Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKYG_01g0004260 | OGI:01011260 | 16/16 | KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:3225369-3251243 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MVAAAGTQHDTTVHCHPDQASSLLRLKASFTGTSLLPSWRAGSDCCHWEGVTCDMASGRVISLDLSELNFISNRLDPALFNLTSLRNLSLAYNDFGKAPLPASGFERLTDMIHLNLSDSSLTGQIPIGIGSLKKLVTLDFSLNYGLYFVKPSFQTVMANLSNLKELHLDYVNILSSRSSWSVILADNTPQLEILSLSQCGLSGSIHSSFSRLRSLKMIDLSANQELSGKVPELFAELSSLSILDISGNSFEGQFPTKIFQLKSNLTSLATLEMWGCNLSTSIPHQIGNLANLTSLGFEDCDFSGQKIPSWISNFTKLRNLQMNSCGFSGPIPSTIGNLTQLEYLTISYNNQLNDPRTKSFFQLTYRNYPSLKSNKLTATMQLSSIWRIKSISYLRLSNKLISLMDDKGERVTSLPNINYLCLASCSLTKFHALRYLDAILELDLESNQNTRNARNNGLLSGSLEDIPSPLTSSLSSIDLSGNQLSGPIPKSFFQLTNLYYLNLESNKFIGSVELSSVWKLENLDFLSLSNNLISLIDDEGETVSPSLPNIRTLYLASCKLTKIPGTLRYLDAILDIDLSSNQITGAIPRWIWENRTYQLNSLNLSHNMFTTVEQSPSLVNIAYLTYLDLSFNRLQGSIPIPVTTSSEIALDYSNNHFSSIVSNFGIYLENASYINFSNNKLSGNVPSSICNASKAIIMDLSGNNYSGSVPACLTGSVNLSVLKLRDNQFHGMLPNNSREGCNLQSIDVNGNQIEGKLARSLSYCQDLELLDAGNNQIVDSFPFWLGKLPNLRVLVLRSNKINGNTLMFTKILTTFKAIDLSDNSFGGPIPKSMGKLASLHGFNLSHNAFTGQIPSQLSSLTQLESLDLSWNMLSGEIPLQLTSLTSLASLNLSYNNLTGRIPQGNQFGSFSSSSFEGNANLCGKPLSKQCDTPGSTSRNASATSETSSFWQDRLGVILLFFFSGLGFTVGFILAVCINPRQQQNDDIHQATPPHSHSPNNDTTIPCLPDQASSLLQLKNSFINNANLSSWRAGSDCCHWEGITCGMASGRVISLDLSGLNLMSNRLDAALFNLTSLRNLNLASNYFWRAELPVSGFERLTDMIHLNFSYCSFSGQIPIELACLMKLVTLDFSSNYGLYFDEPSFQTVMANMSNLRELHLDEVEIFGSTWSVVLADNIPQLEILSLFRCGISGPIHSSISRLRSLKVINLGYKFGLPSKVPEFFAELSSLSILEIAGNSFEGQFPTKIFHLKSLRTLDLSHNPNLSINLPEFPDGNNLETLGLAATNLSYHIPSSFANLKSLKRLGMSTARTSKELPSLLGKLPSLTELELQGSESGLEKAVLSWVGNLKQLTALELVSYDFSESAPSWIGNLTNLKFLWIRDCNFSGSIIPYQIGNLANLETLELWKGFFGQQIPPWIGNFTKLASLAMDRCGFSGSIPSTIGNLTLLENLSITGNPQLNGKFPQSLFALPRLEYITLEANQLSGSLEDIPSPLTSPLMFIYLGHNELSGPIPKSFFQLTNLHRLDLQSNKLTNTVELSSVWKLKNLDLLRLSNNLISLIDDESETVSPSLPNIRYLHLASCKLTKIPGTLRYLDAILDLDLSSNQITGAIPSWIWENWTDHLNSLNLSHNMFTTVEQSPCLVNITYLTYLDLSFNRLQGGIPIPVTTSSEIALDYSNNHFSSIIPNFGIYLENASYINFSNNKLSGHVPSSICNASKAIIMDLSGNNYSGSVPACLTGSVNLSVLKLRDNQFHGMLPNNSREGCNLQSIDVNGNQIEGKLARSLSYCQDLELLDAGNNQIVDSFPFWLGKLPNLRVLVLRSNKINGNTLMFTKILTTFKAIDLSDNSFGGPIPKSMGKLASLHGFNLSHNAFTGQPSQLSSLTQLESLDLSWNMLSGEIPLQLTSLTSLASLNLSYNNLTGRIPQGNQFGSFSSSSFEGNANLCGKPLSKQCDTPGSTSRNASATSETSSFWQDRLGVILLFFFSGLGFTVGFILAYEPMLLVLVLLLQSLHARSLPCLPDQAAALLQLKRSFSATTASATAFRSWRAGTDCCRWAGVRCENDATKNGSGGGRVTSLDLGGRRLQSGGLDTAVFSLTSLRYLNLGGNDFNASHLPATGFERLTELTHLNISTPSFAGQIPPGIGYLTNLESLDLSTRFYIVDQEDDKARKITLSYPSWGLSKINFGRLIENLGNLRELYLGFVYMSNGGEGWCDALVKSTPKIQVLSLPFCKISGPICRPLFSLRSLAVVDLKENDLSGPIPEFFADLPSLSVLQLSRNYFEGLFPSRIFQNRKLATIDISYNYKIYGSLPDFPPNSSLINLHVSGTKFSGQIPSSISNVTGLKELGLSANDFSTELPSSLGTLKSLNLLEVSGLGLIGSMPTWITNLTSLTELQFSHCGLSGSLPPTIGNLKNLRRLSLFKCNFSGSIPLQIFNLTQLQSLDLPLNNFVGTVELTSFWRLPYLSNLDLSNNKLSVVDGLVNDSVVSSPKLEALSLVSCNISKFPNALRHQDEIHFIDLSNNQMQGEIPRWAWETWEELFFLDLSNNKFTSLEHDPLLPCLYTRYINLSYNMFEGPIPMPKESSDSELDYSNNRYNLIDGQLPASLVACKNLVVLDVENNQIGGHFPCWMHALPKLQVLVLKSNKFFGQLGPTLANNEGKCELQQLRILDVSSNNFSGILHEKWFRKLKSMMTVSANKTLVMKDGEMYVTYKGLYMTFTKILETLVLIDVSNNKFYGSIPESIGVLGVLTGLNMSHNALTGPIPNQLASLHELESLDLSSNKLSGEIPQKIASLDFLSTLNLSNNMLEGRIPESPHFSSFPNSSFIQNAGLCGPPLSKECNDKSTSDVVSHPSKKKSVDIMLFLFVGLGFGVGNDKSRLAHTSCAIPMVTALTADWSPHFTPPRRSHARARPRAPIPARSNRWRDWCVRLRPLVVVGKGWGWDGTGNPEYLGGMRRRRGRRGEKLLRSLVAATGGRRRQPRRAACASCRQTEVGREHDVI |
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| Function | Receptor-like protein 50 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q93YT3] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKYG_01g0004260 | OsKYG_01g0004260.01 | Chr01 | 3225369 | 3251243 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.060693 | 1.340681 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g06870 | RBH | 0.412629 | 0.366241 | 0.200309 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0162200 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0004520 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0029590 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0024360 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0004170 | RBH | 0.048750 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0004370 | RBH | 0.675431 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0057100 | RBH | 0 | 0.0605585 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0012130 | SBH | 1.553266 | 1.584764 | 2.542441 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0058300 | RBH | 0.1414535 | 0.116168 | 0.609636 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0004150 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0004320 | RBH | 0.105607 | 0.975155 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0012120 | SBH | 5.845068 | 31.972692 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_Ung0001930 | RBH | 0.327364 | 0.0 | 0.000000 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0012090 | SBH | 0.687408 | 10.825159 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G012280 | SBH | 2.352120 | 10.527529 | 8.430974 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0012130 | SBH | 6.591588 | 14.994800 | 19.610842 |
