Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsGoSa_01g0023530 OGI:01013090 | 16/16 GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:24743287-24755094
Gene Symbol CYP72A31, CYP72A32, OsCYP72A32, CYP72A33, -
DNA seq

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Function Cytochrome P450 72A15 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LUC5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsGoSa_01g0023530 OsGoSa_01g0023530.01 Chr01 24743287 24755094 - NAM
CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsGoSa_01g0023530 OsGoSa_01g0023530.02 Chr01 24743338 24755094 - NAM
CDS seq

atggttcttggaggggggtggttgtcgatatgggctccggcctcatcgccaacaatcctcgcggcgttcggtctcgtcggcctcgtcctcgcgtggcaggccggcctccagctccaccgcctgtggtggcggccgcggcggctggagaaggcgctgcgggcgcggggcctccgcggctcgcgctaccgcttcctcaccggcgacctcgcggaggagagccggcggaggaaggaggcctgggcgaggccgctgccgctgcggtgccacgacatcgcgccgcgcgtcgagccgttcctccacggcgccgtcggcgtcggggcggcgcacggcaagccgcgcatcacctggttcggcccgacgccggaggtgcacgtcgccgatcccgagctggccagggtcgtcctgtccaacaagttcggccacttcgagaaggtcagtttcccggagctatcgaagctgatccccCaaggcctgtccgcccacgagggcgagaagtggatggggtccattggttcggatggctcgtacgaggtggattgctggccggagttcaagagcctcactggagatgtcatctcgcgcaccgcgttcggaagcagctatcttgaaggaagaaggatcttcgagctgcagggcgagctatttgagcgtgtcatcaaatccatccagaagatgttcatcccgggttacatgtatttgcctactgagaacaaccggaagatgcatcaaatgaataaagagatcgaatcgattctgaggggtatgattgggaaaagaatgcaagctatgaaagaaggtgaaagcacaaaagatgatttacttggtatattgcttgagtcaaacacgagacacatggaagtgaatggtcaatcaaaccaaggcttgacaatcaaggatatcatggaggaatgcaagctattctactttgcaggagcggatacaacatcagtgcttctcacatggaccatgctgctattaagcatgcaccccgagtggcaggatcgtgcaagggaagagatcttaggactatttgggaagaataaaccagactatgatggcctgagccgcctcaaaattgtgacaatgatcctctacgaggttcttaggttgtacccaccattcatcgagcttactcgaaaaacatacaaggagatggagataggaggcatcacttaccctgctggtgtcatcattaacctccccgtgatgttcatccaccatgatccggaaatctggggaagtgatgtgcatgagttcaaaccagagaggttctccgaggggatctctaaggcgtctaaggatccaggtgcattccttccattcggttggggaccgcgaatctgcatcggccaaaacttcgcattgcttgaggccaagatggcattgtgcctgattcttcaacgcttggaatttgagcttgcgacatcgtacactcatgcgccacatactataataagtctgcatccgatgcatggtgcacagattaaagttaagagctatatgaccatttcagattatataatggttcttggagggtggctgttgatgtgggctccggcctcatcgccaacaatcctcgtggcgttcggtctcctcttcggcctcgtcctcgcgtggcaggccggcctccagctccaccgcctgtggtggcggccgcggcggctggagaaggcgctgcgtgcgcggggcctccgcggctcgtcctaccgcttcctcaccggcgacctcgcggaggagagccggcggaggaaggaggcctgggcgaggccgctgccgctgcggtgccacgacatcgcgccgcgcatcgagccgttcctccacgacgccgtcgtcaggccggagcagcactacggcaagccgtgcatcacctggctcggcccgacgccggaggtgcacgtcaccgatcccgagctggccaaggtcgtcatgtccaacaagttcggccacttcgagaagatcaggttccaggcgctatcgaagctgctgccccagggcctctcctaccacgagggcgagaagtgggccaagcacaggaggatcctcaacccggctttccagctcgagaagctcaaggagctgatcagcaggtggatgggggccattggttctgatggctcgtacgaggtggattgctggccggagatgaagagcctcaccggagatgtcatctcacgcaccgcgttcggaagcagctatcttgaaggaagaaggatcttcgagctgcagggcgagctatttgagcgtgtaatgaaatccgtcgagaagattttcatcccgggttacatgtatttgcctactgagaacaaccggaagatgcatcaaattaataaagagatcgaatcgattctaaggagtatgattgggaaaagaatgcaagctatgaaagaaggtgaaagcacaaaagatgatttacttggcatattgcttgagtcaaacatgagacacacggaagagaatagtcaatcaagccagggcttgacaatcaaggatatcatggaggaatgcaagttgttctactttgcaggagcggatacaacatcagtgcttctcacatggaccatattgctattaagcatgcaccccgagtggcaggatcgtgcaaggaaagagatcctaggactatttgggaagaacaaacctgagtacgatggcttgagccacctcaaaattgtgacaatgatcctctacgaggttcttaggttgtacccaccgttcatcgagcttaagcggagaacatacaaggagatgaagataggaggcgtcacttaccctgctggtgtcatcattaatcttcccgtgctgtttatccaccatgatctggaaatctggggaagtgacgtgcatgagttcaaaccagagaggttctctgaggggatctctaaggcgtctaaggatccgggtgcgttcctcccattcggttggggaccgcgaatctgcatcggccaaaacttcgcgttgcttgaggccaagatggcgttgtgtctgattcttcaacgcttggagtttgagcttgcgccaacgtacactcatgcgccacatactatgataactttacacccgatgcacggtgcacagattaaaattagagctatatga

