Basic Info

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Function Disease resistance protein RPM1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q39214]

Transcripts

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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CDS seq

ATGGCAGAAGCAATTATTCTTGCTCTATCAAAGATTAATAGTACTTTTGGATTGGATCCCACAAATATTGCCAAATCTGCAGTATCCAAGCTATATCAGAAAGGAAAGAGTTTGGCGGAGTTACCGGGGAAGGTTGAAGAAATAAGAATGGAACTAACAACAATGGAAAATGTCATAGAACAACTAGATACAGCACATCTCACTGACAAAGTTATCAAGGGTTGGATTGCGGAGGTACGAAAGCTGGCCTACCATGTTGAGGATGTAATGGACAAATACTCATATCATGCTCTTCAAATGGAGGAAGAAGGGTTCCTGAAAAAGTACGTTGTCAAAGGATCACATTATGCCATTGTTTTCGATGGAATTGTTGCTGAGATAGTCCAGATTGAGCAGGAAATCCAAAGAGTTATAAAGCTGAAAGATAAATGGCTGCAACCATCCCAGCTTATCCGTAATAAACATTCTGACTTTGAAAGAAAGCGGTCACAAGGCTGCTTGCCAGAGCTCGTAAAGGATGAAGATCTTGTGGGGATCGAAGGCAACAGGATGTTATTGACTGGATGGTTGTACTCAAATGAACTAGATAGCACAGTGATAACAGTATCTGGCATGGGTGGATTAGGAAAAACTACCATTGTTGCCAATGTGTATGAGCGTGGGAAGATCAGGTTCCATGCTCATGCTTGGATTGTCGTGTCACAGACCTATGACGTAGAAGAATTGCTGAGGAAGGTACTCAGGAAGATTGGATATGCAGATCAAGCACACTTGGATGGTATGGATGTTCATGACTTAAAAGAGAAGTTCAAAGAAAACATAAGTGATAGAAGGTGTTTGATAGTGTTGGATGATGTCTGGGATAGAGAAGCATACAACCAAATACATGATGCCTTCCAAAATCTCCAGGCAAGCCGCATCATCATCACTACACGGAGTAAGCATGTGGCAGCACTAACTCTACCAACACGTCACCTTAAACTCCAACCTTTGGACAAGGTCGATGCATTCAGTCTCTTCTGCAGAAGGGCTTTTTATAGCAGGAAGGACTACGATTGCCCCTCAGAACTTCTAGAGTTGGCTAATTCAATCGTCGATAGGTGTCAAGGCCTACCTCTAGCTATCGTATCTATTGGGAGCCTGTTGTCCTCAAAGCAGCCGATACAGCATGCTTGGAAGCAAACATACAATCAGCTACAGAGCGAGCTAGCAAAGAGTGATCATGTACAAGCAATTCTGAACCTAAGCTACTATGACTTACCAGGAGACCTCAGTAACTGCTTTTTGTATTGCAGCATGTTCCCTGAGGATTGCCCCATGCCACGAGACAACCTTGTACGACTTTGGGTTGCTGAAGGATTTGCTGCAAGAAAAGAAAACAACACGCCAGAAGACGTGGCTGAAGGAAATCTCAATGAACTGATCAACCGGAATATGCTGGAAGTGGTAGAGACAGATGAACTTGGTAGGGTTAGTACCTGTAAGATGCATGACATTATGCGTGATCTGGCTCTTTTTGTGGCTAAAGATGAGAGATTTGGTTCAGCAAATGATTCTGGCACAATGATGCTAATGGATAATGAAGTCCGCCGCTTGTCAATGTGTCGTTGGGAGGACAAAGGTGTCTATAAAGCTAAATTTCCTCGCCTTCGAACATTAATATCAGTTCAAACAATTTCATCCTCCTCTAACATGTTGTCCTCAATTTTCTCTGAATCCACCTACCTCACTGTCCTTGAGCTGCAAGATTCTGAAATCACTGAAGTGCCAACAAGTATAGGGAATCTGTTTAACCTAAGATATATCGGCTTAAGGCGCACCAAAGTCAAGTCATTTCCAGAGACAATTGAGAAACTCTATAATCTCCACACTCTAGACATCAAGCAGACAAAAATAGAGAAGCTACCACGAGGGATTGTCAAGGTCAGGAAGCTACAACACCTTTTAGCTGACAGATGTGCTGATGAGAAGCATTCAGATTTCCGGTACTTCACTGGAGTTCAACCTCCGAAAGAGCTATCCAACTTAGAAGAGTTGCAGACACTCGAAACTGTGGAAGCCAGCAAAGATTTGGCCGAGCAGCTGAAGAAACTTACGCAACTTAAAACTGAGACGCTTTGCTTCAAAACCCTCGAGCCTATTTCAGGGAGGCTCCACAAGCTAATTGTCAGAGGGCACTGGGCCAATGGGACACTGCAATGCCCAATATTTCAGGACTGTGGGAGAAATCTCAAGTACTTAGCTCTAAGCTGGTGTCATCTTGGGGAAGATCCCCTGTCACTGTTAGCATCACATGTGCCATACCTCACCTTTCTAAGAATAAACAGGGTGTATACTACAAAGACATTAGTTCTTTCTGCAGGGTGTTTTCCAGAGCTAAAGACACTCGTTTTGAAACACATGCCGGATGTCAACAAGGTGGAGATCGAAGACCGTGCCCTTCCACGGATTGAAGGTTTGCACATTGTGTCTTTGTACAATGTGAAAAAGGTACCTGAAGGCATCGAGTTTCTTCGCTCCTTGAAGAAGCTATGGCTGCTGCATCTACATAAGGACTTCAACACTTACTGGGAGAGCAATGGAATGCACGAGAAAATGGCGCATGCGAATACTGCAAAGACATTGATTCTTTCTGCAGGGTGTTTTCCAGTGCTGAAGACACTCGTGCTGATGCATATGTCGGATGTCAACAAGGTGGAGGTCGAAGCTGAAGCCCTTCCACACATTGAAGGTTTGCACATTGTGAAAAAAGTATCGGAAGGCATCGAGTTTCTTCGCTCCTTAAAGAAGCTATGGTTGTTGAATCTACATAAGGACTTCAACACTTACTCGAAGAGAAATGGAATGCACGAGAAGATGGTGTGTGGACAAGAGGTTTGCCGCATCTAG

