Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_01g0016580 OGI:01044800 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:14958799-14962350
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

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Function Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21300 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9STE1]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_01g0016580 OsCMeo_01g0016580.01 Chr01 14958799 14962350 + NAM
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 2.711647 6.490096 11.264750

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0357800 RBH 2.304354 3.589734 4.942401
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g25530 RBH 1.557959 2.414090 1.271972
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0357800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0016700 RBH 1.233524 6.051852 6.321580
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0016340 RBH 0.453912 2.239537 3.516932
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0016060 RBH 0.084696 0.156536 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0016100 RBH 8.680272 5.818558 21.480713
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0244700 RBH 12.652602 32.8476465 37.6538505
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0016170 RBH 0.541562 0.184308 1.905853
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0239900 RBH 6.3704675 38.4814055 39.205244
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0016060 RBH 0.170351 0.144163 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0016040 RBH 0.974605 13.545795 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0016270 RBH 6.308117 13.783249 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0016120 RBH 1.317639 0.467149 1.484531
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0015910 RBH 0.687429 3.826956 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G016340 RBH 1.108132 2.362780 3.427088
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0016120 RBH 1.172103 13.208362 5.646645
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