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Protein seq

MVLGGGWLSIWAPASSPTILAAFGLVGLVLAWQAGLQLHRLWWRPRRLEKALRARGLRGSRYRFLTGDLAEESRRRKEAWARPLPLRCHDIAPRVEPFLHGAVGVGAAHGKPRITWFGPTPEVHVADPELARVVLSNKFGHFEKVSFPELSKLIPQGLSAHEGEKWMGSIGSDGSYEVDCWPEFKSLTGDVISRTAFGSSYLEGRRIFELQGELFERVIKSIQKMFIPGYMYLPTENNRKMHQMNKEIESILRGMIGKRMQAMKEGESTKDDLLGILLESNTRHMEVNGQSNQGLTIKDIMEECKLFYFAGADTTSVLLTWTMLLLSMHPEWQDRAREEILGLFGKNKPDYDGLSRLKIVTMILYEVLRLYPPFIELTRKTYKEMEIGGITYPAGVIINLPVMFIHHDPEIWGSDVHEFKPERFSEGISKASKDPGAFLPFGWGPRICIGQNFALLEAKMALCLILQRLEFELATSYTHAPHTIISLHPMHGAQIKVKSYMTISDYIMVLGGWLLMWAPASSPTILVAFGLLFGLVLAWQAGLQLHRLWWRPRRLEKALRARGLRGSSYRFLTGDLAEESRRRKEAWARPLPLRCHDIAPRIEPFLHDAVVRPEQHYGKPCITWLGPTPEVHVTDPELAKVVMSNKFGHFEKIRFQALSKLLPQGLSYHEGEKWAKHRRILNPAFQLEKLKELISRWMGAIGSDGSYEVDCWPEMKSLTGDVISRTAFGSSYLEGRRIFELQGELFERVMKSVEKIFIPGYMYLPTENNRKMHQINKEIESILRSMIGKRMQAMKEGESTKDDLLGILLESNMRHTEENSQSSQGLTIKDIMEECKLFYFAGADTTSVLLTWTILLLSMHPEWQDRARKEILGLFGKNKPEYDGLSHLKIVTMILYEVLRLYPPFIELKRRTYKEMKIGGVTYPAGVIINLPVLFIHHDLEIWGSDVHEFKPERFSEGISKASKDPGAFLPFGWGPRICIGQNFALLEAKMALCLILQRLEFELAPTYTHAPHTMITLHPMHGAQIKIRAI

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A5 Chr01 24743817 24743954 - OsGoSa_01g0023530.02 OsGoSa_01g0023530.01,OsGoSa_01g0023530.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 4.089728 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0602400 RBH 6.363934 4.809669 2.796535
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g43750 RBH 0.549879 0.562265 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0602500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0024370 RBH 1.084527 0.0 0.366171
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0025650 SBH 0.089938 0.415210 0.324732
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0024250 RBH 3.246173 0.0 1.355323
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0023600 RBH 0.058752 0.186390 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0025030 RBH 5.137291 0.0 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0396200 RBH 5.855111 0.394289 0.027785
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0023300 RBH 0.546497 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0409800 SBH 1.3210485 4.3304605 0.3144385
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0023310 RBH 0.476392 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0023270 RBH 1.553524 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0023520 RBH 0.0 3.874355 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0023530 RBH 1.013698 0.0 0.484182
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0023450 SBH 0.515966 0.315297 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G023650 RBH 0.485056 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0023330 RBH 0.0 5.115942 4.378813
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