Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsGoSa_11g0018880 OGI:11035040 | 5/16 GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:25301191-25314906
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

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Function Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F7J0N2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsGoSa_11g0018880 OsGoSa_11g0018880.01 Chr11 25301191 25314906 + NAM
CDS seq

atggaggctaccatcactgcctcgctgggagccatgcgctctcttcctagcaaactcgatcggttattatccgaacggaagttggtattgcacaacggagagaagagtagtctctgcatcctcaaaggcgacctggaagtattcattgagaagtaccttatggagccatcgtcagaggtgggggatcctgccttcacgaccaactactggttgaaggaggtgcgagagttgtcttacgacatcgatgacttcgttgataagctcttacacggcgctgccactgcagcagctcatgccaagaatcctaaagttcgcttaaaggcttctaaatttttagctcaaaagaggccgaaaatatggaacccattggtaccattggttgtaccgccggtgattgctgttgcctctgctgcggtcgatgccaagatggcctcttgtctgcaggatcgaaagaagcggcggtggattgccagcgaggtatcaacgttcatggctcgcataaaggaagtgattcaactgcataaatcttatattaagagtaaagtgaggcagcctggttggtgttctgatgaaaccctgtcagttctaccattagccgaagagagttccctcgaaaaaaaattagccgaagagacaggccgtgaccttgtcggtatagacaagaacatggataagctttcttgctggctagttgatgatggccaactagagtgtaaggttattgccattgttggacctggcggagtaggcaagaccacccttgccaaagaactgtttcagaagtttggatggcaattcgagtgtcaagcctttataagggcatctcgaaaacttaacatgaaaatggtcctctttaacatactcacacaagtagggcatcacaagcctcccattaatttggaagtggataatctggttgatgagatcaaatcatatctagaagataagaggtactttattataattgatgacgtatggactctatcaacatgggatactattaatcgtgctttaccaaaaagtaattgcagtagaatagtgataactacagaagtttatcatgtagctcaaataagttgtgctgataactccaaatatatctttaagaaggaaccgttggacgaagatgaatctaataaattgttccttcatagagctttcagtcacaaaccaaaacgtgttgaacacatcaaggaaatttcatctgaattaagtacacatctatgtggtggtttacctctagcaattattgctacagctagtattttagcacgcttgccagatagcatggagcagtggaatgacttagaaaattcattgggttctaatttggggacagagcaagttttgaacattgtttacaatactcttcctaatcctttgaaagcatgcatgctatattttagcatatatgaagaggactacataattttgaaggatgatttagtgaagcagtgggtagatgaaggttttattggtgcaatggatgagaatgacaaggaagaaattgctattggctatttttatgagttcgttaacatgggaattatccaacctgtacaaattagttccaatgatgaagtgttgtcatgtacaacgcactacatggtgcttgattttattagaaacaagtcaatagaggaaaatttctgcattgcaatagatcatacacagattgcaatacgactgagtaataaggttcgtcgactatctcttcactttgacaatggagaagatgcaacaatgccaacatatttgagattatcacaagttcgaactcttgctttttttggactatttaactatccacttcccattgtcgagttcaggtttcttcaggttttaattctccagttatcagttggtcatgatgacatcagttacgatctgacggagatctcagaattatttcgactaagatatttgtatatcagtgcatgccatttgaatataaagttaccgatagagatgcaagggctgaaagatttggtaacgctaaaaatagaagcaaaattaagtactgttccatcggacattgttgatttgccacgtattttgcacctctaccttccaagtgaagctaatctgccccatgatattgaccacatgacatcccttcgcacattagggtattttgatctcagcagtaactcaagaaaaattattatgaatcttggcaagttgaccaatctccaggatctttatctaacctgttctatgtcacagcttgatactctcaaggacaacatgaaatgcttatgttcatttcttgagaaactgaataaactcaggtctctaactttggtatgtacaggctccccttatggaattactacggataagattgatgcttcaagcatggggattagttgtgatgacttcagtgtcatttctcctctaccctttctaagaagatttgagttgtcacgacgctcttgcatccttgctcgcctacctaagtggataaaagtacttgcctatctcagaattttaaaaattgcagttagtaagctgtcaagacatgatattcacattcttagtgaattgcctacactcgctactatctcgttgtatatccaagcagcacttgaagaaatgattgtttttggcaacgcgggattctcaaatttgaggtgcttcaagttcaggtgcagtgtaccttggctaaaatttgaggcgaatgcaatgcctagtcttcagaagctcaagctaaagttcaatgctagctttaatctttacagatcagatacagatggtactaaatccatcagcatcgagcacttgtcaggtcttaaagagatatttgcaaaagtgggaaatgcagatgctagtgtagagtctgatttgatggctaccattagcaatgatccgagcaatcctacaataacatttcaaatggtagataatattttttatggagatacaagcaatggtatgaggacaaaacatgacaaaggctcgactctagggcagcaagacactatagtggaggaagggctgtgttcgaacccttctcccccgcttcctcagaggcgctccggtcaaaacattccctggcttcttcctgtgtgtggtggggtccggcctacttcaaaagctcccattgtaggccacgaccatgtgaactgtcacactggcgacctctccattgctgtcgtacaagccaacaaatctctcaactatcagagctgtgttgagtctttgcaggcattgggcactatgattggcatcttcgatggctatggtggcttcgaggccgccaaatttacatctaaccttggaaactcccaagctgttcttggaaaggtcagttgcactggagagattttcgctgagcagctatctagtgagcacatagctagtgacgcgggcatcaggcatgagctcatggttgcacaccccgatgatccggatattgttaagtccaatattaagtgccaacccatctattgtctcgcggaatcttcaacccaggacatgggaactccggatcgcatggtcggactcatcgagatagatcctcatgaaccatctgtccttcacagcctggataaccaggagtcctcaggcttgaattttccacgagaagtcaatgtgatcgatggggcggtcgaggacgtctatgaggatcgcggaggaagtgcaaaaaggctcataaatatagctcttcgtgccgcagcaaagaagcacaactggcgttattcagatctcttgaagaaagataaggatgatcatagacatctctatgatgatatgactgtcgtggtcttatttatagatcatgctcgattacggaaaggcggacgaggacagcctctttccatccgatacccttag

