Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| LOC_Os11g10310 | OGI:11016730 | 10/16 | Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | Chr11:5592443-5603077 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q1MX30] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| LOC_Os11g10310 | LOC_Os11g10310.1 | Chr11 | 5592443 | 5603077 | - | MSU_osa1r7 | ||
| CDS seq | ATGGCTACTACATCATCAGCATGCGTTTCCATTGCTGTACTAGTAGTAGTGCTATCGTCCACCTCATGCTATTCTTCTCCAAGTCCGACGACCACCGCCAATGGCAGCAGCGACACCGATCTCGCCGCCCTGCTGGCTTTCAAGTCCCAGCTTACCGACCCCCTCGGCGTTCTGACAAGCAACTGGAGCACCAGCACCTCTTTCTGCCACTGGCTTGGTGTCACCTGCAGCCGCCGCCGCCGACATCGTCGTGTCACTGGACTGTCGCTGCCACACACGCCCCTCCATGGACCCATCACTCCTCTCCTCGGTAACCTCTCGTTTCTCTCCTTCCTCAGGCTCACCGACACCAACCTCACGGCCTCCATCCCAGCTGATCTTGGCAAGCTACGCCGTCTTAGACATCTCTGTCTAGGTGAAAACAGCCTCTCTGGTAGGATTCCTCCTGACCTGGGAAACCTAGCAAGGCTCGAGGTTCTTGAATTAGGCAGCAACCAACTCTCCGGTCAGATACCTCCAGAGTTGTTGCTGCATCTGCACAATCTTCAGGTGATTTCTCTAGAAGGGAACTCCTTGAGTGGGCAGATCCCGTCTTTTCTATTCAACAACACGCCTTCCTTGAGGTACCTATCTTTCGGAAACAACAGCCTATCAGGTCCTATACCGGATGGTGTTGCCTCCCTGTCTCAACTCGAGATTCTAGACATGCAGTACAATCAGCTCTCCAGCCTAGTGCCACAAGCCCTGTACAACATGTCCTGGCTTCGAGTCATGGCGCTGGCAGGCAACGGGAACCTGACCGGACCAATACCAAACAATAATCAGACATTCAGGCTCCCTATGCTACGATTTATTTCCCTCGCCCGGAACAGAATCGCCGGTCGGTTTCCTGCGGGGCTTGCATCATGCCAGTACTTAAGGGAAATCTATTTATATAGCAATTCTTTCGTGGATGTTCTCCCAACATGGTTAGCTAAATTGTCACGACTTGAAGTAGTTTCACTGGGTGGAAATAAGCTTGTTGGTACAATCCCAGCTGTTCTTAGCAACCTCACCCGCCTCACAGTACTAGAGCTCTCTTTTGGCAACCTTACAGGAAATATTCCACCAGAGATAGGATTACTTCAGAAACTTGTGTACTTGCTTCTTTCAGCTAATCAGTTGTCTGGCTCGGTACCGCGGACACTGGGGAACATTGCTGCTTTACAGAAGCTCGTTCTACCCCACAACAACCTAGAGGGGAATATGGGCTTCTTGTCATCTCTTTCAGAATGTAGGCAGCTGGAAGACCTTATCTTGGACCATAATTCTTTCGTAGGTGCCCTTCCAGACCATTTGGGTAATCTCTCGGCACGGTTAATTAGTTTCATTGCAGATCATAATAAGTTGGCAGGTAGTCTTCCAGAAAAAATGTCCAACTTAAGCAGCCTTGAACTGATAGATCTTGGTTACAACCAACTCACTGGGGCAATTCCAGAATCAATCGCTACGATGGGAAATCTCGGGTTGCTTGATGTCTCTAACAATCACATTTTAGGCCCTTTGCCAACACAGATTGGCACGCTTTTGAGTATACAACGACTATTTCTTGAAAGGAACAAAATCTCTGGCTCCATACCAGATAGCATTGGCAATCTTAGCAGGTTAGATTACATTGACTTGTCCAACAACCAGTTAAGTGGAAAGATACCAGCAAGCTTATTCCAACTTCATAACCTTATCCAAATAAATCTTTCCTGTAATTCCATTGTCGGTGCTCTGCCAGCCGACATTGCTGGCCTAAGACAAATCGACCAAATTGATGTTTCTAGTAACTTCTTGAATGGAAGCATCCCAGAATCATTGGGACAGCTCAATATGCTAACCTATCTGATTCTCTCACACAACTCCTTGGAAGGTTCAATTCCTAGCACTCTCCAAAGTCTAACTAGCTTAACATGGTTAGACCTTTCCTCAAACAACCTCTCTGGTTCCATTCCCATGTTCCTTGAAAATCTTACCGACTTGACTATGCTGAACCTCTCCTTCAATAGGCTCGAAGGCCCAATACCAGAGGGAGGAATTTTCTCTAATAACCTTACGAGACAATCTTTGATTGGGAATGCTGGGTTATGTGGTTCTCCACGTCTTGGATTTTCACCCTGTCTTAAAAAGTCTCACCCTTATAGCAGACCTCTTCTAAAACTTCTACTCCCAGCCATCTTGGTAGCTTCTGGCATCCTTGCTGTTTTCTTATACTTAATGTTTGAAAAGAAACACAAGAAGGCCAAAGCTTATGGTGATATGGCAGATGTCATAGGCCCTCAGTTACTCACCTATCATGATCTCGTCCTTGCCACTGAGAATTTCAGTGATGATAACCTGTTGGGATCTGGAGGATTTGGAAAAGTATTTAAAGGCCAACTTGGCAGTGGTTTGGTTGTTGCTATAAAAGTTCTAGACATGAAGCTGGAGCATTCGATCAGAATCTTTGATGCTGAGTGTCATATACTACGCATGGTGCGACACCGCAACCTGATAAAGATACTAAATACCTGTTCGAACATGGACTTCAAAGCATTGGTTCTTGAGTTCATGCCAAATGGCAGCTTAGAGAAACTGCTACACTGCTCCGAGGGCACAATGCACCTGGGATTCCTCGAGAGGCTGAATATCATGCTCGATGTGTCCATGGCAGTTCATTATCTGCACCATGAGCACTACGAGGTGGTTTTGCACTGTGATTTGAAGCCTAGTAATGTGCTATTTGACAATGACATGACAGCACATGTGGCGGATTTTGGCATTGCGAAGTTGCTATTAGGCGATGACAACTCGATGATTGTTGCTAGCATGTCTGGAACGGTTGGTTACATGGCACCAGAATATGGCTCTATGGGAAAAGCATCACGTAAGAGTGATGTGTTCAGCTATGGGATCATGCTTCTTGAAGTTTTCACTGGAAGGAGACCAATGGATGCTATGTTTCTTGGAGACCTAATAAGCCTTAGAGAGTGGGTTCATCAGGTATTTCCTACAAAACTTGTCCATGTGGTGGATAGGCATCTACTGCAAGGCTCCTCGTCTTCCAGCTGCAACTTGGATGAGAGCTTTCTTGTGCCAATATTTGAGCTGGGTTTGATCTGCTCTAGTGATTTGCCAAATGAAAGGATGACAATGAGTGATGTGGTCGTCAGACTGAAGAAGATCAAGGTGGCATACACCGAATGGATATCTGCGACATAG
