Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKYG_01g0015360 OGI:01042190 | 6/16 KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:14258932-14272622
Gene Symbol -
DNA seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_01g0015360 OsKYG_01g0015360.01 Chr01 14258932 14272494 + NAM
CDS seq

ATGGATGCTCTGATGAAACGCTCCCGCTCTTTCGCGGAGGCGGTGGTGATCATGGTGTGCCCGGTGCTTCTCGCCATCGCGCTCAAGAAGGTTGACCTGAAGAGCCAGGAGCACGGGCCGGCCATCCCGATCGCCATGCTTGTCATGGCAGCCATCACGCTGATATCCGGCACATTCCCCTTCCTGGCACTCTGCTTCTCCAAGAGGTTCGTCGCCAATGGCGCGTGGAGGCTCCCTACAACGGCGACCAACTGCCTGGCCCCGTTCTCCTGTGCGTGCCTCATCGTCCTCGCGTGCTGGGTCATACGCCTCATCCTCTCCGAGCGCTGGGCCAACGTCTTCCCCGCCATTGGAAGCGTGCTCGTGCTCTGCATCCTGGTCCGTACTGTCGTCTACTGCCGTGCACGGGTTGACCCGGTTGACGATGGCGAGCTGGATGGTAAGCTGGACAACTCGCTGGAGTTCTTGGCCGGAGTCACGGCGCTGCTGTTCTTGGGGCTGGAAGGGCTGGCGCTGGAGGGACAGAGCAATGGCGGACAGGGAGGAGGGCAGCATCGTCTCGCCGCGCCTCTGGGAGTGAGCTTCGTCGCTTGCGTGTTTGGCGTGTCGCTCATGCTCGTCGAGACGATCCCGCCTCTCCCAGATGAAGAAGCCCATGGCAACGACGTAGGCGTCCATGTCGTCATCGTGTCAAACCTTACCGTGATATTTGACATCGTCATGGCTCTCGCTGTCTCGGCGGTCATGTGGTCCATCATGCACGCGATCGTGGAGCTGCGGGCGCTCCTGTTGGTGTTACCGCTCTTCCTCATCTTGCTGGTGCGTGCATACGATGTCGTTGTCGGCGCCGGTGGCGGTGGCGGTGTCGGTGTCGGTGTCGGTGGTGGAGAGGATGAAAAGCCGGCGTCGATGGAGCTGACCAAGGTCACGTTCACCGGGTTTCTGGCCGTGTCGATACCAGCTGTCAGGACTGGCTCACTCTGCAGCTCCACCGATTGGTTCCTCATCTTTGCGGCATCCGCCATTGTTTCAGGCTTCGCTTGGAGGCTCCTGACGCACGCCAAGATGGGGACGACGGCCAATTTCGCTTCCTTCTGCACACATTTCTGCATTGCCATTGCAACGGCGTCCGTCTTGCTTAATATGGTTGCAACCACGTCCCCGTATTCACCGCTTCTGCAAATCATACCAGCCGCCGGCTGCTTTCTGAATTTACTAGCGGCCGATAAGGAGTACAGGGACCGTCCCGACATCGTCAAAATAATTCCATTCGTTATCTTGCTTCTGCACATTCTCTCCTATGTCGGTTTTGTTCTGGTCCAGAACCACAAGTATTCCAACATCAGGGTGTACATCGACACCGCCATCGTGGTGGTGGCATCTTACTTGTCCCTACTCATGGTGAACGCGGGGTACATCGTGCTCGCGATCTTCCCATTCATCGCGCTCGGCTTCATCGTCGTGTTGTGCAGAGCTCTGGTCGGCCGTGGCAATGGCGCCGCCGATGCTGACCAAGCAGGCAGTAGTACAGGTACCGGCGGCGAGGCCATAAATATTGACATAGGCAAGAAGGCAATGCGAGAAGCCGAGCAGCTGAAGGCTATTTCCATAGGGCCCTACTTGCTGCTTGGAGTGATGGGGCGATTAAGTCCGGAGAACTTGGCTGTCTCCCGGTTCCTCCTCTTCCTAAGCACCACCCTAGGTACGCTGATGCTGATGATGATTAGGCTGCCCGCCGGCGTGGTCGCGCCCGGTGTCAAACAGGCGTCCGATCTGCTCCGTAAGACCTCGCTCGTGGTGCTGCTTGTCACCGTGCACACGATGGCAGCAGAGTTGCTTGGCGAGAACGTCGTGTTGTTCCTCATGCCGGAGCTTGTCCCCGCGCTCCTCTGGTTCAGCCTTAACATCGACCGTGGCAGCCCGGTTATCACGGTGGACACGATCAAATCGTGCAAAAATGGACTCATCTTCCTCGGCACACCAGCGGCGATCTGTCTCGTCGCGTACTTGGCAAAATCCATGGATGAGTCTGGAGTCTCCGGGTGTGTGATGACTTCGGTGTCATGTGGAGTTTCAGGCCTTCTAGTGTACTATGTTGTGTTCATGCTGCGTCAGTGGCCAGCGGCACAGAGCACGGCCACGGGCACCAGTGGTGTCTATTCTTTGGGGGAGTTTTGGGCAATCTTTCTGCTGGTAGCAGCCGCTGCGTTACTGCTATCAGCATCGGTGGCTGCTGTCCGGCTAGGTCTGCATGAACAAGCGGTTCCTGCTCTGCTCAAATTTCTGAAAGAATACTACGTCTAA

