Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsAzu_11g0006460 | OGI:11015700 | 16/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:5167082-5190120 | ||||||||
Gene Symbol | Os_F0390, Os_F0253, OsFbox577, Os_F0135 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g56420 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FM89] |
Transcripts
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OsAzu_11g0006460 | OsAzu_11g0006460.01 | Chr11 | 5167082 | 5190120 | - | NAM | ||
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OsAzu_11g0006460 | OsAzu_11g0006460.02 | Chr11 | 5171648 | 5190120 | - | NAM | ||
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|||||||
Protein seq | KKKKNRRSPVAEIPKTSLSPSSSPTCFSASSWICLLFEKLLEHKGPRQGAQSTVPSLPLLPLPTSRRHRPEVAAGRRVGEGGGAI |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
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A3 | Chr11 | 5178859 | 5179377 | - | OsAzu_11g0006460.01 | OsAzu_11g0006460.01,OsAzu_11g0006460.02 | All |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
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Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0201299 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g09478 | RBH | 0.099321 | 0.0 | 0.000000 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0201360 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006400 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0006460 | RBH | 0.241922 | 1.505629 | 0.978664 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006470 | SBH | 1.285396 | 0.405356 | 2.452377 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0006360 | SBH | 0.052242 | 0.019900 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0006280 | SBH | 1.941152 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0083500 | RBH | 0 | 0 | 0 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0006310 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0084800 | RBH | 2.744465 | 3.074941 | 5.580937 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0006330 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006370 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006360 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0006420 | RBH | 0.096540 | 0.0 | 0.254378 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0006390 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G006440 | RBH | 0.385030 | 0.620081 | 0.225241 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006250 | RBH | 0.315602 | 0.767232 | 1.540564 |