Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsZS97_12G0002600 OGI:11000380 | 16/16 Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU Chr12:212395-217453
Gene Symbol -
DNA seq

AGAGAAGACAAGTCAAGCATAAGTGCAAAACCAGCAGCCAGGTAGTCTCCGCTTCTTGATCTTGTTTGCAAAAAAGGCTCACTGCATCTATAATCTATTTACTCCAAAATTTAGGTTATGATTTTCTTCTTCTTTTGATTTACTTACATGGCAAGTCCACTATTTTAGGTGTTAGTACAATATTACTTGACAAGCATTTGTCGATTAATTTGCTAAAGAAACTAAAGAACTTTATTGATTTGCAAAGAAAGAGAACTAGAAGTTCTTTTTTACAATACACATCGGATCTTGTTGTCTTCAATTTCTATTTATATAAGTTATTCAGACTACTTTATTTCTGTGGTTTTTTTATTGTCTAATATACTATCAACATTATTTATCAAGAATAAAATATTATATAACAATTTACAACTAGTTGATTTATTATTTACTATGTTAGTAATATTGTTTTTGTCACTTTAGATATTAGATCACAGTTACATATTACAAATAAAAAATATTTAACCTTAAGGGCCTATGTCACCGAGTTCACGTAGGGCCCTTGAAATTATAGAGCTAGCCCTACGAACAGGCGGCGGAGGGGGAAAAATTGGAGTCGGTGAGAAAGATGGTGAGCAGCATGAAGCTTCCTTTGGTGGATGGGGAGGAGCAGTCGTCCTATGACCCAATGGGGGAAAAGTTGAAGATGATGAGCAGCAAGCATTTTTTGGAGGAGCAGCGTCTAGTGGAGTTGGAGTTGGAGTTGGAAGATGAAGAGGAGGTGGAAGATGAGGAGTTGGCCGAGCTGATAACGGCGCGAGACTTCCGTGTCAGCTGGGAACATCGCTTTACCCCTCGCTATTCCTTCAATGACACCAGTAAGTAATAAATCCTCCTCCGCCCCGCCGTTTTATTCTGCTTCCGTTTCTTTCTTTACTTCAACGCAATCAAGATTATTTCTGCGAATCTATCTATCATGTTTCGTATCACCATTATATACTGGAGTATATACCACTATCTATTTGTGCTCCAATTCTGGTTGTTCCAAGTGTCTTGTTTTATTTTGGGTTAAGAGATTGCCAGGCTAAATACCTGTGTTTGTGTGTCCTCAACTATATATGCAACACATTTAGCATGTGAAACAAGTGCTAGGTTTTCCTAATTACACTCTATAAACCATCACAGTACAAATCCTGTTAATCACAACAGGATACTAGAAAGATTAAATTTGAACCAGATCCGATAGATTATCTGACGTGGTGCCAACTAATTATGTTTCATATATATATTGGGCCGCAAAAGCATGTTAAATAATCTGAGCCAATTTGTCTTCTTTTTCCCTTCATCTAGCACAATGAATTCTGACAGAATTAAAGTGGAATATCAATTAGTTGCTGATTCCCTACTTATTGGAGCAATAATCCCTAATTTTGTATGTTTGTTTATCTTCTTTTTTTTTTTCAAAGTAGCAGGCAGGAGATCTGCTAGCTAAATACATTAGAAGAAGCAACAAATAGAGTCTAGTTTAGTACATACTAAATAGGATATCTACAGCGCCAAGAATAGCAACTTGCATATCAAAATCCGCATTAGAGGGTATCAGCACTAAACGCTAAGGGTAGCTCGTTTACGTCTTGTATCACCAAGAAAACCACCTTGTTCTCGGGTTGGTCCTGGAAGACCCTCATGTTTCTTTCAAGCCGGATATTCCACCACGTAACAAGCAAAGCTCCCAATACTCCCTTTCTGTTTTCACATGGTGTCATTGCACTTGACTTGTTCCACCAATCTGATAGACAATTGTAGGTTGAGTTCATTGCTGTGATCTGTAGTTTTTAGCGAATCATTTCCTACACTTTGGTCGTGAAGGAATATTCCTTAGCAAGATGATTGGTGTCCTCGAAAAAGCTTTAGTGCAGAGAGTACAAATCTCATTACATGGCCAATGTCTTTTAAGCAAATTTTTGGTTGCTAGTACCTTGTGGTGTAACAATAGCCAACCAAATAATTGGTGCTTTGGTTCGTTGTTTGCTTTCCAGAGGCTGGTAAAATTTGAGTATGACACACTTCCAGTGAATTGTGCAAGATACGCTCTTTTTGCCATATATGATGTCATTTTTTATCCCTGGCTGCAGTTTAACCCCAGCTAATAGATCTGCAATCCAAACTAGTTCATTGATTTCTTCAATTGTTGTTAGGGGCCTTAGCAGGAAATCTGTTGTCAGATATTTCAACTAGAATAGAGTTGTTTGTTCTCTTTGCTAGTTTGAACAGACCTGGCACCAGATCCTTTTTTCTCCCATTCTGAATCCAAGTAAATTTCATAAAACTACAGGTATTTTGCACAATTTATCACAAAACTACATATTTAAGAGCTTGTTTTACAAAACTACAGATTTAATGTCTCTGTTTATCACAAAACTACAGGTGCTTTGTATAATCTATCACAAAACTATATATTTAAGAACTTGTTTCACAAAACTATAGATTTAGTGTATTCGTTTATCCCAGAACTACACATTTAGTGTCTTCATTTATCACAAAACTACGGATTTAGTGTCTCCAACTTGTAGTTTTGTGATAAATGAATATATTAAATCTGTAGTTTTGTGAAATAAATTCTTAAATATGTAGTTTTGTGAAATATTGTGCAAAGTACCTGTAGTTTTGTGATAAATGAATATACTGAATTTGTAGTTTTATGAAACAAGCTCTTAAATAGATCATGCAAAGTATATGTGGTTTTATGTAATTTACTCATCCAATTATCGTTCCAGAAGGTAGCTTTACTCCCGTCACCCAACGTGATGGTAGTTGCCGCCGCAAAAGGTTCTTTGTTGATTGTATCACAAGGAGCCTCCATTTGGCGAAGGGCCTTGGCAAACTCCTGCAGCTCCAAAAATGGGTCCACCTAAATTTCTTGGTTTGGCTGGCATACAGTCGCCCAATTTACCAAACTGTATCCAGGGGTGATATTTTCTGGGTCTTACCCTTTCCACAAAAAGGCTCTCCTAATTCTGTCAATTTTCTTGATCAACCATTTTTGTACGTAGAACTGTGAGATGGTATGCTGGGATTGAGCTCAGAGCAGTCTTGATATGTTGTTTATCTTACTCCTCATTCTCATCAAGGTTAATGTCTAGTACTCCATATATGTGCTTATCCACATTGTCACATCAATCATTTAACTAAAACTTGGATTTTTGAGTCGAAAATGGGACACAACAATAGCTAAGAGCAGCATCCACAATGCTATTATTTGATAATAAATATTACTGCTACTTAACTGCAGCAACCGTATGTCCCATACGCTATACGGAGGGACCTATCCCAAGATATGCTTGCTGTGGTGATACCTTGCAGATCTTCTCTCTCCAAGTGAAAGAAGCAAAAGGTGGTCTTGACTGGCCGCTGCATGTGTATGGCTTGGTTGCCACCAGGGACTCTGTAGATCAAAGGCGCAACCTTTTTTTCAGGTGCACAAAGGATAATTGTTAAATTCTCACTCCACAGGTATCTATCTTGTAATTTCCTTATACCTTTATTGTTTTCTCATTTTTCTTGCAGCTTGAAGTGCTCAACCTATCATACTAGTAGATTACTACTGTTCTGTACACTTGTTTGTATAAATATGTTGTCTTTTTGGAGTTATTAGTGCATTCATAGGCTGGCTGCACCTAAACTGTCAATTGAAGGCATGTTTGCAATTTTTTTCCTTACCACTCTTTTTTCACATAATTCATTGGTAAAAACTAAAAACTGAGGATTTGTTTAGTTCCCAAATTTTTTTTCTCAAAAACGTCACATCGAATCTTTGGATATATGTATGGAGCATTAAATATAGATAAAAAAACTAATTGCACGGTTTGCACGGAAATCGCGAGACGAATCTGGTGAGCCTAATTAGTCCATGATTAGCCATAAGTGCTACAGTAACCTACATGTGCTAATGACGGATTAATTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTCTAGGCGAGTTATGAAATTAGTTTTGTCATTCGTGTCCGAACCCCTTCCGGCATCCGGTCAAACGTCCAATGACACCTAAAAATTTTCTTTTCGCGAACTAAACACACTCACTATGACCTATACCTATACTCCTTTTGAAATAATCCACTCGTGGTGTTGGCATTGAATCTGCTGTGTCAACTCTTCCTACCACAGTTTTCTATAAATCAACCTGTGATGATAGTTAATATTATCAACAGCCAAACATAGCAGTATTGCCACATGTATAACCAAGATGAGCACTCACTGTTGCAAATAAATGAATAGCATATTGCATGCAAAACATAAATTATGTTTGTTTATTTTAGGCAATATTATGGCATACTTTCTTTTATTGGTAGCAAAGCTATTGCATTTACCTTGTCTATGGAAATAGAAGTTTTGTGATGGACCGTCTTTAACATGGGCTCGTAGGAAATAACTGCATGGATTGGTTGCATACTGGATCCTTATTATACGGAGGGAACCAAGTTTTAGTAATAATCAATTGGTTGTGATGCCTGCAGGATTCACACCTGCTGTTAACAGGCCCATCTCGTGCAGTTGTGGTAATTGATCCAGTAACGTTTGAAGTTGAACTAAAGGTAAAAGGAAAAACAGAGGCTGAGGATAAGGTGTTGAGCCTAAGGGTCTTTATGCAGCACTACAATGGTGAGTATCCAAGTTAGAGAGGGGTCATGGCCAGATCATATACGAGGGGCAGCGTAGAGGGAGGGGATTTTGTGCTGCTTGATTCTGCCTATTAACAGCTACGATGGTGGCATTGAGCTTTCAAGGCGTGTGGTTTGTGTGGAATTGAGGGGAGATGTGGTGGCAATGGCATCGTCGCACAACCTCAATGTCGTCGTGGGTTCAACCTTGAGGCAAATGCTCTCGGGCATGCCTTGATCCATACTAATCACTTTAGCTTGTTTTGATTTTTGAGTTAACGTACAGCTCGGCTGCATATGCTTGCGTAATTGTGTTTTTGGCGTCATGGTCTGCTCAACCC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CDS seq

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Protein seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_12G0002600 OsZS97_12T0002600.1 Chr12 212395 217453 + makerRMon
CDS seq

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0 0.0570455 0.013646

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0103150 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g01250 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0103150 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0000100 RBH 0.0 0.0 0.000000
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0000250 RBH 0.0 0.000000 0.494638
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0000230 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0000110 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0000250 SBH 8.471019 3.542328 10.424809
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0002500 RBH 0 0.070706 0.0084565
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0000270 SBH 0.458378 0.570691 0.744708
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0002700 RBH 2.7554605 0.7957155 3.502628
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0000110 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_12g0000250 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0000240 SBH 1.311463 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0000250 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0000240 SBH 0.332196 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G000270 SBH 0.501846 1.450618 1.664167
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0000240 SBH 1.000108 0.0 3.680707
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