Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsAzu_04g0018170 OGI:04074670 | 7/16 Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:23138278-23153431
Gene Symbol PTR
DNA seq

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Function Protein NRT1/ PTR FAMILY 4.3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q93VV5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsAzu_04g0018170 OsAzu_04g0018170.01 Chr04 23138278 23153431 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsAzu_04g0018170 OsAzu_04g0018170.02 Chr04 23148744 23153277 - IsoSeq
CDS seq

ATGGTTTATGTTCTTTCTGTCAGTGGTAACAAACATGGAAAATATTCCAAACATGCTGAATTTGGTTACATATCTCCATGGAACCATGCATATGGGAGTTTCAAGCTCTGCAACCACAGT

Protein seq

MVYVLSVSGNKHGKYSKHAEFGYISPWNHAYGSFKLCNHS

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A5 Chr04 23150060 23151643 - OsAzu_04g0018170.02 OsAzu_04g0018170.01,OsAzu_04g0018170.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 7.891736 0.545164

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0491350 RBH 0.000000 0.240934 0.576723
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g41410 RBH 0.000000 0.132717 0.121588
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0491350 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0018160 RBH 0.0 1.166167 0.000000
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0018950 RBH 0.000000 1.176281 0.358577
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0018660 RBH 0.157701 28.965307 1.945760
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0018370 RBH 0.0 0.414421 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0018570 RBH 0.000000 14.799523 0.738092
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0383700 RBH 9.0941355 23.128197 28.875256
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0017350 SBH 0.000000 0.962984 0.395520
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0338900 SBH 7.76006 10.5775585 1.5837065
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0017850 SBH 0.062070 0.064055 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0017700 RBH 0.190359 4.305089 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0017780 RBH 0.000000 7.191635 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0018200 RBH 0.0 0.841977 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0018360 RBH 0.0 4.301220 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G017670 RBH 0.0 1.460823 0.393474
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0017590 SBH 0.000000 4.372428 1.183992
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