Rice Gene Index (RGI): a comprehensive pan-genome database for comparative and functional genomics of Asian rice.

Basic Info

Gene ID		OGI # \| Score			Accession \| Assembly \| Annotation			Location		Links
OsAzu_07g0001860		OGI:07004740 \| 16/16			Azucena \| AzucenaRS1 \| Gramene(+IsoSeq)			Chr07:1629065-1701653		Homologues MicroCollinearity RGI-JBrowse
Gene Symbol		RLK, RLCK221, OsRLCK221, YK35, RLCK226, OsRLCK226, RLCK237, OsRLCK237
DNA seq		TCAAACACTAGCAGTGTCATCGTCTACCTCGGGTGAGGTTTCAATGCTCACCACCGACGACAAAGACAGACATGGCAAGACATACGAGTCGAAGCCTTGGCCCTGCATGAGAGCCACCATGTTGAACTTCAGCTCCGACGGTGCCAACTCTGGCAGCGGCGCGTCGCCGTCGAGGTATCTCTGGACTTGACTCATGGTAGGCCTTTCCATGGCGATTGGGTGAGAACACAATAGACCTAGCTTCAGCACTAGACATGCCTCATCAACATTGTAGTTGCCCTGCAATCTTTTGTCTACTGTCTCAGGCAGTAATCCTTTCTGCCAGTGCTCAAGGACCCAATCAACCAGCATTGGGGGTTGATTATCTTGTTGATTGTTGTTGAGTGGCCTTTGTCCACAAGTGACTTCGAGAAGGAATACGCCAAAGGCAAATATGTCTGTGGCAGGAGATGCCTTGCCTGTGAACACTAGCTCTGGGGCTAGGTACCCCATTGTGCCTACCAGGTGCGTAGTTTGTGGGTCGGTTCCGTGGTCATATAATCTTGAGAGGCCAAAGTCACCTAATCGTGCATTCATATCTTTATCAAGAAGCACGTTGCTTGCCTTGATATCTCGGTGGATTACAATCTTCCCCCATTTCTCATGGAGGTAGAGTAGTCCTGACGTGACACCTTTGACAATGTTAAATCTCTGTGCCCAATCCAATGTTGGCTCGGTCAAATCACAATACAAATAGTTGTCAAGGCTACCGTTTGACATATAGTCATAGACCAGAAGGAGTTCACCTTTCCTCCTACAATAACCGAGCAACTGCACAAGGTTTCGGTGTCGAAGTTGACCGATACTGACAATCTCAGCAACAAACTCCTTCATACCTTGGCTCGACTCATGCGAAACACACTTCACGGCAACCACTCGTTTAGACACCGGAAGCACTCCCTTATACACCTTCCCAAATCCTCCGACACCAAGTAAGTTCTTATCCTTAAATCCTTCAGTGGCATCATACAGAACCTTGTATGAGAAACGATGCGGACCAAACTCAACCTCCCAATCTTCTTGAATCTCTGTGTACTTGAGTCGCCTCCGTACACAGAGAACAAGGAGAACACCAACAAGGAAAATCAATGCAGCGGTTGCCACCGGTGATATGATTACCAAGATCCTAGAAGAATGGGACTTCTTGCTGCCAAGATTTGGCAGCTTGGGCAACCTGGAGATATCAATAGCTTGAGCAGGGCCATTCATCCTAAAGCTCCATCCAAGAACACAGTGTTTTGTGTTGACTACACCTCCAGTTGCAGCTGAGAAACCGATGTAGGCTGAATCTGCAACCACCGTTGAGAGGTCGTAGGTGACAGACAGTAGAGGTCTCTTGGGCTTGGCCAATCTGGCAGGAGCCAAGGTGACACTAATCTTCTTGGCATCACCATCATAATCAAACCAAACTTGCATTGCCTCATGGATGACAAGAGTAAGGTTCCTGAAGATGCCACTCCTGTCTTCATAGAAACCAGCATAGTGTGCATCCAAGGACTTCATGCTGTTGACATTGATCCCTACATGGTTGTCATCCATGTCTTGGAACTCCTTGTTTTGGAAGGTGTCGAGCTCGACGGCGAACAAATCGTTGCTTCTATTGCCATTGTTTTGGTTGTTGAGGAGGCCCAAATATTGTGCAGGCAATGATGCATCAGAGAAGTTCTTGCTTGGTGCTATGAAGAAGGCCATGCCATCGTTGCTCCGATTGGCATATTTTTGGAGGATGCTGAACGCAAATGAAACTGAGAAAGATTGTACCATGTCGTTTGGCGACTTGCGAAAGCGCAACGGAGTTGGGTAGAACGCATGGCCTTCGATATTATTCGCGCCATTGGTGAGCTCAAGGAGCCCATCTTCGGTGATGGTGGCGGCGCCATCAAGGACGAGGTTGCTGCCGGTGAAGCCGGAGAAGACAAACTGGTGCTCACTAGAAGTGACAAAGGATACAAGGCAAAGGAAGAGAAGAAAGGTGTATTTCATGGCAGGTGATGGAATGGGCTGTGAATTGAATTGCAGCAAATCAACAATGAACAATTAGAACTGCAGGGCAGCAATGTCTAGTTAGCTATTGTAATAGTTAGTGCAGAGAAAGTGACATTGTGAGCTACTGTATATAGTTTTGAGTTTTCTCCAGCATGCATTACAGACTTGAATTATTGAAACTTCCTCTCCCAAAAAGGTCAAAGTATAGTCTGGTAGCATCTAGCTTGGTCAAATTATATTTCGTGCACCTAACGAACATAATTAATTGCCACACGAAACTTCGTAGGAAAATTCCTTGTATGAAACATGTTGACGCCATGTTTGTACACATTCAAACTGGTTTACAGACATGTATATTAATACGTTCGTATTTTTTTTTGGAAGTAACTTGTTTTTATTTCTTCTGTACCTAGCAGCTTGTCGGCAACAAATCTTCAATGCTTTATATGAGAGATTTTATGGTCCTCTTAAGTACCATGGCTATAGGTACTAAAATTATACACTAAAATTTTAATACCTCGAGATCGATAACCTAGTTTCTGTAGGTATCAAGTTTTGTATAAAATAATATGATACCTTTCGGTATTTTTTTAAGGATGTTATAATTACCCATATAATATAGTTATATGAAAGATTTTTAATGAAAAATATGCTAATATCATTCTTACATATCAAATCTTAATATAGGTCTATATTTTGGTAATGTAAGATTTCAATATTTCACTACGTATATCTAAAAGGAAAAGTACTAATTACCCCCCCTCCTGACTATCGCAGTCGACCAAATTACCCTCCCTAAACCCAAAAACCAGACATAGTTAACCCTAGACTTTTAATACCGGACAAATTACCCCCATCGACCCAATCCAGAACAGTTTTATCCTACGTGGTATTCCAATCACCATTTTGTTTATAAAAAAAATGTGGGACCCACATGTCATACTCCTCTTCCTCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCACGGGTCGGCGGTAGGCGGTGGGCGGCGCTGCGGGACGCGGAGGCGGCGGGTGACAAGGCACCGGCGGCGGCACGGGAGGCGGCGGCGACGGCGGGTGATGCGGGATGCAGAGGCGACAACGGCAGTCACGACGAGTAGCCGCCCCCTCGACGCGGGGACGGACGGAGGCAGGGTCGGGCCGCGGGTGGTGGGCGGGCGTGGACGGCGGACGCGGAGGCGGCACACACGGTGCCGCGGAGACCCTCCTGCGCCGGAGGGAGTTTGCCGAAGTTCTCTCCCGCTTCCTCACGAAGTTCGCCGCTCCCTCCTCTATGTCCTGCCCCCATCACCGCTGCCTCCGCGTGAGAGAGAGAAAGAGTGAGTGAGTGAGAGAGAGAATGTGTGATCGATAGAGCAAGAGGAGTATGACATGTGGGTCTCACATTAAAGGAAAAAGTACGAATTACCCCCCCCGAACTATCGCGGTCGTCCGAATTACCCCCCTGAACCACAAAACCGGACATTCTTCACCCCCAACTATACAAACCAGACGAATTACCCCCCTCGAACCAATTCAGAGCGGTTTTGAACAACGTGGCAATCTGGTCAGCGTTTTTTTAATTAAAAAATTGTGGGACCCACATGCCATCCTCTTCTCTTCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTTTTTCTCTCTCGCGGCTCACGGGGACGGCGCGGGAGCGGCGAGGACGGCGACGGCGGAGGTAGCGGCGGCGGCGGCGAGGCGAGGCGGCGGCCGAGGCAGCGAGCGCGGGGAGGCGAGCGGCGGGGCTGGGCGGCGGAGGAGGCGAGCGGCGGCGGGAGCTCGCGTTGCTCGCGGAGGAGGCGAGGTGGCGGCGAGGCGAGGCGGCTGGCGAGCCTGGTCGAGCTGCACCCCCTCCGAGGCGGACCCACCGGCGGCGACGCCGACCGCCGCGCCTCTCCCCTCCCTATCTTTCGTCGGCCGCCGCCTCGCCTCGCCGCCGCCGCACCCTGCCGCTGCTCGCCTCTTCCGCCGCCGCCGCCTCGCCTCCTCCGCAAGCAGCGCGAGCTCCCGCCGCCGCTCGCCTCCCCGCGCTCGCTGCCTCCCCCGCCGCCTCTGCCTCCGCCGCCGCCTCGCCTCGCCGCCGCCGCCGCCTCGCGCTCTCCGCCGCCGCTGCCTCCGTCGTCGCCGTCCCCGCGCCATCCACCGCGAGAGAGAAAAGCGAGAGAGAGAGAATAGAGAGAGAGGGGAAGAAGAGAAGAGTATGGCATGCGGGTCCCACATTTTTTTTTAATTAAAAAACACTGACTGGATTGCCACGTGTGCGCCACGTTGGATAAAACCGCTCTAAATTGATTCGAGGGAGGTAATTCGTCCGGTTTACATAGTTGGGGGTGAAGAATGTCCAGTTTTGTGGTTCAGGGGGTAATTCGGACGACCGCGATAGTTCGGGGGGGGTAATTCGTACTTTTTCCAAAATAAAATGCTAACTGAACTGTCACGTGTACGCCACGTAGGACAAAACCAACGATGTCTGGTTTTCAGGTTTAGAGGGGTAATTCGGTCGACCGCGATAGTTCGGGGGGAGGGTAATTCGTACTTTTTCCTATCTAAAATGACATCTATTGATTTATAAACGACCAGGTAATGTCCGGACATTTTTCATAGATCCAAGACATATGGGAGGATATATATGCTCCTTGTAGACTTTCACAGGCGCCAGACAGATCGACAGGTGACAGCCTAGAGTCGTTGGAAGGAACTTGATTGCTTCAAGCAATTGTTAGCATTATTATTTCTCCATGACCAGATTCCACATTAATTATCTAGTGGTTAAGTACAAACTAGTCCTCTTTTTGCCCAATTAAATAGCTAGTTTACCTACCAAAAGTTCAAAAATTAAGTGCCGGACGGTGCATATATTATATCAAGCTGAGTTATACTAACCCATTTTTTCTTAAAAGTTACACTTTGGGGGTTAAATTTAAGTTAACCCTTTT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seq		ATGAATGTACGCTTAGGTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTATACGATCATGGCACCGACATGCAAACCACACACCTGGTTGGCACCATAGGGTATCTTGCCCCTGAGCTAGCAAACACAGGTAAGGCTTCACCCGCCACCGATGTTTTCTCCTTCGGCATATTTGTTCTTGAGGTTACTTGTAGACGAAGGCCCATTGAGCACGGGATGAATAGTGAGTACAAGTTCACGTTGGTAGATTGGGTGATTGATCGTTGGCACGAGGGATCACTTCTTGAGGCAATGGATCCAAAGCTCCAAAATAACTATGATGATGATGAAGCATGCCTTGCTCTAAAACTAGGATTGCTTTGCTCACACCCATCATCTATTGCAATTGCAAGGCCAACCATGTGGCATGTAATGCAGTATCTTAACCATGACTTGCCATTTCCAGAGTTGATGGCGACGGACATGGTGCGAAACCGATGCGTGGACTCACCTATTTCATATTGCCAATCAGTGGCTTTCGTTAGAGCCATGCCTGTCGTGAATCGCTGGTGCTTCCTTCCAATACTCTTTTTCATCTCCATACTGCTAGTTATCATTCTGCCATCCTTGGCTACAACCCTAGGAGACGGCCAATTTGTGTACTACGGCTTCGCTAACAGTAATCTCATCGTCGATGGAGCTGTCACGGTGTTACCAGAGGGCTTGCTCGAGCTGACCAATGGTACGGTCAATCAGAAAGGCCATGCCTTCCACCCGACTCCTTTCCGGCTCCGTAAGTCGCCCAACTCCGCGGTGCAGTCCTTCTCCGCCTCCTTGGTGTTTGGCATCGTCTCTCCCTTGTTGCATGCCAGCACAGAGGGCATGGCCTTCTTTCTTGCCCCAAGCTCTAATTTTTCTGATGTGTTACCGGCACAGTACCTAGGACTGTTCAATTACAGTAACAACGGCAATTTGAGCAACCATATTTTTGCTGTTGAGATCGACACTGCACAAAACAACGAGTTTATGGACATAGATGGCAACCATGTCGGCATCGACATCTGCGATCTTCACTCGGCAACATCTTCTTCTGCAGGCTACTACGATGACATCACTGGTTCCTTCCGAAACTTGAGTCTGATTAGTGGCGAGGCCATGCAAATTTGGATCAACTACGATGGAGAGGCAACATGGATTGATGTGGCTTTAGCTCCATTCAAAATGGCCAGACCCACCAAGACACTCCTGTCAATGTCCTATAACCTCTCAGCCGTGCTCACAGACGTTGCATACGTTGGTTTATCAGCTGCAACAGGTCAAATAGAATCGAGGCACTATATCCTAGGCTGGAGCTTTAGTATGAATGGACCAGCCCCGCCTTTCTTCACAGCTCATCTACCAAATCTACCTAAAGCTCGTGTAGATAGAAAAGCTACTCAGCTCATCTTGCTGCCACTAATTTTTCCTCTAGCAACTCCCACATTTGTCTTTTTGGTGATCTTGGCCATCTTCTTCTTTGTGCGGAGAAGGCTGAGGTATGCTGAGTTGCGAGAAGATTGGGAAATTGAGTTTGGACCACATAGGTTCTCATTTAAGGACCTATATTTAGCCACTGAAGGGTTTAAGAATAGTCATCTCTTAGGCACTGGAGGATTTGGAAGGGTGTACAAGGGTCTTCTTTCCAAGTCTAAGTCACAAATTGCAGTGAAGAGGGTGTCCCATGAGTCGAGACAAGGCATAAGGGAATTTGTTGCTGAGGTTGTTAGCATCGGCCGCCTTCGACACCGGAATATTGTACAGCTACTTGGCTATTGCCGGCGTAAAGGTGAACTTCTTTTGGTTTACGACTATATGCCAAATGGTAGCCTTGATAATTATTTGTATGGTCATAGTAACCGTTCTATTCTAGACTGGATTCAACGGTTTCGAATAATCAAGGGTGTTGCATCTGGTTTATGGTACCTTCATGGAGAGTGGGAGCAAGTTGTCATCCACAGAGACATCAAAGCCAGTAATGTGCTTCTTGATGAAGAGATAAATGCACGCTTAGGTGATTTTGGCCTTGCAAGATTATATGACCATGGCACTGACATGCAAACAACACGCCTGGTTGGAACTATAGGATATCTTGCCCCTGAGTTGTTACAAAAAGGTAAGGCTTCACCCCTAACTGACGTGTTCGCCTTTGGCATATTTGTTCTTGAGGTTACTTGTGGACGACGACCCATTGAACACAAGATGAATAGTGATCAGCTCAAATTAGTAGACTGGGTGATTGATTGTTGGAACGAGAGATCACTTCTTGAGGCAATGGATCCAAAGCTCCAAAATGAGTATGATGCTGATGAAGCATGCCTAGCTTTGAAACTAGGATTGCTTTGCTCACACCAATCACCTGCTGCAAGGCCAAGCATGTGGCATGTCATGCAGTATCTTAACCATGACTTGCCATTTCCCGAGTTGGCGCCAATGGACATGGTGCAGAACCGTCAGGTGGACTCACCCGTTGCATATTGCCAATCAGTGGTGAGCGATGGCACCATCTCTGGCCTCTCCGAAAGGAGCATGAAGCAGTATACTTTGCCTATCATCCTCTTCCTTACCATAAGCATTAGCCTTTTAGCCATCAGTGCTAGTGGAGATCATGACCAATTCATCTACACCGGCTTCACCGGTAGCAATCTAACTCTAGATGGTGCAGCAAAAATCACAGCCACCGGCCTTCTTGGGCTGACAAATGATACATTCCGGATCAAAGGCCATGCATCTCACCCAGCTCCGCTACGCTTCCGCAAGTCCCCCAATGGCACGGTGCAATCTTTCTCTGTCTCCTTTGTATTTGGTATTCTCTCTTCATTTGGTGATATAAGAGGCCATGGATTTGCTTTCTTCATTGCCCCAAGCAATGATTTCTCCACTGCCTTTCCAATCCAATTTTTGGGTCTTCTTAATGATATAAACAATGGCAGTTCGACCAATCACCTCTTTGCAATTGAGCTTGATACCATTAGGAATGATGAGTTCGGGGACATCGACAATAATCATGTCGGGATTGATATCAACAGTCTCAACTCAGTAAGATCCTCTTATGCCGGCTTCTATAATGACAACAATGGCGCGCTCACAAACGTGAGCCTCATTGGAGATAAGCCAATGCAAGTTTGGGTAGAGTATGATGGGAATGCCACACAAATTGATGTGACATTAGCTCCTCTTGGTATTGGAAGACCTAAGAGACCACTACTCTCTGTAGTCCATAACCTCTCAACAGTGCTAACAGATCAAGCATACCTTGGCTTCTCATCCTCAACAGGCTTAAGCACAGGACATCACTATATTGTTCTACCAATAGCATCAGCAATATTCGTACTAGCTATTGGTGTTGCTATTGTTTTACTCGTGAGGAGACATTTAAGGTATAAGGAGGTACGTGAAGATTGGGAGGTTGAGTATGGCCCGCACCGTTTCGCTTACAAAGATTTATTTGATGCCACTAAAGGATTTAAGAACAAAAACTTGGTAGGCACAGGTGGGTTTGGAAGGGTGTACAAAGGGGTGCTTCCTAACTCTAGACTAGAAGTTGCTATAAAGCGGGTTTCGTATGAATCGAAGCAAGGTATAAAAGAATTTGTCGCTGAAGTTGTAAGTATAGGCCATCTTCAACACCGCAATGTTGTGAAATTGCTTGGATATTGTAGGAGAAAAGGTGAACTTCTTCTTGTGTATGACTACATGGCAAATGGAAGTCTAGACAAATACTTGTATCGACAAGAGGGCAAACCAACTTTAAATTGGGGACAAAGGTTTCAAATTATCAAAGACATTGCATCTGGTTTGCTCTACCTCCATGAAGAATGGGATAAAGTTGTCATTCATCGTGATGTCAAGGCAAGCAATGTGCTTCTCGACAAACAACTGAATGGACGACTGGGAGATTTCGGTCTTGCAAGATTATATGACCACGGCACTGACCCACAAACCACACATGTTGTTGGCACAATAGGATACCTAGCTCCAGAGCTAGTACACAGAGGAAAGGCAACCACTCTTACTGATGTCTTCTCATTTGGCATATTTATTCTTGAGGTTACTTGTGGGCAAAAGCCTATCAAGGAAGACTCACAAGGCAGACAACTTATCTTGGTTGATTGGGTGCTTCAGAACTGGCACAAAGGATCACTTCTTGATACAGTGGATATCAAGATCCAAGGTAACTATGATATAGGAGAAGCATGTCTTGTACTAAAGCTGGGATTGATGTGTTCGCACCCATTTCCTAATGTTAGGCCCAATGTGCGACAAGTTATGCAATATCTCGATGGGGATGTGCCACTACCAGAGCTTAAACCGGAGCACTTCAGCTTTGACATGTTAGCATTGATACAAAAGCAAAATGAAGCAAACATACCTCATATGGAGCATCTGTCCCTCCTTTTACCCCTCATCGCCCTAGCCCTAAACCTTGCCATCACCATGAGCGAGGACCAGTTCGTCTATTCGGGCTTCTCCGGCAGAAACCTCACCCTTGATGGTGCAGCAACAGTTACAGATGATGGGGTTCTTGAGCTGACCAATCGCACCGTCCACATCAAAGGCCATGCGTTCTACCCAACTCCATGGCAATTCAGGAAGACGCCCAATGGGACGGTGCAATCCTTCTCAATTAACTTTGTGTTTGGCATGATTCCTGTCTACTCTAATGAAAAATGTACCGATGGCATGACTTTCGTGATCTCTCCAACCAGTGATATGTCAAGTGCTCAGGACTCCCAATACTTGGGTCTACTCAACAAAACATCAGATGGAAAAGCAAGCAACCACATTTTTGCAGTCGAGCTTGATAGTAGCCAAAATACCGAGTTCCACGACATCGACGACAACCACGTTGGCATCGACATCAACAATCTCACCTCAGTTCAATCTCGGCCAGCTGGTTTCTATAGTGATAACAAGAGTATCTTCAACAATTTGTCCCTCTGTAGCTACAAGCCAATGCAAGTATGGGTTGACTACAACGAAGACACCACA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Protein seq		MNVRLGDFGLARLYDHGTDMQTTHLVGTIGYLAPELANTGKASPATDVFSFGIFVLEVTCRRRPIEHGMNSEYKFTLVDWVIDRWHEGSLLEAMDPKLQNNYDDDEACLALKLGLLCSHPSSIAIARPTMWHVMQYLNHDLPFPELMATDMVRNRCVDSPISYCQSVAFVRAMPVVNRWCFLPILFFISILLVIILPSLATTLGDGQFVYYGFANSNLIVDGAVTVLPEGLLELTNGTVNQKGHAFHPTPFRLRKSPNSAVQSFSASLVFGIVSPLLHASTEGMAFFLAPSSNFSDVLPAQYLGLFNYSNNGNLSNHIFAVEIDTAQNNEFMDIDGNHVGIDICDLHSATSSSAGYYDDITGSFRNLSLISGEAMQIWINYDGEATWIDVALAPFKMARPTKTLLSMSYNLSAVLTDVAYVGLSAATGQIESRHYILGWSFSMNGPAPPFFTAHLPNLPKARVDRKATQLILLPLIFPLATPTFVFLVILAIFFFVRRRLRYAELREDWEIEFGPHRFSFKDLYLATEGFKNSHLLGTGGFGRVYKGLLSKSKSQIAVKRVSHESRQGIREFVAEVVSIGRLRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDNYLYGHSNRSILDWIQRFRIIKGVASGLWYLHGEWEQVVIHRDIKASNVLLDEEINARLGDFGLARLYDHGTDMQTTRLVGTIGYLAPELLQKGKASPLTDVFAFGIFVLEVTCGRRPIEHKMNSDQLKLVDWVIDCWNERSLLEAMDPKLQNEYDADEACLALKLGLLCSHQSPAARPSMWHVMQYLNHDLPFPELAPMDMVQNRQVDSPVAYCQSVVSDGTISGLSERSMKQYTLPIILFLTISISLLAISASGDHDQFIYTGFTGSNLTLDGAAKITATGLLGLTNDTFRIKGHASHPAPLRFRKSPNGTVQSFSVSFVFGILSSFGDIRGHGFAFFIAPSNDFSTAFPIQFLGLLNDINNGSSTNHLFAIELDTIRNDEFGDIDNNHVGIDINSLNSVRSSYAGFYNDNNGALTNVSLIGDKPMQVWVEYDGNATQIDVTLAPLGIGRPKRPLLSVVHNLSTVLTDQAYLGFSSSTGLSTGHHYIVLPIASAIFVLAIGVAIVLLVRRHLRYKEVREDWEVEYGPHRFAYKDLFDATKGFKNKNLVGTGGFGRVYKGVLPNSRLEVAIKRVSYESKQGIKEFVAEVVSIGHLQHRNVVKLLGYCRRKGELLLVYDYMANGSLDKYLYRQEGKPTLNWGQRFQIIKDIASGLLYLHEEWDKVVIHRDVKASNVLLDKQLNGRLGDFGLARLYDHGTDPQTTHVVGTIGYLAPELVHRGKATTLTDVFSFGIFILEVTCGQKPIKEDSQGRQLILVDWVLQNWHKGSLLDTVDIKIQGNYDIGEACLVLKLGLMCSHPFPNVRPNVRQVMQYLDGDVPLPELKPEHFSFDMLALIQKQNEANIPHMEHLSLLLPLIALALNLAITMSEDQFVYSGFSGRNLTLDGAATVTDDGVLELTNRTVHIKGHAFYPTPWQFRKTPNGTVQSFSINFVFGMIPVYSNEKCTDGMTFVISPTSDMSSAQDSQYLGLLNKTSDGKASNHIFAVELDSSQNTEFHDIDDNHVGIDINNLTSVQSRPAGFYSDNKSIFNNLSLCSYKPMQVWVDYNEDTTQIKVTMAPIEVGKPLRPLLSEIHNLSLVLEEPSYIGFSASTGPINTLYCVLGLSLGINRPAPAIDLSKLPKLPRVSPKPRTKLLEIILPIATATFILIVGTTIVLLVRRRMRYAELHEDWEAEFGPHRFSYKDLFHATDGFKNRNLLGLGGFGKVYKGVLPTSKLHVAVKRVSHDSKQGMKEFIAEIVSIGRLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYEYMPNGSLDKYLYCEDSKPTLDWAQRFQIIKGVASGLFYLHDRWEKIVIHRDVKASNVLLDGEMNGRLGDFGLAKLYDHGADPQTTHVVGTMGYLAPELARTGKATPLTDVYAFGIFILEVTCGQRPIDNYADDNSQMLIDCVVEHWHKGSLTNMLDKRLLGDYDADEFSFFNTFTSYARVLLLDLFFFLFISNLSALATGEDQFIYSGFNGANLTLDGVASVTPDGLLKLTNGTLRLQGHAFHPTPFSFKKKPNGTVNSFAVSYIFAIYCLRPVICGHGIAFVVSVSKNFSTAMASQYLGLINDHNNGDPTNHFFAIELDTNQNDEFNDVNNNHVGIDINSLTSLNSSSVGYYTDSNGNFNNITLTSYKMMQVWLEYNGDNRQINVTLAPIKMAKPVKPLLSTYYDLSTVLTDMAYVGFSSSTGSFVARHYVLGWSFGINKPAPAIDISKLPKLPYEGEKTHSKVLEITLPIATATFVLAMIALIILLIRRRLRYAEIREDWEVEFGPHRFSYKDLFCATEGFKNKNLLGIGGFGRVYKGLLPTSKLEIAVKRISHDSNQGMKEFVAEIVSIGHLQHRNLVQLHGYCRRKSELILVYDYMSNGSLDKHLYGQENNSTLTWAQRFQIIKDIASGLLYLHEEWEKVILHRDIKPSNILLDDNMNGRLGDFGLARLYDHGTDPQTTHVVGTIGYLAPELARTSKATPLTDVFAFGMFVLEVTCGRKPIDHTAQDNQLMLVDWVLHCWHQGFLNDAVDIKLQGVYNIDEACLALKLGLLCAHPFINKRPSMRHVTQILNREMELPELTPTHMSFNMLSLMQNQGFDPETMTNQFLISNSTLSDLSEVRQTSHTKFFFLFLLVSFGINCASFTNTSDDQLLYLGFTSANLITDDTTVVTSNGLLELTNGTINRKGHAFYPSPLHFRKPHNNKVHSFAVSFVFAIRSSYPRMSLHGLAFVVSPSINFSNALAIQYLGLLNSKNRGSKSNHILAIEFDTILNIEFEDIDDNHVGIDINDLHSIKSHSAGYYDDRNSSFQNMSLISGDAMQAWVDYNGEDKKISVTMAPIKMAKPKRPLILISYDLSTVLKEPSYIGFSASTGLVDSRHYILGWSFGMNKPAPMINVNKLPKLPRQGPNPQPKLLAITLPIASATFVILFCGVFITIVRRRLRYVELKEDWEIEFGPHRFSYKDLFHATHGFDNKNLLGAGGFGKVYKGVLPSSKLEVAVKRVSHESRQGMKEFVAEVVSIGRIRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDAYLYNNELKPTLSWDQRFRIIKGIASGLFYLHDKWEKVVIHRDIKASNVLLDTEMNGRLGDFGLARLYDHGTDLQTTHVVGTMGYLAPELVCTGKASPLTDVFAFGAFLLEVTCGQRPVNHSSQDSPGVLVDWVLEHWQKGLLTNTVDARLQGDYNIDEACFVLKLGLLCSHPFTNMRPNMQQVMQYLDGDVPLPELTQMDMSFSIISMMQDEGFNPYTLSSYPPPGTSIVRCLTEQTKEQLGSLHVSLAVSLSDKDRKGIEDYAEDSCSLASYMIRVKPGLLPVQPSPKHLCTFWHLNSLVLHKLHMENQPVLFSAVFILYVSFLGPFCASSGEESFVYSGFASTGAANLTLDGSAMVTTTGLLQLTDSMPNIQGHAFYPTPLRFKKQSNGIVQSFSVAFMFGIISPYSDASTDGMAFVVAPNKGFPDAKAAQFLGLLNISSDNSTSNHMFAVEIDTAQNTELDDIDGYHVGIDINSLHSKKSQHIGFYNDQHGGLLKNLTLTGSNCKPVQVWVDYDGETTQINVTLAPIKVTKPTRPLLSVPFNLSTVLTDQAYIGFSAATGPLTSHYYVLGWSFAMNAPAPPIEISRLPRLPCPGDNRLQKILQILLPIVAVALIFIVVMILVRRQQRYAELREDWEVEFGPHRFSYKDLFNATEGFKSKHILGVGGFGKVYKGVLRTSKLEVAVKKVSHGSNQGMKEFISEVVSIGHLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDKYLYGEDNKPVTCGRWPISNSAHHGRKMLVDWVLQHWHQGSLPETVDPKLHGIYNVDEACLVLTLGLMCSHPIPGARPIMRQVMQYLDGDAPLPEFTPATLNSSLLAIMHNEGVDPYVAQYPWSGNSLGTMTPDIFMKIMLFGLLAVLAGCSDAVDQFVYSGFTGSNLTLDGGARVTPSGLLELTNGMVRLKGHAFHPTPLHLHESPNGTVQSFSISFVFAILCDYPDSCGHGLAFFIAPSKNFASAFWTQYLGLFNNKNNGDPNNHIFAIELDTVQNDDLQDISNNHIGININSLYSMKSRDAGFYDDKSGDFKNLTLISQKAMQVWVNYDREITQINVTMAPLNVEKPVKPLLSTTYNLSTVLTDSAYIGFSSSTGTVSGKHYVLGWSFGMNSPAPSIDIAKLPRLAVVFLLSAGTTIFLCMRRNLRYAELREDWEVEYGPRRFCYKDLFDATEGFKNKHLLGTGGFGSVYKGVLPISRLDIAVKRVSHDSTQGMKEFIAEIVSIGCLQHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDKYLYGKEGKPTLDWTQRFQIIKGVASGLLYLHEESEKVIIHRDIKASNVLLDNDTNARIGDFGLARLYDHGTDPETTRVVGTIGYLAPELARGGKATPLTDVFAFGMFILEVTCGQKPVMQNTEDDQLVLIDWVLEHWHKGSLADTVDIKLQGEYNIDEACLALNIGLLCSHPLISVRPNMRQVVQYLNKDIPLPESMPTHLSFYVMALIQNKGFSPCTITDPSSATSFGTISSTSLSEGR
Function		L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XUN6]

