Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_01g0023870 OGI:01013090 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:23836282-23846997
Gene Symbol OsSTA22, -
DNA seq

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Function Receptor-like protein EIX1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6JN47]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_01g0023870 OsKeNa_01g0023870.01 Chr01 23836282 23846997 - NAM
CDS seq

atgattgctcccacgctccttgcgcaaagagccactgctactgcaatcctcgtgttcttttttgtctccctagcacaatccgcgtcttctttccatcctgcaaacacgacgacacggcccgccgtcagcgggagttgcattccgagtgagcggaaggcgctcctgaccttcaaggatagcttttgggatcgtgctggtcgtctttattcatggcggggcgaagactgctgccggtggaagggagtccgatgcgacaacacaactgagcatgtcgtcaagctcgacctccgcaacacagacgattggcgctatcggttgagcttgacaacaagtgagatgagcccttccattgttgatttgcatcacttgagtaccgtctctactctatctcattccaatctcacacatcttgaagtcctagatttaacatccaactggtttagctctcctcttgcacgcaactggttttgggatctcactacacttaaaaagctctttctatatgattgtgcctggtctgggccaattcctgatgcattaggaaacatgtctgcccttgagtccatagatctgcatgacaccgatttattgggtaacataccgacaacaatgaaaaatctgtgtaatttacaagagctgaatttatacaacattaatattaacagtttcatatcagaactgatggagagattaccgaagtgttcatggaataagttgcgtaagatggacctgcattctgcaaatttgacaggggaactaccaacttggataggaaatctagcaagtctcagttatcttgatctttctgagaacatgattgttggttctgtacctgatggaatgggaaatcttacaaatctcaactatcttgacctctcgcagaacatgttggttggtcatttgcctgttggaatgggacaattgacaggcctcacctttcttgacctctctcagaacttgctggttggccatatacctgttgggattggcgcatttggcaacttgactagcttgaaccttggccaaaatagcttcagtggtgtgctcacagaacaccattttgcagctctagaaagactggaatatttgaacctctcaaggaactcgctgaaattagatttacatgaagcttggattcccccgtttaaattaacggagggatattttgagtcatgtgacttggggcctcaattcccttcatggctaagatggcaaactggcatagttttccttgatatttcaaatacaagcataaaggatgacttgcctggctggttttggactattttatctaatgcttatgaattgtacctgtcaagcaatcaactgggtggagctttaccagagaaattggaactgccatcaatgcaagcaatggatctctccgataattatttgtcagggaagttaccagcaaatctcactgttcccaatctaatgacactgcatcttcaccacaatcaaattggaggcactattccagcttgtttgtgtcaactgcggagtttgagagtaataaatctgtcatacaatcaactaacaggggaaatcccacaatgttcagtggatcaatttggtttctcattcttggttatagatatgaagaataacaatctatctggtgaattccctagcttccttcaaaatgctggttggttattatttcttgacctttcatataacaagttgtctggaaatgtcccaacatggattgcacagagaatgccttacctggaagttttgattctaagatcgaacatgttttgtggtaacctttctaaccaattaaacaagcttgatcaacttcattttctcgatgtagcacataacaacatatcaggaagtatatattcatctataagaagcttgacagccatgaaatattcacacacatcagggttggacaactacactggtgctagcatatccatgtccataaaagaccaggagcttaactatacctttcaatccacaaataatattatgttgattgacatgtcgtacaatagtttcactggacctattccaagagaattaactctactcaaggggcttcaaagtttgaatctatcaggcaatcaattaagtggaacaattccaaatgatattggcattttaaggagattggagtccctggacctatcctacaatgatttagttggtgaaatcccctcgagtttatcagaccttacttttttgagctgcttaaacttgtcctacaacaatctatcaggaagaatcccctcaggacaacaactacaaacacttaataatctttacatgtacatcggcaatcctggactttgtggacttcctctttccaccaattgttccacgaacagaacaaacaaaattgtccagaatgaacatgatgacgcatcacatgatacaacatatttgtacatcagcacaagtgcagggtttgtggtggggctctggatagtgttctgcaccatcctgttcaagaaatcatggaggatcgcttattttcagttttttgatcagatatatgacaagatatatgtgcaagcagctgtcagtaaggctgttttgataagaaaattcctatgcatccacgttctaatagccttagccttgcttttgttcaccccaatcatctccaaggaggcctcagccagtgccaatagcacaggtggttgtattccaagtgagagatctgcacttatcagcttcaaatcaggattattagaccctggaaacctcctttcgtcatgggagggtgacgattgttttcaatggaatggcgtgtggtgcaacaacgagaccgggcatattgttgagctaaatctcccaggaggtagctgcaacatcttgcccccatgggttccgctggaaccaggactcggaggcagcataggcccctcgttgcttggcttaaagcaactggagcatctcgacctcagctgcaacaatttcagtgggacgctaccggagttcttgggttctctccacaacctgagatctctcgacctatcctggtcgacattcgttgggacagtgccaccgcagctgggtaatctctccaacttgcgctacttcagtcttggttctaatgataattctagcttatattcaacggacgtatcctggttgtcacggttatcttctctcgagcatctagacatgagccttgtgaatctcagtgcggttgtggactgggtttcggtggtgaacaagcttccatctcttagatttctccgtttgtttggatgccagcttagcagcacggtcgattctgttccgaacaacaacctaacatctcttgaaactctggacctttcacttaataatttcaacaagaggattgcacccaattggttttgggatttaactagtcttaaacttctagatatctcagatagtggtttctatggaccatttccaaacgagataggcaatatgacctctattgtggatattgatttatcagtcaataatcttgtgggaatgataccatttaacctgaagaacctatgtaacttggagaaatttaatgttgctggaaccaacatcaatgggaatataacggaaatattcaatagattgcctagatgctcatggaataagttacaagtgttgtttctaccggactgcaacttgactggaagcctaccaacaacactagaacccttgagcaatttgagcatgcttgagcttggtaataacaatatcacaggtcccatcccactttggataggagagctcagtaatctaacaatgttgggcctcagctccaacaatctagatggggtcatacatgaaggccatttatcaggcctagaaagtctagatttgttgatcttgtctgataataaccacatagccatcaaggtgaattctacctgggttccttctttcaagcaaataacagatattgaacttcggtcctgtcagttagggcctaaattcccaacatggctcaggtatctaacagatgtatacaatcttgatatctcaaacacaagcatatcagacaaggttcctgactggttttggaaagcagcatcatcagtaacacatttaaatatgagaaacaatcagattgcaggtgcccttccatctacattggaatacatgagaacgatcgtaatggatctcagttctaataagtttagtggtctaatacccaagcttcctgtcagtctaaccagcttagacttctcaaagaacaatttatccgggcctctaccatcagacataggagcgtcagctctagtatcacttgttctgtatggcaactccctttctggttcaattccatcttatttgtgcaagatgcattctctggaactgttggatatatcaagaaacaagataactgggccaatttctgattgtgcaatcgattcaagctcagcaaactacacatgtacgaatattatcaatataagcttaagaaaaaataacctctcagggcaatttccttcgttctttaagaactgcaaaaaccttgtttttctggatcttgctgaaaatcaattctctgggacactgcctgaatggattggggaaaaattaccttctttggtattcttacggctgcgttctaatagctttagtggtcatattccaattgaacttaccagtctggcgggtcttcaaatatttagaccttgcacataa

