Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
Os11g0516800 OGI:11055230 | 15/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Chr11:18531653-18541501
Gene Symbol -
DNA seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
Os11g0516800 Os11t0516800-01 Chr11 18531653 18541501 - irgsp1_rep
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM None None None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0516800 RBH 0.000000 0.0 2.838117
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g31770 SBH 1.311175 1.475178 6.330320
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0518900 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0015310 RBH 0.0 0.0 3.820550
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0015270 RBH 0.0 0.0 2.159299
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0015220 RBH 0.152978 0.0 8.395219
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0014860 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0015320 RBH 0.0 0.0 8.862785
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0293600 SBH 0.00402 0 2.25465
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0015530 RBH 0.0 0.0 0.469927
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0303600 RBH 0.0083425 0.90486 6.140133
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0015460 RBH 0.292220 0.214302 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0015430 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0015140 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0014890 RBH 0.0 0.0 0.553151
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0015200 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G015030 RBH 0.0 0.0 0.247378
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0015340 RBH 0.0 0.0 3.826103
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