Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKYG_03g0020940 | OGI:11025440 | 1/16 | KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr03:17848358-17857241 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKYG_03g0020940 | OsKYG_03g0020940.01 | Chr03 | 17848358 | 17857241 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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GAAGGGAACCATGGGATACATAGCTCCAGAGCACACTCAAAGTGTCCGTGCATCAACCAGTGGTGATGTTTATAGTTTTGGGGTAGTACTTATGGAGATGCTAATAGGCAAAAGACCAACAGACTCTATGTTCGAGAATGAGCTGACCATTACCAACTTCGTAGAGAGGAAGTTTCCAGATCATATATTACATATAATTGATGTTCATCTCCAGGAAGAATGCAATGGATTCATCCATGAAACAAGGAAGACAGAAAATGCAACCGTATGCTTGGTTTCTCTCGCACAAGTCGCCCTTTCTTGTACGCGTCGGATCCCAACAGAACGTATGAACATGAGAGAAGTAGCCATTAGGTTGCATGCAATTCAATCGTCATATGCCGAAGCAATCAGGCAAGAGAGCTAA
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| Protein seq | MGFKCAKQHKKTDVLTLLALLLLCYEVGNVSASVHENSVDLQALLEFKQGISNDPNGALRNWNTNTHFCRWNGVSCNVTRRPLRVTELNLTAQSLTGEISSSLGNLTFLNTLDLSNNNFRGPVPPIRNMQQLQTFYLYNNFLDGTIPADAFTNCSNLGYLDLSIDSLTGSVPQNIGFLPSLIFLRLDHNHLTGTIPPTLGYATNLMTLCLDSNNLSGTIPPTLGNATNLIHLYLRVNQLEGSIPDELGHLTNLSELLLNENFLSGRIPQAILTLSSLQYLDLGTNNLSNALPPNIGNALSNLIELMMGRNVFEGHIPSSLGNILGLEMIDLSSNNFTGEIPSSFGNLLNLTYLFLSDNMLEARESQGWEFLHALGNCNLLRKLPIQNNLLQGVIPNSIGNLSINSLELLSLGSNNLSGTIPPSIGNFSALNKLGLQHTISVGLFLNGNNFTGSVPSSFGNLLQLTQITLDTNDLEGPIPPSLGNLSQLNILGLSYNKFRGNIPSSLGNLNQLVILDLSYNKLQGNITLEVSNLQQLTELYLSSNKLTDHIPDILGQCQNLKIVELDLNLLTGSIPISLSNLKTLSMLNLSHNNLSGTIPTALENLQFLTQLDLPYNNLKGKVPTKGVFTNSTAISLISNWGLCGGSPDLHLPPCCIVSPRKEIQYYLVRLLILVFGLASIILLFHFLLPVETVSRGKLLLMVSFGKQFPKVSYRDLARATLNFSEANLVGRGSYGSVYKGKIVQAKMQVAIKVFDLEMRCAGKSFTSECEVLRSIRHRNLLPILTACSTIDNLGNDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSDEALGLGQRISIAGNIADALSYLHHDIGTSIVHCDLKPTNILLNVDMNAYLGDFGISNLVHNLTSTLACHSGLDSSLNSSIGLKGTIGYIAPEYAQSGQTSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPMFDNGLNIVIDVNVQEECKGFIEATAVEENEVYHCLLSLLQVALSCTRLYPRERMNMREEQPPKLAMYIQLVLLLLCYGVGNDVVHCSTVHENSVDLQSLLDFKKGITEDPGVLLSWNASTNFCRWNGVICTTSRPWRFRGAISPKIGSLINLQAVYLQQNYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTGLALGQNKLSGGIPSVLNLPLLTRLGLEENMLGQVLPPKISYALPSLQLISMYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGWEFLYLLTNSTSLTVFSLAQNHLQGSLPHSVANLSSNLKILLLGENKLTGIVPPSIGNLCNLSKLGLEQNNFSGEIGEWIGKLKNLQGLNLGGNTFFGPIPPSIVNLTLLTELFLDNNKFEGTIPTALSYLQLLSKLDLSHNHLKGEIPRNGIFGNATAVSLDSNLRLCGGVVDFHMPLCSAVPLKIEKRSYLVRLLIPIFGFMSLTMLIYIITLGKKKPRRTYLFLFSFGKQCPKVSYSDLARATGNFSESNLIGRGSYGSVYKGKLTQAKIEVAIKVLRTIRHWNLLPILTACSTIDNRGKDFRALIYEFMHNGNLDKWLHHGRAGVVRKLLSMDQRVSIAVNIADALVYLHHDCGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFCIASLVVDSSLTSDGNSGCNSSIVVKGTMGYIAPEHTQSVRASTSGDVYSFGVVLMEMLIGKRPTDSMFENELTITNFVERKFPDHILHIIDVHLQEECNGFIHETRKTENATVCLVSLAQVALSCTRRIPTERMNMREVAIRLHAIQSSYAEAIRQES
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.341850 | 0.0 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_03g0266800 | SBH | 6.346891 | 2.673302 | 24.880722 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os03g32580 | SBH | 8.105267 | 6.763444 | 5.492181 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os03g0266800 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0025000 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0025160 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_03g0012010 | SBH | 2.019270 | 33.076569 | 46.621746 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_03g0011960 | SBH | 0.133299 | 1.480447 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_03g0011840 | SBH | 6.577065 | 38.593311 | 48.350948 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_03G0269200 | SBH | 2.0696815 | 0.291296 | 0.5328865 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_03g0011740 | SBH | 0.283807 | 3.740010 | 3.844299 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0425700 | SBH | 0 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_03g0036270 | SBH | 0.288780 | 0.091189 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0023900 | RBH | 0.000000 | 22.513935 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_03g0035940 | SBH | 6.457238 | 18.073820 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024690 | SBH | 0.035031 | 0.082412 | 0.021348 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_03g0035980 | SBH | 1.090934 | 8.124420 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G025060 | SBH | 0.363832 | 0.0 | 1.463381 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0024890 | SBH | 0.206270 | 0.000000 | 0.311611 |
