Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsGoSa_06g0022220 | OGI:06070600 | 16/16 | GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr06:26193801-26217041 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MDEFDYMFLKANAQKRKLRSLGSSSISIAKRLVGHDKFRSKLGKMLKSLSAVKECAHMLVRVMGVENFSSHMLPEPLQWRISSSISIGEFVVGRQKEREELVHQLLEQSDKPESRSKGARSTSLEVITIVGNGGIGKTTLAQLIYNDKRIEDNFDMRAWVCVSHVFDKVRITKEILTTIDKSIDLTNFNFSMLQEELKNKITMKKFLLVLDDVWYDEKVGVPINADRWRELFAPLWHGAKVIKILVTTRMGIVANTLGCATPFCLSGLESKDSWELFRRCAFSTRDPNEHLELKSIGEHIVQKLNGSALAIKAVGGHLSSNFNYEEWNRVLKSGLSNEKDIMTILRLSYECLPEHLQQCFSFCGLFPKGYYFEPDMLVNMWIAHEFIQDRGRTYGSLTSTGKSYFDELLSRSFFQALRYGGTVHYVMHDLMNDLAVHVSNGKCYRVEANEPQEIFPEVQHRSILAERVDLLRAWEFCVEKRKAQGLEVLHDMNELRGFLIFTSLENVKNKDEAIDAQLVNKSQISRLDLQWSFSNADSQSDKEYDVLNALTPHPCLEELNVEGYSGCTSPCWLESKWLSRLQHISIHDCTCWKLLPPLGQLPSLRELHIDGMKSLECIGTSFYGDAGFPSLKTLELTELPELADWSSIDYAFPVLHDVLISRCPKLKELPPVFPPPVKMEVLPSTIVYTQHTDHRLDTCITQKEVSLTSLSGIFHVCHQESVEIAEISFDGADMVNDGLRDLGPNLPSHQGPFICWYADFHRAFASLTEMKIVGCPNITSLLDFRYFPVLKNLIIQDCPELNELQEDGHLTTLTEVLIEHCNKLVSLRSLRNLFFLSKLEIRNCLKLVALPEMFGFFSLRVMIIHKCPEIVSLPEDGLPLTLNFLYLNGCHPLLEEQFEWQHGVEWEKYAMLPSCLFAGESIGYGQGSVNRQPNPPSVNIYEYMIQEIVSLQLLYGFLFWKGKKNLCHNTDQGISDYMAEFSAKSSVGWIVSPIIRKMVSVVQSYISSQFTWKSEMMSDLKNLESTLVQILLVVGAAERRSRKDSSQVMSLHQMKDAVCEADDVLDEFDYLIKEKIEDLGMFSSVLSIGKRLVSIDKLRSKLQEVIKTLGRVRASAEMFAQVMAGEVSSFSQSPEYAPARATGSLLREDTIFGRKNEIDELLFNTVVHSIVGVGGIGKTTLAQAIYNDERITEIFDLKIWVCVSHNFDKTRLTKEIIACTAGTEHIELASFNFSMLQEKLRDRLMCKRFLLVLDDVWYDERVGEHMNRETWKGLGKDDSRMLFRKCAFGNRNPEDYPELKIIEDQIVENLKGSALAIKPHSWYTCQAEGGAGAGCMHQLPCVEGSGEFHVGKKGQSIVGLKDLNELRGELAIRLLENVKTKEEAAKANLDLKKHIRKLELEWGSGDHDGHTSNGCDVLNVLKPHPNLVELTISGYPGATSPTWLNSGWLSSLQLICLRDCKKWEVLPPLGDLPLLKALEVRRMDELKILDQEFLGRKGFPSLERLLLERLPKLEWSIVENDQLFPALRDLSFSGCPSFFYVLRVHLLEFVEKLKIYVDHLRDIPKVAFNNMKQLKELTIFGLGSSWENTYPIISTLWDEDGVTVLPTSLQRLELIKCQLRASSLSKLLNNLVCLDTLDLGPCDTVGMPSQLSLSMHQLRMLRQLNIYKCYWLMSLEGSQSLVSLKELRLENCDNLESVPDMDNMPSLQILLLRSCPQVTRLYQSGCHTALEELRIESCDGLASLEDLNELVSLRKMKVIECSALISLPNMSTFYSLKILVIGRCTQLRALPRNGLPVSLKAFFLIEGHPLLGKQFELKNGPDYNKVAALSGCMRHTNQSTSVESCKEKLKSQDSILSSMATLSLATGVGWVVSPVIKLMVEKVQSYISTQYKWQSNLEDDLKKLETILTEILLVVGTAERRRTLDCNQQTLLHQLKDAVYDAEDILDEFDYMLLKENAEKQNLRSLASSSISIAKRLVGHDKFRSKLRKMLKSLIRVKECAEMLVRVIGPENSSSHMLPEPLQWRITSSFSIDEFVVGRQKERDELVNRLLEQADIPKSRTEGAISVSPEVITIVGTGGIGKTTLTQLIYNDKRIENNYDMRAWICVSHVFDKVRITKEILTSIDKTIDLTNFNFSMLQEELKNKVKMKKFLLVLDDVWYDEKVGGPINADRWRELFAPLRHGVKGVKILVTTRMDIVANTLGCTTPFSLSGLESEDSWELFRRCAFSTRDPNEHQEMKSIGECIVQKLNGSALAIKAVAGHLSLNFNYDEWNRVLKNGLSNEKDIMTILRLSYECLPEHLQQCFSFCGLFPKGYYFEPDVLVNMWIAHEFIQDGRHTYGSLKSTGRSYFDELLSRSFFQALQYGGTVHYVMHDLMNDLAVHTSNGECYRLDVDEPEEIPPAVRHLSIQAERVDLLCVCKLQRLRTLIIWNKVRCFCPRVCVDADLFKELKGLRLLDLTGCCLRHSPDLNHMIHLRCLILPNTNHPLSDSLCSLHHLRMLSVHPHSCFMDTRPIIFPKNLDNLSCIFHIDVHRDLFVDLASVGNMPYLWAAGKFCVGNTKMQGLEVLKDMNELQGFLTITSLENVKNKDEATNAQLVNKSQISRLKLQWGSCNADSKSDEQNVLNSLIPHPGLEELTVDGYPGCSSPSWLESEWLSRLRHISIHNCTCWKFLPPLGQIPSLKKLHIDRMDALECIDTSFYGIAGFPSLETLELTQLPELVYWSSVDYAFPVLRDVFISCPKLKELPLVFPPPVEMKVLSSNIVCTQHTDHRLDTCIIQKVSLTSLVGIFHLWHLDSEEIADTSFDRANMLNNGLRDSSPNLPSLEGPFIGWCSDFHHAFVRLNEMEIVDCPNVTSLVDFGCFPALQNLIIRDCPKLKELPDNGNLTTLTKVLIESCYGLVSLRSLRNLSFLSKLEIKHCLKLVALPEMVNFFSLRVMIIQDCPELVCLPEDGLPMTLNFLYLSGCHPLLEEQFEWQHGVEWEKYAVLPSCFYAGKSMEDTEDIADEILLENDMIEWSTQTSLLHPTDSAASSSSFLQ |
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| Function | Putative disease resistance protein At3g14460 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LRR5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsGoSa_06g0022220 | OsGoSa_06g0022220.01 | Chr06 | 26193801 | 26217041 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 1.559182 | 5.764866 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os06g41670 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.107024 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os06g0621600 | RBH | None | None | None |
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| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_06g0022670 | RBH | 0.749143 | 0.0 | 2.654303 |
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| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_06g0022450 | RBH | 0.0 | 0.0 | 1.756431 |
