Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKYG_11g0007010 OGI:11017320 | 16/16 KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:5814942-5830140
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

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Function Putative disease resistance protein RGA1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA42]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_11g0007010 OsKYG_11g0007010.01 Chr11 5815113 5830140 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_11g0007010 OsKYG_11g0007010.02 Chr11 5814942 5817162 - IsoSeq
CDS seq

ATGTCTACAGGACCTGAGTTTAGTAGGCTTTCAAGAGCTGAAGGACTTGGAAGGGAACATGAGGCGGCTTACTTCGCTACAATCACTAGATCTGTATGGATGCAATACCATGGCATCACTACCACAATGGTTAGGAGAACTCACCTC

Protein seq

MSTGPEFSRLSRAEGLGREHEAAYFATITRSVWMQYHGITTTMVRRTHL

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A5 Chr11 5815317 5815465 - OsKYG_11g0007010.02 OsKYG_11g0007010.02,OsKYG_11g0007010.01 All
A5 Chr11 5815586 5816219 - OsKYG_11g0007010.01 OsKYG_11g0007010.01,OsKYG_11g0007010.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.113749 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0211600 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g10570 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0211600 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0007060 RBH 0.0 0.993930 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0007150 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0006950 RBH 0.0 0.0 0.376646
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0006970 RBH 0.0 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0007000 RBH 6.293403 18.798403 15.241825
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0092600 RBH 2.596614 18.283927 14.3694515
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0006990 RBH 0.265612 0.373630 1.365511
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0099500 SBH 0 0.409908 0.0101205
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0006990 RBH 3.082204 1.990578 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0007020 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0006970 SBH 1.186617 7.702504 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_Ung0064390 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0007110 RBH 0.280194 5.345597 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G007160 SBH 0.0 0.000000 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0007010 SBH 0.0 1.563471 0.0
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