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Protein seq

MAEAIILALSKINSTFGLDPTNIAKSAVSKLYQKGKSLAELPGKVEEIRMELTTMENVIEQLDTAHLTDKVIKGWIAEVRKLAYHVEDVMDKYSYHALQMEEEGFLKKYVVKGSHYAIVFDGIVAEIVQIEQEIQRVIKLKDKWLQPSQLIRNKHSDFERKRSQGCLPELVKDEDLVGIEGNRMLLTGWLYSNELDSTVITVSGMGGLGKTTIVANVYERGKIRFHAHAWIVVSQTYDVEELLRKVLRKIGYADQAHLDGMDVHDLKEKFKENISDRRCLIVLDDVWDREAYNQIHDAFQNLQASRIIITTRSKHVAALTLPTRHLKLQPLDKVDAFSLFCRRAFYSRKDYDCPSELLELANSIVDRCQGLPLAIVSIGSLLSSKQPIQHAWKQTYNQLQSELAKSDHVQAILNLSYYDLPGDLSNCFLYCSMFPEDCPMPRDNLVRLWVAEGFAARKENNTPEDVAEGNLNELINRNMLEVVETDELGRVSTCKMHDIMRDLALFVAKDERFGSANDSGTMMLMDNEVRRLSMCRWEDKGVYKAKFPRLRTLISVQTISSSSNMLSSIFSESTYLTVLELQDSEITEVPTSIGNLFNLRYIGLRRTKVKSFPETIEKLYNLHTLDIKQTKIEKLPRGIVKVRKLQHLLADRCADEKHSDFRYFTGVQPPKELSNLEELQTLETVEASKDLAEQLKKLTQLKTETLCFKTLEPISGRLHKLIVRGHWANGTLQCPIFQDCGRNLKYLALSWCHLGEDPLSLLASHVPYLTFLRINRVYTTKTLVLSAGCFPELKTLVLKHMPDVNKVEIEDRALPRIEGLHIVSLYNVKKVPEGIEFLRSLKKLWLLHLHKDFNTYWESNGMHEKMAHANTAKTLILSAGCFPVLKTLVLMHMSDVNKVEVEAEALPHIEGLHIVKKVSEGIEFLRSLKKLWLLNLHKDFNTYSKRNGMHEKMVCGQEVCRI

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr04 7229882 7237067 - OsAzu_04g0004690.02 OsAzu_04g0004690.02,OsAzu_04g0004690.01 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.061921 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0219600 RBH 0.829693 0.618118 0.429409
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g14220 RBH 0.609254 0.515781 0.081356
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0219550 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0005330 RBH 0.138162 0.000000 0.117424
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0004880 RBH 1.586418 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0006440 SBH 0.025478 0.060152 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0000940 SBH 0.927060 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0091300 SBH 0.434348 2.5582425 1.486456
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0001050 SBH 0.0 0.056818 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0000910 SBH 0.0 0.081087 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0006750 SBH 0.031073 6.329325 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0001020 SBH 0.0 2.236707 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0000880 SBH 0.0 0.0 0.081117
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0001050 SBH 0.125053 1.408552 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G006560 SBH 0.420107 0.0 0.121737
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0001050 SBH 0.0 0.0 0.0
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