Transcripts

Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
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Protein seq	MNVRLGDFGLARLYDHGTDMQTTHLVGTIGYLAPELANTGKASPATDVFSFGIFVLEVTCRRRPIEHGMNSEYKFTLVDWVIDRWHEGSLLEAMDPKLQNNYDDDEACLALKLGLLCSHPSSIAIARPTMWHVMQYLNHDLPFPELMATDMVRNRCVDSPISYCQSVAFVRAMPVVNRWCFLPILFFISILLVIILPSLATTLGDGQFVYYGFANSNLIVDGAVTVLPEGLLELTNGTVNQKGHAFHPTPFRLRKSPNSAVQSFSASLVFGIVSPLLHASTEGMAFFLAPSSNFSDVLPAQYLGLFNYSNNGNLSNHIFAVEIDTAQNNEFMDIDGNHVGIDICDLHSATSSSAGYYDDITGSFRNLSLISGEAMQIWINYDGEATWIDVALAPFKMARPTKTLLSMSYNLSAVLTDVAYVGLSAATGQIESRHYILGWSFSMNGPAPPFFTAHLPNLPKARVDRKATQLILLPLIFPLATPTFVFLVILAIFFFVRRRLRYAELREDWEIEFGPHRFSFKDLYLATEGFKNSHLLGTGGFGRVYKGLLSKSKSQIAVKRVSHESRQGIREFVAEVVSIGRLRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDNYLYGHSNRSILDWIQRFRIIKGVASGLWYLHGEWEQVVIHRDIKASNVLLDEEINARLGDFGLARLYDHGTDMQTTRLVGTIGYLAPELLQKGKASPLTDVFAFGIFVLEVTCGRRPIEHKMNSDQLKLVDWVIDCWNERSLLEAMDPKLQNEYDADEACLALKLGLLCSHQSPAARPSMWHVMQYLNHDLPFPELAPMDMVQNRQVDSPVAYCQSVVSDGTISGLSERSMKQYTLPIILFLTISISLLAISASGDHDQFIYTGFTGSNLTLDGAAKITATGLLGLTNDTFRIKGHASHPAPLRFRKSPNGTVQSFSVSFVFGILSSFGDIRGHGFAFFIAPSNDFSTAFPIQFLGLLNDINNGSSTNHLFAIELDTIRNDEFGDIDNNHVGIDINSLNSVRSSYAGFYNDNNGALTNVSLIGDKPMQVWVEYDGNATQIDVTLAPLGIGRPKRPLLSVVHNLSTVLTDQAYLGFSSSTGLSTGHHYIVLPIASAIFVLAIGVAIVLLVRRHLRYKEVREDWEVEYGPHRFAYKDLFDATKGFKNKNLVGTGGFGRVYKGVLPNSRLEVAIKRVSYESKQGIKEFVAEVVSIGHLQHRNVVKLLGYCRRKGELLLVYDYMANGSLDKYLYRQEGKPTLNWGQRFQIIKDIASGLLYLHEEWDKVVIHRDVKASNVLLDKQLNGRLGDFGLARLYDHGTDPQTTHVVGTIGYLAPELVHRGKATTLTDVFSFGIFILEVTCGQKPIKEDSQGRQLILVDWVLQNWHKGSLLDTVDIKIQGNYDIGEACLVLKLGLMCSHPFPNVRPNVRQVMQYLDGDVPLPELKPEHFSFDMLALIQKQNEANIPHMEHLSLLLPLIALALNLAITMSEDQFVYSGFSGRNLTLDGAATVTDDGVLELTNRTVHIKGHAFYPTPWQFRKTPNGTVQSFSINFVFGMIPVYSNEKCTDGMTFVISPTSDMSSAQDSQYLGLLNKTSDGKASNHIFAVELDSSQNTEFHDIDDNHVGIDINNLTSVQSRPAGFYSDNKSIFNNLSLCSYKPMQVWVDYNEDTTQIKVTMAPIEVGKPLRPLLSEIHNLSLVLEEPSYIGFSASTGPINTLYCVLGLSLGINRPAPAIDLSKLPKLPRVSPKPRTKLLEIILPIATATFILIVGTTIVLLVRRRMRYAELHEDWEAEFGPHRFSYKDLFHATDGFKNRNLLGLGGFGKVYKGVLPTSKLHVAVKRVSHDSKQGMKEFIAEIVSIGRLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYEYMPNGSLDKYLYCEDSKPTLDWAQRFQIIKGVASGLFYLHDRWEKIVIHRDVKASNVLLDGEMNGRLGDFGLAKLYDHGADPQTTHVVGTMGYLAPELARTGKATPLTDVYAFGIFILEVTCGQRPIDNYADDNSQMLIDCVVEHWHKGSLTNMLDKRLLGDYDADEFSFFNTFTSYARVLLLDLFFFLFISNLSALATGEDQFIYSGFNGANLTLDGVASVTPDGLLKLTNGTLRLQGHAFHPTPFSFKKKPNGTVNSFAVSYIFAIYCLRPVICGHGIAFVVSVSKNFSTAMASQYLGLINDHNNGDPTNHFFAIELDTNQNDEFNDVNNNHVGIDINSLTSLNSSSVGYYTDSNGNFNNITLTSYKMMQVWLEYNGDNRQINVTLAPIKMAKPVKPLLSTYYDLSTVLTDMAYVGFSSSTGSFVARHYVLGWSFGINKPAPAIDISKLPKLPYEGEKTHSKVLEITLPIATATFVLAMIALIILLIRRRLRYAEIREDWEVEFGPHRFSYKDLFCATEGFKNKNLLGIGGFGRVYKGLLPTSKLEIAVKRISHDSNQGMKEFVAEIVSIGHLQHRNLVQLHGYCRRKSELILVYDYMSNGSLDKHLYGQENNSTLTWAQRFQIIKDIASGLLYLHEEWEKVILHRDIKPSNILLDDNMNGRLGDFGLARLYDHGTDPQTTHVVGTIGYLAPELARTSKATPLTDVFAFGMFVLEVTCGRKPIDHTAQDNQLMLVDWVLHCWHQGFLNDAVDIKLQGVYNIDEACLALKLGLLCAHPFINKRPSMRHVTQILNREMELPELTPTHMSFNMLSLMQNQGFDPETMTNQFLISNSTLSDLSEVRQTSHTKFFFLFLLVSFGINCASFTNTSDDQLLYLGFTSANLITDDTTVVTSNGLLELTNGTINRKGHAFYPSPLHFRKPHNNKVHSFAVSFVFAIRSSYPRMSLHGLAFVVSPSINFSNALAIQYLGLLNSKNRGSKSNHILAIEFDTILNIEFEDIDDNHVGIDINDLHSIKSHSAGYYDDRNSSFQNMSLISGDAMQAWVDYNGEDKKISVTMAPIKMAKPKRPLILISYDLSTVLKEPSYIGFSASTGLVDSRHYILGWSFGMNKPAPMINVNKLPKLPRQGPNPQPKLLAITLPIASATFVILFCGVFITIVRRRLRYVELKEDWEIEFGPHRFSYKDLFHATHGFDNKNLLGAGGFGKVYKGVLPSSKLEVAVKRVSHESRQGMKEFVAEVVSIGRIRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDAYLYNNELKPTLSWDQRFRIIKGIASGLFYLHDKWEKVVIHRDIKASNVLLDTEMNGRLGDFGLARLYDHGTDLQTTHVVGTMGYLAPELVCTGKASPLTDVFAFGAFLLEVTCGQRPVNHSSQDSPGVLVDWVLEHWQKGLLTNTVDARLQGDYNIDEACFVLKLGLLCSHPFTNMRPNMQQVMQYLDGDVPLPELTQMDMSFSIISMMQDEGFNPYTLSSYPPPGTSIVRCLTEQTKEQLGSLHVSLAVSLSDKDRKGIEDYAEDSCSLASYMIRVKPGLLPVQPSPKHLCTFWHLNSLVLHKLHMENQPVLFSAVFILYVSFLGPFCASSGEESFVYSGFASTGAANLTLDGSAMVTTTGLLQLTDSMPNIQGHAFYPTPLRFKKQSNGIVQSFSVAFMFGIISPYSDASTDGMAFVVAPNKGFPDAKAAQFLGLLNISSDNSTSNHMFAVEIDTAQNTELDDIDGYHVGIDINSLHSKKSQHIGFYNDQHGGLLKNLTLTGSNCKPVQVWVDYDGETTQINVTLAPIKVTKPTRPLLSVPFNLSTVLTDQAYIGFSAATGPLTSHYYVLGWSFAMNAPAPPIEISRLPRLPCPGDNRLQKILQILLPIVAVALIFIVVMILVRRQQRYAELREDWEVEFGPHRFSYKDLFNATEGFKSKHILGVGGFGKVYKGVLRTSKLEVAVKKVSHGSNQGMKEFISEVVSIGHLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDKYLYGEDNKPVTCGRWPISNSAHHGRKMLVDWVLQHWHQGSLPETVDPKLHGIYNVDEACLVLTLGLMCSHPIPGARPIMRQVMQYLDGDAPLPEFTPATLNSSLLAIMHNEGVDPYVAQYPWSGNSLGTMTPDIFMKIMLFGLLAVLAGCSDAVDQFVYSGFTGSNLTLDGGARVTPSGLLELTNGMVRLKGHAFHPTPLHLHESPNGTVQSFSISFVFAILCDYPDSCGHGLAFFIAPSKNFASAFWTQYLGLFNNKNNGDPNNHIFAIELDTVQNDDLQDISNNHIGININSLYSMKSRDAGFYDDKSGDFKNLTLISQKAMQVWVNYDREITQINVTMAPLNVEKPVKPLLSTTYNLSTVLTDSAYIGFSSSTGTVSGKHYVLGWSFGMNSPAPSIDIAKLPRLAVVFLLSAGTTIFLCMRRNLRYAELREDWEVEYGPRRFCYKDLFDATEGFKNKHLLGTGGFGSVYKGVLPISRLDIAVKRVSHDSTQGMKEFIAEIVSIGCLQHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDKYLYGKEGKPTLDWTQRFQIIKGVASGLLYLHEESEKVIIHRDIKASNVLLDNDTNARIGDFGLARLYDHGTDPETTRVVGTIGYLAPELARGGKATPLTDVFAFGMFILEVTCGQKPVMQNTEDDQLVLIDWVLEHWHKGSLADTVDIKLQGEYNIDEACLALNIGLLCSHPLISVRPNMRQVVQYLNKDIPLPESMPTHLSFYVMALIQNKGFSPCTITDPSSATSFGTISSTSLSEGR More

