Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsAzu_03g0030050 OGI:03076650 | 16/16 Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr03:28959687-28976331
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Poly [ADP-ribose] polymerase tankyrase-1 [UniProtKB/Swiss-Prot:O95271]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsAzu_03g0030050 OsAzu_03g0030050.01 Chr03 28959687 28976331 + NAM
CDS seq

ATGGGGAAGAAGGGTAAGGGAAGGCACCGCGGCCGCGGCGGCGGAGGCGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGGGTGGGGATCGCGGCGGTGGAGGGAGCGGAGGAGGAGGGCCGGGAATGGGGCGGCGCGGGAGCGATGCGCGTGCCCAGCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAATCAGCGGCATCGCCACCCGCCTCGGGTTCGGGTGCACCGTCAATGTCGGCGGCGGGATGCCACCGCAGATGGAGTTCCTCATGGCGTGTACGGACGGCGACGTCGCGCGCCTCAAGGAGGTGGTTGATAGCATGGATGAGGATGATCGGGAATCGCTCGCCACTGTGAGGATGGAGGGGTATGGGCCACTATTTGAGGCAGCAAGCTCGGGAAAAATTGATCTCTGCAAGTACTTGGTGGAGGAGCTCGGGTTCGATGTCAATGCTGAAGCTAGTCGTGATTCTGGTATGACGCCTTTGTTTTGCGCTGTGTTGGATGGACAAGAGATTACTGTGAAGTATTTTCTTGACAAAGGTGCTGATCCGAATAAGAAAGATGCAGAAGGCTTTGCTCCTCTTCATGAAGCCGCAAAAATAGGGCACGTTGGAATAGCACGACTGTTGTTATCTAAAGGAGCTAGTGTTGATGTATCTTCTTCTGAAGGGACACCACTTCATGTTGCTGCCTCTAATGGAAAATCTAGCATTGTGCAGATTTTATTAGAGCACCATGCAAATCCAAATGTGATGACGCCAGATTGTTATACACCACTGACCGCAGTTCTTTCTGCCACTCCTGAAATAGTGAATGAATCTGAGTGTTTGAAGTGCATGAAACTCCTTATCAAGGACAAAGGAAGTGATGGAGACAGAAAATCTAAGCTGAAATTACATGGTGGAAAAGCATTTGAGGAGGGTGACTATGCGGGTGCAATCATATTCTACACTGAGGCAATGAAACTTGATCCTGCAGATGCCACACTGTATTCAAACAGGAGCCTTTGCCATCTGAGAAGTGGTGCAGCGCAAGAGGCTTTGCTGGATGCTAATGATTGCATAAAACTCAAGCCTGAGTGGACTAAAGGTTACTATCGCAAAGGATGTGCCCACATGGCACTCAAGGAATACAAAGAAGCTTGTACTGCATTCATGGCTGGAACAAAGCTCGATCCTTTAAGCGATGAAATGCAGAATGCATTTTGGGAGGCAGCTAAAGCAATGAAGAATGAATATATGGCTGGAAGGCGCGTCAGCTCGGACGGCGAAGTGGTGGTGGATCAAGTGCTCGATTCCACGGGGCGCGTGCCCGGCGGCTCGACCGCCAACTTCAGCGCCCACCTCATCGCGGCCCAGCTCGGGATGCAGTGCCGCATGGGTCCCGCGGCGGCGGAGCAGATGAGGCGCGTCATCGCGTCGTCGGACTGCGACACCGGCCGCGTCATGAGGATGTTTGGTGCCATGGAAGGTGGCGACAGTGATTCTGATTCTGATGACTCTGCGGAGACGGAGAAAGTTGGGCCACTGCATGAGGCAGCAAGCGCAGGGAAAATGGATACTTGCAAACATTTGGTGGAGCAGCTTGGGTTTGACATCAATGCTGAAGCAAGTGATGATTTGGGTATGACACCTTTGGCTTGTGCGGTGTCCAAGGGAAAAGCAATTGCTGTGAGGTATTTTCTTGACAAAGGTGCTGATCCAAATAAGCAAGACAACATCGGTTTTACTCCTCTGCACTATGCTACAAAAGAAGGGTATGATGGACTGGCACGACTACTGCTGTCTAAAGGGGCTAGTGTTGATGTTATTTCTTCTAAAGGCACAGCCCTGCATCTTGCTGCCTCCAGTTGGAAGTCTGGCATCATGAAGATTCTATTGGAGCACAATGCAGATCCAAACAAGGTCTCCGCAGATTCAGAGACACCATTAGCTGCAACACTTATAGCTTCTGATGGACTGAATGAACCTGCTGTGCTGAAGTGCATAGAGCTTCTTGTTAAGGCTGGTGCTAATTTGAACTGCGCTATTCCTGATACACCACTGGTGATAGCAACTAACAAAGACTTTGTTGAATGTGTTGAGTACTTGTTGGAGGCTGGTGCAAACGCCAATATTCCAACTAATAACGGTGGTAAGACACCAATAGAAATAGCCGCGAAGTCTGGAAGAAGGAAGCTTGTGGAGATTCTATTTCCTTGCACGTTGCCAATTAAAGGTGTGTCAAACTGGACTGTTGAAGGAATCATCACCCATGTGAAATCAAAAAAATCAAAGAAGAAAGCATGCGCTCAGGATAAGGAAAGTGGTACAGACAAAAAGGCTCAGTTGAAATCATTGGGTGCAAGTGCAGTTCAGGGGAAGGACTATGTTGGTGCATCCAAATTCTACAGTGAGGCCATCCAGCTGGATCCTACCGATGCAACATTGCATTCAAATAGGAGCTTTTGCTACCTAAAAAGTGGTGAAGCACGGGAAGCTTTGGTTGATGCTAAGACTTGCATAGGGCTGAAACCAGATTGGCCAAAAGGTTACTATCGGAAAGGAGCTGCCCTGATGTCGCTCAAGGAATACAAAGAAGCGTGTGATGCATTCATGGATGGAGTGAAACTGGATCCTGCAAGTGGGGAGATGCATGAAGCATTTTGGGAGGCAGCCGCGGCATTGAAGAAGAAACATTTGGCTGGGAAGACTGTCAGCTCATTTGATTAG

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 3.008575

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_03g0680100 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os03g47650 RBH 0.0 0.0 0.488139
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os03g0680200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0022130 SBH 0.0 0.0 0.559346
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_03g0029770 RBH 0.0 0.0 0.387890
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_03g0029830 RBH 0.0 0.0 1.275840
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_03g0029920 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_03g0029660 RBH 0.0 0.0 1.433096
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_03G0467500 RBH 0 0.0238995 0.3960015
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_03g0029370 RBH 0.0 0.0 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_03G0468500 RBH 0.067138 0 2.8495935
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_03g0029690 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_03g0029760 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_03g0029710 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_03g0029540 RBH 0.0 0.0 0.106168
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_03g0029500 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_03G029490 RBH 0.0 0.0 0.330394
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_03g0029450 RBH 0.000000 0.0 5.052599
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