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Protein seq

MEATITASLGAMRSLPSKLDRLLSERKLVLHNGEKSSLCILKGDLEVFIEKYLMEPSSEVGDPAFTTNYWLKEVRELSYDIDDFVDKLLHGAATAAAHAKNPKVRLKASKFLAQKRPKIWNPLVPLVVPPVIAVASAAVDAKMASCLQDRKKRRWIASEVSTFMARIKEVIQLHKSYIKSKVRQPGWCSDETLSVLPLAEESSLEKKLAEETGRDLVGIDKNMDKLSCWLVDDGQLECKVIAIVGPGGVGKTTLAKELFQKFGWQFECQAFIRASRKLNMKMVLFNILTQVGHHKPPINLEVDNLVDEIKSYLEDKRYFIIIDDVWTLSTWDTINRALPKSNCSRIVITTEVYHVAQISCADNSKYIFKKEPLDEDESNKLFLHRAFSHKPKRVEHIKEISSELSTHLCGGLPLAIIATASILARLPDSMEQWNDLENSLGSNLGTEQVLNIVYNTLPNPLKACMLYFSIYEEDYIILKDDLVKQWVDEGFIGAMDENDKEEIAIGYFYEFVNMGIIQPVQISSNDEVLSCTTHYMVLDFIRNKSIEENFCIAIDHTQIAIRLSNKVRRLSLHFDNGEDATMPTYLRLSQVRTLAFFGLFNYPLPIVEFRFLQVLILQLSVGHDDISYDLTEISELFRLRYLYISACHLNIKLPIEMQGLKDLVTLKIEAKLSTVPSDIVDLPRILHLYLPSEANLPHDIDHMTSLRTLGYFDLSSNSRKIIMNLGKLTNLQDLYLTCSMSQLDTLKDNMKCLCSFLEKLNKLRSLTLVCTGSPYGITTDKIDASSMGISCDDFSVISPLPFLRRFELSRRSCILARLPKWIKVLAYLRILKIAVSKLSRHDIHILSELPTLATISLYIQAALEEMIVFGNAGFSNLRCFKFRCSVPWLKFEANAMPSLQKLKLKFNASFNLYRSDTDGTKSISIEHLSGLKEIFAKVGNADASVESDLMATISNDPSNPTITFQMVDNIFYGDTSNGMRTKHDKGSTLGQQDTIVEEGLCSNPSPPLPQRRSGQNIPWLLPVCGGVRPTSKAPIVGHDHVNCHTGDLSIAVVQANKSLNYQSCVESLQALGTMIGIFDGYGGFEAAKFTSNLGNSQAVLGKVSCTGEIFAEQLSSEHIASDAGIRHELMVAHPDDPDIVKSNIKCQPIYCLAESSTQDMGTPDRMVGLIEIDPHEPSVLHSLDNQESSGLNFPREVNVIDGAVEDVYEDRGGSAKRLINIALRAAAKKHNWRYSDLLKKDKDDHRHLYDDMTVVVLFIDHARLRKGGRGQPLSIRYP

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.225869 57.791882 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0592500 SBH 1.378646 2.054198 3.572486
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g38000 SBH 0.951243 1.040434 0.710578
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0592500 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0024250 SBH 0.858141 0.000000 1.780773
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0019080 RBH 0.0 18.882494 0.502767
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0018900 RBH 0.086071 21.888433 9.582742
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0018610 RBH 0.073067 0.435249 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0018900 SBH 4.652048 5.587349 14.969735
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0346800 SBH 4.574145 13.658653 16.609958
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0019460 SBH 0.313898 0.041075 1.635165
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0359600 SBH 4.8730905 13.5585835 18.8810665
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0019270 SBH 0.372636 0.082250 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0019410 SBH 0.430818 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0018910 RBH 8.965060 17.897671 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0018580 SBH 0.278849 0.0 0.586516
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0024090 SBH 0.0 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G018910 SBH 0.764270 3.116920 2.230058
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0019150 RBH 0.132751 51.050747 6.277781
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