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Protein seq	MRAPTAWPSSSPQTRASPMPRRRSSWASSTSAATTAQATTCSPWKSTPPRTPSWTISMATTSASTSTASTPRNPNTSASTMTSMVG

Event Type

Chromosome

Start

End

Strand

Alternative mRNAs

Total mRNAs

Source

Expression

	Leaf	Root	Panicle
FPKM	0.794274	0.468260	0.961358

Homologues

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Genome & Annotation	Homologs	Type	Leaf	Root	Panicle
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KETAN NANGKA \| Os128077RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsKeNa_07g0020060	RBH	0.176769	0.000000	0.271799
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ARC 10497 \| Os117425RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsARC_07g0009350	RBH	0.0	0.0	None
PR 106 \| Os127742RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsPr106_07g0020440	RBH	0.711692	2.715666	0.502037
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KHAO YAI GUANG \| Os127518RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsKYG_07g0001860	RBH	0.094928	0.222106	None
GOBOL SAIL \| Os132424RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsGoSa_07g0009510	RBH	0.0	0.0	None
LIU XU \| Os125827RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLiXu_07g0009660	RBH	0.0	0.0	0.0
LARHA MUGAD \| Os125619RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLaMu_07g0001930	SBH	0.0	0.0	None
N22 \| OsN22RS2 \| Gramene(+IsoSeq)	OsN22_07G002040	RBH	0.000000	0.0	0.0
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