Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsKYG_11g0007010 | OGI:11017320 | 16/16 | KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:5814942-5830140 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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||||||||||
Function | Putative disease resistance protein RGA1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA42] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKYG_11g0007010 | OsKYG_11g0007010.01 | Chr11 | 5815113 | 5830140 | - | NAM | ||
CDS seq | ATGGCGGAAGTCGGGGGTATGCTTGCCGCCGCTGTCCTGAATTTCGTTGGGCAGCAGATCTCTTCCGTGATTGCAGGCCAGATCACGCTGCAGTGGGATTTCAACGACGACCTGAAGAAAATGAAGTCGACGCTGGAGTCTGTGGCGGCGGTGCTCGAGGACGCCGAGAAGCAGTCCATCAAGGAGGCGTCGGTGCGGCTGTGGCTGAAACGGCTCAAAAGTGCCGCGTTCGCCATCTCCGACATGATTGATGAATTTGAAGCTGACACACAAGGGATTCAACCACCGGCCAAAAAAATGTCGTCCATCAAAAAGGGTCTCTTGCAGTTAGCAACTATGATCCCATGTCTCACAGTTGGTCCCAGGATAATTCTCGCTAATAAAATGAAGGCTATGAGGGGAGAACTGAGGGTGATCACAGATGAACACACCAGTTTCAAATTGAAGGTAGCTCCTACCGCCAATGGGGTCAACATTCCAGATGAACGGGAAACATCATCCACGGTAGATAAAACACTCATCATAGGGAGAGCTGAAGATAAACAAATAATAATGGACTCTTTATCTAAGAGCATGACAAATGATTTTACAGTCCTTCCTATATATGGCATTGGAGGCATAGGCAAGACAACTTTGGCAAAACTGGTTTTCAATGATACCCAATTTAAAAACTACTCTCGGGTATGGGTCTACGTGTCACAAATATTTGACTTGAATAAAATTGGCAACTCTATAATATCACAACTAACAGAAGAGGAGAGCCAGTTGACTCAAAAGCAGATGGTATGTAATCGCCTTGAAAAGCTACTTGCTGGAAAGAAGACTCTAATAGTTCTAGATGACCTGTGGGAGGATAATGGATTTCAATTGGATAATTTGACAGATATGCTAAAGGCTGGTGAAGGCAGTAAGGTGGTTGTTGTAGTAACCACACGTGATGGGGACATTGCAAAGAAATTTCATACCATTCAACCACACAAATTAGCACACTTAACGGATGACATGTGTTGGACTATAATAAAGCAAAAGAGTGCCTTTGAATCTAGAGATGATGATAAAGAAAAGTTGCAGAAGATAGGAAGGGACATTGCAAAGAAGTGTGGAGGTGTTGCCTTAGCAGCTGAATCACTTGGATATATGTTGCAATCAATGACGTGCGATGAATGGGAGTCGGTGAAAGACAATGATATCTGGAATATTATATCTTCTTCACACTCACCAGATCAGAATGTGCTTGCATCCTTGATGTTAAGCTATAGCATCTTTCCGAAAGGTCACAAGATAGTTAAAGATGATCTGATTCACCAATGGGTTTCTTTGGGTTTCATTGGGAACCAGACATATTGTTCACAGTCCCCAAAACAAAAAAACATATTCTCAACTAGGCAGCTCAGCGAGAGGCTTGAGTGCCAGCCGGTGGAGCGCGATGGGATCAAGGCTGCGGCAACCTTGCCCCTATCGGCGAGGTCAAAGATTGCTGAATCACATCACGAAGATGTTACAATATTCACCATGCATGATCTAGTGCATGATGTAGCAAGATTGGTCATGATCGATGAAGTTCTACTTACTAGTGAGCAAGCCAACACAGACGGAATCAGCTACCATTATGCGCTGCTCAGTAATTGCATCGAACCACTAGAGACATCCACAGATTACCCCAACAAGATAAGGGCACTTCGCTTTATGAACTGTAAGAAACATAGACTTGACGATGGTGCATTTTCATCTGCCAAATTCTTGCGTGTCTTGGATTTGAGTGAATGCTCCATACAAAAGTTGCCAGATTCTATTGGTCAATTGAAGCAGCTGAGGTATCTTAATGCCCCTGGGGTACAAGATCAAATGATCCCTAATTGCATCACCAAGCTTATAAAGTTAATGTACCTCAGCCTTCGTGGGTCTTCTAAACTATTGTCACTGCCAGAGTCAGTTGGAGAAATGGAGGAGCTGATGTATCTTGATTTATCAGATTGTTCAGGAATTCGGGAACTGCCAGAGTCGTTTGGCAAGCTTAAAAAATTGCTGCATCTTGATTTCTCAGATTGCTCTTGTATCAGAAGTTTATCACTGTGTCTGGGGAGCCTCACGGAACTGCAATATTTGAACCTGTCATGCAGTTCAGATCTGTATCTACCAGAGGTACAATTTTTGGGTAATCTAACCAAACTGGAATATTTGAACCTTTCATGCAGTTCAAATCTATTTATACCTGGTGTGCAATTTTTGGGCGCCCTCACCAAACTTAATTATCTGAACTTGTCATCACAGCACTCGAATCTCCAGAGTCTACCGGAAGATTTTGGTAGCCTCATTGAACTCAAGTACTTGAGCTTATCAGGTTGTGATATGATAGTAGAATTACCAAGATCTTTTGAGAAGCTAAAAAATTTGGTGCATCTGGATTTATCATGTTGTAGTTCATTGTTAAGTATACCTCAAGCTTTACATGGCCTAGCCAAACTCGAATATTTGAATTTGTCACTGCAGAATGGAGAAATCCATCAAGATAAGTTACCTCTCATAGGGTTGCCGGAAGTCATTGGCAGTCTAAGAAATCTGAGATACTTGAATTTAGCACGGTGCATGGATTATGTCTTTGACAACCCATCAACAGATCAAACTGACAGTTTCATTGGTAGCATCAGCACTTTTTCCAATCTAGAGCATCTGGACTTGTGTGAGAATAAAATTCTTTGTCGTTTACCTGAAAGCATTGGCAGCCTGAGGATGCTACATACGTTGAACCTTTCAGGTTCCAGCAAGCTAGCAAGGCTTCCAGAATGTTTGATTAAAATGGAAAGTCTGAAGGTTCTAAATGTGAAGGGCTGCAAATTGTTTGAGGCCAAGCTTCCTCAATCCAACTTCCTCTTCACGTTGCCTCACTTTGTGGTGCACGCCGGTGAAGGTCAATCTAGAAGCAATCTTCCTCTCCTTGAACATGCAATTCTTGATAAACAGTTGGAGCTCAGTAGGCTTGAAAATGTGAAGTCCACACAAGAGGCGCGGAGTATAAAATTGATTGAAAAAGAAAGCATTAATGATCTCAAGTTGGAGTGGACCAGAGGCGCTGATAGGTATGTTGAGGACATGAATGTGTTGGAAGAGATGGTGCCACCAAGCACTTTAACGGAATTTAAGATAGAGGGTTATAGTAGCATCAGCTTTCCATCCTGGGTAATGAATACTGGAAATCATCTCCCTAATCTCGTCAGAATTATTTTGTGGGATTTACCAAAGTGCAACAGCCTGCCGCCTTTTGGTCAGTTACCAAACCTAGGAAATATTACTCTTGGACGCATGCATGGCCTTAGAAGAATTGACAGGGGCATCTATGGTGGCCCGGGGGCATTTCCTCGCTTGACACGATTTCGCCTATTGGCTATGCACAACTTGGAAGAGCTGGATTTCAGGGACGATCTTCAAACACAACTCGTGTTTCCTGTGCTTCACAATATGGAAATTTCTGATTGCCCCAAAGTAAGGATGAAATCGAGCCCACCTAGAGCTGTAAACTGGACAATAATACTCAGTGATAATGTACTATCATCACGGGTAGAGAGATGTCACACCTCTGCTTCCTCCTTTTCTGCAGTGGCTTGCCTGTCAGTCCATTTATGCAAGCTGGTGCCTATGCATCAGTGGCTGTTGCTTTGCCACCTCCCTCCCCTTGTTGATTTACATATCGAGGGATGCGGCGATCTGAGCAGCGCATCACCGGAGATCATCCGAGCCCTCTCCTCCTTAGAATCACTGACACTAGAAGACAATGACCAGGGAGAAGGACTGCCAAGATGGTTGGGTGAGCTCCAATGTCTACAGGACCTGAGTTTAGTAGGCTTTCAAGAGCTGAAGGACTTGGAAGGGAACATGAGGCGGCTTACTTCGCTACAATCACTAGATCTGTATGGATGCAATACCATGGCATCACTACCACAATGGTTAGGAGAACTCACCTCTCTTGAAAAGCTGACATTGAGGTACCGCAAAAATCTGAATGATTTGCAACAGACAATGTGTGACAACCTCACCTCCCTGCAGCCACTAACATTGGAAAAATGCGTTAGAATTCCTTCTCAACCTGAAAGGATGAGCAAACTCAACTCTTTGAAAGAACTAAAAGACAATCAGGCAGAGCAACCAAGATTGTTGGGTGGGATCACATGCGTACAGAACCTGACTTTAAATGGCTTCCCTGATCTGCTGGACTTGCAAGGGAGCATGAGGCAACTCACTTCACTACCATCACTATATCTGTATCAATGCAATAGCATGACATCGCTACCACAATGGTTAGGAGAACTTACCTCTCTCAAAAGGTTGAGGATAGAGGGTTGCGAAAAGCTGAATGATTTGCAAGAGACATTATGCAACATCACCTCCCTACAGTCACTAGAATTGGAATTTTGCCACAGAATTCACTCTCTGCCTGAAAGGATGGGTGACCTCATCTCGCTCAAGGAACTGCAAATCGATAGATGCAAGGGCATCAGTTCATTGCCAGAGAGTATACAACAACTCACTAATCTCGAAAATCTATGTATTCATATGTGCCCCGGATTACGGCAGTGGTATCAATCTGATGAGAACGAGAAGAAACTCGCTCACATAAAAAAAAGGGTATGTGCACAACCGAGCTATGCTATATTTTACGGAGAAATCTTTTATGACAATTTATTAATATCTGCTGCATTAGCAAGACAAGCAGTTGGGGGTGAATATCAGGTGGCAAAATCAAAGCCCTTGATCAACTTACAAGATTTTTTCCATGGCCGAAATGAGATTGATCAGCTCGGAACTGATGTTTTCATGAGAGTCCATAGCATGCAGCAGATTCAGAGGGAACAAAGCTCAGCACATCCTCAATCTCTCCAAGTACAGTTGTATCTGCTGACATTTAACAGCACATCAGAGTTAACCACCGTATGGCTCGAACACACTCCAGGCCAGGCCAGGGTACTTGGTAACTGA
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Protein seq | MAEVGGMLAAAVLNFVGQQISSVIAGQITLQWDFNDDLKKMKSTLESVAAVLEDAEKQSIKEASVRLWLKRLKSAAFAISDMIDEFEADTQGIQPPAKKMSSIKKGLLQLATMIPCLTVGPRIILANKMKAMRGELRVITDEHTSFKLKVAPTANGVNIPDERETSSTVDKTLIIGRAEDKQIIMDSLSKSMTNDFTVLPIYGIGGIGKTTLAKLVFNDTQFKNYSRVWVYVSQIFDLNKIGNSIISQLTEEESQLTQKQMVCNRLEKLLAGKKTLIVLDDLWEDNGFQLDNLTDMLKAGEGSKVVVVVTTRDGDIAKKFHTIQPHKLAHLTDDMCWTIIKQKSAFESRDDDKEKLQKIGRDIAKKCGGVALAAESLGYMLQSMTCDEWESVKDNDIWNIISSSHSPDQNVLASLMLSYSIFPKGHKIVKDDLIHQWVSLGFIGNQTYCSQSPKQKNIFSTRQLSERLECQPVERDGIKAAATLPLSARSKIAESHHEDVTIFTMHDLVHDVARLVMIDEVLLTSEQANTDGISYHYALLSNCIEPLETSTDYPNKIRALRFMNCKKHRLDDGAFSSAKFLRVLDLSECSIQKLPDSIGQLKQLRYLNAPGVQDQMIPNCITKLIKLMYLSLRGSSKLLSLPESVGEMEELMYLDLSDCSGIRELPESFGKLKKLLHLDFSDCSCIRSLSLCLGSLTELQYLNLSCSSDLYLPEVQFLGNLTKLEYLNLSCSSNLFIPGVQFLGALTKLNYLNLSSQHSNLQSLPEDFGSLIELKYLSLSGCDMIVELPRSFEKLKNLVHLDLSCCSSLLSIPQALHGLAKLEYLNLSLQNGEIHQDKLPLIGLPEVIGSLRNLRYLNLARCMDYVFDNPSTDQTDSFIGSISTFSNLEHLDLCENKILCRLPESIGSLRMLHTLNLSGSSKLARLPECLIKMESLKVLNVKGCKLFEAKLPQSNFLFTLPHFVVHAGEGQSRSNLPLLEHAILDKQLELSRLENVKSTQEARSIKLIEKESINDLKLEWTRGADRYVEDMNVLEEMVPPSTLTEFKIEGYSSISFPSWVMNTGNHLPNLVRIILWDLPKCNSLPPFGQLPNLGNITLGRMHGLRRIDRGIYGGPGAFPRLTRFRLLAMHNLEELDFRDDLQTQLVFPVLHNMEISDCPKVRMKSSPPRAVNWTIILSDNVLSSRVERCHTSASSFSAVACLSVHLCKLVPMHQWLLLCHLPPLVDLHIEGCGDLSSASPEIIRALSSLESLTLEDNDQGEGLPRWLGELQCLQDLSLVGFQELKDLEGNMRRLTSLQSLDLYGCNTMASLPQWLGELTSLEKLTLRYRKNLNDLQQTMCDNLTSLQPLTLEKCVRIPSQPERMSKLNSLKELKDNQAEQPRLLGGITCVQNLTLNGFPDLLDLQGSMRQLTSLPSLYLYQCNSMTSLPQWLGELTSLKRLRIEGCEKLNDLQETLCNITSLQSLELEFCHRIHSLPERMGDLISLKELQIDRCKGISSLPESIQQLTNLENLCIHMCPGLRQWYQSDENEKKLAHIKKRVCAQPSYAIFYGEIFYDNLLISAALARQAVGGEYQVAKSKPLINLQDFFHGRNEIDQLGTDVFMRVHSMQQIQREQSSAHPQSLQVQLYLLTFNSTSELTTVWLEHTPGQARVLGN
