Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_01g0023880 | OGI:01013090 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:23858028-23884833 | ||||||||
| Gene Symbol | OsLRP, OsLRR1, LRR1 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MVADQKPFNMTAPPRLLAQGATATTAVLLFFLVFQAQSASPFDRANTTTTPGAVGGICVPSERKALTSFKNSFLDPSGRLSSWRGEDCCQWKGVRCDSTTGHVIELDLRNTFVTENGDWCGGLNEGGGHRLTLQTDEMSPSIVELQHLRYLDLSNNEFKGTSLPSFIGSLNNLRYLNISFTCFGGTTPSQLGNLSNLHYLDIRSSIYESVSDLSWLLGLPLLRYLDMSEVDLSSVRNWVHAVNKLPALQVLVLSSCGLNSTVSTLPNSNLTNLEVLDLSDNPFCSPLQHNWFWDLTTLKKLVLSDCGWSIGPIPDALGNMSTLEVIVLSSNYDIYPSNSYLLGNIPTTLKNMCNLQVFDLHGINIHAPISELMERLPKCSWNKLHEMDLQDANLTGELPFWIGNLTSLSYLDLSQNMIGGSIPGGVEKLTSLKYLDLSQNMLVGHLPIGMGYLTGLTFLDLSQNRLVGHLPVGIGSLTGLTILDLSQNRLVGHLPVGMGNLTGLTILDLSQNRLVGHLPVGMGNLTGLTILDLSQNRLIGNIPVGIGALGNLTELSFFQNRLTGVLSEHHFANLKRLEFLDLSGNSLKLDFKEGWIPPFRLTIGYFTSCDLGPQFPTWIRWVTDKANQPTLDISNTGINDDLPSWFWTFLSNVYRLDLSMNQLRGSLPEKLPANLTIPILKVLRLHYNQISGTIPACFCQFSGLEEINLSHNRLTGEIPQCSIDTFGSSFGVIDMSSNNLSGKFPSFLRKARSLSFLDLSYNKLSGNMPTWIAERMPSLEVLILRSNMFCGNLSMNFSESNQLHFLDIAHNNISGSLPSSVRNLTAMKYSKSDYLNYTGASISISIKNQELNYTFQSTNYIVLIDLSYNSLTGHIPREISELKGLQSLNLSGNQLNGEIPYNIGALRRLESLDVSYNELVGEIPSSLSDLTFLSSLNMSYNNLSGRIPSGQQLQTLNNLYMYIGNPGLCGPPLPTNCSTNKTNQIVHGEHDDASHDTIYLYLSTSAGFAVGLWAVFCTFLFKKAWRIAYFQLNDQIYDKIYVQMAIISLLFTQTNSIDHASSDAEKNGGCIPKERSALLAFRAGLSDPGNILSSWKGDDCCHWKGVRCSNRTGHIVKLDLQTRGCYTDPEYPWVESEPGLGGNISSSLLILQRLQYLDLSCNNFSGVRIPEFFGSLKNLRYLDLSDSSFSGRIPPQLGNLSNLHYLHITNYSSDIYSTDITWLSRLSSLEYLNLDRVNLSTAVDWLLVLNMLPSLKALILPGCQLSTSVDSLPYYNLTSLETLDLWANSFHKRITPNWFWDLTRLKHLDITGNGFYGPFPYEIGNMTSIVELDLSLNELVGMIPANMKNLCNLERFVAYGTNINGSITELFNQLPRCSRNKLQELFLPSCNLTGRLPTTLDLNLSWLDLSNNNLTGPIPLWVGKLTNLTILDLSFNKLEGVIHEGHLSGLARLYWLTLSNNLLAIRVNSTWVPPFKQITQIELRSCQLGPKFPTWLRWLTHVKNLDISNTSISDKVPDWFWIAASSVTYLNMRNNNIRGVLPPRMESMRAIAMDISSNQLSGPLPKLPVNLTGLDLSKNNLSGPLPSDLGAPVLMSLILYDNSISGAITSLCKMHFLLYNQFFGTLPPWIGHKLPSLVFLRLRSNNFSGRIPPDLTSLVGLQYLDLAHNNFSGSIPNSLVKLHGMSPHQEDNEDQLSRAIRYGSGINNNELVDYIENITVVTKGQERLYTGELIYMVNIDLSSNNLTGDIPEEIISLVALTNLNLSWNRLSGQIPEKIGSLSQLESLDLSHNVLSGGIPSSITSLTYLSHMNLSYNNLSGRIPSGNQLDVLEDPASIYVGNIGLCGHPLPNNCSINDDPKIEQGELEEVSFRLSIIIGSVVGLLLVPNTMVSMPELGFLRGATMILWLWLLISQISSICCVHARCVASEREALLSFKASLLDPAGRLSSWHGDDCCHWKGVRCSNRTGNVVTLNLRNSNCWYDVHYTVLSLLRGEMSSSLTDLQNLRHLDLSCNYFNGTSIPVFIASLKDLRYLNLSWAGFSGRIPSQLGNLSSLQYLDVSWNDFFHEEQNSSSMSSTYLSWLPHLTLLRHLDMTSVDLSSVRNWVHVVNMLPALQVLRLSDCVRVGTLGNLTNLDLSGNQLNGILSKDHFAGLLKLEYLDLSYNSLKFAIEPNWAPPFRLKVAGFRSCQLGPQFPQWLRWQTDIDILALENTKLDDVIPDWFWVTFSRASFLQASRNRLCGSLPANLKHISADHIYLGSNLLTGQVPQLPMNISHLNLSSNLLSGPLPSDVKAPLLEELLLANNQISMCQLIGLKRLDLSGNKITGNLEQMQCWKESDNTSSMTNINSGDKFGSNMLSLALNHNELSGEFPQFLQSASQLLFLDLSYNRFFGSLPKWLPERMPNLQILRLRSNIFHGHIPKNIIYLGKLHFLDIAHNNISGSIPDSLANFKAMTVIAQNSEDYIFEESIPVITKDQQRDYTFEIYNQVVNLDFSCNKLTGHIPEEIHLLIGLTNLNLSSNQFSGTIPDQIGDLRQLESLDLSYNELSVEIPPSLSALTSLSHLNLSYNNLSGTIPSGSQLQALDDQIYIYVGNPGLCGPPLLKNCSTNGTQQSVYEDRSYMESLYLGMSIGFVIGLWTVFCTMLMKRTWMMAYFRIIDNLYYEAYVQVAISWSRLMRKNQDAE |
