctaagagatctgctttatgatgcagaagacgttatggacgagctcgactaccaccggctcaaacattggatcgaaaaaggtgaaggctccagtgctgctgctgataataatcctgggacaaactatgctgcttcatccatttcatcttctgcttatcaactaatatgcagtgcaagacaaaaaattactagctggatctcatctggcagaaaaaggaagcgagaagaggaagagccaactgatagcaccatgctgcctcatgatatcaaacgtgacatttctaagaggatcaatagaatagtgaacaatttgcagaaaactggcaattctgttagtggggttcttcagctagagatcccatgccgaggtttgacatcaaatcagaggcacagaatggccaggaacacacgcctgacaacttctgttcctattgaacccaaggtgtatgggagagatgcagataaggacaggataatagagatgttaataaatgagggatctagtgatctccttgtcataccaatagttggcattggtggtattggaaagacaacacttgctagatttgtataccgagatcaaaggattattgatcattttgatttgcaaatatggatttgtgtatccactaacttcaatgaagtaaggctaacgcttgagatcttagagcatgtatgtaaggatagacaagagtacagagatgttagcaatttcaatgtactacaggagattcttttgaagaatattagagataaaagatttcttatcatattggatgatatgtgggaagacagggacagtagtggatgggataagctgttagctccattgaaatgtaatcaagtaaccggttgtgcggtgctagcaacaactcgaagaagctcggttgcacaaatgataggaacagtgaatgcattccaaatcagtggtctggacaaaaaggagttttggctgttcttcaaggcatgcgcatttggtaatgaggcctatgagggtcagcctagtttgcaatctattgggcaaaaaattgctaaaacactaaagggctgcccactagcagcaagaagtgtcggtgcacttttgaacagagatgttagttatgaacattggaggacagttcaggacaaatggaagtctcttcaagtaaaagatgatgacattatacccatcctgaagcttagttacgattatctacctttccaccttcagtgttgtttctcctattgttctctgtttccagaggatcactggtttaatgaagaaactttggtccaggcttggatatctcaaaattttgttcaatatgaagatactggagcgggattggaggaaactgggttgcaatatttggctaatttagtagattttggatttttccaaaaaattggctcacactatgctatgcatgatctaatgcatgaattagcagagcaggtttcatcaaatgaatgcgctaaaataaatggaattcagcttaatgtaattccaccaaacattcgacatttgtccatcataaccaccagccatgaaaatgatgctcctgaggattttctcattgagaaatttgaggagatactacagaagattaggccttttcaaaagctgaggagcttgatgttttttggacagagtagcacaaaattattaaatcccacacttactttttgcaaagaagcaaaatgtttacggttgttaagagtttatgtctcaaatgctggcatcaactctttacaaaattcgttaaatccatatcatctgcgctatcttgaatttattggtgcatatggggatgtcgttcttcctcaagctttgaccagtttttatcatcttcaagtgttgaatgtgggcattcatggaagtcatgatgtacctacttctatgaataatctagttaatcttcgtcatcttattgctcatgacaaagtgcaccgtgcgatagctggtgttggcaacatgtcatcacttcaagaactaaatttcaaggttcaaaatgttggcggttttgagataagacaactccaatccatgaataagcttgtaactcttgagatctctcatcttgaaaatgtgaagactaaagatgaagccagtggggccagacttatagataaagagtaccttaaaaagttgtccttatcatggaatggtggcagcgtgagccttgaacctgacagatcaaaagatgtgcttgagggtcttcgaccacatcataatctgaaaactctaagtataactgggtacagtgatcctaactctccaacatggctttctagtaatctctcggttacatcactgcagacaattcatcttgagaattgcagggagtggaaaattcttagatctcctaaaattcttcctttgcttaggaaactgaaattggtcaagatgtttaatttggttgaactctcaattccttccttggaagagttggtcttaattgagatgccaaagttggagaagtgcattgattgccctcaactgaatgagttcactcctttcggggccgagcagtggtttccgtctctcagagaactcaccattgggtgttgtcctcatataagcaagtgggaaatacttccactgagggaaatgcatgcgctcaagagtttggagttaatagacctccatgctgtcagacagttggaagtcccttccctgcagaagttagtgttgattaacatgctaatcctggaatgttgcagcgggctaacagcttcaactgtgcaaatgtccacttcccaaggggacaaggagtgcctatctggtctccgtgaactcactattcatgattgtccttgtttggtactgtcatatcctctcccgccttctgctctgacgtcccacttctctatcaaggggattccaacatatccaacaatggaaaaagaatatgggcagctcagcataacatctgatgagttgattatgcttgatgacaagatcttagcattccataacctcaggggcattgaatctttgtttataaaagattgtcctaatttagtctctatatctagtgaaggtctcaatcagctcatcgatttagagggcttatatgtaacaggttgtcctaatttcaccatgacaagcggccttgtcctcccatctgtcagatttctctcccttcagtcatgtgccatatcagggagttggctaacggaaatgctttcgcatgtgcggtctctcaagactttgaaattacatgactgcccacaaataaaatttctatccttcagtgaacctgcagcaatggaaggtgccagcagtttgggttcagcagcaacgcactctgatagggatgaacagctgttgaaaattccatctaatatcatccattctctaagagatctatttatttctaactgccctgatctagagttcggaggagaagagggagccctccgaggatacacctctcttgaatccattaaagttcagagttgccccaaactgataccattgttggtgagtggtaagatggaggttggatcgctgccaccgtctctacgaagcttagatattgatatggatcctgagctgtctactgtatgggatctcaaactgcaggagcttgaacagggtgttaatcagttacagtcccgtctgctgtccttcctccctaccatcacaacattagtcatatcggcaagtccagagttgacatctctacagctgggatactccaaggcactggaagagttgataattgtagactgcgagtcacttgcttcagtcgagggctttggatccttgacaaaccttagtgacccgctgcaaacagctcattctctggcaagcatatccttctggcctgcacgaagcaagcgtggtgcgacgatgatgggtctgacagaggaacaagagagagcgctccagcttctgacatccctcgaatatctcatattttggcacttgccgaatctcctgtcacttcctgcaaatctagcaagccttacctccctcaagtggttacatatcggtgactgtccccgcatcacaaggctgccagagatgggccttccactttcactgacacaactgcctggtacctgtaacgggagatccggagatgacggtgccccctccatatgttcgaggaaatgcctggccgataccgttcaagcagagtgctggtacacccagtgcaggaaagaagacgacattcgagagctagttatttctaactgtcctgatctggagttcggtggagaagagggagccctccgaggatacacctctcttaagtccattaaagttcagggttgccccaaactgataccgttgttggtgagtggtaagatggaggttggattgctgccaccgtctctagaatgcttatgtattgatatgggtcctgagctgtctactgtgtgggatctcaaactgcaggagcttgaacagggcagtaatcaggttccaccgccacctccgtcacttgacacattccttatcacgaatctcacagacaagctgggatactccaaggcactgaaagagttggaaattgtagactgcaagtcacttgcttcagttgagggctttggatccttgacaaaccttaggttcttgacagtatatgaatcgcccagcatgcctcaatgttttgagattctatcacaacaacatggggcctctgagatcttgtcccgactggaaaatcttcagatcagtgatggctttatccttactgtttccctctgcaaacagctcacgtctctgagagatctattcttctggcctgaacgaagcaagcctgatgcgacgatgatgggtctgacagaggaacaagagagagcactccagcttctgacatccctcgaacgtctcaacttttgggggttgccgaatctcttgtcccttcctgcaaatctagcaagcctgacctccctcgagtggttagatatctcagactgcccccgcatggcaaggctgccagagatgggccttccaccatcgttgaggagattatctttatgccgttgcagcgacgacctaagtatgcagtgcagaatggtagcaacggagaagctacagttggcgtgctgtgggtggccagaaaatttaactgccaacattatccgaagctcgcacaaagaacattttggtcctaagggttatgatactggtgcaattaaaggaagaaacggcgccgccggccgccatgagcccgtgaccatcggcgaggaggaaaggtggcatgaagacgaagcggtttgtcgacgtaagcccattacggcccatattaaaaagcccatatga