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| Protein seq | MATTSSACVSIAVLVVVLSSTSCYSSPSPTTTANGSSDTDLAALLAFKSQLTDPLGVLTSNWSTSTSFCHWLGVTCSRRRRHRRVTGLSLPHTPLHGPITPLLGNLSFLSFLRLTDTNLTASIPADLGKLRRLRHLCLGENSLSGRIPPDLGNLARLEVLELGSNQLSGQIPPELLLHLHNLQVISLEGNSLSGQIPSFLFNNTPSLRYLSFGNNSLSGPIPDGVASLSQLEILDMQYNQLSSLVPQALYNMSWLRVMALAGNGNLTGPIPNNNQTFRLPMLRFISLARNRIAGRFPAGLASCQYLREIYLYSNSFVDVLPTWLAKLSRLEVVSLGGNKLVGTIPAVLSNLTRLTVLELSFGNLTGNIPPEIGLLQKLVYLLLSANQLSGSVPRTLGNIAALQKLVLPHNNLEGNMGFLSSLSECRQLEDLILDHNSFVGALPDHLGNLSARLISFIADHNKLAGSLPEKMSNLSSLELIDLGYNQLTGAIPESIATMGNLGLLDVSNNHILGPLPTQIGTLLSIQRLFLERNKISGSIPDSIGNLSRLDYIDLSNNQLSGKIPASLFQLHNLIQINLSCNSIVGALPADIAGLRQIDQIDVSSNFLNGSIPESLGQLNMLTYLILSHNSLEGSIPSTLQSLTSLTWLDLSSNNLSGSIPMFLENLTDLTMLNLSFNRLEGPIPEGGIFSNNLTRQSLIGNAGLCGSPRLGFSPCLKKSHPYSRPLLKLLLPAILVASGILAVFLYLMFEKKHKKAKAYGDMADVIGPQLLTYHDLVLATENFSDDNLLGSGGFGKVFKGQLGSGLVVAIKVLDMKLEHSIRIFDAECHILRMVRHRNLIKILNTCSNMDFKALVLEFMPNGSLEKLLHCSEGTMHLGFLERLNIMLDVSMAVHYLHHEHYEVVLHCDLKPSNVLFDNDMTAHVADFGIAKLLLGDDNSMIVASMSGTVGYMAPEYGSMGKASRKSDVFSYGIMLLEVFTGRRPMDAMFLGDLISLREWVHQVFPTKLVHVVDRHLLQGSSSSSCNLDESFLVPIFELGLICSSDLPNERMTMSDVVVRLKKIKVAYTEWISAT
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 5.341686 | 4.505126 | 0.397955 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0208900 | RBH | 8.128173 | 6.831915 | 1.593455 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0208900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006920 | SBH | 1.488999 | 0.0 | 0.410213 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0006900 | RBH | 0.616126 | 0.0 | 0.493502 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0004950 | SBH | 0.351912 | 0.244407 | 1.702016 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0004830 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0006760 | RBH | 17.078571 | 0.0 | 2.234451 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0061400 | SBH | 4.575236 | 3.059625 | 1.525088 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0006740 | RBH | 1.454289 | 0.0 | 0.872801 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0090600 | RBH | 11.8580575 | 0 | 0.0037395 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0006730 | RBH | 1.100941 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006800 | RBH | 3.780000 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006820 | RBH | 8.374599 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0006840 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.446228 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0006860 | SBH | 0.794262 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G006870 | RBH | 1.032044 | 0.0 | 0.183080 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006680 | SBH | 2.995412 | 0.0 | 0.859897 |