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Protein seq

MDALMKRSRSFAEAVVIMVCPVLLAIALKKVDLKSQEHGPAIPIAMLVMAAITLISGTFPFLALCFSKRFVANGAWRLPTTATNCLAPFSCACLIVLACWVIRLILSERWANVFPAIGSVLVLCILVRTVVYCRARVDPVDDGELDGKLDNSLEFLAGVTALLFLGLEGLALEGQSNGGQGGGQHRLAAPLGVSFVACVFGVSLMLVETIPPLPDEEAHGNDVGVHVVIVSNLTVIFDIVMALAVSAVMWSIMHAIVELRALLLVLPLFLILLVRAYDVVVGAGGGGGVGVGVGGGEDEKPASMELTKVTFTGFLAVSIPAVRTGSLCSSTDWFLIFAASAIVSGFAWRLLTHAKMGTTANFASFCTHFCIAIATASVLLNMVATTSPYSPLLQIIPAAGCFLNLLAADKEYRDRPDIVKIIPFVILLLHILSYVGFVLVQNHKYSNIRVYIDTAIVVVASYLSLLMVNAGYIVLAIFPFIALGFIVVLCRALVGRGNGAADADQAGSSTGTGGEAINIDIGKKAMREAEQLKAISIGPYLLLGVMGRLSPENLAVSRFLLFLSTTLGTLMLMMIRLPAGVVAPGVKQASDLLRKTSLVVLLVTVHTMAAELLGENVVLFLMPELVPALLWFSLNIDRGSPVITVDTIKSCKNGLIFLGTPAAICLVAYLAKSMDESGVSGCVMTSVSCGVSGLLVYYVVFMLRQWPAAQSTATGTSGVYSLGEFWAIFLLVAAAALLLSASVAAVRLGLHEQAVPALLKFLKEYYV

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_01g0015360 OsKYG_01g0015360.02 Chr01 14271045 14272622 + IsoSeq
CDS seq

ATGTGGAGTTTCAGGCCTTCTAGTGTACTATGTTGTGTTCATGCTGCGTCAGTGGCCAGCGGCACAGAGCACGGCCACGGGCACCAGTGGTGTCTATTCTTTGGGGGAGTTTTGGGCAATCTTTCTGCTGGTAGCAGCCGCTGCGTTACTGCTATCAGCATCGGTGGCTGCTGTCCGGCTAGGTCT

Protein seq

MWSFRPSSVLCCVHAASVASGTEHGHGHQWCLFFGGVLGNLSAGSSRCVTAISIGGCCPARS

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.802931 11.800835 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0346250 SBH 0.166765 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g24420 SBH 0.069458 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0346250 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0016050 SBH 0.275327 8.258671 0.328700
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0015670 SBH 0.149901 0.000000 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0015910 SBH 0.736315 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0015370 SBH 0.101442 0.167814 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0015480 SBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0231600 RBH 7.908259 11.408142 0.0090835
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0015480 RBH 0.397777 0.0 0.169642
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0226800 RBH 0.1286275 0.127195 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0015390 RBH 0.028803 0.046254 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0015380 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0015570 RBH 12.598705 6.374400 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0015460 SBH 0.849929 0.137199 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0015250 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G015730 SBH 0.370823 0.000000 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0015500 SBH 1.939999 1.835250 0.0
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