Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_11g0022970 OGI:11077650 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:27101232-27124181
Gene Symbol YR2, YR6, YR9, YR10, YR21, YR23, -
DNA seq

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Protein seq

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Function Putative disease resistance protein RGA3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA40]

Transcripts

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_11g0022970 OsARC_11g0022970.02 Chr11 27110037 27124181 + NAM
CDS seq

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Protein seq

MALVLRVRESSHLLEPNIVGKEIIHACRKMVDLVLEHKGRKHYKLAIVGTGGVGKTTLAQKIYNDRKIKGRFNKKAWVCVSKVYSEASLLRELLRIIEVHHGQDESIGELQSKLEIAIKEKRWELLWKSMNISESIELQTLQDVGTEIVRKCGCLPLAIKVIARVLAKDANIYRDDLTRMWIAEGFIEDHGGQLLEETADEYYYELIHRNLLQPDGLYYDHSSCKMHDLLRQLACYLSREECFVGNPESLVGNTVSKLRRVSVVTDKNMVMLPSMDEVQYKVRTWKTSYEKTLRVDNSFFKRFPYLRVLDLTDSFVPSIPGCIGNLIHLRLLDLDGTNVSCLPESIGNLKNLQILNLERCVALHSLPSAITQLCNLRRLGLNYSPIYQVPKGIGKLEFLNDVEGFPVYGGSSSTKMQDGWNLEELAYLYQLRRLHMIKLERAAYRTTYPLLTDKGFLKFLYLWCTERTDEPYTEKDFSNIEKIFEQLIPPCNLEDLAIVKFFGRQYPFWIDSTHLAYIKSLHLFNCKFCMHLPPVGQLPNLKYLKIEGAAAVTIIGPVFAGLRASNLGRTVAFPKLEELLIRDMPNWEEWFFIDEATSTAKERVDDGDSAMPKEKALPPRMQILSRLRRLELSGCPKLKALPRQLAQINSLKEIELRWVSSLKVVENFPLLSETLLIATCQALEKVSNLPQVRELRVQDCPNLRLVEELGTLEQLWLYEDMHEVSTLWVPGLQQQCRQCHGEDLDIV

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_11g0022970 OsARC_11g0022970.03 Chr11 27110240 27112062 + IsoSeq
CDS seq

ATGTTGAGGATTGGGCAGTTTGGAGCAGCTATGGCGGGCTGGACGAGGATATGCAGGAGATCTCTCAGCTGTGGGTCCCAAGGCTTCAAGAGCAACACCGCCAACTCCATGGAGATGAGCATGAGCTGGAGGTCAACGAGTGGCTCTGAGAGCCAGTTA

Protein seq

MLRIGQFGAAMAGWTRICRRSLSCGSQGFKSNTANSMEMSMSWRSTSGSESQL

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.459360 0.024200 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0677000 SBH 0.0 0.000000 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g45050 SBH 1.895145 2.270342 1.721375
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0677000 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0023570 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0023460 SBH 0.0 0.0 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0023120 SBH 0.160988 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0023510 SBH 0.000000 0.279106 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0416600 SBH 0.1248355 0.9264055 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0024020 SBH 0.322438 0.290468 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0430000 SBH 0.0419675 0.0645025 0.058287
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0023840 SBH 1.203734 0.746390 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0023300 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0023050 RBH 0.409612 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0023120 RBH 1.036864 4.214044 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G023300 SBH 0.434635 0.913598 2.277780
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0023730 SBH 1.486182 20.188963 5.723283
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