Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsGoSa_01g0004350 | OGI:01011260 | 16/16 | GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:3191862-3211205 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MYHLRFVMQAKPLSRTYLATTTVDQYQHVLQEVVLKLRDNQFHGVLPNNSREGCNLQSIDVNGNQIEGKLPRSLSYCQDLELLDAGNNQIVDSFPFWLGKLPNLRTTHLVVLFQSQWGKLASLHGFNLSHNAFTGQIPSQLTGVIGSLLEQALRGNPSTVNLSNLSCFVDLSYNNLTGRIPQGNQFGSFSSSSFEGNANLCGKPLSKQCDTPGSTSRNASATSETSSFWQDRLGVILLFFFSGLSTLGASTQDSSKMMISTKQRLLTPILILLICCYSIVTAANNDTTVPCLPEQASSLLQLKNSFINNANLSSWRAGSDCCHWEGITCGMASGRVISLDLSGLNLMSNRLDAALFNLTSLRNLNLASNYFWRAELPVSGFERLTDMIDLNFSHSNFYGQIPIGLACLMKLVTLDFSSNYGLYFDEPSFQTVMANMSNLRELHLDEIEIFGSTWSAVLADNIPQLEILSLLACRISGPIHSSFSRLRSLKVINLGYSFELPSKVPEFFAELSSLSILEIAGNSFEGQFPTKIFHLKRLRTLDLLGEGGNLKQLTALELVSYDFSESAPSWIGNLTNLKFLWIWDCNFSGSIIPYQIGNLAKLETLDFRGCEFFGQQIPPWIGNFTKLANLEMDSCGFSGSIPSTIGNLTQLGSLRITSNPQLNGKIPQSLFALPRLENLNFSSVWKQKNLFILSLSNNLISLIDDEGETVPPYLPNIKYLYLSSCNLTKIPGTLKYLDAVSLLDLSINQITGAIPNWIWENWKGHLNSLNLSCNMFTTLEQSPSLVNVSNLAYLDLSFNRLQGSIPIPVTISREIALDYSNNHFSSVVSNFGIYLKNASYINFSSNKLSGHIPSSICNASKVIIMDLSGNNYSGSVPPCLTESINLSVLKLRDNQFHGVLPNNSREGCNLQSIDVNGNQIEGKLPRSLSYCQDLELLDAGNNQIVDSFPFWLGKLPNLRVLVLRSNKLNGTIRSLRSGYQNSDYFTRLQIIDLASNPSDNERARWYSEWFEHFQSMMNLSDDKQILEYSTKVRIQGLYQDIATITYKGNTLTFTKILTIFKAIDLSNNSIGGPIPKSLGKLVSLRGLNLSHNAFTGHIPSQLNTLTQMESLDLSWNKLSGEIPPEILQGNQFGSFSNSSFEGNVNLCGRPLSKQCDTPGSTSPSESAPSDTNSFWQDRLGVILLFILSGLGFTVGFILAVWFESLQARRRYYETSLLVLMLLLLQARLAQSLPPCSPDQATALLQLKRSFTVNSASATAFRSWRAGTDCCRWTGVRCDGGGSGRVTSLDLGGRGLQSGGLDAAVFSLTSLRYLNLGGNDFNASQLPATGFERLTELTHLSISPPSFAGQVPAGIGRLTNLVSLDLSTRFYVINQEDDRADIMAPSFPNWGFWKVDFVRLVANLGNLRELYLGFVYMSNGGEGWCNALVNSTPKIQVLSLPFCKISGPICQSLFSLPYLSVVDLQENDLYGPIPEFFADLSSLGVLQLSRNKLEGLFPARIFQNRKLTTVDISYNYEIYGSFPNFSPNSSLINLHLSGTKFSGQIPTSISNLTGLKELGLSANDFPTELPSSLGMLKSLNLLEVSGQGLVGSMPAWITNLTSLTELQFSNCGLSGSLPSSIGNLRNLRRLSLFKCSFSGNIPLQIFNLTQLRSLELPINNFVGTVELTSFWRLPYLSDLDLSNNKLSVSMTQ |
||||||||||
Function | Receptor-like protein 7 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C699] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsGoSa_01g0004350 | OsGoSa_01g0004350.01 | Chr01 | 3191862 | 3211205 | + | NAM | ||
CDS seq | atgtaccatcttcgatttgtaatgcaagcaaagccattatcacggacttatctggcaacaactacagtggatcagtaccagcatgtcttacaggaagtcgtattgaaattgagagacaaccaattccatggggtgttacctaacaatagtagagaGGggtgcaatcttcagtcaatagatgtaaatggaaaccaaattgaaggtaaactacctagatcactatcatactgccaagatttggagctcctggatgctggaaataatcagattgttgattcttttccattttggttgggtaaacttccaaatctccgaacaactcatttggtggtcctattccaaagtcaatgggggaagcttgcttcactacatggatttaacctgtcccacaatgccttcacaggacaaattccatcacagcttactggagtcattggatctctcttggaacaagctctcaggggaaatccctctacagttaacctctctaacctctcttgcttcgttgatctttcatacaacaacttgactggaagaataccgcagggcaaccagtttgggtcatttagcagcagctcgtttgaaggcaatgccaacctctgtggaaagccgttgtctaaacaatgtgatactccaggctcaacatctcgaaatgcatcagctacttcagaaaccagcagtttctggcaggacagacttggcgtgatccttttgttcttcttttctggcttgagtacacttggagcatcaacccaagacagcagcAaaatgatgatatccaccaagcaacgcctcctcactcccattctcattctcctcatttgttgttactccatagtcactgcagccaacaatgacacaaccgtcccttgtctcccagagcaagcttcttccctcctacagctcAaaaattccttcatcaataatgcaaacctatcgtcatggcgagctggatcggactgctgccactgggagggcatcacctgtggtatggcctccggcagggtcatttcccttgacctcagtgggttgaacttgatgagcaatcgtctcgatgctgcactctttaacctcacctctcttagaaaccttaaccttgcttccaattacttttggagagccgaactcccagtttctgggtttgagaggctcacagatatgatcgacctcaacttctcccacagcaacttttatggtcagatccccattggacttgcttgcctcatgAaacttgtcactcttgacttttctagtaattatgggttgtatttcgatgaaccaagtttccaaaccgtcatggcaaacatgagcaacctgaGggagctccatcttgatgagatagaaattttcggatcaacttggtcagctgttttagcagacaacattcctcaactcgagattcttagcttgcttgcgtgccgtatatcaggtcctattcactcttcattctcaaggcttcgttccttaaaggtgatcaaccttggatacagttttgaactccccagcaaagttcctgagttctttgctgaattatcttctttgagcattcttgaaattgcaggcaattcttttgaagggcagttcccaacAaaaatcttccacctaaaaagattgagaacgcttgatttgcttggagaaggcggcaaccttaagcagctgactgctttggagcttgtatcgtacgatttctctgaatcggcaccctcctggataggcaatttgacgaatctgaagtttttgtggatctgggactgcaatttctctgggtcaataataccatatcagattggcaatcttgcaaaattggagaccttggactttagagggtgcgagttctttggacagcaaataccaccgtggattggtaattttacgaagttggcaaatttagagatggatagttgtggcttctctgggtcgataccctcaacaatagggaatctgacccaactgggaagtctgcggatcacatctaatccccaactcaacgggaaaattccacaatcgttgttcgctcttccgaggctggaaaatttgaactttagctctgtatggaagcagaagaatctatttatcctaagcctgtcaaacaatttgatatcactcatagatgatgaaggtgaaacagtacctccttatcttcctaacatcaagtacttatacctgtcatcttgcaaccttacaaaaattccaggcacattaaaatatcttgatgcggtttcccttcttgacctttcgattaatcaaataacgggggctataccaaattggatatgggagaattggaagggccaccttaatagtttgaacctctcgtgcaacatgtttactactttggaacaatctccttctcttgttaatgtgtccaacttagcttatcttgatctcagtttcaatagacttcagggaagcataccaataccggtaaccatatctagggagatcgctttggactactcaaacaaccatttctcttctgtcgtatctaattttggcatatatcttaaaaacgccagctatattaatttctccagcaacaaactaagtggccatataccatcttcaatttgtaatgcaagcaaagtcattatcatggacttatctggcaacaactatagtggatcagtaccaccatgtcttacagaaagtatcaacttaagcgttttgaagttgagagacaaccaattccatggggtgttacctaacaatagtagagaggggtgcaatcttcagtcaatagatgtgaatggaaaccaaattgaaggtaaactacctaggtcactatcatactgccaagatttggagctcctggatgctggaaataatcagattgttgattcttttccattttggttgggtaaacttccaaatcttcgagtccttgtcttaagatccaacaaactaaatggtacaattaggagccttagaagtggttaccagaatagtgattacttcacaaggctgcaaataattgatttggcctccaatccttctgataacgagcgggcgagatggtattcagaatggtttgaacattttcaatcaatgatgaatctatctgatgataaacaaatattagagtatagtacaaaagtaagaatacaagggttatatcaagatattgcgactatcacatacaaagggaacactcttacgttcactaaaatcttgactattttcaaagcaattgatctctcaaataactcaattggtggtcctattccaaagtcattggggaagcttgtttcactacgtggacttaacctgtcacacaatgccttcacaggacacattccatcgcagcttaatactctgacccagatggagtcattggatctctcttggaacaagctctcaggggaaatccctcctgaaatactgcagggcaaccagttcgggtcatttagcaacagctcctttgaaggtaatgtcaacctatgtggaaggccactctctaaacaatgtgatactccaggctcaacatctccaagtgaatcagctccttcagataccaacagtttctggcaggacagacttggtgtgatccttttgttcatcttgtctggcctggggttcacagtgggcttcatattggcagtctggttcgaatcattgcaagctcgacgacggtactacgagacatcgttactcgtactgatgctcctcctcctacaagctaggctcgcgcaatcgcttcctccatgctcgccggaccaggccacggcgctgctccagctgaagcggtcgttcaccgtgaacagcgcgtcggccaccgccttccggtcatggcgcgccggcaccgactgctgccgatggacgggcgtccgctgcgacggcggcggcagcggccgcgtcacttccctcgatctcggcggccgcggcctgcagagcggcggccttgacgctgccgtcttcagcctcacgtcgctgaggtatctcaacctcggcggcaacgacttcaacgcgtcacagctcccggccaccgggttcgagcggctcaccgagctgacccatctcagcatctccccacccagcttcgcaggacaggtaccggcaggtataggacgcctcaccaacttggtttctctcgatttatcaactcgcttctatgtgatcaatcaagaagacgatcgtgccgatatcatggcaccttcgtttcccaactggggcttctggaaggtagattttgtgaggttggttgcaaatcttggcaatctgagggagctctatcttggctttgtgtatatgtccaatggaggggaaggatggtgcaacgctctggttaattccactccaaagattcaggttctgagcctaccattttgcaagatctcaggtcccatctgtcagtctctcttcagcttgccatatctttctgttgttgacttgcaagaaaatgacttgtatggtccaatacctgagttcttcgccgatttgtcctcccttggtgttcttcaactctcaagaaacaagttggagggtttatttccagcaaggatcttccagaacagaaaattaacaaccgtagatattagctacaactacgaaatctatggcagttttcccaatttttcacccaatagtagtttgatcaatttgcatctcagtggtaccaagttctctggtcagataccaacctccatttctaatctcacaggtctgaaagagctgggtcttagtgccaatgatttccctacagagctaccatcctctctaggaatgcttaaatccttgaacttattagaggtttctgggcaaggcctagtaggatcaatgccagcttggataacaaatctaacatctctgacagagcttcagttttctaattgtggcttgtctggatctttaccatcttccataggcaatctcagaaatctcaggagactatctttattcaagtgcagtttttctggaaacataccattgcaaatatttaacttgacacaactgcggagcttggaacttccaatcaacaactttgtggggacagtggaacttacctcattctggagactaccatatttatcagaccttgatctttcaaataataaattatctgtgtcaatgactcagtag
More
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|||||||
Protein seq | MYHLRFVMQAKPLSRTYLATTTVDQYQHVLQEVVLKLRDNQFHGVLPNNSREGCNLQSIDVNGNQIEGKLPRSLSYCQDLELLDAGNNQIVDSFPFWLGKLPNLRTTHLVVLFQSQWGKLASLHGFNLSHNAFTGQIPSQLTGVIGSLLEQALRGNPSTVNLSNLSCFVDLSYNNLTGRIPQGNQFGSFSSSSFEGNANLCGKPLSKQCDTPGSTSRNASATSETSSFWQDRLGVILLFFFSGLSTLGASTQDSSKMMISTKQRLLTPILILLICCYSIVTAANNDTTVPCLPEQASSLLQLKNSFINNANLSSWRAGSDCCHWEGITCGMASGRVISLDLSGLNLMSNRLDAALFNLTSLRNLNLASNYFWRAELPVSGFERLTDMIDLNFSHSNFYGQIPIGLACLMKLVTLDFSSNYGLYFDEPSFQTVMANMSNLRELHLDEIEIFGSTWSAVLADNIPQLEILSLLACRISGPIHSSFSRLRSLKVINLGYSFELPSKVPEFFAELSSLSILEIAGNSFEGQFPTKIFHLKRLRTLDLLGEGGNLKQLTALELVSYDFSESAPSWIGNLTNLKFLWIWDCNFSGSIIPYQIGNLAKLETLDFRGCEFFGQQIPPWIGNFTKLANLEMDSCGFSGSIPSTIGNLTQLGSLRITSNPQLNGKIPQSLFALPRLENLNFSSVWKQKNLFILSLSNNLISLIDDEGETVPPYLPNIKYLYLSSCNLTKIPGTLKYLDAVSLLDLSINQITGAIPNWIWENWKGHLNSLNLSCNMFTTLEQSPSLVNVSNLAYLDLSFNRLQGSIPIPVTISREIALDYSNNHFSSVVSNFGIYLKNASYINFSSNKLSGHIPSSICNASKVIIMDLSGNNYSGSVPPCLTESINLSVLKLRDNQFHGVLPNNSREGCNLQSIDVNGNQIEGKLPRSLSYCQDLELLDAGNNQIVDSFPFWLGKLPNLRVLVLRSNKLNGTIRSLRSGYQNSDYFTRLQIIDLASNPSDNERARWYSEWFEHFQSMMNLSDDKQILEYSTKVRIQGLYQDIATITYKGNTLTFTKILTIFKAIDLSNNSIGGPIPKSLGKLVSLRGLNLSHNAFTGHIPSQLNTLTQMESLDLSWNKLSGEIPPEILQGNQFGSFSNSSFEGNVNLCGRPLSKQCDTPGSTSPSESAPSDTNSFWQDRLGVILLFILSGLGFTVGFILAVWFESLQARRRYYETSLLVLMLLLLQARLAQSLPPCSPDQATALLQLKRSFTVNSASATAFRSWRAGTDCCRWTGVRCDGGGSGRVTSLDLGGRGLQSGGLDAAVFSLTSLRYLNLGGNDFNASQLPATGFERLTELTHLSISPPSFAGQVPAGIGRLTNLVSLDLSTRFYVINQEDDRADIMAPSFPNWGFWKVDFVRLVANLGNLRELYLGFVYMSNGGEGWCNALVNSTPKIQVLSLPFCKISGPICQSLFSLPYLSVVDLQENDLYGPIPEFFADLSSLGVLQLSRNKLEGLFPARIFQNRKLTTVDISYNYEIYGSFPNFSPNSSLINLHLSGTKFSGQIPTSISNLTGLKELGLSANDFPTELPSSLGMLKSLNLLEVSGQGLVGSMPAWITNLTSLTELQFSNCGLSGSLPSSIGNLRNLRRLSLFKCSFSGNIPLQIFNLTQLRSLELPINNFVGTVELTSFWRLPYLSDLDLSNNKLSVSMTQ
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.000000 | 0.000000 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0162500 | RBH | 0.310161 | 0.0 | 0.379350 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g06876 | SBH | 0.227791 | 0.118750 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0162500 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0004520 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0004220 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0004510 | SBH | 0.072213 | 0.764565 | 1.948779 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0004170 | SBH | 0.048750 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0004370 | RBH | 0.675431 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0056800 | SBH | 0.10463 | 0.270119 | 0.10602 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0004250 | SBH | 0.024807 | 0.015142 | 0.051441 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0058500 | SBH | 0.218877 | 0.3356845 | 0.6229255 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0004090 | RBH | 0.013525 | 0.020171 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0004260 | SBH | 0.060693 | 1.340681 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0004390 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0004300 | SBH | 0.032240 | 0.0 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0004240 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G004270 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0004210 | SBH | 0.726669 | 0.0 | 0.794022 |