Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_02g0004250 OGI:02010280 | 4/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:2954457-2965674
Gene Symbol -
DNA seq

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CDS seq

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Function Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit [UniProtKB/Swiss-Prot:Q24492]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_02g0004250 OsKeNa_02g0004250.01 Chr02 2954457 2965563 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_02g0004250 OsKeNa_02g0004250.02 Chr02 2955006 2965674 - IsoSeq
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.150551 5.539506 4.648852

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0528500 RBH 0.000000 0.101531 1.744509
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g19280 RBH 0.000000 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0528500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0035630 SBH 0.183303 4.044442 2.813267
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0035610 SBH 0.487087 2.575693 3.908370
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0035290 SBH 2.817656 5.309787 5.419543
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0056100 RBH 0.0021585 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0035130 SBH 0.074390 0.463015 0.635122
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0058900 RBH 0.0501235 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0035380 SBH 0.143219 0.140041 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0035420 SBH 0.354881 0.440140 0.620511
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G035670 SBH 0.149329 1.367663 1.312065
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0035380 SBH 0.731994 4.566481 3.928105
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