Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsIR64_04g0026250 | OGI:04092930 | 16/16 | IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:31395348-31419568 | ||||||||
| Gene Symbol | RGAb, RGAc, PIPR1, OsPiPR1, RGAd | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MGLPPSLRGLSLRGCSDELSMQCRMAATEKLQIRSSHKEHFGPKGYDTGAIKGSMATCVPVCQTERQNSPHLLVETEAKQSSNQSMLLLSFWETNKNAAAAAAAVSPAPPATARRLSPPPLPNPIALVVLCLQLPGPHFLSRARVSPQQQQHGGLGCTVVRTGLMGVEWSVVDAAIGWLVQSVLGTLLAGKLEAWTREVGLAGDVRRLEVGMRSVEMVLAAAAARGRELVGNEPLARSLDDLRQLLYDAEDVVDELDYYRLQLEIEQREDAAAAVDSCVEGGNASSFSSTSSSTCRLVWNAATKLTSWASMAVDFVMAHAGSKRKRGQYELAQDDDTVVVVVPFENKDDISRRINEIATSLCTISDSVHKAIHLEASYCIAVTKEGVVSNRRLTTSVPVEQKVYGRDSDRDMIVELLVNGKSRDLNVLPIVGNGGVGKTTLARFVYRDRRIKDHFDLQMWVCVSSIFDEVRLTREMLEHACRDRQDCEKISSFNVLQEMLMDSVRNRRFLLILDDVWEDKDKNRWNRLLAPLRQNQTVGCMILATTRSPSVAKKIRTLTSVELKGLDDDNFWLFFKQCAFGDENHGDHPSLQVIGQQIAKTLKGYPLAAQSVGALLGQNLNYEHWWKIRDQWASLQKGDDDILPILKLSYDYLPSCLQRCFSYCSLFPQEHKFDGEKLIFAWISQSFVSCKDTKNRVEQTGREYLDKLVDLGFFQKDGPHYVMHGLMHELAQAVSSNDCATIDGLKSNSIPSTIRHLSIITSAYDEVEHDSFPTDKFERQLEKITCLKKLRTLMFFGHGPYGNRNLLKCLLTLCKHAKGLRYLRVHFAFMLIDALWNSIKPFHLRYIEFFNGSITFEKSCWWETEDGPRFSNVYAQLLPTCYHLQALDAGSSSNLVPRRINNLVNLRHLIADKERHSEIANVGRLTSLQELRKFRVENVDGFEIGQLQQMNELVSLGIFQLGNVKTKEEARRARLIDKDYLENLCLVWDDSTTSLKPAMATAEEVLEGLHPNRNVKRIKIRGYNGAICPMWLGSNVSVPLLRSLHLKNCSEWRAIQLEEISSLGKLNLIRMWSLVDVSIPSLDELVLIDLPNLEKCIGTYNRELTSNMRILRMERCGKLKDFTLFLNYDHFRVERKTWQWTILPFEEMHSLKDLKLIAMPGVREVSVPYLKKLVIRNMPNLECCTCANLDLLSSCLEVLKITKCRKLTSFQVLQVSPPHCEEKTWLPNMNKLKVSVSIRGVLAPPAIEMRKHWPLFTIKSYEWSVLNDDTVAFNNLTSILNFRIINCPNLVSVSFEALSQLRSLQSLEIVDCPRLLWPQMMLEEACEGKTKFPSITHLSIVSSSMLGDPLLLPCTQSEQLTVNDKPSTFSCPVEEQSNHLSLLYISSTTTTATTESTRNGPILFHMPHLLYTYVKKLHISDCPNLVFCSRKVGFAGFTSLEELTVTRCPKLLMPMVHEGVSDDHIGGRFLLPPLLNQFETDHLSEKLQLYFPENHTSLRRLSVWDSPSLICLQLHSCTKLEELEIFNCKNLCTLGGLTFLSSLKIMKLARNPKLSTSWEFDSQDQQGTGDQAGDLSILSGLEWLETDDFSVLTMSFFKHLNSLRHLTLSSSRSYWRVVRLSEGQGRVLQQLTHLQELRFLCCDDLLVLPEQLHCLSSLKKLEIGYCPGILRLPEEGLPLLSLEELETRGCTEELNRQCRLAATEKLKVLIDGKVWNTVGQAAIGWLVESVLGSLFTDKLSSWLRRVNLDDDVEELVSEMRNVAVVLEAAKGMKVGDQNEPMAGSLLHLKDLLYDADDVLDKLDYCRLQEQIIKGNSEDVKSTPTSSFFSINRWFTVTGWKRKREENHTLLDNKRQFSATIKQIAGKLRDARGDVSKGLKINGLKSPEASNLSHRSTARATNATTTSYVLEPIVYGRATEIESIKNLIMSNRSDGMIVLPIVGNGGIGKTTLAQQIYKDSEIGKSAIKIWIHVSDKFDLHKVTREILECVSKKKQKETSNFNMLQQDLEENMKSKRFLIVLDDVWDVTTDCWNKLLAPLRANHVNPSKEKVTGNSMVIVTTRKNTTAKLCGTVGSINLEGLKDDDIWSLFKAYAFGSDKHSNNPILQNLGRKIAKELNGNPLAAKTVGSLLRRNLTVDHWSSIIENKEWKSLQHTDGIMHTLKFSYDHLPSHLQQCFSYCSLFPKGYSFSEAQLIQIWIAQGFVEKSSEKLEQKGWEYLAELVNSGFFQQVENEWPSSEDIVLHDLMHDLARMVSKTECATIDGSECEKLAPSIRHLSIVTDSAYSEDPHGNISRNEEFEKRLLKVMSRSKLRTLVLIGQHDSLFFQSFQNLFKEAQHLRLLQMSSTYANFDSFLSNLVNYIHLRYLRLENEECEGALPQALDKCYHLQVLDIGSCTTPNEYVSNVSYVNGYDSDMSSEPSMDMETEGEELPSSDSNGSPSLEYFTDIISNEVIYGLEPHHSLKHNGVASPTCLATSLTSLQTLYLENCGKWQILSLERLCLLKKLVLIRMSNVVEVSICSLEELVLIKMPKLKRCFCTSIRNLNDNLRVLMIKTCPALEVFPLFDNCQQFKIEQPSWLFRLSKLVIHKCPHLHVHNPLPPSTNVSKLSITGVSTLPTVEWSRGILRIGVLDHSGDPSVIDEPSDQLITLDDKVLSFHNLRFLTELVIAGCQNLTSISLQGLRQLIYLRTLEIRGCPKLFSSNMPPELVRENMAATYHNALPSLEYIFIAACGITGKWLSLILQYAQALQDLDLYECPQITGLSIGEEESSQANLMSTPETLSLGHQGDSPTSSARDGLVRIPLNLISSLKHIYIGDCPGLTYNGNDEGFAKLTSLESLRISNCAKLLSSLVHGNGYDERKNIKLIPLSLEVLELRGDLPEEVVPDFLRNPIRLKKLSVMDTLSLKYLQLQSCTALEELEIVNCESLATLEGLQSLRSLKNLIIWGCPILPQWLRSSLEQVQELLPRLERLEIEDASVLTTSFCKHLTSLQRLTLFACNWELVRQTDEQDIALQLLTSLQELSFTCCRNLGDFPVDLYSLPSLKRLNIYYCKDISRLPEKGLPPSLEELDINDCSEELNDQCRMLPSKLKEDEQRRRFTNYLRFAFPMRTTSTEGRLLNQMLGCSGLSFRSLGRIPLAPLPHRRLDPRRWAVAGEVPSR |
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| Function | Disease resistance protein RGA2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XBQ9] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsIR64_04g0026250 | OsIR64_04g0026250.01 | Chr04 | 31395348 | 31419568 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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|
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Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 0.066579 | 0.089628 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0621500 | RBH | 0.234283 | 0.758905 | 0.758510 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g53030 | RBH | 0.183174 | 0.513526 | 0.189823 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0621500 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0027010 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.467856 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0027730 | RBH | 0.032582 | 0.091726 | 0.118973 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0027490 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0027160 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0027430 | RBH | 0.803315 | 0.589062 | 0.756611 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0497400 | RBH | 0.7699455 | 1.2640205 | 1.43007 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0026230 | SBH | 0.157292 | 0.051971 | 0.361639 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0501600 | RBH | 0.6534845 | 0.8790395 | 6.51907 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0026670 | RBH | 0.0 | 0.220850 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0026480 | RBH | 0.000000 | 0.535674 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0026550 | RBH | 0.000000 | 1.231571 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0026990 | RBH | 0.000000 | 0.076545 | 0.000000 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0027180 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G026400 | RBH | 0.000000 | 0.429317 | 0.108574 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0026260 | RBH | 0.0 | 2.343623 | 0.470135 |