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|
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKYG_11g0007010 | OsKYG_11g0007010.02 | Chr11 | 5814942 | 5817162 | - | IsoSeq | ||
CDS seq | ATGTCTACAGGACCTGAGTTTAGTAGGCTTTCAAGAGCTGAAGGACTTGGAAGGGAACATGAGGCGGCTTACTTCGCTACAATCACTAGATCTGTATGGATGCAATACCATGGCATCACTACCACAATGGTTAGGAGAACTCACCTC |
|||||||
Protein seq | MSTGPEFSRLSRAEGLGREHEAAYFATITRSVWMQYHGITTTMVRRTHL |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
A5 | Chr11 | 5815317 | 5815465 | - | OsKYG_11g0007010.02 | OsKYG_11g0007010.02,OsKYG_11g0007010.01 | All |
A5 | Chr11 | 5815586 | 5816219 | - | OsKYG_11g0007010.01 | OsKYG_11g0007010.01,OsKYG_11g0007010.02 | All |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 1.113749 | 0.0 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0211600 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g10570 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0211600 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0007060 | RBH | 0.0 | 0.993930 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0007150 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006950 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.376646 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0006970 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0007000 | RBH | 6.293403 | 18.798403 | 15.241825 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0092600 | RBH | 2.596614 | 18.283927 | 14.3694515 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0006990 | RBH | 0.265612 | 0.373630 | 1.365511 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0099500 | SBH | 0 | 0.409908 | 0.0101205 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0006990 | RBH | 3.082204 | 1.990578 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0007020 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006970 | SBH | 1.186617 | 7.702504 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_Ung0064390 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0007110 | RBH | 0.280194 | 5.345597 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G007160 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0007010 | SBH | 0.0 | 1.563471 | 0.0 |