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Protein seq

MIAPTLLAQRATATAILVFFFVSLAQSASSFHPANTTTRPAVSGSCIPSERKALLTFKDSFWDRAGRLYSWRGEDCCRWKGVRCDNTTEHVVKLDLRNTDDWRYRLSLTTSEMSPSIVDLHHLSTVSTLSHSNLTHLEVLDLTSNWFSSPLARNWFWDLTTLKKLFLYDCAWSGPIPDALGNMSALESIDLHDTDLLGNIPTTMKNLCNLQELNLYNININSFISELMERLPKCSWNKLRKMDLHSANLTGELPTWIGNLASLSYLDLSENMIVGSVPDGMGNLTNLNYLDLSQNMLVGHLPVGMGQLTGLTFLDLSQNLLVGHIPVGIGAFGNLTSLNLGQNSFSGVLTEHHFAALERLEYLNLSRNSLKLDLHEAWIPPFKLTEGYFESCDLGPQFPSWLRWQTGIVFLDISNTSIKDDLPGWFWTILSNAYELYLSSNQLGGALPEKLELPSMQAMDLSDNYLSGKLPANLTVPNLMTLHLHHNQIGGTIPACLCQLRSLRVINLSYNQLTGEIPQCSVDQFGFSFLVIDMKNNNLSGEFPSFLQNAGWLLFLDLSYNKLSGNVPTWIAQRMPYLEVLILRSNMFCGNLSNQLNKLDQLHFLDVAHNNISGSIYSSIRSLTAMKYSHTSGLDNYTGASISMSIKDQELNYTFQSTNNIMLIDMSYNSFTGPIPRELTLLKGLQSLNLSGNQLSGTIPNDIGILRRLESLDLSYNDLVGEIPSSLSDLTFLSCLNLSYNNLSGRIPSGQQLQTLNNLYMYIGNPGLCGLPLSTNCSTNRTNKIVQNEHDDASHDTTYLYISTSAGFVVGLWIVFCTILFKKSWRIAYFQFFDQIYDKIYVQAAVSKAVLIRKFLCIHVLIALALLLFTPIISKEASASANSTGGCIPSERSALISFKSGLLDPGNLLSSWEGDDCFQWNGVWCNNETGHIVELNLPGGSCNILPPWVPLEPGLGGSIGPSLLGLKQLEHLDLSCNNFSGTLPEFLGSLHNLRSLDLSWSTFVGTVPPQLGNLSNLRYFSLGSNDNSSLYSTDVSWLSRLSSLEHLDMSLVNLSAVVDWVSVVNKLPSLRFLRLFGCQLSSTVDSVPNNNLTSLETLDLSLNNFNKRIAPNWFWDLTSLKLLDISDSGFYGPFPNEIGNMTSIVDIDLSVNNLVGMIPFNLKNLCNLEKFNVAGTNINGNITEIFNRLPRCSWNKLQVLFLPDCNLTGSLPTTLEPLSNLSMLELGNNNITGPIPLWIGELSNLTMLGLSSNNLDGVIHEGHLSGLESLDLLILSDNNHIAIKVNSTWVPSFKQITDIELRSCQLGPKFPTWLRYLTDVYNLDISNTSISDKVPDWFWKAASSVTHLNMRNNQIAGALPSTLEYMRTIVMDLSSNKFSGLIPKLPVSLTSLDFSKNNLSGPLPSDIGASALVSLVLYGNSLSGSIPSYLCKMHSLELLDISRNKITGPISDCAIDSSSANYTCTNIINISLRKNNLSGQFPSFFKNCKNLVFLDLAENQFSGTLPEWIGEKLPSLVFLRLRSNSFSGHIPIELTSLAGLQIFRPCT

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.871613 0.333286

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0601700 RBH 0.294044 0.0 1.347924
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g41780 RBH 0.188767 0.0 0.329391
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0601700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0012610 SBH 3.314848 19.322317 18.064363
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0024050 SBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0024360 SBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0023750 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0012200 SBH 16.795937 24.858669 37.170464
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0395700 SBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0012130 SBH 1.553266 1.584764 2.542441
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0384700 RBH 0.309498 0.2416125 0.5060555
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0012140 SBH 0.391875 0.322095 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0023200 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0012120 SBH 5.845068 31.972692 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0012280 SBH 2.698003 2.435953 4.170121
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0023350 RBH 0.050005 0.167608 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G023570 SBH 0.038315 0.0 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0023280 SBH 0.000000 0.449103 0.089174
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