Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsGoSa_01g0004350 OGI:01011260 | 16/16 GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:3191862-3211205
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Receptor-like protein 7 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C699]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsGoSa_01g0004350 OsGoSa_01g0004350.01 Chr01 3191862 3211205 + NAM
CDS seq

atgtaccatcttcgatttgtaatgcaagcaaagccattatcacggacttatctggcaacaactacagtggatcagtaccagcatgtcttacaggaagtcgtattgaaattgagagacaaccaattccatggggtgttacctaacaatagtagagaGGggtgcaatcttcagtcaatagatgtaaatggaaaccaaattgaaggtaaactacctagatcactatcatactgccaagatttggagctcctggatgctggaaataatcagattgttgattcttttccattttggttgggtaaacttccaaatctccgaacaactcatttggtggtcctattccaaagtcaatgggggaagcttgcttcactacatggatttaacctgtcccacaatgccttcacaggacaaattccatcacagcttactggagtcattggatctctcttggaacaagctctcaggggaaatccctctacagttaacctctctaacctctcttgcttcgttgatctttcatacaacaacttgactggaagaataccgcagggcaaccagtttgggtcatttagcagcagctcgtttgaaggcaatgccaacctctgtggaaagccgttgtctaaacaatgtgatactccaggctcaacatctcgaaatgcatcagctacttcagaaaccagcagtttctggcaggacagacttggcgtgatccttttgttcttcttttctggcttgagtacacttggagcatcaacccaagacagcagcAaaatgatgatatccaccaagcaacgcctcctcactcccattctcattctcctcatttgttgttactccatagtcactgcagccaacaatgacacaaccgtcccttgtctcccagagcaagcttcttccctcctacagctcAaaaattccttcatcaataatgcaaacctatcgtcatggcgagctggatcggactgctgccactgggagggcatcacctgtggtatggcctccggcagggtcatttcccttgacctcagtgggttgaacttgatgagcaatcgtctcgatgctgcactctttaacctcacctctcttagaaaccttaaccttgcttccaattacttttggagagccgaactcccagtttctgggtttgagaggctcacagatatgatcgacctcaacttctcccacagcaacttttatggtcagatccccattggacttgcttgcctcatgAaacttgtcactcttgacttttctagtaattatgggttgtatttcgatgaaccaagtttccaaaccgtcatggcaaacatgagcaacctgaGggagctccatcttgatgagatagaaattttcggatcaacttggtcagctgttttagcagacaacattcctcaactcgagattcttagcttgcttgcgtgccgtatatcaggtcctattcactcttcattctcaaggcttcgttccttaaaggtgatcaaccttggatacagttttgaactccccagcaaagttcctgagttctttgctgaattatcttctttgagcattcttgaaattgcaggcaattcttttgaagggcagttcccaacAaaaatcttccacctaaaaagattgagaacgcttgatttgcttggagaaggcggcaaccttaagcagctgactgctttggagcttgtatcgtacgatttctctgaatcggcaccctcctggataggcaatttgacgaatctgaagtttttgtggatctgggactgcaatttctctgggtcaataataccatatcagattggcaatcttgcaaaattggagaccttggactttagagggtgcgagttctttggacagcaaataccaccgtggattggtaattttacgaagttggcaaatttagagatggatagttgtggcttctctgggtcgataccctcaacaatagggaatctgacccaactgggaagtctgcggatcacatctaatccccaactcaacgggaaaattccacaatcgttgttcgctcttccgaggctggaaaatttgaactttagctctgtatggaagcagaagaatctatttatcctaagcctgtcaaacaatttgatatcactcatagatgatgaaggtgaaacagtacctccttatcttcctaacatcaagtacttatacctgtcatcttgcaaccttacaaaaattccaggcacattaaaatatcttgatgcggtttcccttcttgacctttcgattaatcaaataacgggggctataccaaattggatatgggagaattggaagggccaccttaatagtttgaacctctcgtgcaacatgtttactactttggaacaatctccttctcttgttaatgtgtccaacttagcttatcttgatctcagtttcaatagacttcagggaagcataccaataccggtaaccatatctagggagatcgctttggactactcaaacaaccatttctcttctgtcgtatctaattttggcatatatcttaaaaacgccagctatattaatttctccagcaacaaactaagtggccatataccatcttcaatttgtaatgcaagcaaagtcattatcatggacttatctggcaacaactatagtggatcagtaccaccatgtcttacagaaagtatcaacttaagcgttttgaagttgagagacaaccaattccatggggtgttacctaacaatagtagagaggggtgcaatcttcagtcaatagatgtgaatggaaaccaaattgaaggtaaactacctaggtcactatcatactgccaagatttggagctcctggatgctggaaataatcagattgttgattcttttccattttggttgggtaaacttccaaatcttcgagtccttgtcttaagatccaacaaactaaatggtacaattaggagccttagaagtggttaccagaatagtgattacttcacaaggctgcaaataattgatttggcctccaatccttctgataacgagcgggcgagatggtattcagaatggtttgaacattttcaatcaatgatgaatctatctgatgataaacaaatattagagtatagtacaaaagtaagaatacaagggttatatcaagatattgcgactatcacatacaaagggaacactcttacgttcactaaaatcttgactattttcaaagcaattgatctctcaaataactcaattggtggtcctattccaaagtcattggggaagcttgtttcactacgtggacttaacctgtcacacaatgccttcacaggacacattccatcgcagcttaatactctgacccagatggagtcattggatctctcttggaacaagctctcaggggaaatccctcctgaaatactgcagggcaaccagttcgggtcatttagcaacagctcctttgaaggtaatgtcaacctatgtggaaggccactctctaaacaatgtgatactccaggctcaacatctccaagtgaatcagctccttcagataccaacagtttctggcaggacagacttggtgtgatccttttgttcatcttgtctggcctggggttcacagtgggcttcatattggcagtctggttcgaatcattgcaagctcgacgacggtactacgagacatcgttactcgtactgatgctcctcctcctacaagctaggctcgcgcaatcgcttcctccatgctcgccggaccaggccacggcgctgctccagctgaagcggtcgttcaccgtgaacagcgcgtcggccaccgccttccggtcatggcgcgccggcaccgactgctgccgatggacgggcgtccgctgcgacggcggcggcagcggccgcgtcacttccctcgatctcggcggccgcggcctgcagagcggcggccttgacgctgccgtcttcagcctcacgtcgctgaggtatctcaacctcggcggcaacgacttcaacgcgtcacagctcccggccaccgggttcgagcggctcaccgagctgacccatctcagcatctccccacccagcttcgcaggacaggtaccggcaggtataggacgcctcaccaacttggtttctctcgatttatcaactcgcttctatgtgatcaatcaagaagacgatcgtgccgatatcatggcaccttcgtttcccaactggggcttctggaaggtagattttgtgaggttggttgcaaatcttggcaatctgagggagctctatcttggctttgtgtatatgtccaatggaggggaaggatggtgcaacgctctggttaattccactccaaagattcaggttctgagcctaccattttgcaagatctcaggtcccatctgtcagtctctcttcagcttgccatatctttctgttgttgacttgcaagaaaatgacttgtatggtccaatacctgagttcttcgccgatttgtcctcccttggtgttcttcaactctcaagaaacaagttggagggtttatttccagcaaggatcttccagaacagaaaattaacaaccgtagatattagctacaactacgaaatctatggcagttttcccaatttttcacccaatagtagtttgatcaatttgcatctcagtggtaccaagttctctggtcagataccaacctccatttctaatctcacaggtctgaaagagctgggtcttagtgccaatgatttccctacagagctaccatcctctctaggaatgcttaaatccttgaacttattagaggtttctgggcaaggcctagtaggatcaatgccagcttggataacaaatctaacatctctgacagagcttcagttttctaattgtggcttgtctggatctttaccatcttccataggcaatctcagaaatctcaggagactatctttattcaagtgcagtttttctggaaacataccattgcaaatatttaacttgacacaactgcggagcttggaacttccaatcaacaactttgtggggacagtggaacttacctcattctggagactaccatatttatcagaccttgatctttcaaataataaattatctgtgtcaatgactcagtag

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.000000 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0162500 RBH 0.310161 0.0 0.379350
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g06876 SBH 0.227791 0.118750 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0162500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0004520 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0004220 RBH 0.000000 0.0 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0004510 SBH 0.072213 0.764565 1.948779
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0004170 SBH 0.048750 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0004370 RBH 0.675431 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0056800 SBH 0.10463 0.270119 0.10602
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0004250 SBH 0.024807 0.015142 0.051441
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0058500 SBH 0.218877 0.3356845 0.6229255
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0004090 RBH 0.013525 0.020171 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0004260 SBH 0.060693 1.340681 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0004390 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0004300 SBH 0.032240 0.0 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0004240 RBH 0.000000 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G004270 SBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0004210 SBH 0.726669 0.0 0.794022
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