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Protein seq

MMWLVGSVVDAAIGCLVQSILGSFFTEQMEAWTHEIGLAEDIEKLEFEMKAVERVLAAAEGRSIDNKLLAQSLGSLRDLLYDAEDVMDELDYHRLKHWIEKGEGSSAAADNNPGTNYAASSISSSAYQLICSARQKITSWISSGRKRKREEEEPTDSTMLPHDIKRDISKRINRIVNNLQKTGNSVSGVLQLEIPCRGLTSNQRHRMARNTRLTTSVPIEPKVYGRDADKDRIIEMLINEGSSDLLVIPIVGIGGIGKTTLARFVYRDQRIIDHFDLQIWICVSTNFNEVRLTLEILEHVCKDRQEYRDVSNFNVLQEILLKNIRDKRFLIILDDMWEDRDSSGWDKLLAPLKCNQVTGCAVLATTRRSSVAQMIGTVNAFQISGLDKKEFWLFFKACAFGNEAYEGQPSLQSIGQKIAKTLKGCPLAARSVGALLNRDVSYEHWRTVQDKWKSLQVKDDDIIPILKLSYDYLPFHLQCCFSYCSLFPEDHWFNEETLVQAWISQNFVQYEDTGAGLEETGLQYLANLVDFGFFQKIGSHYAMHDLMHELAEQVSSNECAKINGIQLNVIPPNIRHLSIITTSHENDAPEDFLIEKFEEILQKIRPFQKLRSLMFFGQSSTKLLNPTLTFCKEAKCLRLLRVYVSNAGINSLQNSLNPYHLRYLEFIGAYGDVVLPQALTSFYHLQVLNVGIHGSHDVPTSMNNLVNLRHLIAHDKVHRAIAGVGNMSSLQELNFKVQNVGGFEIRQLQSMNKLVTLEISHLENVKTKDEASGARLIDKEYLKKLSLSWNGGSVSLEPDRSKDVLEGLRPHHNLKTLSITGYSDPNSPTWLSSNLSVTSLQTIHLENCREWKILRSPKILPLLRKLKLVKMFNLVELSIPSLEELVLIEMPKLEKCIDCPQLNEFTPFGAEQWFPSLRELTIGCCPHISKWEILPLREMHALKSLELIDLHAVRQLEVPSLQKLVLINMLILECCSGLTASTVQMSTSQGDKECLSGLRELTIHDCPCLVLSYPLPPSALTSHFSIKGIPTYPTMEKEYGQLSITSDELIMLDDKILAFHNLRGIESLFIKDCPNLVSISSEGLNQLIDLEGLYVTGCPNFTMTSGLVLPSVRFLSLQSCAISGSWLTEMLSHVRSLKTLKLHDCPQIKFLSFSEPAAMEGASSLGSAATHSDRDEQLLKIPSNIIHSLRDLFISNCPDLEFGGEEGALRGYTSLESIKVQSCPKLIPLLVSGKMEVGSLPPSLRSLDIDMDPELSTVWDLKLQELEQGVNQLQSRLLSFLPTITTLVISASPELTSLQLGYSKALEELIIVDCESLASVEGFGSLTNLSDPLQTAHSLASISFWPARSKRGATMMGLTEEQERALQLLTSLEYLIFWHLPNLLSLPANLASLTSLKWLHIGDCPRITRLPEMGLPLSLTQLPGTCNGRSGDDGAPSICSRKCLADTVQAECWYTQCRKEDDIRELVISNCPDLEFGGEEGALRGYTSLKSIKVQGCPKLIPLLVSGKMEVGLLPPSLECLCIDMGPELSTVWDLKLQELEQGSNQVPPPPPSLDTFLITNLTDKLGYSKALKELEIVDCKSLASVEGFGSLTNLRFLTVYESPSMPQCFEILSQQHGASEILSRLENLQISDGFILTVSLCKQLTSLRDLFFWPERSKPDATMMGLTEEQERALQLLTSLERLNFWGLPNLLSLPANLASLTSLEWLDISDCPRMARLPEMGLPPSLRRLSLCRCSDDLSMQCRMVATEKLQLACCGWPENLTANIIRSSHKEHFGPKGYDTGAIKGRNGAAGRHEPVTIGEEERWHEDEAVCRRKPITAHIKKPI

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_04g0027710 OsKeNa_04g0027710.04 Chr04 30162161 30163397 + IsoSeq
CDS seq

atgatgcagaagacgttatggacgagctcgactaccaccggctcaaacattggatcgaaaaaggttcatgacttacactgtcttgctctatgctttctgcttctttcttctttcatatatgtacttgagagc

Protein seq

MMQKTLWTSSTTTGSNIGSKKVHDLHCLALCFLLLSSFIYVLES

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.103852 10.445362 1.663262

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0620950 RBH 0.579718 0.477920 1.161857
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g53000 RBH 0.449281 0.368280 0.270999
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0620950 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0026930 RBH 1.003033 2.395791 4.491940
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0027730 SBH 0.032582 0.091726 0.118973
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0027430 RBH 3.192248 6.534117 14.789726
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0027130 RBH 0.333661 0.013635 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0027410 RBH 2.433429 9.948519 8.328281
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0496800 RBH 4.2219485 12.3049565 8.2823945
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0026230 RBH 0.157292 0.051971 0.361639
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0500900 RBH 3.2863475 41.414265 13.2948085
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0026650 RBH 0.696363 0.246535 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0026470 RBH 0.922922 10.440888 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0026530 RBH 2.316206 12.307158 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0026980 RBH 1.371948 0.377353 1.140641
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0027160 RBH 0.966941 0.878698 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G026380 RBH 0.157113 7.582769 2.315366
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0026220 RBH 0.361956 32.372398 2.055341
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