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| Function | Receptor-like protein EIX2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6JN46] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_01g0023880 | OsKeNa_01g0023880.01 | Chr01 | 23858028 | 23884833 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MVADQKPFNMTAPPRLLAQGATATTAVLLFFLVFQAQSASPFDRANTTTTPGAVGGICVPSERKALTSFKNSFLDPSGRLSSWRGEDCCQWKGVRCDSTTGHVIELDLRNTFVTENGDWCGGLNEGGGHRLTLQTDEMSPSIVELQHLRYLDLSNNEFKGTSLPSFIGSLNNLRYLNISFTCFGGTTPSQLGNLSNLHYLDIRSSIYESVSDLSWLLGLPLLRYLDMSEVDLSSVRNWVHAVNKLPALQVLVLSSCGLNSTVSTLPNSNLTNLEVLDLSDNPFCSPLQHNWFWDLTTLKKLVLSDCGWSIGPIPDALGNMSTLEVIVLSSNYDIYPSNSYLLGNIPTTLKNMCNLQVFDLHGINIHAPISELMERLPKCSWNKLHEMDLQDANLTGELPFWIGNLTSLSYLDLSQNMIGGSIPGGVEKLTSLKYLDLSQNMLVGHLPIGMGYLTGLTFLDLSQNRLVGHLPVGIGSLTGLTILDLSQNRLVGHLPVGMGNLTGLTILDLSQNRLVGHLPVGMGNLTGLTILDLSQNRLIGNIPVGIGALGNLTELSFFQNRLTGVLSEHHFANLKRLEFLDLSGNSLKLDFKEGWIPPFRLTIGYFTSCDLGPQFPTWIRWVTDKANQPTLDISNTGINDDLPSWFWTFLSNVYRLDLSMNQLRGSLPEKLPANLTIPILKVLRLHYNQISGTIPACFCQFSGLEEINLSHNRLTGEIPQCSIDTFGSSFGVIDMSSNNLSGKFPSFLRKARSLSFLDLSYNKLSGNMPTWIAERMPSLEVLILRSNMFCGNLSMNFSESNQLHFLDIAHNNISGSLPSSVRNLTAMKYSKSDYLNYTGASISISIKNQELNYTFQSTNYIVLIDLSYNSLTGHIPREISELKGLQSLNLSGNQLNGEIPYNIGALRRLESLDVSYNELVGEIPSSLSDLTFLSSLNMSYNNLSGRIPSGQQLQTLNNLYMYIGNPGLCGPPLPTNCSTNKTNQIVHGEHDDASHDTIYLYLSTSAGFAVGLWAVFCTFLFKKAWRIAYFQLNDQIYDKIYVQMAIISLLFTQTNSIDHASSDAEKNGGCIPKERSALLAFRAGLSDPGNILSSWKGDDCCHWKGVRCSNRTGHIVKLDLQTRGCYTDPEYPWVESEPGLGGNISSSLLILQRLQYLDLSCNNFSGVRIPEFFGSLKNLRYLDLSDSSFSGRIPPQLGNLSNLHYLHITNYSSDIYSTDITWLSRLSSLEYLNLDRVNLSTAVDWLLVLNMLPSLKALILPGCQLSTSVDSLPYYNLTSLETLDLWANSFHKRITPNWFWDLTRLKHLDITGNGFYGPFPYEIGNMTSIVELDLSLNELVGMIPANMKNLCNLERFVAYGTNINGSITELFNQLPRCSRNKLQELFLPSCNLTGRLPTTLDLNLSWLDLSNNNLTGPIPLWVGKLTNLTILDLSFNKLEGVIHEGHLSGLARLYWLTLSNNLLAIRVNSTWVPPFKQITQIELRSCQLGPKFPTWLRWLTHVKNLDISNTSISDKVPDWFWIAASSVTYLNMRNNNIRGVLPPRMESMRAIAMDISSNQLSGPLPKLPVNLTGLDLSKNNLSGPLPSDLGAPVLMSLILYDNSISGAITSLCKMHFLLYNQFFGTLPPWIGHKLPSLVFLRLRSNNFSGRIPPDLTSLVGLQYLDLAHNNFSGSIPNSLVKLHGMSPHQEDNEDQLSRAIRYGSGINNNELVDYIENITVVTKGQERLYTGELIYMVNIDLSSNNLTGDIPEEIISLVALTNLNLSWNRLSGQIPEKIGSLSQLESLDLSHNVLSGGIPSSITSLTYLSHMNLSYNNLSGRIPSGNQLDVLEDPASIYVGNIGLCGHPLPNNCSINDDPKIEQGELEEVSFRLSIIIGSVVGLLLVPNTMVSMPELGFLRGATMILWLWLLISQISSICCVHARCVASEREALLSFKASLLDPAGRLSSWHGDDCCHWKGVRCSNRTGNVVTLNLRNSNCWYDVHYTVLSLLRGEMSSSLTDLQNLRHLDLSCNYFNGTSIPVFIASLKDLRYLNLSWAGFSGRIPSQLGNLSSLQYLDVSWNDFFHEEQNSSSMSSTYLSWLPHLTLLRHLDMTSVDLSSVRNWVHVVNMLPALQVLRLSDCVRVGTLGNLTNLDLSGNQLNGILSKDHFAGLLKLEYLDLSYNSLKFAIEPNWAPPFRLKVAGFRSCQLGPQFPQWLRWQTDIDILALENTKLDDVIPDWFWVTFSRASFLQASRNRLCGSLPANLKHISADHIYLGSNLLTGQVPQLPMNISHLNLSSNLLSGPLPSDVKAPLLEELLLANNQISMCQLIGLKRLDLSGNKITGNLEQMQCWKESDNTSSMTNINSGDKFGSNMLSLALNHNELSGEFPQFLQSASQLLFLDLSYNRFFGSLPKWLPERMPNLQILRLRSNIFHGHIPKNIIYLGKLHFLDIAHNNISGSIPDSLANFKAMTVIAQNSEDYIFEESIPVITKDQQRDYTFEIYNQVVNLDFSCNKLTGHIPEEIHLLIGLTNLNLSSNQFSGTIPDQIGDLRQLESLDLSYNELSVEIPPSLSALTSLSHLNLSYNNLSGTIPSGSQLQALDDQIYIYVGNPGLCGPPLLKNCSTNGTQQSVYEDRSYMESLYLGMSIGFVIGLWTVFCTMLMKRTWMMAYFRIIDNLYYEAYVQVAISWSRLMRKNQDAE
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.013616 | 0.000000 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0279800 | SBH | 4.516546 | 3.064296 | 18.462210 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g59440 | SBH | 5.649399 | 4.125950 | 9.420048 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0279800 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0012610 | SBH | 3.314848 | 19.322317 | 18.064363 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_03g0022880 | SBH | 1.033957 | 13.479699 | 8.436419 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0012640 | RBH | 5.246065 | 23.924568 | 26.454285 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0023690 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0012200 | RBH | 16.795937 | 24.858669 | 37.170464 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0395800 | RBH | 0.083564 | 0.830832 | 0.0183955 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0012130 | RBH | 1.553266 | 1.584764 | 2.542441 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0384800 | RBH | 0.00217 | 0 | 0.2913575 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0012140 | SBH | 0.391875 | 0.322095 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0023220 | SBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0012120 | SBH | 5.845068 | 31.972692 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0012280 | RBH | 2.698003 | 2.435953 | 4.170121 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0012090 | SBH | 0.687408 | 10.825159 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G031890 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.474389 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0023430 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
