Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_01g0002540 OGI:01002250 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:1946348-1971307
Gene Symbol RLCK21, OsRLCK21, RLCK22, OsRLCK22, RLCK23, OsRLCK23, -
DNA seq

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Function LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.4 [UniProtKB/Swiss-Prot:F4HQ22]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_01g0002540 OsKeNa_01g0002540.02 Chr01 1952577 1971307 + NAM
CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_01g0002540 OsKeNa_01g0002540.01 Chr01 1946348 1952577 + NAM
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.038586 0.000000 0.469836

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0137500 SBH 0.0 0.144809 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g04490 SBH 0.117723 0.193910 0.204156
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0137500 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0002630 SBH 0.0 0.0 0.642887
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0002500 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0002660 SBH 0.086951 1.405004 0.239140
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0002520 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0002610 RBH 0.428048 1.129574 2.189153
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0034200 RBH 0.00408 0.0224565 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0002580 RBH 0.105404 0.0 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0033900 RBH 0.4744315 0.421361 0.025073
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0002430 RBH 0.031298 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0002590 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0002670 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0002660 RBH 0.000000 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0002540 RBH 0.000000 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G002740 RBH 0.0 0.0 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0002580 SBH 0.259614 0.0 0.677685
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